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Heatmap: Cluster_86 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.75 -0.7 -0.56 0.05 0.45 0.49 0.48 0.4 0.09 -0.19 -0.16 -0.31 -0.96 -0.15 0.1 0.47 -0.22 0.27 0.21 -0.57 -0.64 0.19 0.6 -0.32 0.29 -0.23
-0.41 -0.17 -0.29 -0.3 0.16 0.5 0.46 0.24 0.11 0.12 -0.28 -0.17 -0.64 -1.11 -0.37 -0.63 -0.12 0.84 0.65 0.43 -1.13 -1.03 0.9 0.22 -0.19 -0.39
-2.57 -0.67 -0.86 -0.35 0.51 0.79 0.84 0.61 0.06 -0.04 -0.09 -0.56 -3.1 -0.77 -0.92 -0.77 -0.13 0.4 -0.6 -0.66 -2.13 -1.86 1.89 0.06 0.94 0.31
-1.44 -0.37 -0.08 0.47 0.94 0.85 0.46 0.39 -1.03 -0.95 -0.75 -1.29 -2.33 -1.42 -0.78 -0.6 -0.08 -0.1 0.26 0.21 -0.04 0.44 1.09 -0.03 0.57 0.19
-0.87 0.28 0.12 0.06 0.28 0.28 0.29 0.1 0.03 -0.17 -0.52 -0.86 -1.11 -0.18 0.32 0.37 0.07 0.63 0.48 0.14 -0.98 0.32 0.36 -0.2 -0.42 -0.77
-0.71 -0.81 -0.42 -0.01 -0.25 0.69 0.12 -0.3 -0.5 -0.44 -0.32 0.17 -0.87 0.23 0.03 -0.05 -0.05 0.59 0.32 0.25 -1.19 0.0 0.83 -0.3 0.47 0.41
-0.81 -1.07 -1.37 -0.79 0.2 0.17 0.64 0.53 0.12 -0.02 -0.42 -0.48 -1.62 -0.44 -0.66 0.06 0.14 0.99 0.91 0.36 -2.15 -1.83 1.14 -0.24 0.45 0.34
-1.53 -0.23 -0.31 -0.35 0.31 0.58 0.06 -0.23 -0.46 -0.45 -0.41 -0.58 -2.06 -0.84 0.2 0.05 0.21 0.56 0.52 0.45 -0.39 -1.28 1.46 0.63 -0.02 -0.27
-0.27 -0.33 -0.28 -0.08 0.16 0.53 0.49 0.21 0.18 -0.02 -0.3 -0.57 -0.46 -0.35 0.02 -0.17 -0.14 0.22 0.31 0.04 -0.74 0.08 0.71 0.23 -0.22 -0.32
-1.88 0.51 0.25 0.08 0.26 0.78 0.43 0.23 0.29 -0.16 -0.65 -0.92 -1.99 -0.82 -0.22 -0.82 -0.33 0.16 0.49 -0.21 -2.09 0.05 1.73 -0.65 -0.01 -0.55
-2.19 -0.89 0.06 0.24 0.33 0.31 0.15 0.17 0.27 0.11 -0.01 -0.27 -1.74 -0.37 -0.12 -0.35 -0.55 0.91 0.24 0.1 -1.26 -0.66 1.61 -0.2 -0.11 -0.55
-1.65 -0.76 -0.11 -0.03 0.08 0.37 0.51 0.31 -0.08 -0.09 -0.18 -0.59 -1.4 0.13 -0.02 0.16 -0.31 0.47 0.49 -0.0 -1.61 0.49 0.86 -0.35 0.43 -0.13
-0.67 -0.05 -0.03 -0.11 0.03 0.08 0.2 0.05 -0.09 -0.3 -0.62 -0.71 -0.84 -0.19 0.21 0.23 0.1 0.76 0.37 0.19 -0.43 -0.02 0.95 -0.12 -0.06 -0.45
-1.84 -0.27 -0.4 -0.03 0.53 0.54 0.3 0.15 -0.08 -0.45 -0.99 -1.37 -2.89 -0.49 0.38 -0.2 -0.47 0.54 0.4 -0.1 -0.25 0.58 1.15 0.25 0.32 -0.13
-2.57 -0.26 -0.42 0.16 0.32 0.39 0.36 0.03 -0.17 -0.48 -0.94 -1.26 -3.52 -0.36 0.57 0.21 0.14 0.94 0.67 0.04 -0.44 0.41 0.65 -0.13 -0.09 0.11
-0.56 0.49 0.31 -0.06 0.05 0.39 -0.23 -0.03 -0.04 -0.23 -0.36 -0.49 -1.35 -0.99 0.21 -0.1 -0.17 0.68 0.77 0.46 -0.61 -2.31 1.19 0.35 -0.58 -0.76
