1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
1.0 0.88 0.26 0.25 0.18 0.22 0.14 0.25 0.15 0.11
Spa_g00094 (SEP1)
 0.89 1.0 0.28 0.35 0.24 0.32 0.22 0.15 0.18 0.12
0.82 1.0 0.16 0.27 0.23 0.26 0.19 0.15 0.15 0.07
1.0 0.87 0.24 0.41 0.26 0.37 0.21 0.17 0.11 0.09
1.0 0.88 0.27 0.36 0.22 0.34 0.2 0.2 0.18 0.13
1.0 0.99 0.24 0.34 0.26 0.34 0.21 0.21 0.2 0.12
0.99 1.0 0.17 0.22 0.14 0.2 0.13 0.19 0.13 0.06
0.89 1.0 0.28 0.25 0.24 0.24 0.21 0.22 0.16 0.14
Spa_g02789 (LHB1B2)
 1.0 0.75 0.07 0.05 0.04 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01
Spa_g02826 (OEC33)
 1.0 0.91 0.07 0.19 0.05 0.13 0.02 0.1 0.01 0.0
0.9 1.0 0.23 0.23 0.13 0.28 0.15 0.01 0.1 0.0
Spa_g03449 (LHB1B2)
 1.0 0.87 0.23 0.39 0.25 0.29 0.18 0.09 0.1 0.02
1.0 0.88 0.2 0.27 0.17 0.27 0.15 0.1 0.09 0.07
Spa_g04007 (PSB27)
 0.97 1.0 0.13 0.21 0.11 0.15 0.06 0.1 0.04 0.02
1.0 0.85 0.22 0.33 0.18 0.23 0.19 0.41 0.18 0.1
1.0 0.94 0.22 0.39 0.19 0.31 0.16 0.18 0.14 0.11
1.0 0.79 0.18 0.23 0.17 0.18 0.17 0.34 0.17 0.09
0.82 1.0 0.19 0.29 0.15 0.24 0.12 0.09 0.07 0.07
Spa_g04655 (TWN3)
 1.0 0.92 0.19 0.27 0.2 0.23 0.15 0.21 0.11 0.08
Spa_g04656 (TWN3)
 0.95 1.0 0.25 0.33 0.22 0.24 0.17 0.23 0.17 0.15
Spa_g04749 (CHLM)
 1.0 0.93 0.13 0.12 0.13 0.09 0.11 0.17 0.07 0.01
1.0 0.92 0.16 0.33 0.12 0.27 0.12 0.38 0.18 0.06
1.0 0.9 0.18 0.3 0.16 0.26 0.13 0.22 0.13 0.06
Spa_g04945 (LHCA2)
 0.89 1.0 0.11 0.45 0.11 0.33 0.07 0.15 0.08 0.02
Spa_g04947 (LHCB5)
 0.85 1.0 0.13 0.33 0.15 0.29 0.12 0.22 0.07 0.01
1.0 0.8 0.22 0.34 0.17 0.3 0.16 0.2 0.14 0.1
0.91 1.0 0.4 0.36 0.2 0.34 0.2 0.42 0.23 0.16
Spa_g05331 (PSB27)
 1.0 0.93 0.1 0.38 0.14 0.22 0.11 0.14 0.13 0.02
Spa_g05418 (APX4)
 1.0 0.72 0.18 0.26 0.14 0.23 0.14 0.28 0.14 0.1
Spa_g05570 (AVP1)
 1.0 0.73 0.07 0.28 0.09 0.26 0.04 0.03 0.0 0.0
0.92 1.0 0.22 0.29 0.2 0.26 0.16 0.17 0.11 0.09
Spa_g05629 (Deg1)
 0.87 1.0 0.19 0.32 0.15 0.29 0.13 0.14 0.12 0.12
1.0 0.69 0.12 0.2 0.14 0.16 0.14 0.09 0.05 0.05
Spa_g05781 (RPL9)
 1.0 0.81 0.2 0.34 0.2 0.35 0.15 0.32 0.17 0.07
0.86 1.0 0.13 0.27 0.1 0.2 0.09 0.21 0.09 0.04
Spa_g06473 (RPL15)
 1.0 0.95 0.16 0.3 0.15 0.23 0.11 0.12 0.05 0.07
Spa_g06559 (CYP38)
 1.0 0.89 0.21 0.28 0.13 0.22 0.11 0.26 0.1 0.09
Spa_g06611 (HEME2)
 1.0 0.75 0.2 0.25 0.13 0.2 0.11 0.18 0.09 0.05
1.0 0.75 0.36 0.35 0.27 0.32 0.24 0.2 0.21 0.2
1.0 0.83 0.34 0.33 0.3 0.29 0.25 0.24 0.21 0.17
