Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Spa_g00221 (PYM)
0.42 0.56 0.53 0.51 0.67 0.5 0.7 0.77 1.0 0.5
Spa_g00314 (TCTP)
0.19 0.33 0.34 0.27 0.51 0.28 0.57 0.57 1.0 0.35
0.19 0.38 0.34 0.14 0.42 0.11 0.51 0.74 1.0 0.33
0.3 0.52 0.46 0.43 0.77 0.47 0.85 0.85 1.0 0.46
0.51 0.75 0.66 0.41 0.82 0.37 0.85 0.98 1.0 0.59
0.25 0.62 0.57 0.16 0.45 0.21 0.57 0.85 1.0 0.28
Spa_g01957 (CPL4)
0.34 0.44 0.54 0.39 0.52 0.39 0.6 0.82 1.0 0.48
Spa_g01972 (IDN2)
0.36 0.65 0.71 0.39 0.64 0.44 0.62 0.91 1.0 0.4
Spa_g02611 (SLT1)
0.24 0.4 0.6 0.44 0.57 0.46 0.57 0.81 1.0 0.39
Spa_g02913 (UBP3)
0.17 0.27 0.36 0.37 0.64 0.37 0.69 0.73 1.0 0.49
0.5 0.72 0.57 0.4 0.75 0.46 0.77 0.7 1.0 0.46
0.05 0.27 0.24 0.06 0.28 0.07 0.42 0.37 1.0 0.08
0.38 0.57 0.62 0.46 0.71 0.5 0.76 0.75 1.0 0.58
0.34 0.5 0.68 0.48 0.58 0.56 0.6 0.9 1.0 0.45
Spa_g04380 (CKB1)
0.22 0.41 0.39 0.29 0.59 0.31 0.64 0.7 1.0 0.4
0.41 0.52 0.45 0.46 0.74 0.49 0.79 0.72 1.0 0.54
Spa_g04559 (GAS41)
0.48 0.58 0.6 0.53 0.77 0.56 0.84 0.8 1.0 0.56
Spa_g04738 (CDC48C)
0.25 0.37 0.51 0.23 0.58 0.24 0.64 0.96 1.0 0.5
0.14 0.25 0.23 0.18 0.37 0.1 0.42 0.73 1.0 0.15
0.19 0.39 0.45 0.23 0.49 0.26 0.65 0.8 1.0 0.23
0.27 0.53 0.59 0.34 0.75 0.37 0.79 0.8 1.0 0.49
0.44 0.58 0.73 0.52 0.67 0.63 0.74 0.97 1.0 0.57
Spa_g05222 (CPSF30)
0.33 0.51 0.57 0.35 0.52 0.4 0.59 0.78 1.0 0.47
Spa_g05381 (ECT5)
0.11 0.24 0.2 0.15 0.32 0.18 0.37 0.77 1.0 0.26
0.34 0.48 0.51 0.32 0.46 0.39 0.57 0.94 1.0 0.35
0.08 0.33 0.21 0.2 0.57 0.22 0.66 0.59 1.0 0.26
0.54 0.46 0.53 0.36 0.51 0.35 0.53 0.83 1.0 0.53
0.43 0.49 0.64 0.37 0.63 0.41 0.73 0.8 1.0 0.57
0.44 0.47 0.58 0.3 0.54 0.32 0.56 0.89 1.0 0.43
0.36 0.5 0.53 0.32 0.66 0.35 0.75 0.62 1.0 0.49
0.2 0.17 0.21 0.13 0.34 0.14 0.37 0.75 1.0 0.25
0.42 0.64 0.51 0.42 0.65 0.43 0.7 0.9 1.0 0.48
0.12 0.25 0.24 0.17 0.47 0.29 0.65 0.54 1.0 0.37
Spa_g06888 (RPT6A)
0.25 0.35 0.33 0.35 0.52 0.32 0.56 0.68 1.0 0.36
Spa_g06947 (ZIG)
0.09 0.21 0.2 0.23 0.45 0.25 0.51 0.58 1.0 0.34
Spa_g07200 (FVE)
0.13 0.16 0.21 0.2 0.34 0.21 0.39 0.69 1.0 0.27
0.41 0.55 0.5 0.28 0.55 0.3 0.6 0.91 1.0 0.45
0.26 0.2 0.37 0.25 0.52 0.29 0.55 0.6 1.0 0.33
0.29 0.51 0.4 0.38 0.62 0.4 0.73 0.73 1.0 0.4
0.23 0.39 0.52 0.36 0.51 0.38 0.54 0.7 1.0 0.43
0.41 0.66 0.69 0.47 0.76 0.55 0.75 0.98 1.0 0.48
