Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Spa_g00221 (PYM)
-0.54 -0.15 -0.22 -0.28 0.12 -0.3 0.19 0.32 0.7 -0.3
Spa_g00314 (TCTP)
-1.18 -0.43 -0.36 -0.73 0.22 -0.65 0.36 0.37 1.18 -0.35
-1.15 -0.14 -0.28 -1.62 0.02 -1.86 0.29 0.84 1.26 -0.35
-1.04 -0.24 -0.41 -0.52 0.34 -0.38 0.47 0.48 0.71 -0.39
-0.45 0.11 -0.07 -0.75 0.24 -0.92 0.3 0.49 0.53 -0.23
-1.01 0.33 0.21 -1.67 -0.14 -1.27 0.21 0.78 1.02 -0.82
Spa_g01957 (CPL4)
-0.69 -0.34 -0.02 -0.48 -0.09 -0.52 0.12 0.57 0.86 -0.21
Spa_g01972 (IDN2)
-0.76 0.08 0.21 -0.65 0.06 -0.47 0.01 0.57 0.71 -0.6
Spa_g02611 (SLT1)
-1.18 -0.45 0.13 -0.31 0.05 -0.26 0.06 0.56 0.87 -0.49
Spa_g02913 (UBP3)
-1.58 -0.91 -0.5 -0.47 0.32 -0.46 0.43 0.53 0.97 -0.05
-0.35 0.2 -0.14 -0.66 0.25 -0.47 0.29 0.14 0.66 -0.47
-2.61 -0.08 -0.25 -2.26 0.01 -2.07 0.56 0.39 1.82 -1.82
-0.73 -0.15 -0.02 -0.46 0.17 -0.35 0.26 0.24 0.66 -0.13
-0.86 -0.28 0.15 -0.34 -0.07 -0.12 -0.02 0.56 0.72 -0.43
Spa_g04380 (CKB1)
-1.18 -0.27 -0.36 -0.75 0.25 -0.69 0.38 0.51 1.02 -0.31
-0.58 -0.23 -0.45 -0.4 0.27 -0.32 0.37 0.24 0.71 -0.19
Spa_g04559 (GAS41)
-0.48 -0.21 -0.16 -0.34 0.2 -0.26 0.32 0.25 0.57 -0.27
Spa_g04738 (CDC48C)
-1.06 -0.52 -0.05 -1.21 0.13 -1.12 0.28 0.86 0.92 -0.08
-1.36 -0.52 -0.65 -0.97 0.07 -1.91 0.23 1.03 1.49 -1.24
-1.34 -0.25 -0.05 -1.01 0.06 -0.88 0.47 0.77 1.09 -1.0
-1.15 -0.15 -0.01 -0.82 0.34 -0.68 0.42 0.43 0.76 -0.28
-0.63 -0.25 0.1 -0.4 -0.04 -0.12 0.11 0.5 0.55 -0.26
Spa_g05222 (CPSF30)
-0.74 -0.11 0.05 -0.67 -0.09 -0.48 0.11 0.5 0.86 -0.24
Spa_g05381 (ECT5)
-1.76 -0.59 -0.82 -1.22 -0.17 -1.02 0.03 1.1 1.47 -0.48
-0.67 -0.17 -0.07 -0.75 -0.21 -0.47 0.09 0.82 0.91 -0.61
-2.31 -0.31 -0.95 -1.07 0.46 -0.9 0.68 0.52 1.27 -0.68
-0.05 -0.3 -0.1 -0.63 -0.15 -0.68 -0.1 0.56 0.83 -0.09
-0.5 -0.32 0.08 -0.71 0.06 -0.57 0.27 0.4 0.72 -0.1
-0.33 -0.24 0.08 -0.87 -0.04 -0.8 0.01 0.69 0.86 -0.36
-0.64 -0.15 -0.08 -0.79 0.24 -0.67 0.43 0.15 0.84 -0.19
-0.82 -1.04 -0.78 -1.46 -0.06 -1.38 0.06 1.08 1.49 -0.5
-0.55 0.06 -0.27 -0.56 0.09 -0.52 0.19 0.55 0.7 -0.37
