Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g00162 (FdC1)	0.4	1.0	0.23	0.29	0.33	0.27	0.33	0.45	0.39	0.15
Spa_g00393	0.53	1.0	0.22	0.26	0.31	0.27	0.31	0.42	0.33	0.14
Spa_g03287	0.86	1.0	0.33	0.42	0.29	0.44	0.29	0.44	0.36	0.2
Spa_g04205	0.54	1.0	0.23	0.24	0.22	0.23	0.23	0.32	0.28	0.12
Spa_g04511	0.54	1.0	0.15	0.25	0.16	0.22	0.14	0.22	0.12	0.07
Spa_g04554	0.64	1.0	0.25	0.37	0.36	0.34	0.29	0.6	0.35	0.18
Spa_g04575 (SBE2.2)	0.33	1.0	0.21	0.29	0.29	0.32	0.32	0.36	0.34	0.17
Spa_g04595 (PNP)	0.49	1.0	0.22	0.2	0.27	0.2	0.26	0.4	0.33	0.1
Spa_g04708 (FTSH8)	0.4	1.0	0.14	0.25	0.19	0.25	0.18	0.34	0.23	0.07
Spa_g04793	0.56	1.0	0.38	0.32	0.26	0.34	0.28	0.46	0.29	0.19
Spa_g04939	0.65	1.0	0.2	0.24	0.2	0.21	0.15	0.49	0.24	0.05
Spa_g05150	0.55	1.0	0.11	0.17	0.13	0.14	0.11	0.2	0.14	0.06
Spa_g05535	0.42	1.0	0.11	0.13	0.12	0.1	0.08	0.25	0.03	0.0
Spa_g06152	0.52	1.0	0.07	0.13	0.14	0.13	0.1	0.11	0.05	0.01
Spa_g06304	0.84	1.0	0.35	0.42	0.35	0.47	0.28	0.46	0.25	0.21
Spa_g06532 (PRK)	0.51	1.0	0.13	0.23	0.12	0.21	0.08	0.2	0.06	0.0
Spa_g06581	0.32	1.0	0.25	0.25	0.3	0.29	0.29	0.32	0.35	0.19
Spa_g06629	0.46	1.0	0.1	0.35	0.1	0.27	0.07	0.28	0.16	0.02
Spa_g06691 (emb1138)	0.3	1.0	0.14	0.14	0.14	0.14	0.11	0.29	0.15	0.04
Spa_g07528 (MAP1D)	0.36	1.0	0.2	0.26	0.29	0.26	0.27	0.33	0.3	0.14
Spa_g07673 (ERS)	0.92	1.0	0.4	0.43	0.36	0.45	0.35	0.52	0.36	0.19
Spa_g07720	0.43	1.0	0.19	0.29	0.2	0.27	0.2	0.3	0.18	0.09
Spa_g07772	0.44	1.0	0.16	0.28	0.19	0.28	0.16	0.42	0.26	0.09
Spa_g07848 (ACSF)	0.52	1.0	0.07	0.19	0.11	0.15	0.07	0.26	0.09	0.02
Spa_g07976 (PAA2)	0.68	1.0	0.43	0.45	0.34	0.44	0.3	0.51	0.33	0.32
Spa_g08291	0.6	1.0	0.19	0.31	0.2	0.3	0.21	0.33	0.21	0.09
Spa_g08308	0.47	1.0	0.27	0.31	0.36	0.33	0.35	0.38	0.44	0.15
Spa_g08358 (GR2)	0.34	1.0	0.26	0.24	0.32	0.26	0.33	0.38	0.32	0.15
Spa_g08671	0.27	1.0	0.16	0.25	0.25	0.25	0.27	0.28	0.23	0.13
Spa_g08736	0.36	1.0	0.24	0.3	0.22	0.25	0.2	0.51	0.29	0.12
Spa_g08766 (OVA2)	0.52	1.0	0.26	0.3	0.31	0.31	0.31	0.42	0.43	0.16
Spa_g09010 (OK1)	0.48	1.0	0.31	0.25	0.32	0.27	0.32	0.46	0.35	0.23
Spa_g09508 (MAR1)	0.62	1.0	0.26	0.32	0.16	0.32	0.12	0.32	0.11	0.07
Spa_g09551	0.33	1.0	0.19	0.27	0.26	0.28	0.27	0.3	0.3	0.11
Spa_g09917	0.39	1.0	0.27	0.3	0.3	0.3	0.29	0.33	0.28	0.14
Spa_g10050	0.75	1.0	0.19	0.36	0.21	0.33	0.16	0.41	0.18	0.2
