Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
10.14 11.96 50.68 48.47 201.09 90.43 18.94
2.02 5.72 0.72 0.71 42.13 14.41 0.29
5.08 5.76 10.11 7.44 31.33 15.74 6.84
0.54 0.24 0.01 0.0 9.76 2.77 0.59
Tin_g02797 (RBL1)
0.06 0.09 0.34 0.11 3.24 1.01 0.25
0.0 0.13 0.0 0.13 4.39 0.77 0.0
9.31 7.15 1.15 3.16 313.83 141.36 1.4
2.87 5.1 3.94 3.49 32.24 13.97 1.97
0.54 1.72 2.15 3.03 13.63 6.86 0.71
4.31 10.11 12.28 8.52 59.68 20.06 6.19
0.58 1.51 1.03 2.74 59.29 23.01 0.41
0.11 0.27 0.53 0.45 3.0 1.14 0.3
Tin_g03857 (CTF7)
2.38 3.01 2.74 3.03 10.58 4.45 2.9
Tin_g03923 (CPH)
9.24 16.94 23.8 17.78 89.98 38.42 8.59
0.51 2.02 1.57 1.16 11.14 3.2 0.8
Tin_g04031 (CYL2)
2.17 2.57 2.54 2.45 10.4 3.72 1.76
0.32 0.12 0.32 1.56 8.88 0.5 0.2
Tin_g04051 (IRX14)
0.62 1.55 1.53 1.19 8.18 3.16 0.68
Tin_g04659 (CPK13)
1.2 3.51 2.67 1.85 16.64 5.97 1.5
Tin_g04674 (GT13)
0.22 0.71 0.34 0.13 6.56 2.76 0.47
Tin_g04951 (PCNA1)
22.65 25.85 28.4 33.29 91.78 39.04 35.22
14.41 27.65 30.01 28.03 100.34 56.15 21.28
Tin_g05550 (TBL25)
0.3 1.15 0.39 0.32 11.07 4.09 1.04
Tin_g05574 (CYCA1;1)
1.26 3.66 3.47 3.02 15.37 7.68 3.18
Tin_g05879 (RABA1f)
10.36 10.89 17.54 13.7 48.87 23.4 10.63
Tin_g05948 (TUA6)
10.26 37.23 31.95 21.94 314.45 123.32 24.69
Tin_g05986 (ATSMO2)
3.78 6.45 10.04 8.85 49.19 25.01 4.91
0.05 0.33 0.43 0.55 4.51 1.2 0.0
30.63 36.61 48.12 41.3 135.05 57.71 41.1
Tin_g07028 (SUB1)
2.17 3.25 6.63 6.92 28.62 12.49 3.34
0.77 1.72 2.34 1.23 15.22 5.2 0.82
5.21 4.89 0.52 0.17 49.39 17.81 0.15
Tin_g08257 (SKU5)
4.17 6.65 11.62 8.56 57.14 17.72 3.74
0.47 3.65 1.62 0.89 26.43 10.98 2.19
2.82 4.79 3.56 2.88 29.99 13.63 3.22
Tin_g08783 (YDA)
1.41 1.91 1.93 1.88 5.99 3.78 1.36
0.14 1.2 0.2 0.17 8.76 3.68 0.44
3.34 3.86 5.02 4.5 8.31 4.57 4.13
0.81 2.06 3.2 3.05 16.94 5.09 3.5
Tin_g09399 (IQD3)
6.02 15.95 22.12 9.86 225.82 59.66 3.02
Tin_g10229 (FUT2)
0.41 2.19 0.82 0.47 13.31 5.41 0.79
0.67 2.15 2.0 1.84 7.49 2.75 1.25
0.0 0.16 0.0 0.0 5.48 1.48 0.35
6.67 18.24 94.12 125.64 819.62 341.69 89.92
Tin_g10998 (ZHD2)
0.16 2.12 0.46 0.09 14.23 4.93 0.69
1.0 2.19 2.57 1.28 16.4 7.24 3.55
1.06 2.99 6.47 3.99 26.64 9.22 2.43
0.05 1.48 2.04 1.37 14.13 3.44 0.58
15.94 25.43 54.15 40.12 391.5 134.64 21.56
Tin_g11504 (RUK)
0.32 0.61 0.58 0.61 3.74 1.35 0.47
2.78 4.88 5.42 5.05 19.15 9.18 3.59
0.39 0.29 0.37 0.05 9.4 2.69 0.6
0.69 1.52 2.05 2.03 7.29 2.62 1.85
Tin_g13121 (DRS1)
0.04 0.9 0.54 0.9 4.96 2.13 1.13
Tin_g13122 (QUA1)
