Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.05 0.06 0.25 0.24 1.0 0.45 0.09
0.05 0.14 0.02 0.02 1.0 0.34 0.01
0.16 0.18 0.32 0.24 1.0 0.5 0.22
0.05 0.02 0.0 0.0 1.0 0.28 0.06
Tin_g02797 (RBL1)
0.02 0.03 0.11 0.04 1.0 0.31 0.08
0.0 0.03 0.0 0.03 1.0 0.18 0.0
0.03 0.02 0.0 0.01 1.0 0.45 0.0
0.09 0.16 0.12 0.11 1.0 0.43 0.06
0.04 0.13 0.16 0.22 1.0 0.5 0.05
0.07 0.17 0.21 0.14 1.0 0.34 0.1
0.01 0.03 0.02 0.05 1.0 0.39 0.01
0.04 0.09 0.18 0.15 1.0 0.38 0.1
Tin_g03857 (CTF7)
0.22 0.28 0.26 0.29 1.0 0.42 0.27
Tin_g03923 (CPH)
0.1 0.19 0.26 0.2 1.0 0.43 0.1
0.05 0.18 0.14 0.1 1.0 0.29 0.07
Tin_g04031 (CYL2)
0.21 0.25 0.24 0.24 1.0 0.36 0.17
0.04 0.01 0.04 0.18 1.0 0.06 0.02
Tin_g04051 (IRX14)
0.08 0.19 0.19 0.15 1.0 0.39 0.08
Tin_g04659 (CPK13)
0.07 0.21 0.16 0.11 1.0 0.36 0.09
Tin_g04674 (GT13)
0.03 0.11 0.05 0.02 1.0 0.42 0.07
Tin_g04951 (PCNA1)
0.25 0.28 0.31 0.36 1.0 0.43 0.38
0.14 0.28 0.3 0.28 1.0 0.56 0.21
Tin_g05550 (TBL25)
0.03 0.1 0.04 0.03 1.0 0.37 0.09
Tin_g05574 (CYCA1;1)
0.08 0.24 0.23 0.2 1.0 0.5 0.21
Tin_g05879 (RABA1f)
0.21 0.22 0.36 0.28 1.0 0.48 0.22
Tin_g05948 (TUA6)
0.03 0.12 0.1 0.07 1.0 0.39 0.08
Tin_g05986 (ATSMO2)
0.08 0.13 0.2 0.18 1.0 0.51 0.1
0.01 0.07 0.1 0.12 1.0 0.27 0.0
0.23 0.27 0.36 0.31 1.0 0.43 0.3
Tin_g07028 (SUB1)
0.08 0.11 0.23 0.24 1.0 0.44 0.12
0.05 0.11 0.15 0.08 1.0 0.34 0.05
0.11 0.1 0.01 0.0 1.0 0.36 0.0
Tin_g08257 (SKU5)
0.07 0.12 0.2 0.15 1.0 0.31 0.07
0.02 0.14 0.06 0.03 1.0 0.42 0.08
0.09 0.16 0.12 0.1 1.0 0.45 0.11
Tin_g08783 (YDA)
0.24 0.32 0.32 0.31 1.0 0.63 0.23
0.02 0.14 0.02 0.02 1.0 0.42 0.05
0.4 0.46 0.6 0.54 1.0 0.55 0.5
0.05 0.12 0.19 0.18 1.0 0.3 0.21
Tin_g09399 (IQD3)
0.03 0.07 0.1 0.04 1.0 0.26 0.01
Tin_g10229 (FUT2)
0.03 0.16 0.06 0.04 1.0 0.41 0.06
0.09 0.29 0.27 0.25 1.0 0.37 0.17
0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.27 0.06
0.01 0.02 0.11 0.15 1.0 0.42 0.11
Tin_g10998 (ZHD2)
0.01 0.15 0.03 0.01 1.0 0.35 0.05
0.06 0.13 0.16 0.08 1.0 0.44 0.22
0.04 0.11 0.24 0.15 1.0 0.35 0.09
0.0 0.1 0.14 0.1 1.0 0.24 0.04
0.04 0.06 0.14 0.1 1.0 0.34 0.06
Tin_g11504 (RUK)
0.09 0.16 0.16 0.16 1.0 0.36 0.13
0.14 0.25 0.28 0.26 1.0 0.48 0.19
0.04 0.03 0.04 0.01 1.0 0.29 0.06
0.1 0.21 0.28 0.28 1.0 0.36 0.25
Tin_g13121 (DRS1)
0.01 0.18 0.11 0.18 1.0 0.43 0.23
Tin_g13122 (QUA1)