Spa_g07161 (SECE1)
 1.0 0.81 0.28 0.36 0.22 0.28 0.18 0.17 0.16 0.14
1.0 0.82 0.22 0.31 0.18 0.29 0.14 0.13 0.09 0.16
1.0 0.83 0.32 0.35 0.16 0.26 0.15 0.15 0.12 0.14
Spa_g07561 (ATPD)
 0.86 1.0 0.1 0.17 0.07 0.15 0.04 0.06 0.02 0.01
Spa_g07743 (RPS1)
 1.0 0.76 0.3 0.3 0.21 0.29 0.19 0.19 0.16 0.17
Spa_g07765 (UVR3)
 0.92 1.0 0.25 0.28 0.19 0.29 0.13 0.26 0.06 0.09
Spa_g08046 (LHCA5)
 0.95 1.0 0.17 0.29 0.14 0.27 0.1 0.11 0.06 0.07
0.84 1.0 0.18 0.17 0.15 0.16 0.12 0.08 0.06 0.06
Spa_g08465 (CP31)
 1.0 0.91 0.29 0.33 0.29 0.34 0.28 0.24 0.21 0.15
Spa_g08718 (RPL12-C)
 0.89 1.0 0.24 0.38 0.24 0.35 0.2 0.22 0.2 0.08
Spa_g08728 (RPL4)
 1.0 0.8 0.14 0.23 0.14 0.19 0.12 0.27 0.15 0.05
1.0 0.84 0.25 0.31 0.2 0.31 0.17 0.11 0.11 0.1
Spa_g09685 (LPA1)
 0.91 1.0 0.37 0.37 0.27 0.41 0.28 0.33 0.27 0.18
Spa_g09692 (SPS1)
 1.0 0.99 0.39 0.22 0.1 0.21 0.08 0.4 0.13 0.12
1.0 0.79 0.15 0.16 0.07 0.12 0.04 0.14 0.02 0.02
Spa_g10009 (CSP41A)
 0.89 1.0 0.08 0.22 0.06 0.17 0.04 0.1 0.03 0.01
0.85 1.0 0.4 0.44 0.35 0.42 0.35 0.3 0.32 0.21
0.81 1.0 0.18 0.26 0.15 0.23 0.15 0.14 0.11 0.09
1.0 0.69 0.26 0.28 0.22 0.27 0.19 0.23 0.18 0.17
Spa_g11042 (emb2394)
 1.0 0.99 0.22 0.35 0.21 0.28 0.2 0.2 0.16 0.09
0.89 1.0 0.28 0.29 0.24 0.27 0.24 0.16 0.17 0.11
Spa_g11354 (HCF106)
 0.95 1.0 0.25 0.37 0.31 0.36 0.32 0.24 0.3 0.15
0.91 1.0 0.13 0.15 0.04 0.13 0.02 0.03 0.01 0.02
1.0 0.84 0.09 0.19 0.17 0.17 0.11 0.32 0.06 0.04
1.0 0.65 0.12 0.14 0.11 0.13 0.08 0.07 0.06 0.06
Spa_g11701 (AMT1;2)
 0.87 1.0 0.12 0.19 0.07 0.18 0.05 0.1 0.02 0.01
1.0 0.9 0.26 0.35 0.23 0.33 0.2 0.29 0.22 0.11
Spa_g11754 (PSAO)
 0.86 1.0 0.13 0.34 0.12 0.21 0.08 0.15 0.06 0.01
Spa_g11755 (PSAO)
 0.84 1.0 0.11 0.28 0.13 0.17 0.09 0.2 0.07 0.02
1.0 0.89 0.15 0.33 0.09 0.26 0.08 0.16 0.05 0.04
Spa_g12334 (PPOX)
 1.0 0.84 0.26 0.33 0.25 0.34 0.23 0.36 0.27 0.18
Spa_g12575 (LHCB2)
 0.83 1.0 0.26 0.3 0.2 0.27 0.13 0.09 0.05 0.01
Spa_g12576 (LHCB2)
 0.91 1.0 0.16 0.3 0.2 0.25 0.13 0.08 0.05 0.0
Spa_g12577 (LHCB2)
 0.8 1.0 0.11 0.2 0.17 0.14 0.09 0.06 0.02 0.01
1.0 0.91 0.24 0.41 0.17 0.37 0.17 0.27 0.16 0.11
1.0 0.79 0.25 0.32 0.19 0.28 0.15 0.33 0.18 0.13
0.93 1.0 0.26 0.25 0.2 0.24 0.2 0.16 0.12 0.15
Spa_g12995 (HCF136)
 1.0 0.96 0.16 0.33 0.11 0.26 0.08 0.08 0.05 0.06
1.0 0.98 0.42 0.42 0.42 0.39 0.36 0.46 0.34 0.26
Spa_g13142 (CEST)
 0.9 1.0 0.3 0.28 0.15 0.26 0.13 0.11 0.09 0.08
