Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet
Young Primary Rachis
Mature Primary Rachis
Young Petiole
Mature Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Spa_g00162 (FdC1)
77.43 195.19 45.74 57.44 64.14 52.24 64.64 87.4 76.37 30.24
35.78 67.94 15.03 17.72 21.16 18.29 21.09 28.71 22.6 9.57
18.6 21.58 7.19 9.16 6.3 9.48 6.35 9.6 7.78 4.26
53.42 98.04 22.44 23.93 21.62 22.18 22.35 31.52 27.02 11.83
27.76 50.95 7.73 12.93 8.35 11.32 7.02 11.42 6.25 3.7
52.44 81.84 20.71 30.24 29.75 27.81 24.01 49.38 28.69 14.72
Spa_g04575 (SBE2.2)
37.62 114.56 24.01 33.02 33.33 36.82 36.09 41.01 39.25 19.49
Spa_g04595 (PNP)
10.8 21.88 4.8 4.39 5.86 4.28 5.64 8.86 7.26 2.25
Spa_g04708 (FTSH8)
83.94 209.81 29.06 51.66 40.19 51.48 37.96 71.81 48.38 15.41
12.48 22.23 8.4 7.03 5.67 7.57 6.12 10.19 6.36 4.22
20.48 31.41 6.13 7.57 6.31 6.65 4.71 15.53 7.4 1.49
430.5 787.77 84.98 130.46 102.83 107.84 85.37 153.95 112.15 51.06
19.36 46.18 5.27 6.01 5.36 4.75 3.72 11.75 1.39 0.1
80.67 155.39 11.64 20.94 22.22 19.44 15.33 16.36 8.03 0.8
16.78 19.97 7.02 8.44 6.97 9.3 5.49 9.18 5.04 4.24
Spa_g06532 (PRK)
155.69 303.5 39.65 69.07 36.66 63.54 25.49 61.27 17.17 0.2
10.44 32.41 8.06 8.06 9.8 9.24 9.31 10.5 11.21 6.04
794.91 1716.99 176.28 600.95 168.63 471.58 120.61 476.42 275.48 39.47
Spa_g06691 (emb1138)
155.16 524.87 71.01 72.7 70.89 74.15 59.88 151.6 76.35 19.68
Spa_g07528 (MAP1D)
36.96 103.86 20.95 27.36 29.84 26.91 27.79 34.1 31.05 14.33
Spa_g07673 (ERS)
26.58 28.81 11.58 12.27 10.25 12.96 9.97 15.08 10.31 5.37
12.21 28.39 5.52 8.11 5.54 7.75 5.56 8.6 5.19 2.56
24.01 54.15 8.9 15.18 10.39 14.96 8.58 22.88 14.04 4.89
Spa_g07848 (ACSF)
74.5 144.43 9.57 26.88 16.23 22.28 10.8 37.17 12.58 2.63
Spa_g07976 (PAA2)
22.0 32.34 14.02 14.59 10.91 14.35 9.76 16.59 10.76 10.34
12.36 20.75 4.04 6.47 4.05 6.19 4.28 6.84 4.29 1.85
35.29 75.54 20.04 23.36 27.15 25.03 26.52 28.44 33.3 11.37
Spa_g08358 (GR2)
32.69 95.79 24.52 22.78 30.45 25.23 31.13 36.14 30.7 14.64
15.39 56.74 9.21 14.12 14.19 14.01 15.3 15.71 13.15 7.13
38.47 105.45 25.26 31.99 22.85 26.72 21.58 53.56 30.66 12.89
Spa_g08766 (OVA2)
27.45 52.82 13.54 15.93 16.19 16.33 16.62 22.05 22.57 8.46
Spa_g09010 (OK1)
16.07 33.35 10.36 8.33 10.78 8.87 10.55 15.19 11.83 7.6
Spa_g09508 (MAR1)
15.79 25.53 6.57 8.15 4.1 8.28 3.19 8.13 2.73 1.68
