Heatmap: Cluster_86 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.39 0.41 0.45 0.69 0.9 0.93 0.92 0.87 0.7 0.58 0.59 0.53 0.34 0.59 0.71 0.92 0.57 0.8 0.77 0.45 0.42 0.75 1.0 0.53 0.81 0.56
0.4 0.48 0.44 0.44 0.6 0.76 0.74 0.63 0.58 0.58 0.44 0.48 0.34 0.25 0.41 0.35 0.49 0.96 0.84 0.72 0.24 0.26 1.0 0.62 0.47 0.41
0.05 0.17 0.15 0.21 0.38 0.47 0.48 0.41 0.28 0.26 0.25 0.18 0.03 0.16 0.14 0.16 0.25 0.36 0.18 0.17 0.06 0.07 1.0 0.28 0.52 0.33
0.17 0.36 0.44 0.65 0.9 0.85 0.65 0.61 0.23 0.24 0.28 0.19 0.09 0.18 0.27 0.31 0.44 0.44 0.56 0.54 0.46 0.64 1.0 0.46 0.7 0.54
0.35 0.78 0.7 0.67 0.78 0.78 0.79 0.69 0.66 0.58 0.45 0.35 0.3 0.57 0.81 0.83 0.68 1.0 0.9 0.71 0.33 0.81 0.83 0.56 0.48 0.38
0.34 0.32 0.42 0.56 0.48 0.91 0.61 0.46 0.4 0.42 0.45 0.63 0.31 0.66 0.57 0.55 0.54 0.85 0.7 0.67 0.25 0.56 1.0 0.46 0.78 0.75
0.26 0.22 0.18 0.26 0.52 0.51 0.71 0.65 0.49 0.45 0.34 0.33 0.15 0.34 0.29 0.47 0.5 0.9 0.86 0.58 0.1 0.13 1.0 0.38 0.62 0.58
0.13 0.31 0.29 0.29 0.45 0.54 0.38 0.31 0.27 0.27 0.27 0.24 0.09 0.2 0.42 0.38 0.42 0.54 0.52 0.5 0.28 0.15 1.0 0.56 0.36 0.3
0.51 0.49 0.5 0.58 0.69 0.88 0.86 0.71 0.69 0.6 0.5 0.41 0.45 0.48 0.62 0.54 0.55 0.71 0.76 0.63 0.37 0.65 1.0 0.72 0.52 0.49
0.08 0.43 0.36 0.32 0.36 0.52 0.4 0.35 0.37 0.27 0.19 0.16 0.08 0.17 0.26 0.17 0.24 0.34 0.42 0.26 0.07 0.31 1.0 0.19 0.3 0.21
0.07 0.18 0.34 0.39 0.41 0.41 0.36 0.37 0.39 0.35 0.32 0.27 0.1 0.25 0.3 0.26 0.22 0.62 0.39 0.35 0.14 0.21 1.0 0.29 0.3 0.22
0.18 0.33 0.51 0.54 0.59 0.71 0.78 0.68 0.52 0.52 0.49 0.37 0.21 0.6 0.55 0.62 0.45 0.76 0.77 0.55 0.18 0.78 1.0 0.43 0.74 0.5
0.33 0.5 0.51 0.48 0.53 0.55 0.59 0.54 0.49 0.42 0.34 0.32 0.29 0.45 0.6 0.61 0.55 0.88 0.67 0.59 0.38 0.51 1.0 0.48 0.5 0.38
0.13 0.38 0.34 0.44 0.65 0.65 0.56 0.5 0.43 0.33 0.23 0.17 0.06 0.32 0.59 0.39 0.33 0.66 0.6 0.42 0.38 0.67 1.0 0.54 0.56 0.41
0.09 0.43 0.39 0.58 0.65 0.68 0.67 0.53 0.46 0.37 0.27 0.22 0.05 0.41 0.77 0.6 0.57 1.0 0.83 0.53 0.38 0.69 0.82 0.47 0.49 0.56
0.3 0.61 0.54 0.42 0.45 0.57 0.37 0.43 0.42 0.37 0.34 0.31 0.17 0.22 0.51 0.41 0.39 0.7 0.75 0.6 0.29 0.09 1.0 0.56 0.29 0.26