2.94 6.95 9.74 7.46 37.31 17.83 5.74
1.67 2.87 2.62 2.57 13.47 5.88 2.25
0.23 0.95 0.85 1.09 5.74 1.84 0.63
Tin_g13778 (GATL7)
0.8 1.24 3.5 1.63 13.87 7.63 1.12
1.58 3.53 10.93 5.25 45.24 21.81 3.75
0.3 0.49 0.53 0.68 10.93 4.6 0.17
4.07 4.63 4.48 4.86 2522.31 980.87 5.54
Tin_g14169 (AGP8)
0.17 0.79 0.89 0.72 9.43 4.48 0.45
Tin_g14262 (CSLC5)
1.23 1.57 1.97 1.85 14.97 4.3 1.21
0.0 0.0 0.0 0.0 3.75 1.09 0.0
0.03 0.0 0.2 2.11 2257.47 954.32 9.91
13.65 16.74 43.16 47.13 325.71 117.89 17.75
3.5 6.35 10.61 5.79 72.44 19.51 1.38
8.46 8.86 10.9 12.69 34.39 19.42 11.92
0.58 0.32 0.0 0.0 13.52 5.97 0.0
Tin_g19305 (TUB7)
2.57 14.65 18.2 14.44 167.9 48.71 13.26
1.07 2.01 2.23 2.18 10.82 4.18 3.03
1.75 4.66 18.64 17.86 77.68 22.84 15.79
Tin_g20235 (sks5)
2.58 4.66 1.86 0.16 98.72 32.28 3.53
6.19 8.21 11.18 7.68 33.15 15.26 6.99
0.85 1.49 4.29 2.1 35.15 18.32 5.48
4.26 9.17 18.29 11.94 65.62 25.44 10.53
1.73 5.66 11.66 9.28 58.19 23.89 4.86
0.2 0.83 0.51 0.74 4.15 1.55 0.49
4.89 4.69 8.24 7.31 50.83 16.21 3.98
0.19 0.24 1.59 0.78 6.03 2.1 0.72
Tin_g25380 (TMO6)
21.38 33.85 40.86 37.39 100.24 46.27 27.6
8.35 12.89 22.64 16.83 110.05 46.15 10.33
3.21 5.49 10.04 4.68 60.05 23.96 13.48
11.59 28.92 22.95 23.31 110.82 55.05 33.62
Tin_g27917 (MAP65-1)
0.95 3.01 16.18 8.74 51.74 14.4 1.6
1.23 5.25 5.26 2.55 53.13 29.06 4.56
11.46 14.49 20.87 18.77 36.36 18.87 13.03
0.39 1.04 1.46 0.71 10.37 4.76 0.88
0.44 1.83 8.72 5.96 35.85 10.26 0.72
Tin_g30555 (SOL1)
0.02 0.34 0.03 0.0 4.62 1.84 0.3
0.24 0.97 0.0 0.14 12.74 5.17 0.0
1.42 2.66 3.55 5.37 25.87 11.67 0.92
0.5 0.74 0.78 0.39 15.04 5.53 2.2
Tin_g31049 (LAC17)
0.02 2.93 0.05 0.0 112.26 36.43 8.32
Tin_g31280 (EXS)
0.19 0.56 0.22 0.22 3.29 1.51 0.32
0.68 1.91 1.26 0.91 30.82 10.05 2.65
Tin_g31519 (FLA10)
0.75 2.01 0.09 0.01 80.87 29.17 1.46
0.67 1.49 1.26 1.57 6.31 3.02 1.43
Tin_g32114 (SMAP1)
3.72 7.05 7.85 10.5 47.75 18.55 7.77
0.48 0.7 0.77 0.88 4.02 1.59 0.66
9.75 16.34 27.76 32.2 269.31 79.05 16.41
1.12 2.88 4.67 5.52 52.82 19.42 2.0
1.17 4.46 4.19 4.94 97.61 35.59 3.5
3.39 9.45 18.98 13.49 85.03 34.78 5.57
42.88 133.17 49.8 63.45 5389.02 1650.22 41.82
0.62 1.46 2.31 5.05 24.74 5.56 1.11
Tin_g43901 (FAH1)
1.74 3.35 3.17 2.6 35.02 15.11 2.22
0.0 1.27 0.0 0.0 14.48 6.0 1.09
0.05 1.64 3.55 1.95 16.58 4.32 0.91
Tin_g45125 (LAC3)
1.08 3.52 0.0 0.0 106.94 33.84 7.36
9.13 13.61 10.35 7.19 61.03 28.77 11.81

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)