-1.38 -0.57 -0.4 0.21 0.46 0.52 0.53 0.53 0.04 -0.41 -0.48 -0.46 -1.7 -0.7 -0.54 -0.43 -0.66 0.13 0.1 -0.77 -0.5 0.48 1.22 0.08 0.78 0.2
-2.81 -0.92 -0.49 -0.2 0.46 0.55 0.73 0.25 -0.57 -0.62 -0.52 -0.84 -2.41 0.13 -0.13 -0.0 0.35 0.26 0.28 0.18 -1.63 0.21 0.96 0.08 0.99 0.0
-0.77 -0.63 -0.52 -0.34 0.04 0.45 0.04 -0.24 0.09 0.16 -0.03 -0.03 -1.01 -0.43 -0.42 -0.07 -0.21 0.45 0.48 0.17 -1.06 1.14 0.16 0.43 0.04 0.0
-0.58 -0.12 -0.08 -0.19 0.07 0.06 0.15 0.02 -0.17 -0.31 -0.57 -0.8 -0.76 -0.09 0.18 0.59 -0.02 0.85 0.29 0.03 -0.42 0.53 0.76 -0.12 -0.31 -0.7
-0.89 -0.27 -0.12 0.18 0.4 0.69 0.12 -0.38 -0.02 -0.1 -0.22 -0.26 -0.99 -0.34 -0.09 0.06 -0.04 0.33 0.33 0.19 -1.31 0.29 0.49 0.21 0.1 0.01
-0.4 -0.65 -0.46 -0.21 0.34 0.85 0.69 0.4 0.3 -0.07 -0.57 -0.73 -0.43 -0.2 -0.09 -0.08 -0.18 0.19 0.19 0.03 -0.33 -0.93 0.9 0.24 -0.54 -0.31
-0.53 -0.11 -0.21 0.22 0.6 0.54 0.57 0.11 0.25 -0.46 -0.45 -0.76 -0.58 -1.26 -0.8 -0.64 -0.64 -0.09 -0.1 -0.44 -1.05 0.89 1.39 -0.76 0.47 0.14
-5.27 -1.3 -0.69 -0.11 0.36 1.06 0.42 0.42 -0.97 -1.06 -1.49 -2.16 -3.8 -0.43 -0.19 0.65 0.39 0.23 0.24 1.22 - -0.22 1.23 -0.6 1.01 0.36
-0.29 -0.02 -0.06 0.2 0.32 0.37 0.31 0.23 0.07 -0.1 -0.01 -0.19 -0.41 -0.71 -0.23 -0.33 -0.32 0.62 0.27 -0.09 -2.83 -0.46 0.98 -0.31 0.01 0.19
-0.6 0.56 0.24 -0.17 -0.18 -0.33 -0.01 -0.15 -0.52 -0.72 -1.26 -1.62 -1.01 -0.03 0.22 0.61 0.31 1.26 0.85 0.43 -0.94 -0.62 1.26 -0.94 -0.66 -0.97
-2.11 -1.32 -0.96 -0.73 0.48 1.23 0.96 0.56 0.01 -0.81 -0.81 -1.33 -2.31 -0.81 -0.57 0.61 0.01 -0.08 0.12 -0.11 -0.01 0.14 0.85 0.5 0.47 -0.15
-0.5 -0.32 -0.54 0.24 0.7 0.39 0.43 0.46 -0.12 -0.25 -0.11 -0.62 -0.5 -0.55 -0.38 -0.2 -0.55 0.13 -0.43 -0.6 -0.84 0.01 1.24 -0.23 0.58 0.19
-0.07 -0.04 -0.2 -0.23 0.1 0.23 0.07 -0.1 -0.36 -0.44 -0.53 -0.56 -1.05 -0.29 0.15 -0.09 0.11 0.48 0.68 0.41 -1.71 -0.98 0.97 0.24 0.52 0.11
-1.54 -0.28 -0.02 -0.08 0.15 0.55 0.18 0.01 0.22 0.34 -0.12 -0.33 -1.95 -0.71 -0.11 -0.18 0.08 0.54 0.5 0.02 -3.62 1.37 -0.38 -0.34 0.14 0.15
-1.74 0.26 0.52 0.4 0.36 -0.02 0.25 0.18 0.16 -0.15 -0.7 -0.9 -1.99 -0.64 0.07 -0.11 -0.02 1.02 0.69 0.46 -1.76 -1.26 1.48 -1.15 -0.59 -1.02
-1.24 -0.44 -0.13 0.33 0.76 0.8 0.47 0.42 -0.37 -0.58 -0.65 -1.01 -2.09 -1.12 -0.94 -0.18 -0.6 0.34 -0.09 -0.26 -0.57 0.68 0.96 -0.61 1.06 0.23
-0.31 -0.08 0.08 0.02 0.11 0.09 0.2 0.08 0.03 -0.03 -0.2 -0.37 -0.36 -0.12 0.23 0.21 0.23 0.52 0.49 0.32 -0.9 -0.11 0.28 -0.57 -0.33 -0.4