Spa_g10395	0.32	1.0	0.26	0.23	0.28	0.23	0.27	0.33	0.28	0.16
Spa_g11068	0.5	1.0	0.33	0.36	0.35	0.36	0.33	0.47	0.48	0.3
Spa_g11346	0.56	1.0	0.41	0.29	0.24	0.29	0.26	0.32	0.35	0.12
Spa_g11548	0.47	1.0	0.21	0.29	0.24	0.29	0.2	0.43	0.26	0.18
Spa_g12026 (HCF107)	0.58	1.0	0.29	0.36	0.23	0.33	0.19	0.39	0.22	0.12
Spa_g12321	0.43	1.0	0.3	0.31	0.34	0.34	0.32	0.44	0.44	0.19
Spa_g13340	0.59	1.0	0.37	0.4	0.38	0.42	0.35	0.52	0.4	0.2
Spa_g13380	0.55	1.0	0.25	0.32	0.19	0.29	0.22	0.43	0.24	0.12
Spa_g14098 (PGR5)	0.57	1.0	0.27	0.32	0.3	0.36	0.23	0.4	0.31	0.18
Spa_g14632	0.68	1.0	0.24	0.35	0.32	0.36	0.27	0.38	0.24	0.22
Spa_g14739 (emb2726)	0.64	1.0	0.22	0.26	0.22	0.24	0.22	0.29	0.31	0.13
Spa_g14866	0.54	1.0	0.08	0.23	0.14	0.2	0.09	0.19	0.07	0.01
Spa_g15163	0.72	1.0	0.28	0.36	0.36	0.3	0.28	0.47	0.39	0.15
Spa_g15501 (EMB2369)	0.49	1.0	0.23	0.22	0.19	0.23	0.16	0.27	0.25	0.14
Spa_g16041 (emb2738)	0.62	1.0	0.53	0.45	0.5	0.43	0.51	0.54	0.56	0.3
Spa_g16717 (CRM3)	0.44	1.0	0.11	0.15	0.07	0.14	0.06	0.2	0.05	0.01
Spa_g17218	0.57	1.0	0.08	0.1	0.06	0.08	0.05	0.25	0.06	0.03
Spa_g17299 (AGY1)	0.31	1.0	0.16	0.16	0.22	0.16	0.2	0.23	0.2	0.08
Spa_g17572 (RSR4)	0.24	1.0	0.12	0.11	0.08	0.1	0.07	0.24	0.14	0.09
Spa_g17715	0.67	1.0	0.13	0.21	0.1	0.15	0.07	0.35	0.1	0.03
Spa_g17964	0.68	1.0	0.32	0.39	0.25	0.41	0.24	0.43	0.22	0.15
Spa_g18968	0.67	1.0	0.29	0.25	0.15	0.21	0.1	0.36	0.12	0.13
Spa_g19012	0.53	1.0	0.16	0.28	0.13	0.22	0.1	0.2	0.1	0.05
Spa_g19053	0.39	1.0	0.14	0.26	0.23	0.27	0.22	0.31	0.21	0.08
Spa_g21293	0.59	1.0	0.14	0.24	0.09	0.19	0.08	0.28	0.08	0.04
Spa_g21337 (FFC)	0.6	1.0	0.29	0.32	0.27	0.31	0.26	0.37	0.41	0.14
Spa_g21430	0.44	1.0	0.24	0.22	0.18	0.2	0.13	0.22	0.31	0.06
Spa_g21718	0.43	1.0	0.28	0.29	0.29	0.3	0.27	0.41	0.48	0.1
Spa_g21915	0.55	1.0	0.08	0.15	0.15	0.14	0.1	0.1	0.05	0.0
Spa_g22044 (PPO2)	0.53	1.0	0.31	0.23	0.29	0.24	0.26	0.24	0.21	0.13
Spa_g22077 (ATATH8)	0.44	1.0	0.25	0.19	0.21	0.19	0.2	0.25	0.17	0.1
Spa_g22097	0.54	1.0	0.36	0.35	0.37	0.33	0.38	0.46	0.43	0.26
Spa_g22190	0.82	1.0	0.39	0.38	0.34	0.37	0.3	0.45	0.25	0.24
Spa_g22231	0.63	1.0	0.22	0.37	0.28	0.3	0.22	0.35	0.29	0.1
Spa_g22241 (PTAC4)	0.5	1.0	0.22	0.35	0.41	0.33	0.4	0.44	0.47	0.2
Spa_g23137 (CRSH)	0.37	1.0	0.29	0.31	0.3	0.31	0.32	0.28	0.29	0.14