Spa_g07663 (U2A')
0.52 0.65 0.69 0.53 0.78 0.58 0.75 0.81 1.0 0.58
Spa_g07798 (MEE49)
0.31 0.32 0.39 0.4 0.48 0.4 0.48 0.67 1.0 0.4
0.43 0.64 0.65 0.45 0.59 0.44 0.61 0.87 1.0 0.46
Spa_g07837 (TPR2)
0.45 0.68 0.55 0.46 0.84 0.51 0.8 0.69 1.0 0.54
0.12 0.32 0.23 0.11 0.46 0.14 0.4 0.46 1.0 0.21
0.16 0.27 0.24 0.16 0.53 0.18 0.55 0.55 1.0 0.21
0.25 0.36 0.37 0.22 0.57 0.24 0.58 0.57 1.0 0.29
0.16 0.25 0.3 0.18 0.45 0.18 0.54 0.57 1.0 0.35
Spa_g07883 (GCN1)
0.22 0.44 0.41 0.35 0.64 0.41 0.69 0.62 1.0 0.43
Spa_g08100 (RPB2)
0.1 0.24 0.2 0.15 0.36 0.17 0.42 0.71 1.0 0.24
Spa_g08279 (SMU2)
0.34 0.42 0.42 0.37 0.54 0.37 0.57 0.87 1.0 0.44
0.34 0.57 0.55 0.48 0.78 0.51 0.8 0.77 1.0 0.54
0.25 0.5 0.49 0.29 0.51 0.29 0.54 0.91 1.0 0.36
Spa_g08554 (Y14)
0.28 0.43 0.51 0.41 0.68 0.42 0.74 0.75 1.0 0.53
0.34 0.57 0.68 0.43 0.59 0.48 0.62 0.93 1.0 0.49
Spa_g09288 (XRN3)
0.18 0.37 0.36 0.2 0.43 0.24 0.5 0.72 1.0 0.36
Spa_g09289 (EDM2)
0.47 0.66 0.63 0.31 0.52 0.34 0.57 1.0 0.94 0.4
0.06 0.16 0.15 0.1 0.31 0.1 0.36 0.82 1.0 0.18
0.14 0.37 0.27 0.19 0.52 0.23 0.57 0.76 1.0 0.3
Spa_g09873 (AL4)
0.15 0.31 0.35 0.18 0.35 0.2 0.4 0.57 1.0 0.27
Spa_g09882 (PHL1)
0.31 0.69 0.58 0.48 0.71 0.5 0.78 0.88 1.0 0.45
Spa_g09913 (TOPP4)
0.2 0.3 0.31 0.22 0.37 0.25 0.49 0.85 1.0 0.38
0.28 0.51 0.23 0.3 0.52 0.3 0.59 0.77 1.0 0.28
0.06 0.27 0.22 0.17 0.57 0.19 0.66 0.72 1.0 0.36
0.23 0.45 0.32 0.17 0.7 0.22 0.6 0.52 1.0 0.33
Spa_g10425 (ERF4)
0.17 0.43 0.33 0.36 0.66 0.37 0.66 0.81 1.0 0.41
0.4 0.55 0.67 0.31 0.47 0.31 0.49 1.0 0.96 0.5
0.15 0.29 0.27 0.18 0.46 0.18 0.52 0.93 1.0 0.34
0.11 0.26 0.23 0.17 0.47 0.19 0.52 0.87 1.0 0.3
0.2 0.5 0.43 0.35 0.67 0.39 0.76 0.85 1.0 0.53
0.36 0.62 0.48 0.38 0.69 0.47 0.73 0.72 1.0 0.53
0.3 0.48 0.56 0.28 0.64 0.33 0.65 0.68 1.0 0.46
Spa_g11421 (GATA27)
0.05 0.2 0.16 0.19 0.39 0.19 0.47 0.42 1.0 0.2
0.23 0.44 0.39 0.28 0.69 0.3 0.73 0.63 1.0 0.36
Spa_g11581 (CYCT1;4)
0.3 0.3 0.5 0.3 0.58 0.31 0.63 0.83 1.0 0.39
Spa_g11978 (SCL30A)
0.52 0.57 0.65 0.42 0.74 0.53 0.68 0.98 1.0 0.52
Spa_g12056 (VAC1)
0.17 0.45 0.42 0.12 0.44 0.17 0.52 0.53 1.0 0.27
0.31 0.41 0.46 0.23 0.57 0.26 0.56 0.64 1.0 0.47
0.33 0.3 0.44 0.29 0.46 0.28 0.52 0.87 1.0 0.38
Spa_g12756 (MIRO1)
0.28 0.41 0.4 0.32 0.55 0.33 0.57 0.83 1.0 0.42