1.0 0.94 0.3 0.25 0.27 0.25 0.26 0.28 0.21 0.14
1.0 0.9 0.16 0.21 0.1 0.21 0.08 0.05 0.05 0.03
0.75 1.0 0.28 0.27 0.24 0.22 0.2 0.14 0.1 0.1
1.0 0.98 0.15 0.2 0.16 0.16 0.14 0.13 0.08 0.09
Spa_g14970 (AMT1;2)
 0.92 1.0 0.05 0.17 0.05 0.16 0.02 0.02 0.0 0.01
1.0 0.7 0.13 0.21 0.08 0.18 0.07 0.06 0.08 0.04
1.0 0.82 0.22 0.19 0.22 0.15 0.2 0.29 0.19 0.07
0.87 1.0 0.1 0.31 0.13 0.23 0.09 0.09 0.03 0.01
Spa_g15828 (UGT85A4)
 1.0 0.92 0.2 0.12 0.05 0.12 0.02 0.19 0.14 0.03
1.0 0.99 0.24 0.26 0.24 0.28 0.22 0.48 0.27 0.12
0.98 1.0 0.38 0.39 0.33 0.37 0.36 0.22 0.31 0.35
Spa_g16044 (SKL2)
 1.0 0.71 0.27 0.22 0.22 0.25 0.23 0.19 0.2 0.1
Spa_g16166 (SIGB)
 1.0 0.85 0.28 0.36 0.25 0.34 0.2 0.22 0.13 0.14
Spa_g16220 (PRPL11)
 1.0 0.66 0.19 0.2 0.08 0.18 0.06 0.07 0.05 0.04
1.0 0.86 0.23 0.4 0.23 0.37 0.19 0.39 0.24 0.17
1.0 0.78 0.22 0.28 0.16 0.29 0.11 0.14 0.11 0.07
Spa_g16729 (LHCB2)
 1.0 0.72 0.38 0.28 0.18 0.25 0.12 0.09 0.11 0.08
0.98 1.0 0.28 0.38 0.22 0.31 0.18 0.18 0.12 0.07
Spa_g17586 (GC1)
 1.0 0.88 0.13 0.2 0.07 0.18 0.05 0.15 0.05 0.03
1.0 0.73 0.15 0.16 0.13 0.13 0.12 0.1 0.05 0.15
Spa_g17778 (LHCB3)
 0.74 1.0 0.08 0.16 0.14 0.14 0.09 0.06 0.04 0.01
1.0 1.0 0.1 0.25 0.07 0.22 0.06 0.07 0.03 0.03
1.0 0.84 0.24 0.25 0.23 0.21 0.17 0.14 0.11 0.09
1.0 0.78 0.36 0.41 0.3 0.39 0.27 0.44 0.38 0.21
1.0 0.98 0.34 0.37 0.28 0.35 0.27 0.43 0.26 0.2
0.75 1.0 0.1 0.23 0.12 0.19 0.05 0.08 0.04 0.04
Spa_g18930 (PGM)
 1.0 0.89 0.37 0.32 0.22 0.34 0.21 0.22 0.32 0.14
0.96 1.0 0.43 0.44 0.29 0.38 0.25 0.44 0.32 0.14
Spa_g19121 (SFD4)
 0.87 1.0 0.2 0.25 0.19 0.23 0.16 0.26 0.13 0.14
0.96 1.0 0.35 0.45 0.27 0.43 0.27 0.33 0.3 0.19
Spa_g21350 (LHB1B2)
 1.0 0.98 0.17 0.26 0.28 0.21 0.21 0.07 0.09 0.02
Spa_g21623 (PSB28)
 0.84 1.0 0.18 0.25 0.15 0.25 0.13 0.2 0.14 0.08
Spa_g22371 (LHCB2)
 0.84 1.0 0.11 0.2 0.19 0.17 0.11 0.05 0.01 0.0
Spa_g22930 (ACSF)
 1.0 0.78 0.31 0.32 0.18 0.34 0.14 0.21 0.15 0.06
1.0 0.67 0.2 0.18 0.15 0.18 0.1 0.13 0.12 0.05
1.0 0.88 0.28 0.36 0.3 0.34 0.19 0.16 0.23 0.22
1.0 0.95 0.3 0.35 0.28 0.31 0.26 0.38 0.25 0.13
1.0 0.9 0.24 0.28 0.21 0.31 0.2 0.18 0.3 0.1
1.0 0.85 0.2 0.23 0.09 0.33 0.11 0.21 0.07 0.07
1.0 0.91 0.39 0.34 0.33 0.38 0.32 0.39 0.32 0.2
Spa_g26242 (RPL9)
 1.0 0.83 0.15 0.34 0.21 0.27 0.14 0.33 0.14 0.08
1.0 0.98 0.18 0.31 0.08 0.23 0.06 0.11 0.07 0.06
Spa_g29201 (PSBX)
