Heatmap: Cluster_168 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.69 0.89 1.0 0.64 0.38 0.43 0.33
0.7 0.68 1.0 0.71 0.24 0.2 0.54
0.71 0.69 1.0 0.76 0.51 0.44 0.52
0.5 0.6 1.0 0.68 0.38 0.42 0.4
0.88 0.83 1.0 0.79 0.32 0.39 0.52
Tin_g01216 (KUP10)
0.42 0.44 1.0 0.82 0.28 0.09 0.32
0.39 0.8 1.0 0.55 0.27 0.18 0.12
0.74 0.56 1.0 0.6 0.02 0.02 0.05
0.64 0.57 1.0 0.82 0.27 0.3 0.43
Tin_g02587 (MYB1)
0.75 0.66 1.0 0.65 0.37 0.41 0.38
0.53 1.0 0.86 0.49 0.35 0.23 0.18
0.74 0.62 1.0 0.63 0.31 0.39 0.06
0.8 0.94 1.0 0.9 0.57 0.36 0.42
Tin_g04164 (HOT1)
0.45 0.74 1.0 0.66 0.49 0.33 0.17
Tin_g04559 (Deg1)
0.76 1.0 0.96 0.76 0.76 0.53 0.28
Tin_g04685 (BLH1)
0.43 0.71 1.0 0.92 0.1 0.13 0.08
0.88 0.9 1.0 0.81 0.31 0.42 0.51
0.53 0.54 1.0 0.57 0.36 0.39 0.38
0.76 0.9 0.99 1.0 0.43 0.47 0.58
0.71 0.9 1.0 0.89 0.19 0.13 0.23
0.78 0.72 1.0 0.64 0.3 0.4 0.43
Tin_g06486 (ATJ)
0.63 1.0 0.99 0.6 0.39 0.22 0.2
Tin_g06758 (ECI1)
0.53 0.88 1.0 0.71 0.47 0.44 0.57
0.29 0.62 1.0 0.72 0.34 0.36 0.21
0.55 0.84 1.0 0.67 0.17 0.3 0.39
0.97 1.0 0.98 0.72 0.39 0.47 0.39
Tin_g07268 (EDL2)
0.67 0.64 1.0 0.69 0.55 0.41 0.29
Tin_g07654 (BAG7)
0.55 0.86 1.0 0.46 0.27 0.15 0.06
Tin_g07725 (PSY)
0.51 0.64 1.0 0.66 0.26 0.34 0.39
0.88 0.72 1.0 0.81 0.42 0.38 0.52
0.75 0.81 1.0 0.96 0.26 0.32 0.59
1.0 0.73 0.98 0.46 0.04 0.12 0.23
0.47 0.75 1.0 0.9 0.14 0.18 0.12
0.65 0.82 1.0 0.73 0.54 0.48 0.56
0.8 0.65 1.0 0.75 0.32 0.34 0.45
0.59 0.77 1.0 0.7 0.42 0.38 0.42
0.82 0.82 1.0 0.65 0.26 0.38 0.5
0.84 1.0 0.93 0.7 0.55 0.42 0.38
Tin_g11155 (HSP18.2)
0.43 0.54 1.0 0.63 0.34 0.32 0.27
0.6 0.72 1.0 0.92 0.32 0.45 0.38
Tin_g11650 (VSR3)
0.54 0.77 1.0 0.93 0.49 0.59 0.45
0.7 0.87 1.0 0.91 0.37 0.45 0.55
0.48 0.78 1.0 0.48 0.3 0.16 0.21
Tin_g12295 (RKF3)
0.83 0.79 1.0 0.72 0.47 0.45 0.57
Tin_g12637 (DSPTP1)
0.64 0.5 1.0 0.51 0.22 0.29 0.42
0.9 0.84 1.0 0.85 0.52 0.6 0.68
0.62 0.66 1.0 0.77 0.38 0.3 0.41
0.87 0.91 1.0 0.93 0.7 0.6 0.73
0.49 0.72 1.0 0.76 0.36 0.22 0.19
0.57 0.59 1.0 0.7 0.24 0.25 0.32
0.89 0.94 1.0 0.79 0.53 0.61 0.63
0.74 0.63 1.0 0.99 0.34 0.38 0.54
0.53 0.81 1.0 0.57 0.14 0.18 0.06
Tin_g15530 (PEX11A)
0.83 0.77 1.0 0.87 0.55 0.41 0.5
0.59 0.6 1.0 0.71 0.17 0.4 0.08
0.72 0.56 1.0 0.62 0.04 0.07 0.2
0.67 1.0 0.97 0.81 0.41 0.43 0.5
0.41 0.35 1.0 0.21 0.04 0.21 0.19
0.96 0.57 1.0 0.52 0.06 0.09 0.1
0.56 0.58 1.0 0.67 0.26 0.49 0.29
1.0 0.39 0.79 0.32 0.05 0.12 0.26
0.74 0.94 1.0 0.89 0.33 0.47 0.49
0.39 0.54 1.0 0.8 0.01 0.02 0.05
0.53 0.15 1.0 0.49 0.03 0.03 0.09
0.51 0.6 1.0 0.67 0.2 0.07 0.17
Tin_g20093 (HSF1)
0.54 0.94 1.0 0.52 0.39 0.21 0.25
Tin_g20544 (PRR7)
0.96 0.68 1.0 0.75 0.33 0.3 0.44
Tin_g20613 (SYP131)
