Heatmap: Cluster_168 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
5.61 7.22 8.1 5.2 3.12 3.5 2.71
22.66 22.26 32.55 23.09 7.83 6.67 17.45
41.18 40.16 58.16 44.23 29.94 25.76 30.38
8.66 10.38 17.22 11.64 6.52 7.18 6.89
33.42 31.74 38.04 30.24 12.03 14.66 19.9
Tin_g01216 (KUP10)
10.45 10.8 24.77 20.23 6.91 2.14 7.83
26.56 54.46 67.9 37.09 18.24 12.28 8.35
119.97 91.46 163.2 98.56 3.35 2.71 8.48
173.13 153.97 270.66 221.61 72.35 80.96 117.26
Tin_g02587 (MYB1)
4.61 4.06 6.13 4.01 2.25 2.49 2.3
43.88 83.31 71.72 40.41 29.53 19.52 14.82
34.11 28.42 45.95 29.17 14.2 17.9 2.68
16.26 19.03 20.27 18.33 11.58 7.26 8.53
Tin_g04164 (HOT1)
26.69 43.91 59.51 39.38 29.39 19.47 9.97
Tin_g04559 (Deg1)
13.32 17.44 16.8 13.24 13.24 9.31 4.92
Tin_g04685 (BLH1)
18.1 30.2 42.26 38.69 4.2 5.68 3.31
115.4 118.3 131.74 106.8 41.48 55.04 67.24
6.54 6.68 12.27 6.99 4.43 4.76 4.67
34.23 40.87 44.67 45.24 19.45 21.37 26.4
289.27 365.65 405.66 360.65 77.1 52.96 91.52
30.01 27.73 38.33 24.4 11.41 15.25 16.35
Tin_g06486 (ATJ)
118.01 186.81 184.49 111.94 73.58 41.23 37.18
Tin_g06758 (ECI1)
10.13 16.83 19.09 13.52 8.99 8.33 10.94
37.98 79.95 128.98 93.3 44.39 46.95 27.53
13.44 20.68 24.51 16.39 4.27 7.26 9.55
158.21 163.6 160.28 118.35 63.19 76.7 63.83
Tin_g07268 (EDL2)
56.24 53.44 83.47 57.83 46.21 34.52 23.8
Tin_g07654 (BAG7)
15.06 23.53 27.45 12.73 7.52 4.05 1.66
Tin_g07725 (PSY)
6.01 7.58 11.79 7.81 3.05 3.98 4.55
22.12 18.24 25.27 20.5 10.68 9.61 13.26
2.71 2.92 3.61 3.46 0.95 1.16 2.12
29.9 21.86 29.3 13.74 1.09 3.58 6.8
13.5 21.59 28.94 26.11 4.13 5.29 3.35
135.18 168.69 206.72 151.34 111.68 100.07 116.52
11.05 9.04 13.87 10.4 4.44 4.65 6.2
14.53 19.15 24.74 17.28 10.43 9.4 10.27
38.35 38.38 46.95 30.38 12.02 17.63 23.29
96.0 114.08 105.86 80.42 63.25 48.48 43.86
Tin_g11155 (HSP18.2)
92.63 118.39 217.95 137.95 74.37 69.71 59.64
6.16 7.4 10.23 9.42 3.29 4.61 3.91
Tin_g11650 (VSR3)
73.07 104.76 135.86 126.89 67.17 80.11 61.73
17.57 21.8 25.06 22.75 9.18 11.4 13.73
134.46 219.63 282.26 135.35 84.0 44.76 58.94
Tin_g12295 (RKF3)
8.9 8.45 10.73 7.69 5.05 4.78 6.09
Tin_g12637 (DSPTP1)
82.05 63.2 127.53 65.0 27.94 37.0 53.04
13.65 12.68 15.14 12.83 7.94 9.05 10.37
20.09 21.31 32.42 24.94 12.21 9.7 13.42
44.59 46.62 51.24 47.42 35.77 30.51 37.29
4.29 6.31 8.78 6.68 3.2 1.91 1.68
95.72 99.26 167.45 117.4 40.73 42.3 53.94
16.58 17.5 18.56 14.61 9.79 11.25 11.65
117.95 100.16 159.47 157.72 53.79 61.37 85.89
128.67 196.51 242.65 137.23 34.93 44.44 13.6
Tin_g15530 (PEX11A)
21.65 20.0 26.05 22.57 14.34 10.62 12.95
10.53 10.64 17.87 12.7 3.02 7.21 1.49
32.29 25.14 45.03 27.87 1.76 2.99 9.06
10.12 15.09 14.6 12.16 6.2 6.49 7.55
23.74 20.39 57.44 11.83 2.55 11.85 10.66
36.64 21.8 38.31 19.87 2.13 3.27 3.96
8.97 9.21 15.92 10.64 4.14 7.75 4.68
33.31 12.92 26.2 10.57 1.57 3.88 8.7
45.71 58.4 61.9 55.36 20.71 28.87 30.2
200.79 275.54 512.87 409.6 3.98 9.53 25.55
2.58 0.72 4.83 2.38 0.15 0.14 0.42
3.74 4.35 7.31 4.9 1.46 0.55 1.25
Tin_g20093 (HSF1)
97.38 169.36 180.77 93.99 71.18 37.84 44.97
Tin_g20544 (PRR7)
45.53 31.95 47.19 35.26 15.63 14.07 20.84