0.33 0.5 0.48 0.32 0.59 0.3 0.63 0.87 1.0 0.45
Spa_g13108 (U2AF35B)
0.44 0.5 0.7 0.55 0.72 0.6 0.75 0.9 1.0 0.61
0.17 0.44 0.33 0.31 0.58 0.3 0.6 0.77 1.0 0.37
0.1 0.12 0.12 0.06 0.43 0.1 0.49 0.65 1.0 0.33
0.2 0.4 0.49 0.41 0.6 0.39 0.64 0.71 1.0 0.42
0.29 0.55 0.59 0.37 0.55 0.33 0.6 0.83 1.0 0.41
0.16 0.51 0.53 0.38 0.57 0.43 0.5 0.83 1.0 0.29
0.25 0.52 0.41 0.24 0.61 0.28 0.67 0.68 1.0 0.33
Spa_g14927 (VPS28-2)
0.33 0.52 0.34 0.35 0.61 0.39 0.66 0.71 1.0 0.46
Spa_g15124 (CUM1)
0.38 0.44 0.47 0.42 0.61 0.41 0.65 0.81 1.0 0.47
0.4 0.45 0.53 0.33 0.59 0.42 0.65 0.75 1.0 0.53
0.29 0.54 0.62 0.27 0.38 0.27 0.46 0.96 1.0 0.45
0.13 0.27 0.31 0.15 0.45 0.16 0.51 0.68 1.0 0.3
0.15 0.33 0.33 0.21 0.54 0.21 0.61 0.63 1.0 0.37
0.16 0.5 0.3 0.34 0.62 0.35 0.67 0.62 1.0 0.39
0.48 0.51 0.57 0.47 0.68 0.47 0.71 0.83 1.0 0.48
0.5 0.49 0.6 0.38 0.64 0.37 0.67 0.92 1.0 0.56
0.49 0.56 0.49 0.27 0.42 0.31 0.49 0.78 1.0 0.4
0.36 0.53 0.71 0.37 0.61 0.42 0.64 0.91 1.0 0.34
0.36 0.52 0.62 0.31 0.62 0.33 0.65 0.82 1.0 0.5
Spa_g18068 (HD1)
0.64 0.5 0.72 0.44 0.54 0.41 0.62 1.0 0.98 0.6
0.34 0.38 0.62 0.36 0.57 0.41 0.57 1.0 0.93 0.35
0.28 0.51 0.3 0.34 0.53 0.39 0.55 0.65 1.0 0.35
Spa_g19168 (SR30)
0.26 0.29 0.34 0.3 0.44 0.36 0.49 0.55 1.0 0.34
0.12 0.22 0.22 0.2 0.37 0.19 0.43 0.73 1.0 0.28
Spa_g19306 (U2AF35B)
0.21 0.5 0.6 0.4 0.56 0.47 0.68 0.91 1.0 0.25
0.27 0.43 0.48 0.34 0.65 0.37 0.67 0.84 1.0 0.46
Spa_g20774 (MED21)
0.23 0.2 0.33 0.31 0.46 0.36 0.53 0.66 1.0 0.4
Spa_g20926 (U2AF35B)
0.32 0.46 0.71 0.41 0.69 0.54 0.68 0.96 1.0 0.37
0.48 0.65 0.73 0.6 0.78 0.61 0.79 0.98 1.0 0.61
Spa_g22183 (CRF4)
0.08 0.1 0.18 0.1 0.4 0.12 0.54 0.7 1.0 0.34
0.07 0.18 0.16 0.17 0.37 0.19 0.46 0.5 1.0 0.28
0.4 0.37 0.69 0.33 0.7 0.29 0.66 0.99 1.0 0.59
0.51 0.71 0.7 0.41 0.67 0.47 0.61 1.0 0.97 0.55
0.22 0.38 0.26 0.08 0.48 0.09 0.36 0.54 1.0 0.15
0.53 0.35 0.62 0.36 0.48 0.37 0.5 0.86 1.0 0.45
0.49 0.54 0.65 0.37 0.66 0.41 0.77 0.88 1.0 0.52
0.22 0.59 0.41 0.15 0.65 0.16 0.77 0.92 1.0 0.19
0.4 0.65 0.57 0.39 0.58 0.4 0.64 0.87 1.0 0.42
0.38 0.46 0.59 0.34 0.65 0.36 0.66 0.75 1.0 0.45
Spa_g25581 (YUC11)
0.15 0.14 0.22 0.13 0.27 0.17 0.4 0.6 1.0 0.23
0.55 0.74 0.72 0.48 0.68 0.5 0.67 0.9 1.0 0.58
0.08 0.07 0.48 0.02 0.35 0.08 0.25 0.71 1.0 0.32
