1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.08 0.27 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.18 0.02 0.01 0.02 0.0 0.24 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.11 0.01 0.25 0.04 0.45 0.01 0.48 0.01 0.01 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01
AT1G09860 (PUP16)
 0.0 0.09 0.39 0.12 0.25 0.11 0.17 0.03 0.02 0.02 0.08 0.0 0.1 0.08 0.04 0.04 0.03 0.03 0.04 0.16 0.01 0.06 0.13 0.02 0.01 0.04 0.04 0.04 0.11 0.0 0.04 0.05 0.06 0.13 0.05 0.08 0.11 0.03 0.03 0.02 0.0 1.0 0.09 0.09 0.46 0.64 0.0 0.01
0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.19 0.0 0.03 0.32 0.0 0.21 0.45 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.51 0.45 0.21 1.0 0.0 0.0 0.2 0.03 0.0 0.0 0.06 0.15 0.23 0.09 0.0 0.0 0.49
AT1G34245 (EPF2)
 0.22 0.73 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.46 0.09 0.01 0.0 0.0 0.55 0.02 0.36 1.0 0.59 0.01 0.25 0.0 0.14 0.37 0.0 0.03 0.5 0.52 0.16 0.05 0.0 0.0 0.3 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT1G53480 (MRD1)
 0.2 0.08 0.59 0.5 0.63 0.36 0.52 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.05 0.61 0.03 0.04 0.04 0.03 0.18 0.03 0.06 0.1 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.12 0.01 0.09 0.05 0.26 0.14 0.13 0.1 0.05 0.37 0.01 0.05 0.0 0.27 0.46 1.0 0.06 0.64 0.29 0.01
0.0 0.18 0.09 0.38 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 1.0 0.88 0.08 0.59 0.2 0.11 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.28 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.03 0.0 0.0 0.11
0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.17 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.04 0.15 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.68 0.0 0.15 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.07 0.0 0.0 0.24 0.02 0.07 0.0 0.03 0.01 0.09 0.04 0.0 0.1 0.08 0.0 0.25 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.06 0.74 0.05 0.15 1.0 0.06 0.11 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.21 0.0 0.39 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66
0.0 0.0 0.02 0.02 0.08 0.1 0.03 0.03 0.02 0.01 0.0 0.21 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 0.05 0.02 0.03 0.0 0.01 0.09 0.02 0.06 0.0 0.0 0.06 0.11 1.0 0.4 0.0 0.09 0.36
0.01 0.36 0.5 1.0 0.59 0.39 0.99 0.0 0.02 0.0 0.05 0.01 0.0 0.32 0.51 0.1 0.06 0.11 0.04 0.35 0.09 0.11 0.09 0.07 0.0 0.09 0.03 0.13 0.05 0.0 0.09 0.07 0.11 0.05 0.07 0.17 0.16 0.14 0.1 0.0 0.0 0.04 0.15 0.07 0.09 0.0 0.0 0.03
AT3G27920 (GL1)
 0.02 0.18 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0 0.01 0.16 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.68 0.03 1.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.14 0.39 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 1.0 0.07 0.45 0.13 0.1 0.33 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.47 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.39 0.28 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.27 0.17 0.18 1.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.07 0.0 0.57 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.32 0.0 0.0 0.0 0.14
AT3G44490 (hda17)
 0.04 0.86 0.5 0.0 0.47 0.44 0.03 0.12 0.0 0.04 0.02 0.02 0.03 0.19 0.56 0.59 0.0 0.0 0.02 0.18 0.19 1.0 0.57 0.02 0.0 0.12 0.0 0.07 0.09 0.02 0.01 0.03 0.09 0.03 0.04 0.05 0.0 0.16 0.03 0.0 0.38 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.0 1.0 0.03 0.01 0.0 0.37 0.12 0.17 0.26 0.0 0.0 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.66 0.22 0.03 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.19 0.0 0.86 1.0 0.47 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.3 0.0 0.0 0.47 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.4 0.0 0.34 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.32 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.96 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.24 0.32 0.53 0.01 0.0 0.33 0.55 0.4 1.0 0.49 0.44 0.03 0.36 0.0 0.0 0.09 0.16 0.15 0.68 0.15 0.36 0.12 0.14 0.0 0.27 0.13 0.0 0.0 0.05 0.08 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0
0.02 0.6 0.03 0.15 0.04 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.13 0.1 0.1 0.04 0.05 0.18 0.18 0.09 0.14 0.23 0.13 0.22 0.03 0.0 0.04 0.11 0.08 0.53 1.0 0.48 0.02 0.22 0.12 0.79 0.34 0.0 0.0 0.1 0.22 0.2 0.17 0.0 0.0 0.26
0.07 0.03 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.16 0.09 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.47 0.36 0.06 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.17 0.0 0.04 0.02 0.02 0.01 0.05 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.29 0.04 0.93 0.11 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.58 0.28 1.0 0.21 0.02 0.95 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.05 0.0 0.02 0.03 0.05 0.03 0.05 0.07 0.05 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.26 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.03
AT5G60880 (BASL)
 0.5 0.47 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.6 0.11 0.01 0.07 0.02 0.62 0.0 0.36 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.12 0.0 0.0 0.06 0.42 0.45 0.11 0.09 0.02 0.0 0.14 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.05 0.19 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)