 1.0 0.88 0.13 0.32 0.06 0.24 0.04 0.23 0.05 0.08
Spa_g29645 (LHCB3)
 1.0 0.72 0.36 0.27 0.11 0.24 0.05 0.12 0.06 0.01
1.0 0.87 0.16 0.27 0.21 0.27 0.2 0.12 0.14 0.11
0.95 1.0 0.28 0.31 0.23 0.3 0.21 0.41 0.32 0.13
1.0 0.86 0.22 0.43 0.26 0.4 0.23 0.37 0.25 0.11
1.0 0.81 0.34 0.47 0.35 0.44 0.31 0.35 0.32 0.27
0.87 1.0 0.32 0.37 0.26 0.32 0.25 0.28 0.19 0.11
Spa_g41881 (LHB1B2)
 0.86 1.0 0.17 0.19 0.2 0.13 0.12 0.08 0.05 0.05
1.0 0.8 0.2 0.22 0.29 0.21 0.29 0.18 0.24 0.13
Spa_g42268 (CP24)
 0.95 1.0 0.17 0.42 0.14 0.39 0.1 0.26 0.08 0.07
Spa_g43709 (NPQ1)
 0.93 1.0 0.32 0.39 0.23 0.38 0.18 0.22 0.13 0.11
Spa_g46739 (PSRP5)
 0.99 1.0 0.28 0.36 0.27 0.33 0.23 0.39 0.24 0.2
Spa_g46754 (PSRP4)
 1.0 0.78 0.23 0.37 0.16 0.33 0.13 0.12 0.09 0.1
1.0 0.7 0.25 0.18 0.2 0.18 0.17 0.1 0.11 0.12
Spa_g48114 (CS17)
 1.0 0.75 0.15 0.19 0.1 0.15 0.09 0.11 0.08 0.05
1.0 0.86 0.23 0.26 0.14 0.25 0.14 0.25 0.2 0.1
0.91 1.0 0.32 0.32 0.2 0.31 0.18 0.21 0.18 0.13
1.0 0.79 0.21 0.3 0.18 0.21 0.15 0.17 0.08 0.09
1.0 0.87 0.24 0.31 0.17 0.25 0.14 0.18 0.21 0.11
Spa_g50863 (FKBP13)
 0.92 1.0 0.22 0.26 0.16 0.21 0.14 0.4 0.24 0.12
Spa_g50931 (LHCB4.1)
 0.9 1.0 0.08 0.34 0.1 0.23 0.06 0.05 0.03 0.01
Spa_g51015 (GDC1)
 1.0 0.69 0.24 0.27 0.23 0.26 0.18 0.2 0.2 0.13
Spa_g51028 (LPA19)
 0.84 1.0 0.13 0.16 0.05 0.12 0.04 0.07 0.05 0.02
1.0 0.76 0.13 0.2 0.06 0.19 0.04 0.03 0.01 0.03
1.0 0.74 0.18 0.21 0.31 0.19 0.26 0.18 0.24 0.1
1.0 0.91 0.37 0.32 0.27 0.35 0.16 0.31 0.25 0.15
Spa_g51870 (HEMC)
 1.0 0.71 0.23 0.19 0.18 0.25 0.14 0.17 0.1 0.04
1.0 0.9 0.18 0.47 0.26 0.39 0.19 0.32 0.2 0.09
1.0 1.0 0.17 0.44 0.1 0.4 0.07 0.25 0.09 0.04
0.78 1.0 0.11 0.19 0.22 0.16 0.09 0.05 0.03 0.0
1.0 0.96 0.43 0.48 0.3 0.44 0.26 0.39 0.26 0.23
Spa_g53717 (OEC33)
 0.82 1.0 0.08 0.21 0.14 0.16 0.1 0.11 0.06 0.03
1.0 0.89 0.16 0.3 0.19 0.29 0.17 0.21 0.13 0.1
1.0 0.91 0.13 0.03 0.03 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01
1.0 0.91 0.39 0.24 0.18 0.26 0.14 0.4 0.21 0.1
Spa_g54810 (CSD2)
 0.92 1.0 0.22 0.41 0.15 0.33 0.12 0.24 0.14 0.11
Spa_g54890 (CP24)
 1.0 0.86 0.1 0.36 0.07 0.29 0.04 0.09 0.04 0.01
1.0 0.96 0.34 0.35 0.2 0.4 0.14 0.19 0.16 0.22
1.0 0.74 0.08 0.28 0.1 0.22 0.04 0.01 0.0 0.01
Spa_g56297 (LHCB3)
 0.77 1.0 0.06 0.16 0.22 0.13 0.12 0.09 0.06 0.03
1.0 0.75 0.11 0.14 0.06 0.09 0.04 0.21 0.07 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)