1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G02500 (MAT1)
 0.11 0.18 0.12 0.13 0.09 0.07 0.16 0.05 0.06 0.02 0.05 0.02 0.0 0.21 0.13 0.1 0.13 0.18 0.05 0.11 0.11 0.09 0.12 0.24 0.01 0.36 0.09 0.13 0.05 0.0 0.13 0.12 0.24 0.29 0.1 0.3 0.16 0.48 0.16 0.08 0.08 0.88 0.4 0.19 0.36 1.0 0.32 0.22
0.01 0.1 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.28 0.26 0.68 1.0 0.49 0.03 0.08 0.91 0.2 0.23 0.35 0.0 0.47 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.16 0.47 0.86 0.15 0.63 0.28 0.78 0.88 0.0 0.0 0.73 0.08 0.01 0.84 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.19 0.17 0.29 0.12 0.0 0.04 0.37 0.17 0.09 0.16 0.0 0.23 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.2 0.19 0.39 0.17 0.39 0.07 0.32 0.05 0.0 0.0 1.0 0.41 0.1 0.63 0.0 0.0 0.09
0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.28 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
AT1G20160 (ATSBT5.2)
 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.05 0.01 0.08 0.17 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.22 0.01 0.08 1.0 0.19 0.06 0.01 0.0 0.4 0.01 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
AT1G43790 (TED6)
 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.12 0.43 1.0 0.46 0.02 0.05 0.68 0.13 0.1 0.3 0.0 0.36 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.12 0.14 0.56 0.11 0.46 0.08 0.7 0.06 0.0 0.0 0.44 0.08 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0
0.02 0.75 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.27 0.08 0.04 0.21 0.14 0.12 0.14 0.02 0.0 0.01 0.31 0.02 0.43 0.44 0.02 0.05 0.01 0.54 0.03 0.05 0.37 0.0 0.48 0.4 0.34 0.37 0.0 0.0 0.3 0.74 0.02 0.41 0.0 0.0 0.12
0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.05 0.12 0.1 0.37 0.12 0.49 1.0 0.17 0.02 0.03 0.32 0.12 0.11 0.37 0.0 0.43 0.03 0.03 0.03 0.0 0.1 0.07 0.14 0.26 0.05 0.87 0.03 0.39 0.03 0.01 0.0 0.52 0.09 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.18 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.14 0.04 0.14 0.0 0.01 0.01 0.0 0.08 0.02 0.08 0.0 0.09 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.05 0.14 0.25 0.06 0.28 0.07 0.21 0.06 0.0 0.0 1.0 0.14 0.0 0.53 0.0 0.0 0.02
AT1G58370 (RXF12)
 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.11 0.26 0.32 0.34 0.2 0.03 0.06 0.44 0.09 0.09 0.28 0.0 0.41 0.01 0.01 0.02 0.0 0.05 0.29 0.4 0.64 0.07 0.67 0.06 1.0 0.05 0.0 0.0 0.9 0.36 0.01 1.0 0.0 0.0 0.02
0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.27 0.14 0.39 0.12 0.0 0.03 0.14 0.11 0.15 0.27 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.21 0.23 0.04 1.0 0.18 0.88 0.03 0.0 0.0 0.16 0.01 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0
AT1G67110 (CYP735A2)
 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.09 1.0 0.04 0.06 0.07 0.33 0.0 0.0 0.0 0.51 0.02 0.01 0.67 0.0 0.0 0.0
AT1G76410 (ATL8)
 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.21 0.31 0.82 0.59 1.0 0.09 0.02 0.17 0.08 0.13 0.0 0.17 0.03 0.0 0.12 0.0 0.03 0.01 0.19 0.42 0.04 0.22 0.26 0.44 0.45 0.0 0.0 0.21 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
AT1G76560 (CP12-3)
 0.33 0.1 0.04 0.03 0.04 0.02 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.24 0.01 0.13 0.09 0.15 0.03 0.03 0.05 0.22 0.07 0.13 0.15 0.13 0.43 0.13 0.42 0.06 0.04 0.31 0.06 0.14 0.27 0.28 0.38 0.42 1.0 0.41 0.3 0.07 0.06 0.68 0.39 0.2 0.5 0.0 0.0 0.08
