1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.46 1.44 0.1 0.11 0.12 0.09 0.1 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.96 0.11 0.08 0.09 0.02 1.32 5.42 0.0 0.03 0.07 0.02 0.02 0.06 0.03 0.6 0.03 1.33 0.22 2.44 0.03 2.62 0.06 0.03 1.55 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.03 0.0 0.0 0.04
AT1G09860 (PUP16)
 0.0 0.27 1.19 0.38 0.76 0.35 0.52 0.09 0.05 0.06 0.24 0.0 0.31 0.24 0.13 0.13 0.08 0.09 0.13 0.5 0.02 0.18 0.41 0.06 0.02 0.12 0.13 0.11 0.33 0.0 0.12 0.14 0.18 0.41 0.15 0.25 0.32 0.09 0.08 0.05 0.0 3.08 0.27 0.27 1.42 1.99 0.0 0.04
0.05 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.64 0.0 0.1 1.12 0.0 0.71 1.54 0.17 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 1.75 1.55 0.74 3.45 0.0 0.0 0.67 0.11 0.0 0.0 0.2 0.53 0.8 0.32 0.0 0.0 1.68
AT1G34245 (EPF2)
 2.83 9.29 0.11 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.67 5.93 1.13 0.11 0.0 0.03 7.01 0.21 4.55 12.75 7.54 0.1 3.16 0.0 1.73 4.71 0.0 0.42 6.41 6.59 2.06 0.62 0.0 0.0 3.76 0.42 0.56 0.0 0.0 0.0 0.2 0.13 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 1.08 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT1G53480 (MRD1)
 19.05 7.99 56.25 48.14 60.51 34.48 49.52 0.36 0.24 0.89 0.51 0.14 0.0 4.48 58.16 2.76 3.7 3.68 2.55 17.17 3.23 5.92 9.14 1.68 1.29 1.18 1.61 0.8 11.4 1.24 8.25 4.77 24.76 13.42 12.31 9.16 4.5 35.47 1.16 4.55 0.0 26.02 44.0 95.5 5.81 61.54 28.06 0.64
0.0 0.07 0.04 0.16 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 2.58 2.26 0.21 1.52 0.52 0.27 0.04 0.0 0.04 0.01 0.0 0.19 0.02 0.1 0.01 0.01 0.0 0.73 0.05 0.01 0.06 0.07 0.01 0.02 0.01 0.01 0.08 0.0 0.0 0.02 0.09 0.02 0.02 0.02 0.01 0.05 0.27 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.31 0.08 0.0 0.0 0.28
0.06 101.0 0.0 0.4 0.91 0.49 1.06 0.0 0.0 0.49 0.0 0.07 0.65 0.2 0.28 0.06 0.12 0.11 0.0 0.09 0.0 1.29 1.2 1.14 1.17 1.03 0.0 0.43 3.62 0.67 0.12 5.59 0.94 0.89 0.0 1.85 0.66 17.13 2.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.92 0.04 0.14 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.24 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 7.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.49 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.29 0.52 0.0 0.0 1.88 0.18 0.57 0.0 0.21 0.12 0.69 0.35 0.0 0.78 0.6 0.0 1.99 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.07 0.79 0.05 0.16 1.07 0.06 0.12 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.22 0.0 0.41 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 1.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.24
0.0 0.02 0.13 0.14 0.53 0.63 0.21 0.19 0.1 0.07 0.03 1.36 1.12 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.04 0.05 0.05 0.01 0.09 0.0 0.0 0.13 0.17 0.14 0.0 0.32 0.1 0.22 0.01 0.04 0.55 0.1 0.37 0.0 0.0 0.39 0.69 6.45 2.55 0.0 0.59 2.32
0.03 1.82 2.54 5.05 2.99 1.99 5.0 0.0 0.11 0.0 0.24 0.07 0.0 1.61 2.59 0.51 0.29 0.55 0.21 1.77 0.47 0.54 0.46 0.36 0.0 0.43 0.15 0.65 0.24 0.02 0.43 0.35 0.55 0.27 0.35 0.88 0.8 0.69 0.52 0.0 0.0 0.21 0.78 0.34 0.45 0.0 0.0 0.13
AT3G27920 (GL1)
 0.07 0.73 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.43 0.02 0.0 0.03 0.64 1.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.08 2.82 0.13 4.14 0.0 0.0 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.19 0.0 0.48 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 8.47 0.6 3.79 1.1 0.84 2.84 0.11 0.0 0.15 0.0 0.0 0.5 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.07 0.0 0.08 4.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.89 0.65 0.0 2.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 1.02 0.63 0.69 3.82 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.28 0.0 2.16 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.06
AT3G44490 (hda17)
 0.11 2.28 1.32 0.0 1.24 1.16 0.09 0.3 0.0 0.1 0.06 0.05 0.09 0.51 1.48 1.56 0.0 0.0 0.04 0.47 0.5 2.63 1.51 0.04 0.0 0.31 0.0 0.19 0.25 0.05 0.04 0.09 0.23 0.08 0.1 0.14 0.0 0.41 0.07 0.0 1.01 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04
1.09 0.21 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.33 0.01 0.15 0.04 0.01 0.02 0.0 0.02 0.23 0.0 0.03 0.02 0.35 0.24 0.14 0.0 8.8 0.29 0.12 0.01 3.28 1.04 1.49 2.3 0.0 0.0 1.16 0.32 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.75 0.25 0.03 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 1.15 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.05 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.43 0.13 0.0 0.0 0.2 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 7.17 0.0 1.32 0.0 0.0 2.84 0.0 2.43 0.0 1.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 2.32 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.43 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 2.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.62 14.14 0.31 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.15 0.0 3.5 4.73 7.81 0.13 0.0 4.78 8.04 5.84 14.66 7.23 6.44 0.41 5.32 0.0 0.0 1.3 2.32 2.27 10.04 2.16 5.28 1.71 2.13 0.0 3.95 1.89 0.0 0.0 0.79 1.11 0.21 0.71 0.0 0.0 0.0
0.29 9.18 0.41 2.38 0.64 0.3 1.3 0.0 0.05 0.0 0.11 0.0 0.0 2.24 2.08 1.57 1.55 0.54 0.71 2.72 2.74 1.44 2.21 3.51 2.05 3.46 0.47 0.0 0.59 1.64 1.2 8.17 15.43 7.38 0.32 3.44 1.84 12.18 5.32 0.0 0.0 1.58 3.47 3.05 2.6 0.0 0.0 4.08
0.05 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.13 0.07 0.79 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.36 0.27 0.05 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.04 0.06 0.76 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 5.5 0.68 17.47 2.07 0.38 18.73 0.03 0.0 0.02 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
52.33 179.94 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.25 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.66 14.99 7.18 25.7 5.32 0.46 24.31 0.21 0.0 0.0 0.0 2.04 0.93 1.34 0.0 0.41 0.83 1.37 0.71 1.25 1.82 1.24 0.61 0.24 0.0 0.14 0.0 0.0 6.62 0.0 0.58 0.23 0.07 0.36 0.08 0.0 0.27 0.91 0.27 0.99 0.0 0.0 0.0 0.49 0.66 0.0 0.0 0.74
AT5G60880 (BASL)
 5.22 4.94 0.39 0.0 0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 6.3 1.2 0.09 0.69 0.18 6.55 0.03 3.79 10.49 0.18 0.05 0.06 0.0 1.29 0.01 0.0 0.59 4.43 4.71 1.16 0.96 0.17 0.03 1.5 0.08 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.09 0.0 5.59 0.02 0.0 0.0 0.43 0.44 0.26 1.07 0.0 0.0 0.27 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)