0.17 0.29 0.32 0.5 0.59 0.62 0.62 0.62 0.44 0.32 0.31 0.31 0.13 0.26 0.3 0.32 0.27 0.47 0.46 0.25 0.3 0.6 1.0 0.45 0.74 0.49
0.07 0.27 0.36 0.44 0.69 0.74 0.83 0.6 0.34 0.33 0.35 0.28 0.09 0.55 0.46 0.5 0.64 0.6 0.61 0.57 0.16 0.58 0.98 0.53 1.0 0.5
0.27 0.29 0.32 0.36 0.47 0.62 0.47 0.38 0.48 0.51 0.45 0.45 0.23 0.34 0.34 0.43 0.39 0.62 0.63 0.51 0.22 1.0 0.51 0.61 0.47 0.46
0.37 0.51 0.52 0.49 0.58 0.58 0.61 0.56 0.49 0.45 0.37 0.32 0.33 0.52 0.63 0.83 0.55 1.0 0.68 0.57 0.41 0.8 0.94 0.51 0.45 0.34
0.34 0.51 0.57 0.71 0.82 1.0 0.67 0.48 0.61 0.58 0.53 0.52 0.31 0.49 0.58 0.64 0.6 0.78 0.78 0.71 0.25 0.76 0.87 0.72 0.67 0.62
0.41 0.34 0.39 0.47 0.68 0.97 0.87 0.71 0.66 0.51 0.36 0.32 0.4 0.47 0.51 0.51 0.47 0.61 0.61 0.55 0.43 0.28 1.0 0.64 0.37 0.43
0.26 0.35 0.33 0.45 0.58 0.56 0.57 0.41 0.46 0.28 0.28 0.23 0.26 0.16 0.22 0.25 0.25 0.36 0.36 0.28 0.18 0.71 1.0 0.23 0.53 0.42
0.01 0.17 0.26 0.4 0.55 0.89 0.57 0.57 0.22 0.2 0.15 0.1 0.03 0.32 0.37 0.67 0.56 0.5 0.5 0.99 0.0 0.37 1.0 0.28 0.86 0.55
0.42 0.5 0.49 0.58 0.63 0.66 0.63 0.6 0.53 0.47 0.5 0.44 0.38 0.31 0.43 0.4 0.41 0.78 0.61 0.48 0.07 0.37 1.0 0.41 0.51 0.58
0.28 0.62 0.49 0.37 0.37 0.33 0.41 0.38 0.29 0.25 0.17 0.14 0.21 0.41 0.49 0.64 0.52 1.0 0.75 0.56 0.22 0.27 1.0 0.22 0.27 0.21
0.1 0.17 0.22 0.26 0.6 1.0 0.83 0.63 0.43 0.24 0.24 0.17 0.09 0.24 0.29 0.65 0.43 0.4 0.46 0.4 0.42 0.47 0.77 0.61 0.59 0.39
0.3 0.34 0.29 0.5 0.69 0.56 0.57 0.58 0.39 0.36 0.39 0.28 0.3 0.29 0.32 0.37 0.29 0.46 0.31 0.28 0.24 0.43 1.0 0.36 0.63 0.48
0.49 0.5 0.45 0.44 0.55 0.6 0.54 0.48 0.4 0.38 0.36 0.35 0.25 0.42 0.57 0.48 0.55 0.71 0.82 0.68 0.16 0.26 1.0 0.61 0.73 0.55
0.13 0.32 0.38 0.36 0.43 0.56 0.44 0.39 0.45 0.49 0.36 0.31 0.1 0.24 0.36 0.34 0.41 0.56 0.55 0.39 0.03 1.0 0.3 0.3 0.43 0.43
0.11 0.43 0.51 0.47 0.46 0.35 0.42 0.4 0.4 0.32 0.22 0.19 0.09 0.23 0.38 0.33 0.35 0.73 0.58 0.49 0.11 0.15 1.0 0.16 0.24 0.18
0.2 0.35 0.44 0.6 0.82 0.84 0.67 0.64 0.37 0.32 0.31 0.24 0.11 0.22 0.25 0.42 0.32 0.61 0.45 0.4 0.32 0.77 0.93 0.32 1.0 0.56
0.56 0.66 0.74 0.71 0.76 0.74 0.8 0.74 0.71 0.69 0.61 0.54 0.55 0.64 0.82 0.81 0.82 1.0 0.98 0.87 0.37 0.65 0.85 0.47 0.56 0.53
