Heatmap: Cluster_138 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g43113	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43160 (NRPE6A)	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.65	-	-
Spa_g43192	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43224	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-4.09
Spa_g43238	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43261 (R1)	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.53	-	-
Spa_g43276	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.9	-3.88	-5.53
Spa_g43282 (MBF1B)	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.53	-4.96	-
Spa_g43287	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.77	-	-
Spa_g43304	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.07	-	-
Spa_g43315 (PRL)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.03	-6.36	-6.15
Spa_g43328	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.31	-	-
Spa_g43339	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-6.75
Spa_g43345 (HAG2)	-	-	3.29	-	-	-	-	-4.11	-5.57	-2.9
Spa_g43357 (CDPK9)	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.86	-	-2.89
Spa_g43366 (ARP4)	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.74	-	-5.59
Spa_g43367 (EB1A)	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.19	-4.48	-5.86
Spa_g43381	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-2.48	-
Spa_g43388	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.52	-6.31	-
Spa_g43391	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.37	-4.25	-
Spa_g43408	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.89	-4.18	-
Spa_g43412	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.61	-	-
Spa_g43416 (CYCA3;1)	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.88	-5.76	-
Spa_g43417	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.82	-3.29	-5.95
Spa_g43420 (SAE2)	-	-	3.32	-	-	-	-	-6.4	-	-
Spa_g43423	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.17	-	-
Spa_g43424	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.32	-5.79	-4.9
Spa_g43429	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.65	-6.86	-
Spa_g43431 (NUP155)	-	-	3.32	-	-	-	-	-7.12	-5.42	-
Spa_g43432	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.8	-6.28	-5.0
Spa_g43444	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.61	-	-
Spa_g43477	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43489	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43522	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43534	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43567	-	-3.64	3.3	-	-	-	-	-	-	-3.51
Spa_g43569	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.33	-	-
Spa_g43584	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43620	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-4.67
Spa_g43634 (PER1)	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.63	-	-
Spa_g43644	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.65	-4.45	-
Spa_g43660 (SEH1H)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43663	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43664	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.05	-	-
Spa_g43673 (RAB1C)	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.05	-4.88	-3.54
Spa_g43675	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.33	-2.89	-
Spa_g43695	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.26	-	-5.8
Spa_g43697 (LOS4)	-	-	3.29	-	-	-	-5.93	-3.12	-5.11	-4.86
Spa_g43708 (MCM3)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.72	-5.72	-4.96
Spa_g43787	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43801	-	-	3.28	-	-	-	-	-	-3.67	-2.29
Spa_g43813	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.78	-	-4.4
Spa_g43825	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43841	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43872	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.83	-5.21	-3.83
Spa_g43887	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.29	-	-
Spa_g43903	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.87	-3.33	-4.43
Spa_g43938	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.96	-6.16	-4.23
Spa_g43943	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.31	-	-4.43
Spa_g43950	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g43955	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-4.64	-
Spa_g44057	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44099	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44109	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.66	-	-
Spa_g44135	-	-	3.29	-	-	-	-	-3.29	-3.16	-
Spa_g44145	-	-	3.3	-	-	-	-	-5.13	-	-2.92
Spa_g44146 (ARA7)	-	-	3.27	-	-	-	-	-3.43	-4.03	-2.47
Spa_g44152 (IVD)	-	-	3.32	-	-7.22	-	-	-5.56	-	-5.82
Spa_g44159 (RSW3)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.89	-4.78	-
Spa_g44170	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.78	-5.04	-4.26
Spa_g44286	-	-	3.25	-	-	-	-	-2.73	-3.32	-2.23
Spa_g44291 (EIF3K)	-	-	3.28	-	-	-	-	-4.02	-3.47	-2.79
Spa_g44296	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-4.26	-
Spa_g44306	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.2	-	-6.03
Spa_g44316	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44330	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44334	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-3.22	-4.02
Spa_g44356 (POLA4)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.45	-	-3.57
Spa_g44357	-	-	3.28	-	-5.39	-	-	-	-2.61	-3.26
Spa_g44374	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.57	-	-
Spa_g44381	-	-	3.28	-	-	-	-	-2.29	-4.17	-5.41
Spa_g44387	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.88	-5.98	-5.64
Spa_g44392	-	-	3.29	-	-6.94	-	-	-2.47	-4.16	-
Spa_g44395	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.36	-4.82	-5.48
Spa_g44411	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.57	-	-
Spa_g44506	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44514	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44552	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44556	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44558	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44584 (R1)	-	-	3.28	-	-	-	-	-2.27	-4.52	-4.63