Tin_g20613 (SYP131)
32.84 33.71 36.27 33.04 26.11 22.83 24.59
Tin_g20772 (HSP81-3)
414.1 494.75 508.71 284.06 241.08 141.89 140.94
9.07 8.26 9.34 8.78 3.48 6.18 6.81
6.67 5.72 11.77 7.0 1.32 0.94 0.72
29.91 21.08 37.73 17.97 0.5 1.38 1.2
Tin_g21768 (MYB50)
14.31 10.46 25.13 18.2 0.43 0.59 5.79
11.3 10.96 13.64 11.56 8.14 5.26 7.91
Tin_g22057 (LAC17)
2.54 4.88 11.23 6.89 0.37 0.36 2.78
2.63 2.49 4.17 2.37 0.32 0.79 1.47
Tin_g22897 (STP11)
21.26 22.65 17.76 13.17 1.06 0.95 0.77
94.4 127.75 193.84 137.65 53.36 49.73 65.04
250.37 247.88 381.93 259.4 48.85 89.56 25.08
45.94 45.21 57.66 41.51 27.63 23.84 35.28
576.95 420.23 785.06 626.94 112.89 199.43 402.34
34.07 37.98 45.31 33.37 13.04 15.82 21.24
32.25 30.99 37.11 26.75 19.59 13.63 18.42
164.57 291.78 452.1 203.88 156.66 67.51 78.01
3.76 2.38 4.82 4.31 0.91 0.73 0.54
7.12 6.94 7.61 4.46 0.36 0.34 0.49
2.44 3.13 6.48 2.07 0.45 0.82 0.68
61.2 44.79 102.61 59.39 15.72 25.16 42.47
56.71 42.99 82.91 46.6 1.74 3.08 4.69
9.09 14.79 21.62 18.81 4.3 5.87 8.68
58.59 52.42 67.04 57.96 27.6 29.82 31.4
2.47 4.49 6.22 4.03 1.52 1.14 1.4
28.96 26.29 44.88 26.41 10.92 16.23 19.47
1.47 1.51 2.85 1.25 0.13 0.32 0.08
49.95 46.42 47.72 31.42 3.09 2.66 4.08
1.61 3.34 3.77 2.46 1.25 0.78 0.83
Tin_g27042 (HSP70)
539.02 650.46 798.79 492.93 255.94 226.52 234.92
11.82 8.44 12.43 8.24 0.15 0.3 0.48
1.86 2.02 2.66 1.56 0.45 0.36 0.15
80.07 51.96 119.15 81.35 21.01 29.61 48.95
195.78 306.27 313.45 175.25 104.91 58.77 95.26
2.87 2.17 3.64 1.96 1.34 1.02 0.63
Tin_g28576 (LKS1)
11.0 10.37 13.94 11.92 6.58 5.58 5.81
7.87 10.42 13.34 10.42 7.51 7.54 5.14
1.76 4.41 4.88 2.69 1.32 0.67 0.91
1.29 1.41 4.79 1.89 0.82 1.11 0.8
19.58 11.3 28.26 18.06 7.69 8.07 7.13
10.02 9.24 23.78 15.18 3.26 2.56 8.02
4.37 4.82 3.64 3.42 0.85 1.11 1.27
6.23 20.84 25.68 16.21 1.24 2.8 3.5
48.57 48.93 71.32 45.45 23.12 30.0 33.06
57.9 49.82 103.85 66.88 14.73 25.76 39.27
11.46 10.28 12.61 9.42 5.26 5.79 6.14
6.86 5.57 9.66 6.29 3.81 4.43 4.79
74.42 80.65 108.42 76.48 15.78 31.41 9.95
10.37 9.06 13.3 9.14 5.04 6.91 6.86
8.03 6.3 8.33 5.43 0.15 0.53 0.4
5.92 5.09 5.53 3.44 0.26 0.68 1.84
11.46 7.34 14.76 11.12 4.4 2.72 6.46
153.46 108.41 178.87 140.19 23.28 49.5 100.87
32.69 25.38 39.58 23.79 0.28 0.57 1.78
47.49 37.13 69.54 44.48 16.54 23.41 29.52
Tin_g37680 (HSP21)
78.11 144.99 167.68 71.64 59.52 33.47 20.33
27.51 23.9 25.47 14.68 0.31 6.48 0.57
77.36 53.21 131.8 70.87 1.08 1.42 5.8
6.12 5.57 10.37 5.5 0.11 0.1 0.81
9.98 7.11 13.46 12.99 4.14 5.07 8.53
90.86 86.45 127.03 90.41 72.81 48.03 37.91
44.68 44.3 56.77 43.57 29.04 22.42 33.4
17.47 15.29 25.78 22.74 9.29 6.73 7.69
Tin_g44255 (HSP18.2)
72.0 97.04 206.47 114.94 63.09 52.82 37.23
Tin_g44325 (HSP17.6II)
59.76 131.36 133.11 64.31 81.37 36.42 21.48
17.71 13.43 14.87 11.19 6.2 5.1 6.73
122.24 154.01 147.96 123.89 18.3 24.69 40.78
52.2 58.05 56.62 56.84 31.94 27.26 27.07
Tin_g46142 (CPK17)
5.36 3.96 6.81 4.19 1.68 1.27 2.64
Tin_g46333 (bZIP68)
44.46 40.92 49.57 48.56 29.42 28.23 31.84

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)