1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
566.87 500.55 146.62 143.91 103.41 126.16 78.9 143.83 84.04 62.28
Spa_g00094 (SEP1)
 193.88 217.89 61.25 76.16 51.99 68.82 47.01 33.45 38.78 26.82
239.11 293.21 48.19 80.15 66.23 75.95 55.16 44.05 43.05 19.18
208.67 181.82 49.42 85.46 55.18 77.68 44.26 36.2 23.38 18.66
74.23 65.43 20.4 26.67 16.05 25.16 14.66 14.89 13.22 9.62
300.84 297.37 71.22 101.68 77.03 100.84 63.73 62.89 61.62 37.43
121.85 122.49 20.82 27.42 17.66 24.23 15.88 23.67 16.31 7.91
94.31 105.82 30.09 26.32 25.18 25.58 22.47 23.63 17.28 14.81
Spa_g02789 (LHB1B2)
 1475.39 1109.12 107.23 73.46 53.88 41.07 23.63 44.94 11.49 8.7
Spa_g02826 (OEC33)
 309.57 282.7 20.77 59.32 14.03 39.72 5.35 31.24 3.41 1.3
120.56 134.01 30.51 30.3 16.96 36.92 19.99 1.85 12.97 0.23
Spa_g03449 (LHB1B2)
 1045.99 906.15 245.37 405.07 260.68 298.51 186.24 94.87 103.05 17.04
197.05 172.78 38.87 53.64 32.86 53.19 29.51 19.07 17.2 13.54
Spa_g04007 (PSB27)
 105.95 108.97 14.64 22.35 11.58 16.85 7.04 10.57 4.76 2.42
88.49 74.91 19.48 29.42 15.96 20.58 16.74 36.24 15.71 9.26
231.7 217.43 50.39 91.52 43.22 71.94 36.69 41.52 32.86 24.58
166.02 130.5 30.64 38.35 28.64 29.78 28.55 55.86 27.81 15.67
214.36 261.02 49.4 74.58 39.93 61.96 32.23 23.73 19.42 19.43
Spa_g04655 (TWN3)
 96.58 89.21 18.69 26.47 18.84 22.33 14.76 20.0 10.98 7.71
Spa_g04656 (TWN3)
 29.56 31.03 7.75 10.18 6.76 7.35 5.24 7.18 5.27 4.76
Spa_g04749 (CHLM)
 69.78 64.57 8.87 8.62 9.06 6.44 7.83 11.62 4.72 1.0
165.44 151.46 25.97 54.64 20.3 43.91 19.28 62.54 29.15 10.41
63.35 56.79 11.46 19.01 10.39 16.33 8.27 13.86 8.32 3.93
Spa_g04945 (LHCA2)
 326.4 366.55 40.6 163.33 38.62 122.71 25.21 54.98 27.66 8.19
Spa_g04947 (LHCB5)
 862.34 1015.04 127.33 331.53 155.26 294.1 117.46 225.91 70.0 13.77
185.94 149.6 40.2 62.33 32.08 56.14 29.47 37.74 25.53 17.75
25.03 27.45 11.11 9.94 5.54 9.45 5.57 11.44 6.29 4.28
Spa_g05331 (PSB27)
 70.75 66.09 7.1 26.67 10.09 15.57 7.81 9.84 9.24 1.24
Spa_g05418 (APX4)
 58.34 42.17 10.65 15.18 8.16 13.41 8.2 16.07 8.06 5.7
Spa_g05570 (AVP1)
 31.47 22.87 2.23 8.74 2.84 8.04 1.17 1.09 0.1 0.06
36.26 39.54 8.85 11.44 8.1 10.35 6.41 6.53 4.19 3.38