0.41 0.64 0.65 0.43 0.63 0.52 0.63 0.96 1.0 0.44
Spa_g28087 (TSN1)
0.12 0.31 0.44 0.23 0.53 0.32 0.67 0.83 1.0 0.42
0.59 0.59 0.71 0.33 0.6 0.34 0.62 0.95 1.0 0.6
0.06 0.25 0.24 0.1 0.48 0.14 0.47 0.64 1.0 0.37
0.31 0.52 0.45 0.25 0.65 0.26 0.7 0.91 1.0 0.39
0.27 0.43 0.45 0.31 0.56 0.39 0.68 0.86 1.0 0.53
0.06 0.39 0.35 0.01 0.08 0.03 0.08 0.86 1.0 0.14
0.07 0.42 0.49 0.04 0.18 0.08 0.26 0.97 1.0 0.15
0.56 0.59 0.72 0.29 0.58 0.32 0.59 0.97 1.0 0.59
0.17 0.52 0.33 0.38 0.65 0.43 0.71 0.6 1.0 0.36
0.45 0.42 0.59 0.33 0.56 0.39 0.68 0.83 1.0 0.51
0.18 0.52 0.22 0.21 0.58 0.27 0.63 0.56 1.0 0.21
0.21 0.29 0.47 0.31 0.54 0.3 0.58 0.83 1.0 0.4
0.37 0.62 0.61 0.4 0.55 0.45 0.59 1.0 0.98 0.43
0.31 0.45 0.58 0.28 0.49 0.32 0.52 0.88 1.0 0.32
0.38 0.68 0.69 0.44 0.64 0.46 0.68 0.89 1.0 0.5
0.24 0.43 0.37 0.12 0.42 0.17 0.5 1.0 0.76 0.12
0.21 0.39 0.38 0.25 0.59 0.37 0.67 0.85 1.0 0.53
0.2 0.3 0.3 0.28 0.52 0.34 0.54 0.57 1.0 0.33
0.08 0.07 0.3 0.14 0.54 0.12 0.54 0.78 1.0 0.26
0.11 0.15 0.44 0.2 0.36 0.18 0.27 0.69 1.0 0.35
0.16 0.3 0.3 0.23 0.53 0.26 0.57 0.89 1.0 0.36
0.16 0.33 0.22 0.21 0.51 0.23 0.56 0.58 1.0 0.26
Spa_g49371 (SIZ1)
0.18 0.25 0.4 0.33 0.52 0.35 0.63 0.94 1.0 0.43
Spa_g49636 (MYC2)
0.11 0.41 0.29 0.23 0.56 0.25 0.66 0.56 1.0 0.34
0.24 0.36 0.53 0.31 0.55 0.33 0.63 0.86 1.0 0.4
Spa_g49852 (DDL)
0.46 0.52 0.73 0.55 0.71 0.55 0.74 0.87 1.0 0.55
0.29 0.37 0.47 0.31 0.48 0.32 0.5 0.85 1.0 0.35
0.15 0.35 0.3 0.22 0.6 0.25 0.69 0.84 1.0 0.47
Spa_g50633 (PUB49)
0.31 0.47 0.54 0.46 0.62 0.49 0.66 0.8 1.0 0.43
0.1 0.18 0.26 0.17 0.39 0.16 0.41 0.91 1.0 0.25
0.49 0.53 0.6 0.26 0.51 0.29 0.56 0.96 1.0 0.5
0.09 0.26 0.31 0.19 0.48 0.2 0.52 0.55 1.0 0.31
Spa_g51867 (ALS)
0.07 0.53 0.15 0.12 0.42 0.13 0.48 0.73 1.0 0.2
0.49 0.67 0.78 0.41 0.62 0.44 0.69 0.87 1.0 0.51
0.12 0.47 0.25 0.17 0.5 0.2 0.57 0.84 1.0 0.4
0.35 0.74 0.49 0.31 0.68 0.32 0.66 0.87 1.0 0.32
0.28 0.31 0.52 0.2 0.46 0.22 0.53 0.68 1.0 0.42
0.28 0.32 0.58 0.27 0.51 0.27 0.61 0.8 1.0 0.52
0.14 0.54 0.42 0.13 0.71 0.22 0.73 0.85 1.0 0.31
0.61 0.59 0.74 0.49 0.79 0.44 0.83 1.0 1.0 0.65
0.34 0.45 0.51 0.28 0.52 0.28 0.64 0.98 1.0 0.36
0.21 0.29 0.36 0.2 0.51 0.22 0.56 0.69 1.0 0.34
0.14 0.25 0.25 0.23 0.41 0.22 0.48 0.7 1.0 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)