AT2G05440 (GRP9)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.28 0.0 0.01 0.05 0.02 0.02 0.0 0.2 0.47 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0
0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.49 0.0 0.0 0.0 0.19 0.19 0.03 0.13 0.02 0.06 0.42 0.14 0.0 0.0 0.0 1.0 0.71 0.22 0.85 0.0 0.05 0.46
AT2G31180 (MYB14)
 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.02 0.31 0.37 0.09 0.0 0.0 0.11 0.18 0.56 0.02 0.0 0.4 0.4 0.01 0.0 0.0 1.0 0.67 0.68 0.45 0.0 0.0 0.76
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.17 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.2 0.0 0.1 1.0 0.22 0.11 0.0 0.0 0.19 0.01 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0
AT2G36120 (DOT1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.17 0.39 0.02 0.9 0.97 0.42 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
AT2G38320 (TBL34)
 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.21 0.16 0.23 0.12 0.01 0.05 0.29 0.09 0.08 0.14 0.0 0.14 0.0 0.01 0.1 0.0 0.02 0.29 0.16 0.36 0.06 0.46 0.02 0.22 0.02 0.03 0.0 1.0 0.6 0.01 0.56 0.0 0.0 0.07
0.07 0.77 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.73 0.16 0.04 0.06 0.02 0.12 0.14 0.45 0.45 0.04 0.01 0.03 0.0 0.03 0.04 0.01 0.02 0.03 0.1 0.08 0.11 0.23 0.17 1.0 0.02 0.03 0.0 0.35 0.11 0.01 0.08 0.0 0.0 0.03
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.04 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.01 0.09 0.17 0.1 0.22 0.22 0.06 0.14 0.0 0.22 0.37 0.43 0.09 0.18 0.43 0.41 0.26 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.1 0.2 0.3 0.06 0.02 0.09 0.08 0.09 0.03 0.11 0.0 0.17 0.04 0.01 0.0 0.0 0.02 0.09 0.15 0.14 0.02 0.35 1.0 0.29 0.07 0.01 0.0 0.08 0.03 0.07 0.07 0.16 0.13 0.02
0.1 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.08 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.14 0.01 0.0 0.03 0.03 0.13 0.58 0.25 0.07 0.05 0.06 1.0 0.0 0.41 0.08 0.27 0.06 0.19 0.03 0.19 0.02 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.24 0.63 0.0 0.04 0.0 0.02 0.12 0.03 0.16 0.0 0.16 0.87 0.29 0.01 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.02 0.09 0.04 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.28 0.3 0.21 0.65 0.31 0.01 0.05 0.3 0.11 0.12 0.22 0.0 0.22 0.03 0.04 0.03 0.0 0.03 0.11 0.23 0.69 0.05 0.16 0.04 0.58 0.18 0.0 0.0 0.74 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.02
0.03 0.23 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.18 0.11 0.09 0.09 0.05 0.15 0.12 0.04 0.19 0.17 0.07 0.01 0.08 0.03 0.04 0.02 0.01 0.06 0.06 0.31 0.34 0.12 0.51 0.26 0.31 0.11 0.01 0.17 1.0 0.13 0.04 0.56 0.06 0.0 0.03
0.04 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.11 0.15 0.24 0.0 0.29 0.01 0.05 0.06 0.0 0.04 0.16 0.15 0.14 0.18 1.0 0.06 0.44 0.03 0.0 0.0 0.54 0.45 0.0 0.19 0.69 0.0 0.07
0.04 0.1 0.04 0.03 0.08 0.11 0.01 0.08 0.09 0.06 0.11 0.01 0.02 0.11 0.2 0.31 0.54 0.25 0.04 0.07 0.44 0.21 0.12 0.19 0.01 0.22 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.19 0.3 0.49 0.11 0.49 0.1 0.3 0.09 0.0 0.0 1.0 0.32 0.01 0.42 0.0 0.0 0.01
AT3G63280 (NEK4)