-1.88 -0.97 -0.07 0.27 0.45 0.56 0.44 -0.04 -0.4 -0.2 -0.31 -0.08 -1.43 -1.09 -0.45 -0.63 0.13 0.18 0.11 -0.31 0.03 0.27 1.2 0.48 0.26 0.08
-0.57 -0.07 0.16 0.15 0.12 0.24 0.16 0.25 0.08 -0.24 -0.23 -0.28 -0.76 -0.37 -0.03 -0.31 0.2 0.17 0.23 0.27 -0.91 -0.34 0.82 0.18 0.08 -0.13
-1.42 -0.66 -0.3 0.3 0.34 0.21 0.31 0.33 0.2 -0.17 -0.11 -0.36 -1.23 -0.78 -0.2 -0.32 -0.42 0.74 0.29 -0.28 -1.04 -0.25 1.28 -0.18 0.46 0.17
-1.84 -1.54 -0.24 0.09 0.01 0.35 -0.04 -0.0 0.04 -0.17 -0.23 -0.05 -1.63 -0.43 -0.03 -0.15 -0.33 0.1 0.25 0.37 -0.27 -0.41 1.31 0.95 0.11 0.16
-0.56 -0.1 -0.24 -0.35 0.27 0.27 0.33 -0.08 0.14 -0.4 -0.49 -0.69 -1.23 -0.88 0.28 -0.51 0.32 0.79 0.96 0.37 -3.2 -0.62 0.84 0.46 -0.12 0.01
-0.88 -0.56 -0.45 -0.56 -0.05 0.53 0.41 0.0 -0.36 -0.74 -0.9 -0.98 -0.68 0.16 0.32 0.22 0.12 0.81 0.48 0.21 -0.2 0.24 1.1 0.17 -0.8 -0.38
-0.57 -0.64 -0.48 -0.52 0.28 0.86 0.33 -0.09 -0.42 -0.8 -0.78 -1.04 -0.93 0.12 0.46 0.34 0.32 0.66 0.57 0.09 -0.28 0.03 1.03 -0.25 -0.64 -0.59
-2.59 -0.76 -0.73 -0.23 0.52 0.95 0.65 0.16 -0.47 -0.61 -0.73 -0.55 -3.54 -0.49 -0.48 0.43 -0.17 0.39 0.08 0.16 -0.74 0.45 0.84 0.41 0.94 -0.29
-2.52 -1.38 -0.88 -0.4 0.48 0.71 0.94 0.77 0.04 -0.54 -0.88 -1.66 -3.88 -1.17 -0.5 -0.07 0.11 0.75 0.71 0.13 -2.25 -1.67 1.76 -0.06 0.56 -0.15
-2.0 -1.18 -0.89 -0.18 0.46 0.59 0.57 0.25 -0.12 -0.38 -0.74 -1.21 -2.38 -0.05 0.15 0.6 0.11 0.48 0.72 -0.01 -0.85 0.34 0.96 -0.1 0.17 -0.14
-3.41 -1.01 -0.96 -0.51 0.39 0.99 0.7 0.52 -0.46 -0.97 -1.99 -2.17 -4.27 -0.92 -0.21 1.14 0.13 0.55 0.32 0.23 -0.64 0.51 1.53 -0.02 -0.02 -0.85
-1.29 -0.16 -0.12 -0.02 0.29 0.43 0.22 0.12 0.12 0.2 0.13 0.06 -1.45 -0.77 0.01 -0.35 0.01 0.42 0.54 0.38 -1.32 0.09 0.75 0.19 -0.25 -0.7
-1.78 -0.65 0.5 0.38 0.15 0.14 -0.37 -0.18 0.05 -0.88 -1.13 -1.35 -2.66 -1.76 -0.6 -1.63 -0.43 0.32 0.34 0.85 -0.61 0.59 1.92 0.37 -0.09 0.49
-0.07 -0.29 -0.34 -0.0 0.14 0.17 0.25 0.22 0.1 0.13 -0.03 -0.07 -0.03 -0.53 -0.32 -0.54 -0.13 0.56 0.43 0.15 -1.2 -0.47 0.81 -0.21 -0.11 0.09
-0.96 -0.38 -0.2 -0.36 0.32 0.16 0.5 0.38 -0.28 -0.08 -0.39 -0.15 -1.05 -0.99 -0.94 -0.95 -0.18 1.12 0.94 0.38 -1.96 -2.23 1.54 0.88 -0.71 -1.27
-0.05 -1.0 -1.21 -0.13 -0.16 0.58 1.13 0.78 0.06 -0.68 -1.16 -1.08 -1.36 -1.26 -1.14 -0.76 -0.78 0.15 0.45 -0.66 -1.65 -0.1 1.48 0.51 1.1 0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.