Spa_g05629 (Deg1)
 18.7 21.52 4.13 6.91 3.15 6.16 2.77 3.09 2.52 2.53
39.25 26.91 4.88 8.02 5.6 6.43 5.54 3.5 1.77 1.88
Spa_g05781 (RPL9)
 30.25 24.5 6.2 10.14 6.0 10.68 4.67 9.69 5.21 2.27
196.0 228.38 29.51 61.87 23.8 46.38 20.49 47.13 20.5 9.97
Spa_g06473 (RPL15)
 148.95 142.11 23.56 44.4 22.13 34.19 15.67 17.75 7.81 10.25
Spa_g06559 (CYP38)
 26.08 23.2 5.55 7.38 3.4 5.71 2.88 6.67 2.64 2.43
Spa_g06611 (HEME2)
 82.54 62.08 16.4 20.86 10.79 16.62 9.29 14.56 7.51 4.25
108.73 81.25 39.22 37.84 28.83 34.7 26.17 21.3 22.58 22.2
12.42 10.35 4.18 4.06 3.69 3.57 3.06 2.92 2.58 2.11
Spa_g07161 (SECE1)
 35.22 28.69 9.79 12.67 7.66 10.0 6.28 6.05 5.51 5.05
7.38 6.05 1.62 2.3 1.34 2.12 1.06 0.98 0.64 1.16
9.85 8.2 3.15 3.43 1.53 2.61 1.51 1.47 1.18 1.42
Spa_g07561 (ATPD)
 268.25 311.67 32.22 51.54 21.27 45.82 13.88 19.2 6.73 1.65
Spa_g07743 (RPS1)
 67.49 51.01 20.47 20.42 13.93 19.26 12.53 12.51 10.77 11.18
Spa_g07765 (UVR3)
 20.66 22.35 5.49 6.23 4.21 6.54 3.0 5.7 1.37 2.01
Spa_g08046 (LHCA5)
 43.87 46.16 7.68 13.16 6.48 12.46 4.64 5.05 2.63 3.25
104.71 124.88 22.41 21.14 18.76 19.41 14.78 10.06 7.52 7.65
Spa_g08465 (CP31)
 283.93 258.02 81.99 93.93 82.21 95.12 80.81 67.79 60.03 43.18
Spa_g08718 (RPL12-C)
 267.33 300.74 73.52 112.79 71.2 105.98 59.84 66.31 59.26 24.46
Spa_g08728 (RPL4)
 154.53 124.1 22.33 35.53 21.27 29.08 18.75 41.69 22.54 8.19
43.63 36.65 10.8 13.45 8.8 13.53 7.35 5.01 4.95 4.33
Spa_g09685 (LPA1)
 13.74 15.14 5.56 5.6 4.06 6.23 4.22 5.0 4.02 2.75
Spa_g09692 (SPS1)
 20.57 20.45 7.98 4.63 2.11 4.25 1.7 8.22 2.64 2.45
63.73 50.41 9.64 10.36 4.19 7.58 2.26 9.01 1.06 1.53
Spa_g10009 (CSP41A)
 288.52 324.68 26.41 72.67 20.47 56.11 14.06 31.78 11.21 4.16
19.84 23.25 9.41 10.22 8.24 9.86 8.23 7.07 7.54 4.93
126.42 156.96 28.05 40.42 24.13 35.72 22.98 22.11 16.73 14.81
39.06 27.03 9.96 10.98 8.68 10.65 7.38 8.81 6.84 6.52
Spa_g11042 (emb2394)
 245.47 243.26 52.96 85.2 52.15 69.66 48.2 48.32 39.33 23.2
180.7 202.48 55.84 58.56 49.32 54.2 49.08 32.93 34.42 23.27
Spa_g11354 (HCF106)
 49.97 52.72 13.14 19.63 16.12 18.9 17.09 12.52 15.98 8.15
30.69 33.66 4.48 4.92 1.25 4.3 0.71 1.14 0.49 0.78
21.7 18.18 1.88 4.18 3.63 3.63 2.32 6.94 1.27 0.89