-1.81 -0.74 -0.79 -1.25 0.21 -0.51 0.66 0.41 1.29 -0.16
Spa_g06888 (RPT6A)
-0.94 -0.44 -0.53 -0.44 0.15 -0.55 0.25 0.53 1.08 -0.38
Spa_g06947 (ZIG)
-2.1 -0.87 -0.92 -0.73 0.2 -0.64 0.4 0.59 1.37 -0.18
Spa_g07200 (FVE)
-1.44 -1.13 -0.81 -0.86 -0.07 -0.78 0.12 0.93 1.47 -0.41
-0.43 -0.01 -0.16 -1.0 -0.01 -0.88 0.12 0.72 0.85 -0.3
-0.74 -1.11 -0.25 -0.79 0.24 -0.58 0.33 0.46 1.19 -0.42
-0.93 -0.11 -0.45 -0.53 0.19 -0.44 0.42 0.43 0.87 -0.46
-1.16 -0.37 0.04 -0.51 0.02 -0.41 0.1 0.48 0.98 -0.24
-0.72 -0.04 0.04 -0.53 0.17 -0.29 0.16 0.53 0.57 -0.5
Spa_g07663 (U2A')
-0.42 -0.08 0.01 -0.37 0.18 -0.25 0.12 0.24 0.54 -0.26
Spa_g07798 (MEE49)
-0.65 -0.61 -0.32 -0.29 -0.02 -0.26 -0.01 0.47 1.04 -0.29
-0.53 0.06 0.09 -0.45 -0.05 -0.49 -0.01 0.5 0.7 -0.42
Spa_g07837 (TPR2)
-0.52 0.06 -0.25 -0.51 0.37 -0.36 0.3 0.08 0.62 -0.27
-1.51 -0.12 -0.61 -1.65 0.41 -1.29 0.2 0.43 1.54 -0.71
-1.27 -0.5 -0.69 -1.24 0.47 -1.13 0.5 0.51 1.38 -0.86
-0.82 -0.32 -0.27 -1.0 0.35 -0.91 0.39 0.36 1.17 -0.61
-1.35 -0.68 -0.41 -1.17 0.17 -1.14 0.44 0.52 1.33 -0.16
Spa_g07883 (GCN1)
-1.25 -0.24 -0.35 -0.57 0.29 -0.36 0.41 0.25 0.94 -0.27
Spa_g08100 (RPB2)
-1.83 -0.57 -0.86 -1.23 0.01 -1.06 0.21 0.98 1.47 -0.56
Spa_g08279 (SMU2)
-0.67 -0.34 -0.35 -0.52 0.0 -0.51 0.1 0.7 0.9 -0.28
-0.89 -0.16 -0.2 -0.41 0.29 -0.32 0.34 0.28 0.66 -0.22
-1.05 -0.04 -0.08 -0.84 -0.01 -0.83 0.08 0.83 0.96 -0.51
Spa_g08554 (Y14)
-1.04 -0.43 -0.16 -0.49 0.24 -0.44 0.36 0.38 0.8 -0.11
-0.85 -0.1 0.15 -0.51 -0.06 -0.35 0.02 0.61 0.7 -0.32
Spa_g09288 (XRN3)
-1.3 -0.24 -0.29 -1.12 -0.02 -0.86 0.2 0.73 1.2 -0.26
Spa_g09289 (EDM2)
-0.31 0.18 0.11 -0.92 -0.17 -0.8 -0.03 0.78 0.68 -0.55
-2.34 -0.99 -1.1 -1.75 -0.08 -1.65 0.15 1.34 1.63 -0.87
-1.67 -0.22 -0.68 -1.18 0.27 -0.9 0.39 0.8 1.2 -0.55
Spa_g09873 (AL4)
-1.33 -0.26 -0.12 -1.11 -0.09 -0.95 0.07 0.59 1.41 -0.48
Spa_g09882 (PHL1)
-1.04 0.12 -0.13 -0.42 0.16 -0.35 0.29 0.46 0.65 -0.49
Spa_g09913 (TOPP4)
-1.13 -0.54 -0.48 -0.97 -0.24 -0.82 0.15 0.96 1.2 -0.21
-0.77 0.11 -1.07 -0.69 0.12 -0.66 0.31 0.69 1.07 -0.79
-2.74 -0.65 -0.96 -1.33 0.43 -1.17 0.64 0.78 1.25 -0.23