 0.49 0.03 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.03 0.04 0.04 0.08 0.07 1.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.04 0.04 0.07 0.07 0.32 0.19 0.23 0.04 0.0 0.0 0.19 0.07 0.06 0.15 0.01 0.0 0.03
AT4G00230 (XSP1)
 0.58 0.57 0.26 0.13 0.25 0.22 0.19 0.19 0.11 0.18 0.12 0.93 0.04 0.39 0.39 0.71 1.0 0.55 0.21 0.45 0.72 0.38 0.33 0.39 0.28 0.48 0.26 0.12 0.25 0.28 0.24 0.29 0.53 0.76 0.32 0.77 0.66 0.87 0.7 0.14 0.22 0.57 0.31 0.32 0.76 0.37 0.28 0.13
AT4G01850 (SAM2)
 0.17 0.13 0.13 0.11 0.1 0.06 0.11 0.02 0.02 0.01 0.01 0.07 0.01 0.2 0.26 0.09 0.36 0.42 0.07 0.11 0.18 0.12 0.1 0.18 0.01 0.17 0.09 0.19 0.03 0.01 0.08 0.13 0.16 0.36 0.09 0.23 0.19 0.34 0.09 0.04 0.03 0.38 0.57 0.36 0.4 1.0 0.12 0.37
0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.26 0.15 0.31 0.28 0.0 0.05 0.28 0.2 0.22 0.29 0.0 0.47 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.12 0.14 0.6 0.02 0.85 0.21 1.0 0.04 0.01 0.0 0.98 0.27 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0
0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.08 0.08 0.15 0.01 0.08 0.26 0.06 0.02 0.29 0.09 0.52 1.0 0.01 0.01 0.0 0.09 0.11 0.17 0.21 0.16 0.33 0.29 0.37 0.05 0.0 0.0 0.99 0.08 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01
AT4G22270 (MRB1)
 0.04 0.09 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.46 0.28 0.36 0.22 0.0 0.3 0.21 0.15 0.08 0.25 0.06 0.5 0.08 0.03 0.06 0.07 0.16 0.05 0.23 0.43 0.05 0.07 0.02 0.1 0.06 0.04 0.07 0.18 0.39 0.82 0.25 0.23 0.03 1.0 0.27 0.05 0.08 0.11 0.0 0.02 0.04
AT4G25434 (NUDT10)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.01 0.01 0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.23 1.0 0.17 0.03 0.03 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.08 0.08 0.03 0.02 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.37 0.01 0.03 0.2 0.17 0.03 0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.39 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.05 0.05 0.02 0.02 0.03 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.12 0.0 0.06 1.0 0.2 0.03 0.0 0.0 0.69 0.11 0.0 0.24 0.0 0.0 0.02
0.0 0.1 0.02 0.2 0.05 0.03 0.13 1.0 0.23 0.2 0.23 0.0 0.07 0.24 0.36 0.41 0.8 0.34 0.41 0.07 0.82 0.21 0.23 0.26 0.0 0.39 0.0 0.24 0.01 0.0 0.02 0.12 0.27 0.26 0.1 0.28 0.03 0.5 0.06 0.0 0.0 0.24 0.05 0.06 0.27 0.0 0.0 0.04
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.65 0.03 0.24 0.17 0.05 0.1 0.05 0.01 0.01 0.09 0.01 0.01 0.11 0.0 0.13 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.17 0.92 0.01 0.13 0.02 0.48 0.07 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.17 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.21 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.17 0.02 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.09 0.16 0.18 0.11 0.0 0.01 0.11 0.03 0.04 0.42 0.0 0.57 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.09 0.31 0.02 1.0 0.26 0.89 0.02 0.0 0.0 0.82 0.2 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0
AT5G43780 (APS4)
 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.03 0.14 0.07 0.12 0.03 0.03 0.07 0.03 0.02 0.25 0.07 0.51 1.0 0.03 0.01 0.01 0.05 0.08 0.09 0.4 0.05 0.35 0.52 0.49 0.25 0.0 0.01 0.93 0.18 0.05 0.21 0.02 0.23 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)