1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
1.0 0.15 0.29 0.26 0.21 0.1 0.21 0.18 0.44 0.43 0.53 0.84 0.13 0.06 0.16 0.09 0.12 0.09 0.39 0.16 0.08 0.1 0.15 0.06 0.02 0.05 0.03 0.12 0.08 0.02 0.16 0.04 0.03 0.02 0.13 0.06 0.04 0.07 0.04 0.01 0.02 0.0 0.01 0.06 0.03 0.0 0.0 0.02
0.46 0.12 0.34 0.32 0.39 0.46 0.37 0.26 0.14 0.06 0.08 1.0 0.14 0.07 0.14 0.07 0.11 0.11 0.06 0.1 0.11 0.05 0.06 0.09 0.02 0.08 0.07 0.08 0.12 0.01 0.08 0.07 0.07 0.1 0.06 0.1 0.07 0.09 0.07 0.01 0.01 0.11 0.23 0.18 0.09 0.35 0.0 0.11
AT1G04600 (XIA)
 1.0 0.04 0.18 0.18 0.2 0.35 0.22 0.46 0.58 0.32 0.45 0.78 0.19 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.36 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.0 0.1 0.01
AT1G08600 (ATRX)
 0.23 0.05 0.04 0.05 0.03 0.02 0.04 0.03 0.07 0.02 0.04 1.0 0.1 0.03 0.05 0.02 0.03 0.02 0.04 0.04 0.04 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.05 0.27 0.01 0.04 0.03 0.02 0.02 0.04 0.02 0.04 0.02 0.02 0.0 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.02 0.05 0.02
0.73 0.0 0.16 0.2 0.1 0.01 0.15 0.01 0.05 0.03 0.07 1.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.13 0.14 0.17 0.2 0.22 0.19 0.14 0.11 0.07 0.1 0.97 0.24 0.06 0.16 0.21 0.13 0.08 0.12 0.09 0.05 0.07 0.06 0.06 0.04 0.07 0.06 0.07 0.04 0.05 0.08 0.07 0.07 0.04 0.05 0.03 0.04 0.07 0.04 0.03 0.11 0.1 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01
0.27 0.07 0.21 0.35 0.17 0.07 0.38 0.04 0.06 0.04 0.05 1.0 0.07 0.03 0.03 0.03 0.02 0.02 0.11 0.05 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.01 0.09 0.03 0.13 0.01 0.04 0.06 0.04 0.05 0.07 0.02 0.08 0.04 0.06 0.0 0.0 0.01 0.02 0.08 0.1 0.0 0.0 0.07
AT1G32380 (PRS2)
 0.4 0.13 0.46 0.46 0.29 0.19 0.39 0.35 0.39 0.23 0.31 1.0 0.13 0.09 0.09 0.07 0.03 0.03 0.13 0.14 0.05 0.07 0.11 0.05 0.33 0.03 0.07 0.25 0.06 0.36 0.11 0.15 0.06 0.04 0.14 0.02 0.04 0.09 0.03 0.01 0.01 0.03 0.08 0.27 0.1 0.0 0.06 0.14
AT1G48310 (CHA18)
 0.27 0.07 0.11 0.15 0.09 0.07 0.15 0.07 0.08 0.04 0.08 1.0 0.1 0.04 0.06 0.02 0.02 0.01 0.03 0.05 0.03 0.03 0.05 0.03 0.02 0.02 0.03 0.08 0.09 0.02 0.04 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04 0.04 0.04 0.03 0.0 0.01 0.03 0.04 0.08 0.04 0.0 0.01 0.04
AT1G51960 (IQD27)
 0.69 0.09 0.07 0.03 0.1 0.04 0.04 0.08 0.07 0.04 0.06 1.0 0.05 0.06 0.08 0.0 0.0 0.01 0.03 0.06 0.0 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0 0.1 0.07 0.04 0.09 0.0 0.01 0.01 0.25 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.72 0.95 0.31 0.02 0.73 0.05 0.08 0.02 0.09 1.0 0.15 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 0.02 0.61 0.46 0.56 0.18 0.49 0.18 0.05 0.08 0.04 1.0 0.17 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.2 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.08 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.87 0.04 0.03 0.03 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 1.0 0.06 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.16 0.02 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.11 0.01 0.01 0.02 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.14 0.04 0.01 0.03 0.14 0.0 0.01
AT1G78540 (SHB)