99.19 64.38 12.12 14.3 10.6 12.73 7.91 7.02 5.85 5.5
Spa_g11701 (AMT1;2)
 18.17 20.81 2.57 3.88 1.36 3.7 1.08 2.14 0.44 0.29
40.88 36.71 10.46 14.3 9.31 13.34 8.09 11.91 8.86 4.54
Spa_g11754 (PSAO)
 921.34 1070.11 134.67 361.23 130.68 225.34 81.84 159.32 61.59 14.36
Spa_g11755 (PSAO)
 1171.29 1402.6 158.58 386.26 176.59 242.16 121.64 280.0 95.85 24.18
45.29 40.46 7.0 14.72 4.02 11.57 3.45 7.3 2.19 1.89
Spa_g12334 (PPOX)
 30.21 25.28 7.72 10.05 7.52 10.36 6.86 10.8 8.19 5.46
Spa_g12575 (LHCB2)
 2994.87 3597.72 943.18 1086.51 731.15 977.65 458.98 335.97 197.17 41.65
Spa_g12576 (LHCB2)
 1764.23 1943.6 315.77 574.6 388.42 482.68 257.47 162.48 98.79 7.64
Spa_g12577 (LHCB2)
 834.63 1047.35 115.51 213.15 173.48 151.44 92.05 64.3 19.3 5.53
59.84 54.69 14.21 24.5 10.41 22.21 10.21 16.17 9.8 6.7
29.69 23.55 7.49 9.52 5.58 8.31 4.53 9.67 5.26 3.89
35.95 38.79 10.0 9.86 7.87 9.12 7.72 6.23 4.68 5.64
Spa_g12995 (HCF136)
 133.83 127.95 21.63 44.23 14.71 35.22 11.05 10.56 6.8 7.73
104.28 102.6 43.66 43.91 43.34 41.01 37.28 47.7 35.54 26.63
Spa_g13142 (CEST)
 54.3 60.04 17.74 16.9 9.29 15.47 8.08 6.78 5.11 4.77
9.18 8.62 2.77 2.28 2.47 2.31 2.41 2.57 1.91 1.27
67.82 61.17 10.59 14.56 6.71 14.33 5.53 3.67 3.2 2.24
69.49 92.39 26.3 25.22 21.99 20.76 18.43 12.85 9.3 9.52
243.59 239.22 35.62 47.97 37.94 40.18 33.67 31.24 20.55 21.37
Spa_g14970 (AMT1;2)
 53.34 57.86 2.68 9.65 2.95 9.48 1.2 1.12 0.28 0.34
17.44 12.14 2.24 3.72 1.42 3.12 1.16 0.97 1.33 0.78
40.71 33.44 9.02 7.54 8.84 6.2 8.0 11.77 7.63 2.86
316.43 365.07 37.56 112.97 45.81 84.43 33.12 31.46 12.32 5.45
Spa_g15828 (UGT85A4)
 11.44 10.5 2.31 1.4 0.63 1.4 0.22 2.22 1.61 0.31
25.0 24.76 5.93 6.55 5.93 6.96 5.4 12.0 6.63 2.98
53.59 54.84 20.71 21.59 18.07 20.15 19.75 12.21 17.12 19.19
Spa_g16044 (SKL2)
 17.93 12.75 4.91 4.01 3.92 4.54 4.09 3.47 3.51 1.76
Spa_g16166 (SIGB)
 37.23 31.53 10.54 13.24 9.32 12.65 7.38 8.28 4.82 5.28
Spa_g16220 (PRPL11)
 186.73 123.75 35.48 36.61 14.45 33.14 11.84 13.29 9.67 8.4
135.94 116.44 30.72 55.01 31.88 49.65 25.3 53.25 32.67 23.31
19.11 14.88 4.13 5.32 3.14 5.48 2.18 2.62 2.02 1.26
Spa_g16729 (LHCB2)