15.43 46.52 8.78 12.77 12.15 13.17 12.35 14.17 13.8 5.35
63.82 165.55 44.08 49.05 50.25 49.96 47.81 54.01 46.86 23.72
22.38 29.71 5.74 10.81 6.2 9.78 4.78 12.21 5.4 5.81
27.81 86.26 22.83 19.56 24.13 20.08 23.12 28.24 23.97 13.99
26.86 53.96 17.91 19.32 18.8 19.34 17.83 25.38 25.77 16.09
6.45 11.45 4.7 3.28 2.77 3.35 3.03 3.62 4.06 1.35
5.38 11.41 2.43 3.3 2.78 3.32 2.27 4.89 2.94 2.08
Spa_g12026 (HCF107)
13.92 23.84 6.85 8.6 5.46 7.89 4.41 9.34 5.2 2.88
34.43 80.91 23.98 24.86 27.74 27.73 26.08 35.54 35.79 15.44
4.61 7.86 2.91 3.18 3.0 3.34 2.74 4.11 3.15 1.58
31.64 57.24 14.07 18.57 10.7 16.6 12.51 24.78 13.57 6.74
Spa_g14098 (PGR5)
16.89 29.7 7.97 9.44 8.82 10.72 6.87 11.78 9.08 5.26
44.85 65.84 16.12 22.9 21.15 23.72 17.9 24.82 15.7 14.42
Spa_g14739 (emb2726)
20.85 32.83 7.1 8.53 7.23 8.03 7.12 9.5 10.01 4.15
60.78 112.79 8.82 26.28 15.97 22.42 9.93 21.56 7.66 1.24
92.66 127.9 35.68 46.25 45.86 38.27 36.11 60.59 49.89 19.18
Spa_g15501 (EMB2369)
17.74 36.35 8.53 8.14 7.08 8.34 5.75 9.91 8.94 4.98
Spa_g16041 (emb2738)
14.34 23.08 12.2 10.37 11.49 9.92 11.68 12.48 12.81 7.01
Spa_g16717 (CRM3)
12.4 28.04 3.08 4.35 2.1 3.96 1.73 5.6 1.5 0.4
13.18 23.24 1.96 2.28 1.5 1.8 1.13 5.75 1.42 0.71
Spa_g17299 (AGY1)
9.73 31.47 5.14 5.09 6.92 5.17 6.45 7.19 6.43 2.52
Spa_g17572 (RSR4)
33.94 141.06 16.71 14.83 11.69 14.56 9.68 33.82 19.2 13.16
54.64 81.74 10.39 17.2 8.49 12.22 5.82 28.46 8.02 2.11
18.87 27.9 8.84 10.97 6.88 11.54 6.65 12.12 6.17 4.12
32.45 48.31 13.9 12.02 7.19 10.19 4.81 17.43 5.68 6.19
12.23 23.25 3.7 6.54 3.08 5.2 2.4 4.57 2.37 1.21
34.45 87.29 12.5 22.4 19.79 23.56 19.44 27.36 18.0 7.37
32.45 55.28 7.82 13.3 5.15 10.6 4.64 15.49 4.26 2.16
Spa_g21337 (FFC)
31.73 53.08 15.19 17.2 14.24 16.47 13.64 19.59 21.92 7.63
51.87 117.37 27.89 26.16 20.89 23.15 15.65 26.41 36.31 7.22
11.36 26.32 7.3 7.6 7.65 7.77 7.12 10.9 12.57 2.75
88.07 160.99 12.48 24.47 23.42 23.03 16.11 16.9 8.08 0.65
Spa_g22044 (PPO2)
17.58 32.96 10.09 7.72 9.48 7.92 8.42 7.92 6.78 4.44
Spa_g22077 (ATATH8)
18.25 41.91 10.35 7.76 8.98 7.98 8.41 10.64 6.93 4.11
70.8 131.33 46.79 46.6 48.59 43.65 49.42 60.03 56.27 34.58
8.98 10.93 4.22 4.2 3.67 4.09 3.33 4.92 2.71 2.57
20.12 31.82 6.85 11.76 8.85 9.54 6.91 11.04 9.09 3.05
Spa_g22241 (PTAC4)
30.88 61.25 13.74 21.2 24.91 20.31 24.61 27.15 28.88 12.41
Spa_g23137 (CRSH)