-0.99 -0.02 -0.5 -1.46 0.63 -1.06 0.4 0.2 1.14 -0.45
Spa_g10425 (ERF4)
-1.58 -0.27 -0.67 -0.52 0.34 -0.5 0.34 0.63 0.94 -0.33
-0.51 -0.04 0.25 -0.85 -0.27 -0.86 -0.21 0.82 0.76 -0.18
-1.56 -0.59 -0.68 -1.27 0.08 -1.28 0.28 1.11 1.21 -0.34
-1.89 -0.66 -0.82 -1.25 0.19 -1.11 0.34 1.08 1.27 -0.48
-1.49 -0.18 -0.39 -0.69 0.23 -0.55 0.42 0.58 0.82 -0.1
-0.74 0.05 -0.31 -0.64 0.21 -0.36 0.3 0.27 0.74 -0.18
-0.83 -0.17 0.06 -0.95 0.26 -0.72 0.28 0.33 0.89 -0.22
Spa_g11421 (GATA27)
-2.84 -0.68 -1.07 -0.76 0.26 -0.81 0.52 0.37 1.61 -0.68
-1.13 -0.19 -0.38 -0.84 0.45 -0.75 0.53 0.31 0.99 -0.5
Spa_g11581 (CYCT1;4)
-0.78 -0.79 -0.03 -0.78 0.17 -0.73 0.29 0.69 0.96 -0.38
Spa_g11978 (SCL30A)
-0.34 -0.22 -0.02 -0.65 0.17 -0.33 0.05 0.57 0.6 -0.35
Spa_g12056 (VAC1)
-1.28 0.14 0.05 -1.83 0.12 -1.27 0.33 0.38 1.29 -0.58
-0.67 -0.28 -0.08 -1.09 0.22 -0.9 0.18 0.39 1.03 -0.06
-0.56 -0.7 -0.14 -0.76 -0.09 -0.78 0.1 0.83 1.03 -0.35
Spa_g12756 (MIRO1)
-0.87 -0.31 -0.36 -0.66 0.1 -0.62 0.16 0.69 0.97 -0.29
-0.72 -0.14 -0.18 -0.79 0.11 -0.88 0.21 0.67 0.87 -0.29
Spa_g13108 (U2AF35B)
-0.62 -0.44 0.06 -0.31 0.08 -0.17 0.15 0.42 0.56 -0.16
-1.52 -0.15 -0.56 -0.64 0.25 -0.68 0.3 0.65 1.04 -0.4
-1.78 -1.47 -1.47 -2.48 0.33 -1.77 0.52 0.93 1.55 -0.03
-1.38 -0.38 -0.11 -0.35 0.2 -0.45 0.29 0.43 0.92 -0.32
-0.95 -0.02 0.11 -0.57 -0.01 -0.73 0.12 0.59 0.86 -0.43
-1.74 -0.04 0.03 -0.45 0.13 -0.26 -0.05 0.68 0.94 -0.86
-1.02 0.07 -0.29 -1.06 0.29 -0.82 0.42 0.44 1.0 -0.58
Spa_g14927 (VPS28-2)
-0.71 -0.04 -0.65 -0.61 0.18 -0.47 0.3 0.39 0.9 -0.22
Spa_g15124 (CUM1)
-0.58 -0.36 -0.27 -0.42 0.11 -0.48 0.2 0.52 0.82 -0.27
-0.49 -0.31 -0.1 -0.78 0.06 -0.43 0.19 0.4 0.82 -0.08
-0.83 0.04 0.24 -0.94 -0.47 -0.95 -0.18 0.87 0.93 -0.22
-1.64 -0.56 -0.34 -1.38 0.19 -1.3 0.36 0.77 1.33 -0.38
-1.54 -0.4 -0.43 -1.04 0.3 -1.05 0.48 0.52 1.19 -0.24
-1.66 0.03 -0.7 -0.53 0.32 -0.51 0.43 0.32 1.02 -0.34
-0.38 -0.29 -0.13 -0.4 0.13 -0.39 0.2 0.43 0.69 -0.36
-0.3 -0.31 -0.03 -0.7 0.07 -0.73 0.12 0.58 0.71 -0.14
-0.08 0.09 -0.08 -0.95 -0.31 -0.76 -0.09 0.59 0.94 -0.38