 56.1 40.19 21.08 15.86 10.29 14.06 6.77 4.97 6.23 4.31
22.64 23.14 6.53 8.72 5.19 7.19 4.08 4.14 2.69 1.6
Spa_g17586 (GC1)
 25.97 22.85 3.49 5.22 1.84 4.66 1.17 3.94 1.25 0.69
160.29 117.11 24.65 26.05 20.26 21.51 19.23 16.2 8.54 24.38
Spa_g17778 (LHCB3)
 680.99 914.43 75.27 149.49 130.95 124.87 79.75 50.83 35.79 13.59
181.31 181.14 17.5 45.91 13.51 39.4 10.14 13.31 5.36 5.34
59.74 50.29 14.34 14.7 13.89 12.4 10.04 8.56 6.7 5.41
222.8 174.69 80.66 92.24 65.87 87.21 60.89 97.16 85.59 46.73
19.09 18.69 6.42 7.04 5.35 6.72 5.22 8.21 5.02 3.79
11.25 14.95 1.43 3.41 1.84 2.85 0.82 1.14 0.56 0.55
Spa_g18930 (PGM)
 76.1 67.42 28.26 24.38 16.58 26.21 16.26 16.37 24.1 10.27
4.37 4.57 1.97 2.02 1.31 1.73 1.16 2.02 1.45 0.66
Spa_g19121 (SFD4)
 283.26 324.11 65.45 82.48 62.9 74.65 50.9 83.56 42.4 44.56
33.37 34.77 12.23 15.51 9.32 15.04 9.5 11.37 10.28 6.6
Spa_g21350 (LHB1B2)
 2848.71 2795.01 476.95 729.32 786.13 603.0 601.11 206.79 248.43 43.39
Spa_g21623 (PSB28)
 35.97 43.06 7.61 10.66 6.65 10.77 5.72 8.78 6.17 3.23
Spa_g22371 (LHCB2)
 465.93 552.64 59.18 110.81 106.46 95.05 58.17 27.45 7.66 1.97
Spa_g22930 (ACSF)
 55.91 43.74 17.11 17.93 9.96 19.06 7.89 11.93 8.13 3.36
200.02 133.67 40.63 35.27 30.47 35.63 20.23 27.0 24.0 10.89
34.39 30.12 9.59 12.44 10.31 11.58 6.49 5.35 8.05 7.67
449.9 425.23 134.15 158.26 127.5 139.65 116.11 169.63 113.11 57.41
79.18 71.15 19.28 22.32 16.37 24.34 15.44 14.22 23.55 8.1
9.01 7.62 1.85 2.09 0.85 3.0 0.96 1.86 0.65 0.6
15.38 14.0 6.02 5.19 5.08 5.92 4.95 6.04 4.95 3.01
Spa_g26242 (RPL9)
 28.22 23.32 4.36 9.73 6.05 7.51 3.91 9.42 3.83 2.23
54.84 53.48 9.82 16.99 4.25 12.59 3.02 5.81 3.96 3.21
Spa_g29201 (PSBX)
 129.81 114.28 17.46 41.52 8.06 31.18 5.76 29.58 6.89 10.1
Spa_g29645 (LHCB3)
 105.68 76.21 37.63 28.71 11.26 24.88 5.72 12.68 6.85 1.43
128.53 111.64 21.02 34.74 26.94 34.54 25.09 15.72 18.21 13.68
39.16 41.43 11.69 12.81 9.45 12.22 8.6 16.79 13.42 5.18
78.02 66.73 17.52 33.71 20.62 31.04 17.78 28.72 19.85 8.8
21.19 17.12 7.29 10.0 7.46 9.41 6.56 7.37 6.69 5.67
12.32 14.24 4.61 5.23 3.72 4.51 3.52 4.03 2.69 1.59
Spa_g41881 (LHB1B2)
 2863.44 3329.75 564.76 630.05 657.39 445.11 394.99 261.58 168.75 159.35