0.12 0.22 0.41 0.52 0.59 0.64 0.59 0.42 0.33 0.38 0.35 0.41 0.16 0.2 0.32 0.28 0.47 0.49 0.47 0.35 0.44 0.52 1.0 0.6 0.52 0.46
0.38 0.54 0.63 0.63 0.62 0.67 0.63 0.67 0.6 0.48 0.48 0.47 0.33 0.44 0.55 0.46 0.65 0.64 0.66 0.68 0.3 0.45 1.0 0.64 0.6 0.52
0.15 0.26 0.33 0.5 0.52 0.47 0.51 0.52 0.47 0.36 0.38 0.32 0.18 0.24 0.36 0.33 0.31 0.69 0.5 0.34 0.2 0.34 1.0 0.36 0.57 0.46
0.11 0.14 0.34 0.43 0.41 0.52 0.39 0.4 0.41 0.36 0.34 0.39 0.13 0.3 0.4 0.37 0.32 0.43 0.48 0.52 0.33 0.31 1.0 0.78 0.44 0.45
0.35 0.48 0.44 0.4 0.62 0.62 0.64 0.48 0.56 0.39 0.36 0.32 0.22 0.28 0.62 0.36 0.64 0.89 1.0 0.66 0.06 0.33 0.92 0.71 0.47 0.52
0.25 0.32 0.34 0.32 0.45 0.67 0.62 0.47 0.36 0.28 0.25 0.24 0.29 0.52 0.58 0.55 0.51 0.82 0.65 0.54 0.41 0.55 1.0 0.53 0.27 0.36
0.33 0.32 0.35 0.34 0.59 0.89 0.62 0.46 0.37 0.28 0.28 0.24 0.26 0.53 0.67 0.62 0.61 0.77 0.73 0.52 0.4 0.5 1.0 0.41 0.31 0.32
0.09 0.31 0.31 0.44 0.74 1.0 0.81 0.58 0.37 0.34 0.31 0.35 0.04 0.37 0.37 0.7 0.46 0.68 0.55 0.58 0.31 0.71 0.93 0.69 0.99 0.42
0.05 0.11 0.16 0.22 0.41 0.48 0.57 0.5 0.3 0.2 0.16 0.09 0.02 0.13 0.21 0.28 0.32 0.5 0.48 0.32 0.06 0.09 1.0 0.28 0.44 0.27
0.13 0.23 0.28 0.46 0.71 0.78 0.76 0.61 0.48 0.4 0.31 0.22 0.1 0.5 0.57 0.78 0.56 0.72 0.85 0.51 0.29 0.65 1.0 0.48 0.58 0.47
0.03 0.17 0.18 0.24 0.45 0.69 0.56 0.49 0.25 0.18 0.09 0.08 0.02 0.18 0.3 0.76 0.38 0.51 0.43 0.4 0.22 0.49 1.0 0.34 0.34 0.19
0.24 0.53 0.55 0.59 0.73 0.8 0.69 0.65 0.65 0.68 0.65 0.62 0.22 0.35 0.6 0.47 0.6 0.79 0.87 0.77 0.24 0.63 1.0 0.68 0.5 0.37
0.08 0.17 0.37 0.34 0.29 0.29 0.2 0.23 0.27 0.14 0.12 0.1 0.04 0.08 0.17 0.09 0.2 0.33 0.34 0.47 0.17 0.4 1.0 0.34 0.25 0.37
0.55 0.47 0.45 0.57 0.63 0.64 0.68 0.67 0.61 0.63 0.56 0.54 0.56 0.4 0.46 0.39 0.52 0.84 0.77 0.63 0.25 0.41 1.0 0.49 0.53 0.61
0.18 0.26 0.3 0.27 0.43 0.38 0.48 0.45 0.28 0.32 0.26 0.31 0.17 0.17 0.18 0.18 0.3 0.75 0.66 0.45 0.09 0.07 1.0 0.63 0.21 0.14
0.35 0.18 0.16 0.33 0.32 0.54 0.78 0.62 0.38 0.22 0.16 0.17 0.14 0.15 0.16 0.21 0.21 0.4 0.49 0.23 0.11 0.34 1.0 0.51 0.77 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)