-0.7 -0.16 0.27 -0.66 0.06 -0.48 0.12 0.62 0.76 -0.8
-0.68 -0.14 0.11 -0.89 0.13 -0.81 0.18 0.51 0.81 -0.19
Spa_g18068 (HD1)
-0.02 -0.36 0.17 -0.55 -0.26 -0.67 -0.05 0.63 0.6 -0.11
-0.7 -0.54 0.16 -0.63 0.04 -0.44 0.04 0.86 0.75 -0.65
-0.82 0.06 -0.73 -0.52 0.11 -0.32 0.18 0.4 1.03 -0.47
Spa_g19168 (SR30)
-0.76 -0.61 -0.38 -0.52 0.0 -0.29 0.16 0.34 1.2 -0.34
-1.6 -0.8 -0.78 -0.92 -0.02 -0.96 0.21 0.95 1.41 -0.42
Spa_g19306 (U2AF35B)
-1.44 -0.15 0.1 -0.48 0.02 -0.25 0.28 0.7 0.84 -1.13
-1.04 -0.36 -0.2 -0.71 0.23 -0.56 0.29 0.61 0.86 -0.25
Spa_g20774 (MED21)
-0.95 -1.19 -0.44 -0.51 0.03 -0.31 0.25 0.55 1.16 -0.16
Spa_g20926 (U2AF35B)
-0.96 -0.43 0.21 -0.58 0.17 -0.18 0.16 0.64 0.7 -0.72
-0.59 -0.15 0.02 -0.28 0.11 -0.24 0.13 0.43 0.47 -0.24
Spa_g22183 (CRF4)
-2.22 -1.83 -0.99 -1.82 0.16 -1.51 0.6 0.98 1.49 -0.06
-2.21 -0.88 -1.07 -1.02 0.14 -0.86 0.45 0.55 1.56 -0.26
-0.6 -0.69 0.2 -0.85 0.21 -1.06 0.13 0.72 0.73 -0.03
-0.37 0.11 0.08 -0.68 0.02 -0.5 -0.11 0.6 0.55 -0.25
-0.68 0.11 -0.45 -2.14 0.43 -2.02 -0.0 0.6 1.49 -1.26
-0.07 -0.66 0.18 -0.63 -0.19 -0.58 -0.14 0.64 0.86 -0.29
-0.37 -0.22 0.05 -0.75 0.07 -0.63 0.29 0.49 0.67 -0.29
-1.18 0.21 -0.32 -1.77 0.37 -1.68 0.61 0.87 0.98 -1.44
-0.57 0.13 -0.05 -0.61 -0.02 -0.56 0.1 0.56 0.76 -0.5
-0.56 -0.28 0.05 -0.72 0.2 -0.65 0.22 0.42 0.82 -0.32
Spa_g25581 (YUC11)
-1.16 -1.2 -0.61 -1.36 -0.29 -0.92 0.27 0.85 1.6 -0.54
-0.31 0.12 0.09 -0.51 0.01 -0.45 -0.03 0.4 0.55 -0.24
-2.05 -2.18 0.52 -3.81 0.06 -2.06 -0.45 1.07 1.57 -0.07
-0.62 0.01 0.04 -0.54 -0.01 -0.28 0.0 0.61 0.66 -0.52
Spa_g28087 (TSN1)
-2.01 -0.65 -0.14 -1.06 0.11 -0.62 0.46 0.77 1.04 -0.21
-0.09 -0.1 0.17 -0.94 -0.07 -0.9 -0.03 0.58 0.66 -0.09
-2.73 -0.58 -0.65 -1.93 0.35 -1.45 0.34 0.77 1.42 -0.02
-0.82 -0.07 -0.26 -1.12 0.27 -1.09 0.36 0.74 0.88 -0.48
-1.0 -0.37 -0.28 -0.82 0.04 -0.5 0.32 0.65 0.87 -0.06
-2.33 0.38 0.21 -4.35 -1.92 -3.44 -1.86 1.52 1.74 -1.13
-2.33 0.21 0.41 -3.12 -1.05 -2.25 -0.47 1.4 1.45 -1.26
-0.16 -0.07 0.2 -1.09 -0.11 -0.94 -0.07 0.65 0.69 -0.07