0.08 0.19 0.26 0.2 1.0 0.48 0.15
0.12 0.21 0.19 0.19 1.0 0.44 0.17
0.04 0.16 0.15 0.19 1.0 0.32 0.11
Tin_g13778 (GATL7)
0.06 0.09 0.25 0.12 1.0 0.55 0.08
0.03 0.08 0.24 0.12 1.0 0.48 0.08
0.03 0.04 0.05 0.06 1.0 0.42 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.39 0.0
Tin_g14169 (AGP8)
0.02 0.08 0.09 0.08 1.0 0.48 0.05
Tin_g14262 (CSLC5)
0.08 0.1 0.13 0.12 1.0 0.29 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.29 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.42 0.0
0.04 0.05 0.13 0.14 1.0 0.36 0.05
0.05 0.09 0.15 0.08 1.0 0.27 0.02
0.25 0.26 0.32 0.37 1.0 0.56 0.35
0.04 0.02 0.0 0.0 1.0 0.44 0.0
Tin_g19305 (TUB7)
0.02 0.09 0.11 0.09 1.0 0.29 0.08
0.1 0.19 0.21 0.2 1.0 0.39 0.28
0.02 0.06 0.24 0.23 1.0 0.29 0.2
Tin_g20235 (sks5)
0.03 0.05 0.02 0.0 1.0 0.33 0.04
0.19 0.25 0.34 0.23 1.0 0.46 0.21
0.02 0.04 0.12 0.06 1.0 0.52 0.16
0.06 0.14 0.28 0.18 1.0 0.39 0.16
0.03 0.1 0.2 0.16 1.0 0.41 0.08
0.05 0.2 0.12 0.18 1.0 0.37 0.12
0.1 0.09 0.16 0.14 1.0 0.32 0.08
0.03 0.04 0.26 0.13 1.0 0.35 0.12
Tin_g25380 (TMO6)
0.21 0.34 0.41 0.37 1.0 0.46 0.28
0.08 0.12 0.21 0.15 1.0 0.42 0.09
0.05 0.09 0.17 0.08 1.0 0.4 0.22
0.1 0.26 0.21 0.21 1.0 0.5 0.3
Tin_g27917 (MAP65-1)
0.02 0.06 0.31 0.17 1.0 0.28 0.03
0.02 0.1 0.1 0.05 1.0 0.55 0.09
0.32 0.4 0.57 0.52 1.0 0.52 0.36
0.04 0.1 0.14 0.07 1.0 0.46 0.08
0.01 0.05 0.24 0.17 1.0 0.29 0.02
Tin_g30555 (SOL1)
0.0 0.07 0.01 0.0 1.0 0.4 0.07
0.02 0.08 0.0 0.01 1.0 0.41 0.0
0.05 0.1 0.14 0.21 1.0 0.45 0.04
0.03 0.05 0.05 0.03 1.0 0.37 0.15
Tin_g31049 (LAC17)
0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.32 0.07
Tin_g31280 (EXS)
0.06 0.17 0.07 0.07 1.0 0.46 0.1
0.02 0.06 0.04 0.03 1.0 0.33 0.09
Tin_g31519 (FLA10)
0.01 0.02 0.0 0.0 1.0 0.36 0.02
0.11 0.24 0.2 0.25 1.0 0.48 0.23
Tin_g32114 (SMAP1)
0.08 0.15 0.16 0.22 1.0 0.39 0.16
0.12 0.17 0.19 0.22 1.0 0.39 0.17
0.04 0.06 0.1 0.12 1.0 0.29 0.06
0.02 0.05 0.09 0.1 1.0 0.37 0.04
0.01 0.05 0.04 0.05 1.0 0.36 0.04
0.04 0.11 0.22 0.16 1.0 0.41 0.07
0.01 0.02 0.01 0.01 1.0 0.31 0.01
0.03 0.06 0.09 0.2 1.0 0.22 0.05
Tin_g43901 (FAH1)
0.05 0.1 0.09 0.07 1.0 0.43 0.06
0.0 0.09 0.0 0.0 1.0 0.41 0.08
0.0 0.1 0.21 0.12 1.0 0.26 0.05
Tin_g45125 (LAC3)
0.01 0.03 0.0 0.0 1.0 0.32 0.07
0.15 0.22 0.17 0.12 1.0 0.47 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)