0.91 0.93 1.0 0.91 0.72 0.63 0.68
Tin_g20772 (HSP81-3)
0.81 0.97 1.0 0.56 0.47 0.28 0.28
0.97 0.88 1.0 0.94 0.37 0.66 0.73
0.57 0.49 1.0 0.59 0.11 0.08 0.06
0.79 0.56 1.0 0.48 0.01 0.04 0.03
Tin_g21768 (MYB50)
0.57 0.42 1.0 0.72 0.02 0.02 0.23
0.83 0.8 1.0 0.85 0.6 0.39 0.58
Tin_g22057 (LAC17)
0.23 0.43 1.0 0.61 0.03 0.03 0.25
0.63 0.6 1.0 0.57 0.08 0.19 0.35
Tin_g22897 (STP11)
0.94 1.0 0.78 0.58 0.05 0.04 0.03
0.49 0.66 1.0 0.71 0.28 0.26 0.34
0.66 0.65 1.0 0.68 0.13 0.23 0.07
0.8 0.78 1.0 0.72 0.48 0.41 0.61
0.73 0.54 1.0 0.8 0.14 0.25 0.51
0.75 0.84 1.0 0.74 0.29 0.35 0.47
0.87 0.84 1.0 0.72 0.53 0.37 0.5
0.36 0.65 1.0 0.45 0.35 0.15 0.17
0.78 0.49 1.0 0.89 0.19 0.15 0.11
0.94 0.91 1.0 0.59 0.05 0.04 0.06
0.38 0.48 1.0 0.32 0.07 0.13 0.1
0.6 0.44 1.0 0.58 0.15 0.25 0.41
0.68 0.52 1.0 0.56 0.02 0.04 0.06
0.42 0.68 1.0 0.87 0.2 0.27 0.4
0.87 0.78 1.0 0.86 0.41 0.44 0.47
0.4 0.72 1.0 0.65 0.24 0.18 0.22
0.65 0.59 1.0 0.59 0.24 0.36 0.43
0.52 0.53 1.0 0.44 0.05 0.11 0.03
1.0 0.93 0.96 0.63 0.06 0.05 0.08
0.43 0.89 1.0 0.65 0.33 0.21 0.22
Tin_g27042 (HSP70)
0.67 0.81 1.0 0.62 0.32 0.28 0.29
0.95 0.68 1.0 0.66 0.01 0.02 0.04
0.7 0.76 1.0 0.59 0.17 0.13 0.06
0.67 0.44 1.0 0.68 0.18 0.25 0.41
0.62 0.98 1.0 0.56 0.33 0.19 0.3
0.79 0.6 1.0 0.54 0.37 0.28 0.17
Tin_g28576 (LKS1)
0.79 0.74 1.0 0.85 0.47 0.4 0.42
0.59 0.78 1.0 0.78 0.56 0.57 0.39
0.36 0.9 1.0 0.55 0.27 0.14 0.19
0.27 0.3 1.0 0.39 0.17 0.23 0.17
0.69 0.4 1.0 0.64 0.27 0.29 0.25
0.42 0.39 1.0 0.64 0.14 0.11 0.34
0.91 1.0 0.76 0.71 0.18 0.23 0.26
0.24 0.81 1.0 0.63 0.05 0.11 0.14
0.68 0.69 1.0 0.64 0.32 0.42 0.46
0.56 0.48 1.0 0.64 0.14 0.25 0.38
0.91 0.82 1.0 0.75 0.42 0.46 0.49
0.71 0.58 1.0 0.65 0.39 0.46 0.5
0.69 0.74 1.0 0.71 0.15 0.29 0.09
0.78 0.68 1.0 0.69 0.38 0.52 0.52
0.96 0.76 1.0 0.65 0.02 0.06 0.05
1.0 0.86 0.93 0.58 0.04 0.12 0.31
0.78 0.5 1.0 0.75 0.3 0.18 0.44
0.86 0.61 1.0 0.78 0.13 0.28 0.56
0.83 0.64 1.0 0.6 0.01 0.01 0.04
0.68 0.53 1.0 0.64 0.24 0.34 0.42
Tin_g37680 (HSP21)
0.47 0.86 1.0 0.43 0.35 0.2 0.12
1.0 0.87 0.93 0.53 0.01 0.24 0.02
0.59 0.4 1.0 0.54 0.01 0.01 0.04
0.59 0.54 1.0 0.53 0.01 0.01 0.08
0.74 0.53 1.0 0.96 0.31 0.38 0.63
0.72 0.68 1.0 0.71 0.57 0.38 0.3
0.79 0.78 1.0 0.77 0.51 0.39 0.59
0.68 0.59 1.0 0.88 0.36 0.26 0.3
Tin_g44255 (HSP18.2)
0.35 0.47 1.0 0.56 0.31 0.26 0.18
Tin_g44325 (HSP17.6II)
0.45 0.99 1.0 0.48 0.61 0.27 0.16
1.0 0.76 0.84 0.63 0.35 0.29 0.38
0.79 1.0 0.96 0.8 0.12 0.16 0.26
0.9 1.0 0.98 0.98 0.55 0.47 0.47
Tin_g46142 (CPK17)
0.79 0.58 1.0 0.62 0.25 0.19 0.39
Tin_g46333 (bZIP68)
0.9 0.83 1.0 0.98 0.59 0.57 0.64

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)