-1.6 0.02 -0.63 -0.45 0.33 -0.25 0.47 0.21 0.96 -0.53
-0.34 -0.47 0.05 -0.81 -0.04 -0.57 0.24 0.53 0.8 -0.18
-1.32 0.25 -1.02 -1.03 0.4 -0.68 0.53 0.35 1.19 -1.06
-1.24 -0.75 -0.06 -0.69 0.12 -0.71 0.24 0.74 1.02 -0.29
-0.68 0.05 0.03 -0.6 -0.12 -0.42 -0.02 0.73 0.7 -0.47
-0.73 -0.19 0.17 -0.87 -0.08 -0.67 0.01 0.77 0.96 -0.68
-0.73 0.1 0.12 -0.53 0.01 -0.47 0.09 0.48 0.65 -0.36
-0.8 0.05 -0.14 -1.84 0.02 -1.25 0.28 1.28 0.88 -1.83
-1.31 -0.43 -0.46 -1.05 0.18 -0.51 0.36 0.7 0.93 0.01
-1.16 -0.55 -0.53 -0.66 0.24 -0.38 0.31 0.38 1.2 -0.4
-2.35 -2.47 -0.34 -1.46 0.5 -1.7 0.5 1.03 1.38 -0.54
-1.72 -1.28 0.23 -0.93 -0.08 -1.09 -0.45 0.88 1.41 -0.1
-1.49 -0.63 -0.64 -0.99 0.21 -0.81 0.31 0.95 1.12 -0.36
-1.39 -0.29 -0.86 -0.98 0.33 -0.84 0.46 0.53 1.3 -0.64
Spa_g49371 (SIZ1)
-1.45 -1.03 -0.34 -0.62 0.05 -0.53 0.32 0.91 0.99 -0.21
Spa_g49636 (MYC2)
-2.06 -0.09 -0.62 -0.94 0.34 -0.8 0.58 0.35 1.18 -0.38
-1.11 -0.53 0.01 -0.74 0.07 -0.67 0.28 0.73 0.94 -0.38
Spa_g49852 (DDL)
-0.55 -0.37 0.13 -0.28 0.09 -0.28 0.15 0.38 0.58 -0.27
-0.76 -0.41 -0.08 -0.65 -0.04 -0.62 0.0 0.78 1.02 -0.48
-1.7 -0.48 -0.69 -1.16 0.3 -0.98 0.51 0.79 1.04 -0.06
Spa_g50633 (PUB49)
-0.9 -0.31 -0.1 -0.34 0.1 -0.24 0.2 0.47 0.8 -0.43
-1.9 -1.12 -0.56 -1.14 0.01 -1.26 0.1 1.25 1.39 -0.63
-0.22 -0.1 0.08 -1.13 -0.16 -0.96 -0.02 0.74 0.81 -0.18
-2.09 -0.59 -0.33 -1.02 0.29 -0.97 0.42 0.48 1.35 -0.32
Spa_g51867 (ALS)
-2.42 0.46 -1.37 -1.71 0.13 -1.5 0.33 0.93 1.39 -0.94
-0.41 0.05 0.27 -0.66 -0.06 -0.57 0.09 0.43 0.62 -0.34
-1.9 0.04 -0.88 -1.39 0.15 -1.15 0.34 0.89 1.14 -0.18
-0.7 0.37 -0.23 -0.9 0.23 -0.84 0.2 0.61 0.8 -0.84
-0.71 -0.58 0.18 -1.23 0.01 -1.1 0.2 0.55 1.11 -0.12
-0.88 -0.68 0.17 -0.96 -0.01 -0.94 0.24 0.63 0.95 0.02
-1.9 0.09 -0.25 -1.96 0.49 -1.21 0.53 0.76 0.99 -0.7
-0.22 -0.28 0.04 -0.54 0.15 -0.71 0.22 0.49 0.48 -0.13
-0.66 -0.24 -0.08 -0.92 -0.04 -0.92 0.26 0.86 0.9 -0.58
-1.08 -0.59 -0.3 -1.14 0.23 -1.02 0.35 0.67 1.19 -0.36
-1.48 -0.69 -0.69 -0.8 0.02 -0.86 0.25 0.8 1.32 -0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.