4.91 13.29 3.92 4.15 3.96 4.13 4.21 3.76 3.83 1.87
8.34 27.6 2.56 3.24 2.97 4.41 2.44 6.48 2.07 1.45
Spa_g24240 (NSI)
14.64 37.81 7.33 5.33 7.07 4.83 5.7 11.52 10.88 2.66
20.1 46.95 5.97 6.74 6.45 6.3 5.27 10.72 6.01 3.32
52.18 216.76 22.28 38.49 31.11 36.05 24.75 40.61 30.91 3.87
Spa_g25498 (PSBQ)
270.2 474.01 49.57 121.72 84.52 96.18 65.96 114.68 60.51 15.04
46.46 118.35 37.3 41.07 43.34 40.95 38.2 53.56 36.18 27.14
13.05 27.59 10.69 11.74 9.14 12.35 8.36 12.64 9.31 4.65
Spa_g25843 (AAO3)
23.34 41.96 19.03 13.75 13.57 15.59 13.57 18.52 15.15 6.05
Spa_g26001 (RPT1)
29.11 39.17 15.85 13.75 12.85 15.51 11.68 16.18 10.53 6.99
22.73 36.12 9.2 11.2 7.93 10.16 6.5 11.61 5.69 3.82
127.65 202.73 20.1 38.21 34.49 36.34 23.47 48.17 18.17 5.13
102.8 182.31 15.87 40.55 32.56 35.89 23.99 30.58 13.52 4.14
67.57 129.68 10.4 15.41 23.81 18.96 15.91 23.46 8.79 0.49
Spa_g30430 (OVA5)
42.41 80.56 17.96 20.83 20.08 20.23 18.41 21.59 16.32 9.42
28.71 81.61 23.64 27.29 17.19 25.16 15.86 36.52 23.49 12.11
150.17 232.65 40.26 71.11 56.57 62.79 46.54 69.2 49.32 12.59
Spa_g37335 (GATB)
18.51 41.44 10.17 6.92 7.04 7.09 7.16 12.31 9.51 4.62
17.49 38.84 8.72 9.29 6.82 8.29 4.49 9.49 7.06 2.36
Spa_g38741 (CFM2)
8.47 12.68 4.33 4.33 3.04 4.64 3.28 6.22 3.55 2.08
Spa_g40347 (emb1513)
16.45 36.7 13.46 13.57 11.31 12.81 11.71 19.39 17.59 9.05
52.98 129.23 26.62 27.14 24.63 26.67 25.51 41.56 27.68 10.38
18.96 35.2 6.13 8.82 8.03 9.34 6.95 13.3 6.16 3.2
22.46 43.61 15.11 15.77 16.92 15.97 17.18 19.45 18.73 10.43
2.73 5.79 1.78 1.44 1.38 1.48 1.58 2.16 1.77 0.96
Spa_g48071 (NPL1)
46.48 58.83 20.15 23.16 18.95 21.68 13.51 22.09 12.53 7.14
Spa_g50025 (RSR4)
18.4 74.58 10.0 9.38 7.43 8.92 6.73 18.32 11.17 7.42
Spa_g50677 (RABE1b)
57.79 101.43 15.66 26.61 20.03 22.87 17.05 27.23 13.87 7.71
22.99 50.43 7.3 9.17 9.55 8.82 8.02 12.06 10.73 3.4
30.37 55.16 10.03 14.26 9.79 13.6 8.29 21.51 8.47 6.14
Spa_g51315 (CTF2A)
33.16 84.16 22.05 27.32 28.07 28.06 27.14 26.27 27.04 13.63
Spa_g51789 (PSAF)
32.31 52.01 4.71 9.81 8.38 7.32 5.53 12.21 4.21 0.88
15.7 35.66 6.36 9.42 7.5 9.02 5.86 17.81 6.08 1.62
7.75 17.26 4.56 2.37 3.58 2.24 3.19 6.02 3.51 1.38
Spa_g56471 (PTAC16)
106.15 202.2 32.04 42.23 31.22 39.22 25.22 58.15 32.27 17.4
Spa_g56583 (NSI)
13.91 23.57 4.03 6.48 4.79 4.79 4.81 9.99 8.14 1.75

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)