 1.0 0.39 0.37 0.51 0.33 0.17 0.39 0.09 0.09 0.04 0.11 0.9 0.08 0.19 0.15 0.15 0.14 0.07 0.08 0.27 0.18 0.18 0.21 0.11 0.07 0.11 0.12 0.23 0.16 0.08 0.24 0.09 0.11 0.09 0.12 0.12 0.09 0.14 0.13 0.06 0.03 0.12 0.14 0.36 0.09 0.0 0.14 0.15
0.31 0.0 0.6 0.73 0.52 0.1 0.6 0.07 0.05 0.04 0.03 1.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.37 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
AT2G02240 (MEE66)
 0.18 0.02 0.01 0.01 0.02 0.1 0.04 0.33 0.11 0.07 0.04 1.0 0.31 0.06 0.14 0.05 0.03 0.01 0.08 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 0.34 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.05 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.62 0.0 0.15 0.12 0.07 0.01 0.11 0.01 0.0 0.02 0.0 1.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.05 0.05 0.07 0.04 0.03 0.07 0.04 0.05 0.03 0.04 1.0 0.05 0.04 0.05 0.03 0.03 0.03 0.04 0.06 0.03 0.03 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.06 0.31 0.02 0.05 0.03 0.03 0.03 0.05 0.03 0.05 0.04 0.03 0.01 0.04 0.03 0.02 0.04 0.03 0.06 0.03 0.02
AT2G27120 (TIL2)
 0.24 0.02 0.11 0.19 0.15 0.12 0.17 0.08 0.05 0.06 0.02 1.0 0.16 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.38 0.0 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
1.0 0.06 0.56 0.34 0.74 0.08 0.14 0.01 0.04 0.01 0.03 0.78 0.01 0.02 0.02 0.05 0.01 0.0 0.01 0.02 0.04 0.02 0.0 0.03 0.02 0.05 0.13 0.0 0.19 0.01 0.05 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.1 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.65 0.13 0.07 0.15 0.05 0.02 0.12 0.05 0.04 0.05 0.06 1.0 0.23 0.06 0.08 0.02 0.02 0.03 0.08 0.14 0.02 0.07 0.13 0.05 0.0 0.02 0.0 0.25 0.15 0.0 0.16 0.06 0.04 0.02 0.21 0.04 0.01 0.05 0.0 0.21 0.0 0.02 0.08 0.21 0.11 0.02 0.0 0.15
0.56 0.01 0.78 0.58 0.76 0.69 0.66 0.37 0.16 0.15 0.15 1.0 0.41 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.18 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.15 0.14 0.14 0.15 0.08 0.14 0.07 0.16 0.09 0.13 1.0 0.13 0.06 0.07 0.02 0.03 0.04 0.13 0.13 0.09 0.05 0.08 0.05 0.06 0.03 0.11 0.14 0.17 0.05 0.18 0.09 0.03 0.04 0.14 0.03 0.01 0.05 0.01 0.02 0.02 0.05 0.06 0.15 0.1 0.09 0.1 0.09
0.28 0.05 0.67 0.68 0.52 0.26 0.64 0.06 0.07 0.03 0.05 1.0 0.09 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.07 0.06 0.05 0.02 0.03 0.04 0.01 0.03 0.0 0.08 0.06 0.01 0.07 0.04 0.03 0.03 0.04 0.02 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.03 0.05 0.18 0.09 0.03 0.0 0.16
0.76 0.4 0.64 0.76 0.42 0.19 0.63 0.17 0.11 0.06 0.1 1.0 0.1 0.19 0.25 0.12 0.1 0.1 0.13 0.35 0.15 0.17 0.27 0.14 0.05 0.11 0.17 0.32 0.28 0.05 0.33 0.11 0.12 0.08 0.26 0.13 0.11 0.15 0.07 0.23 0.1 0.09 0.14 0.33 0.15 0.06 0.21 0.17
AT3G05780 (LON3)
 0.95 0.01 0.2 0.01 0.37 0.36 0.01 0.06 0.0 0.04 0.0 1.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01
0.18 0.02 0.28 0.46 0.21 0.05 0.41 0.03 0.04 0.03 0.04 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.61 0.42 0.76 0.45 0.47 0.24 0.16 0.1 0.1 0.91 0.21 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.16 0.41 0.38 0.27 0.07 0.34 0.02 0.02 0.03 0.01 1.0 0.14 0.04 0.05 0.01 0.01 0.01 0.08 0.1 0.13 0.02 0.02 0.09 0.01 0.04 0.03 0.09 0.45 0.01 0.31 0.05 0.04 0.02 0.1 0.08 0.2 0.09 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02
