Heatmap: Cluster_70 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00859	0.02	0.0	0.01	0.05	1.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00991	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00997	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01460	0.0	0.03	0.03	0.03	0.03	1.0	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.02	0.01	0.06	0.06	0.13	0.02
Gb_01468 (AAE15)	0.07	0.09	0.04	0.04	0.12	0.58	0.94	0.02	0.0	0.01	0.0	0.05	0.0	0.0	0.02	0.03	0.05	0.07	0.65	1.0
Gb_02219	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.83	0.07	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	1.0	0.01	0.73
Gb_02722	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	1.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.1	0.0	0.03
Gb_02725	0.02	0.12	0.02	0.0	0.04	1.0	0.03	0.02	0.02	0.01	0.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.01	0.04	0.09	0.0	0.06
Gb_03164	0.97	0.71	1.0	0.58	0.77	0.57	0.19	0.32	0.34	0.26	0.44	0.21	0.33	0.34	0.32	0.63	0.38	0.57	0.25	0.24
Gb_03299	0.15	1.0	0.4	0.17	0.37	0.76	0.32	0.11	0.14	0.07	0.06	0.09	0.06	0.05	0.07	0.2	0.1	0.28	0.28	0.14
Gb_03300	0.22	1.0	0.64	0.22	0.24	0.87	0.47	0.16	0.16	0.06	0.13	0.06	0.1	0.16	0.24	0.27	0.11	0.22	0.29	0.23
Gb_04454 (BGLU13)	0.06	0.0	0.01	0.02	0.07	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04761	0.43	0.39	0.36	0.39	0.5	1.0	0.29	0.34	0.46	0.54	0.5	0.36	0.36	0.39	0.51	0.44	0.17	0.4	0.55	0.51
Gb_04808 (JGL)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05584	1.0	0.57	0.97	0.9	0.46	0.35	0.05	0.12	0.08	0.07	0.03	0.03	0.03	0.05	0.01	0.17	0.08	0.34	0.1	0.14
Gb_06269	0.22	0.23	0.28	0.34	0.55	0.65	0.58	0.17	0.07	0.07	0.12	0.11	0.04	0.05	0.14	0.12	0.2	0.97	0.72	1.0
Gb_06875 (NRT1.5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08477	0.62	0.41	0.48	0.56	0.53	0.36	0.33	0.29	0.15	0.16	0.24	0.17	0.06	0.07	0.2	0.2	0.27	0.7	0.64	1.0
Gb_08693	0.15	0.05	0.13	0.05	0.1	1.0	0.2	0.1	0.08	0.1	0.02	0.02	0.05	0.03	0.04	0.02	0.1	0.14	0.2	0.17
Gb_09252 (NLM6)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.86	1.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.03
Gb_09270	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10444	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	1.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.03	0.01	0.04
Gb_12800 (MES17)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12947 (MC6)	0.0	0.0	0.0	0.07	0.05	1.0	0.0	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.08	0.07	0.0	0.68
Gb_14010 (LBD20)	0.03	0.01	0.02	0.0	0.06	0.74	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Gb_14173 (GPAT6)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.12	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14414	0.97	0.47	0.75	1.0	0.79	0.68	0.11	0.21	0.13	0.1	0.1	0.14	0.07	0.07	0.1	0.23	0.21	0.58	0.41	0.33
Gb_14995	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15131	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15555	0.15	0.09	0.09	0.14	0.3	1.0	0.15	0.37	0.47	0.56	0.39	0.16	0.47	0.29	0.34	0.36	0.68	0.14	0.12	0.95
Gb_15556	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15557	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15979	0.37	0.12	0.4	0.09	0.49	1.0	0.53	0.13	0.24	0.18	0.1	0.11	0.27	0.23	0.22	0.45	0.11	0.1	0.08	0.5
Gb_16975	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17153	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18798 (PLA-I{gamma}1)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01
Gb_19434	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19884	0.01	0.0	0.01	0.08	0.08	0.55	1.0	0.35	0.32	0.38	0.18	0.38	0.14	0.16	0.23	0.31	0.23	0.17	0.01	0.72
Gb_20397 (ATSBT5.2)	0.06	0.0	0.01	0.51	0.32	1.0	0.09	0.11	0.07	0.06	0.16	0.05	0.06	0.07	0.27	0.18	0.18	0.28	0.06	0.21
Gb_20519	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_20679 (FLS)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24086	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25235	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	1.0	0.11	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01
Gb_27456	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28007	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38
Gb_28054 (NPC2)	0.04	0.02	0.01	0.01	0.0	1.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_28229	1.0	0.42	0.63	0.88	0.65	0.79	0.75	0.31	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.05	0.07	0.67	0.2	0.42
Gb_28230	0.84	0.33	0.77	1.0	0.86	0.47	0.63	0.32	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.06	0.7	0.14	0.24
Gb_29137	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29138	1.0	0.18	0.62	0.61	0.46	0.77	0.06	0.41	0.34	0.25	0.33	0.22	0.22	0.21	0.26	0.28	0.56	0.36	0.51	0.15
Gb_29275	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29502 (NPC2)	0.06	0.07	0.17	0.05	0.03	1.0	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.03	0.03	0.0	0.06
Gb_29506	0.32	0.28	0.56	0.49	0.5	1.0	0.02	0.07	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.06	0.03	0.06	0.12	0.22	0.0	0.06
Gb_30563	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.08	0.04	0.01	0.01	0.02	0.0	0.03	0.05	0.0	0.02	0.03	0.01	0.12
Gb_30760	1.0	0.54	0.87	0.93	0.53	0.35	0.13	0.27	0.25	0.16	0.15	0.18	0.19	0.22	0.17	0.38	0.31	0.38	0.3	0.24
Gb_31075 (MS2)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_31528	0.01	0.0	0.01	0.01	0.16	1.0	0.09	0.06	0.05	0.08	0.14	0.13	0.13	0.11	0.07	0.16	0.25	0.01	0.0	0.02
Gb_31529	0.14	0.0	0.02	0.28	0.15	0.9	0.0	0.14	0.2	0.24	1.0	0.3	0.17	0.3	0.0	0.05	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_31625 (SHT)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_32529	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33455	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	1.0	0.1	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.0	0.0	0.12	0.02	0.03	0.03	0.0	0.21
Gb_33876	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34465	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.16	0.18
Gb_35511	0.37	0.0	0.95	1.0	0.2	0.37	0.0	0.06	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.09	0.31
Gb_35667	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36655	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37287	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39343 (LBD20)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0
Gb_40048 (ZF14)	1.0	0.08	0.31	0.34	0.23	0.29	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.59
Gb_41176	0.71	0.0	0.07	0.23	0.5	1.0	0.92	0.21	0.34	0.2	0.27	0.13	0.21	0.36	0.7	0.62	0.2	0.13	0.17	0.6

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)