Spa_g23563	0.3	1.0	0.09	0.12	0.11	0.16	0.09	0.23	0.07	0.05
Spa_g24240 (NSI)	0.39	1.0	0.19	0.14	0.19	0.13	0.15	0.3	0.29	0.07
Spa_g25217	0.43	1.0	0.13	0.14	0.14	0.13	0.11	0.23	0.13	0.07
Spa_g25293	0.24	1.0	0.1	0.18	0.14	0.17	0.11	0.19	0.14	0.02
Spa_g25498 (PSBQ)	0.57	1.0	0.1	0.26	0.18	0.2	0.14	0.24	0.13	0.03
Spa_g25539	0.39	1.0	0.32	0.35	0.37	0.35	0.32	0.45	0.31	0.23
Spa_g25804	0.47	1.0	0.39	0.43	0.33	0.45	0.3	0.46	0.34	0.17
Spa_g25843 (AAO3)	0.56	1.0	0.45	0.33	0.32	0.37	0.32	0.44	0.36	0.14
Spa_g26001 (RPT1)	0.74	1.0	0.4	0.35	0.33	0.4	0.3	0.41	0.27	0.18
Spa_g27297	0.63	1.0	0.25	0.31	0.22	0.28	0.18	0.32	0.16	0.11
Spa_g27344	0.63	1.0	0.1	0.19	0.17	0.18	0.12	0.24	0.09	0.03
Spa_g27603	0.56	1.0	0.09	0.22	0.18	0.2	0.13	0.17	0.07	0.02
Spa_g29868	0.52	1.0	0.08	0.12	0.18	0.15	0.12	0.18	0.07	0.0
Spa_g30430 (OVA5)	0.53	1.0	0.22	0.26	0.25	0.25	0.23	0.27	0.2	0.12
Spa_g31824	0.35	1.0	0.29	0.33	0.21	0.31	0.19	0.45	0.29	0.15
Spa_g32035	0.65	1.0	0.17	0.31	0.24	0.27	0.2	0.3	0.21	0.05
Spa_g37335 (GATB)	0.45	1.0	0.25	0.17	0.17	0.17	0.17	0.3	0.23	0.11
Spa_g38576	0.45	1.0	0.22	0.24	0.18	0.21	0.12	0.24	0.18	0.06
Spa_g38741 (CFM2)	0.67	1.0	0.34	0.34	0.24	0.37	0.26	0.49	0.28	0.16
Spa_g40347 (emb1513)	0.45	1.0	0.37	0.37	0.31	0.35	0.32	0.53	0.48	0.25
Spa_g40629	0.41	1.0	0.21	0.21	0.19	0.21	0.2	0.32	0.21	0.08
Spa_g41235	0.54	1.0	0.17	0.25	0.23	0.27	0.2	0.38	0.18	0.09
Spa_g46885	0.51	1.0	0.35	0.36	0.39	0.37	0.39	0.45	0.43	0.24
Spa_g47688	0.47	1.0	0.31	0.25	0.24	0.25	0.27	0.37	0.31	0.17
Spa_g48071 (NPL1)	0.79	1.0	0.34	0.39	0.32	0.37	0.23	0.38	0.21	0.12
Spa_g50025 (RSR4)	0.25	1.0	0.13	0.13	0.1	0.12	0.09	0.25	0.15	0.1
Spa_g50677 (RABE1b)	0.57	1.0	0.15	0.26	0.2	0.23	0.17	0.27	0.14	0.08
Spa_g50959	0.46	1.0	0.14	0.18	0.19	0.17	0.16	0.24	0.21	0.07
Spa_g51205	0.55	1.0	0.18	0.26	0.18	0.25	0.15	0.39	0.15	0.11
Spa_g51315 (CTF2A)	0.39	1.0	0.26	0.32	0.33	0.33	0.32	0.31	0.32	0.16
Spa_g51789 (PSAF)	0.62	1.0	0.09	0.19	0.16	0.14	0.11	0.23	0.08	0.02
Spa_g53767	0.44	1.0	0.18	0.26	0.21	0.25	0.16	0.5	0.17	0.05
Spa_g54452	0.45	1.0	0.26	0.14	0.21	0.13	0.18	0.35	0.2	0.08
Spa_g56471 (PTAC16)	0.52	1.0	0.16	0.21	0.15	0.19	0.12	0.29	0.16	0.09
Spa_g56583 (NSI)	0.59	1.0	0.17	0.27	0.2	0.2	0.2	0.42	0.35	0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)