0.64 0.0 0.47 0.25 0.37 0.12 0.24 0.04 0.1 0.03 0.06 1.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.19 0.07 0.1 0.06 0.03 0.18 0.01 0.0 0.01 0.0 0.64 0.17 0.06 0.04 0.02 0.01 0.03 0.08 0.2 0.01 0.05 0.1 0.06 0.0 0.02 0.0 0.22 0.08 0.0 0.25 0.07 0.02 0.02 0.28 0.02 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.02 0.1 0.32 0.19 0.0 0.0 0.25
AT3G60010 (SK13)
 0.02 0.01 0.53 1.0 0.31 0.02 0.78 0.01 0.02 0.03 0.03 0.99 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT4G11720 (GCS1)
 0.39 0.01 0.09 0.08 0.04 0.04 0.07 0.11 0.18 0.06 0.15 1.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01
0.05 0.0 0.79 0.38 0.49 0.07 0.32 0.06 0.09 0.03 0.07 1.0 0.13 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.01 0.74 0.45 0.64 0.12 0.37 0.05 0.08 0.04 0.08 1.0 0.19 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.04 0.06 0.1 0.32 0.69 0.23 0.4 0.23 0.06 0.07 1.0 0.07 0.14 0.04 0.03 0.0 0.01 0.03 0.05 0.05 0.0 0.0 0.04 0.01 0.04 0.09 0.01 0.17 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.21 0.04 0.11 0.01 0.03 0.03 0.16 0.0 0.08 0.19 0.0 0.04
0.34 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 1.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.09 0.04 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.06 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.0 0.8 1.0 0.49 0.1 0.76 0.06 0.03 0.03 0.03 0.8 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01
0.34 0.0 0.58 0.41 0.45 0.29 0.46 0.08 0.06 0.03 0.03 1.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.01 0.12 0.16 0.08 0.05 0.13 0.05 0.03 0.04 0.02 1.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.14 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT5G19910 (MED31)
 0.4 0.13 0.25 0.28 0.29 0.31 0.34 0.06 0.07 0.03 0.05 1.0 0.08 0.08 0.05 0.06 0.09 0.07 0.07 0.13 0.08 0.05 0.09 0.08 0.05 0.06 0.08 0.11 0.1 0.05 0.13 0.14 0.06 0.08 0.14 0.06 0.08 0.09 0.1 0.06 0.26 0.08 0.1 0.19 0.1 0.16 0.0 0.12
AT5G25380 (CYCA2;1)
 0.33 0.07 0.02 0.02 0.01 0.03 0.01 0.15 0.21 0.06 0.16 1.0 0.22 0.02 0.06 0.01 0.0 0.02 0.02 0.08 0.0 0.08 0.12 0.03 0.0 0.02 0.0 0.14 0.09 0.0 0.03 0.02 0.02 0.01 0.04 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.15 0.04 0.0 0.0 0.06
AT5G27610 (ALY1)
 0.52 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 1.0 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.21 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.09 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.01 0.97 0.24 0.49 0.19 0.12 0.2 0.06 0.04 0.05 1.0 0.4 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.01 0.54 0.67 0.59 0.24 0.56 0.23 0.07 0.03 0.03 1.0 0.32 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.09 0.47 0.31 0.34 0.21 0.29 0.11 0.09 0.07 0.07 1.0 0.07 0.07 0.06 0.04 0.04 0.02 0.22 0.08 0.04 0.05 0.06 0.04 0.07 0.03 0.09 0.08 0.04 0.07 0.08 0.04 0.05 0.02 0.12 0.03 0.05 0.09 0.11 0.0 0.04 0.01 0.01 0.05 0.02 0.0 0.01 0.04
AT5G53520 (OPT8)
 0.35 0.01 0.01 0.08 0.03 0.05 0.09 0.07 0.05 0.03 0.04 1.0 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.01 0.26 0.26 0.25 0.21 0.23 0.15 0.13 0.06 0.08 1.0 0.13 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)