Spa_g44595 (BSH)	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.0	-3.88	-4.67
Spa_g44596	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-5.19
Spa_g44605	-	-4.39	3.29	-	-	-	-	-	-	-2.79
Spa_g44617	-	-9.06	3.3	-	-	-	-7.67	-4.66	-5.54	-3.4
Spa_g44626	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.74	-	-
Spa_g44627	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.56	-	-4.13
Spa_g44641	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.65	-	-4.65
Spa_g44645	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.84	-7.31	-5.39
Spa_g44682	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44797	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.8	-	-
Spa_g44852	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44921	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44931	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44956	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g44957 (R1)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45009	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.08	-	-4.6
Spa_g45023 (RAD51)	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.01	-4.88	-
Spa_g45026 (UBC7)	-	-	3.26	-	-	-	-	-2.15	-5.18	-2.87
Spa_g45059 (UKL3)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45069	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.37	-6.83	-3.92
Spa_g45070	-	-	3.32	-	-	-	-	-4.72	-	-
Spa_g45074 (FAR5)	-	-	3.3	-	-	-	-5.47	-4.78	-	-3.9
Spa_g45122	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45185	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45246 (ARPC4)	-	-	3.25	-	-	-	-3.43	-1.52	-4.19	-
Spa_g45248	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.5	-	-
Spa_g45271 (P5CR)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45285	-	-	3.28	-	-	-	-	-1.97	-	-
Spa_g45292	-	-	3.27	-	-	-	-	-2.05	-2.92	-
Spa_g45293 (RAN1)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.23	-5.03	-5.14
Spa_g45307	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.53	-	-3.6
Spa_g45315 (CYCA1;1)	-	-	3.3	-	-	-	-6.38	-2.82	-6.16	-
Spa_g45337 (CHB4)	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.43	-6.77	-6.43
Spa_g45518	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45623	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.35	-	-4.67
Spa_g45640 (TAF15)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.73	-4.28	-
Spa_g45661	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.7	-4.54	-
Spa_g45663	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.67	-3.96	-5.34
Spa_g45690 (GPA1)	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.76	-	-4.0
Spa_g45708	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g45714	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.5	-5.97	-
Spa_g45832	-	-	3.31	-	-	-	-5.6	-4.78	-	-
Spa_g46223	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46253	-	-	3.3	-	-	-	-4.81	-5.71	-3.99	-
Spa_g46321	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46342	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.19	-3.02	-
Spa_g46469 (TOPP3)	-	-	3.28	-	-	-	-	-3.12	-5.8	-2.87
Spa_g46478	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46918	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46954	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g46972	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47057	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47087	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47098	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47290	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.87	-	-
Spa_g47297	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47374	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-4.28
Spa_g47487	-	-	3.28	-	-	-	-	-4.68	-2.97	-3.35
Spa_g47497	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.14	-	-5.17
Spa_g47527	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.96	-	-5.31
Spa_g47553	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47577	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.94	-7.73	-6.46
Spa_g47579	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47595 (FHA)	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.35	-4.23	-
Spa_g47621	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g47627 (CHR17)	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.14	-5.61	-5.85
Spa_g47646	-	-	3.31	-	-	-	-	-4.17	-5.05	-
Spa_g47655	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-4.56
Spa_g47751	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-5.17	-3.28
Spa_g47897 (AGO1)	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.9	-4.79	-
Spa_g47965	-	-	3.31	-	-	-	-	-5.95	-4.82	-
Spa_g48079	-	-5.78	3.32	-	-	-	-	-	-5.84	-
Spa_g48110	-	-	3.3	-	-	-	-	-3.22	-6.1	-4.76
Spa_g48211	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g48231	-	-	3.3	-	-	-	-	-5.28	-3.15	-
Spa_g48309	-	-	3.29	-	-	-	-7.23	-2.64	-5.13	-8.24
Spa_g48322	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.38	-	-5.84
Spa_g48466 (POLD2)	-	-	3.3	-	-	-	-	-2.58	-	-
Spa_g48476 (TOPII)	-	-	3.31	-	-	-	-7.26	-3.99	-8.04	-
Spa_g48539	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g48544	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-3.73	-
Spa_g48653	-	-	3.31	-	-	-	-	-3.52	-	-
Spa_g48679 (IWS1)	-	-	3.26	-	-	-	-	-2.69	-	-2.09
Spa_g48762	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g48802	-	-	3.3	-	-	-	-	-4.14	-4.0	-
Spa_g48921	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.19	-	-
Spa_g48927	-	-	3.32	-	-	-	-	-5.85	-	-
Spa_g49129 (RPB2)	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-4.14	-3.67
Spa_g49200	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49343	-	-	3.29	-	-	-	-	-2.57	-6.16	-4.81
Spa_g49421	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49671	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49685	-	-	3.28	-	-	-	-	-2.34	-3.99	-5.96
Spa_g49703	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49802 (TUA3)	-	-4.71	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49803 (TOR2)	-	-	3.27	-	-	-	-5.22	-2.08	-3.37	-
Spa_g49873	-	-	3.32	-	-	-	-	-4.6	-	-
Spa_g49874 (MRE11)	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spa_g49910	-	-	3.3	-	-	-	-3.34	-4.49	-	-
Spa_g50075	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.