42.49 34.18 8.47 9.54 12.11 9.02 12.51 7.7 10.08 5.62
Spa_g42268 (CP24)
 147.64 155.76 26.89 66.15 22.53 60.41 15.53 39.98 12.56 10.75
Spa_g43709 (NPQ1)
 32.79 35.12 11.39 13.54 7.91 13.51 6.25 7.81 4.44 3.86
Spa_g46739 (PSRP5)
 200.57 203.32 56.02 73.66 54.33 67.51 46.04 80.11 49.77 39.78
Spa_g46754 (PSRP4)
 136.0 106.55 31.74 49.73 21.34 44.46 18.25 16.93 12.66 13.9
173.56 121.57 42.54 31.87 34.36 31.36 30.3 18.18 18.3 20.74
Spa_g48114 (CS17)
 264.88 198.93 40.06 49.12 27.44 40.21 25.15 30.2 21.47 12.21
14.77 12.73 3.45 3.89 2.09 3.71 2.0 3.62 2.9 1.49
24.81 27.22 8.64 8.76 5.33 8.48 4.85 5.63 4.91 3.65
65.26 51.51 13.56 19.8 11.77 13.83 9.91 11.01 5.01 5.59
37.94 33.17 9.21 11.76 6.28 9.42 5.44 6.76 7.92 4.17
Spa_g50863 (FKBP13)
 53.34 58.23 12.62 15.01 9.14 12.16 8.14 23.34 14.0 7.19
Spa_g50931 (LHCB4.1)
 929.8 1038.36 78.6 354.96 98.71 243.21 62.0 54.47 36.15 5.38
Spa_g51015 (GDC1)
 153.87 105.55 37.56 42.29 35.26 39.83 28.12 30.05 31.5 19.28
Spa_g51028 (LPA19)
 6.92 8.22 1.08 1.29 0.4 0.95 0.3 0.57 0.44 0.2
10.14 7.67 1.28 2.01 0.6 1.92 0.41 0.34 0.1 0.32
25.15 18.65 4.61 5.25 7.77 4.9 6.6 4.56 5.94 2.54
12.81 11.66 4.78 4.13 3.49 4.48 2.1 4.03 3.23 1.89
Spa_g51870 (HEMC)
 14.38 10.16 3.24 2.7 2.56 3.55 1.97 2.39 1.49 0.63
102.73 92.76 18.54 48.13 26.74 39.97 19.08 33.18 20.72 9.14
142.32 142.3 24.15 61.97 13.61 57.04 9.28 35.23 12.46 5.7
155.76 199.23 21.69 38.27 44.58 32.02 18.38 9.03 5.36 0.39
25.78 24.79 10.99 12.31 7.67 11.22 6.61 10.07 6.78 5.97
Spa_g53717 (OEC33)
 321.21 391.08 30.27 83.64 55.81 62.94 39.57 43.31 22.29 12.91
77.44 68.81 12.33 23.32 14.63 22.39 12.8 16.22 10.15 8.1
203.44 185.88 26.38 6.7 5.1 6.12 3.83 1.92 0.72 2.04
6.51 5.91 2.56 1.59 1.19 1.66 0.89 2.61 1.39 0.68
Spa_g54810 (CSD2)
 37.82 41.09 9.04 16.97 6.11 13.38 4.74 9.67 5.59 4.71
Spa_g54890 (CP24)
 164.52 141.62 16.73 58.47 12.24 47.84 6.5 14.81 6.09 0.86
7.36 7.08 2.47 2.61 1.48 2.92 1.03 1.4 1.2 1.64
47.36 34.82 3.66 13.44 4.67 10.39 1.75 0.63 0.05 0.35
Spa_g56297 (LHCB3)
 164.01 211.95 11.82 34.24 46.29 28.16 25.94 19.63 13.05 5.59
12.1 9.06 1.29 1.72 0.75 1.12 0.48 2.59 0.8 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)