Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Young Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet	Young Primary Rachis	Mature Primary Rachis	Young Petiole	Mature Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Spa_g00646	0.34	1.0	0.85	0.06	0.14	0.06	0.07	0.21	0.14	0.23
Spa_g01977	0.75	0.69	1.0	0.02	0.02	0.03	0.07	0.14	0.09	0.0
Spa_g06546	0.31	1.0	0.83	0.2	0.39	0.22	0.4	0.23	0.24	0.28
Spa_g06705	1.0	0.62	0.64	0.02	0.03	0.02	0.04	0.25	0.09	0.0
Spa_g07610	0.69	0.6	1.0	0.16	0.09	0.19	0.08	0.24	0.15	0.25
Spa_g07628	0.54	1.0	0.71	0.36	0.5	0.29	0.35	0.36	0.41	0.39
Spa_g08431 (SD2-5)	0.3	1.0	0.81	0.03	0.13	0.03	0.06	0.22	0.39	0.02
Spa_g08827	0.33	1.0	0.63	0.1	0.07	0.1	0.08	0.13	0.23	0.17
Spa_g11237	0.95	1.0	0.99	0.33	0.27	0.42	0.24	0.24	0.27	0.25
Spa_g11412	0.55	0.34	1.0	0.08	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.33
Spa_g11572 (DDB2)	0.78	0.5	1.0	0.11	0.12	0.08	0.09	0.26	0.08	0.08
Spa_g12050	0.69	0.73	1.0	0.42	0.28	0.42	0.27	0.46	0.25	0.36
Spa_g12565 (RVE2)	0.39	1.0	0.76	0.06	0.21	0.06	0.12	0.31	0.12	0.28
Spa_g12829 (MRP6)	0.35	1.0	0.72	0.3	0.22	0.36	0.21	0.28	0.3	0.31
Spa_g13415	0.36	1.0	0.67	0.03	0.07	0.0	0.02	0.11	0.02	0.18
Spa_g13425	0.14	0.75	1.0	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.0	0.07
Spa_g13471 (OPT4)	0.69	0.63	1.0	0.22	0.2	0.24	0.19	0.21	0.11	0.18
Spa_g13679 (scpl42)	0.84	0.7	1.0	0.04	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.05
Spa_g13823	0.1	0.62	1.0	0.01	0.03	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0
Spa_g14063	0.4	1.0	0.76	0.06	0.19	0.1	0.13	0.26	0.1	0.33
Spa_g14368	0.56	0.5	1.0	0.07	0.03	0.05	0.01	0.16	0.09	0.09
Spa_g14392 (CCH)	0.43	1.0	0.58	0.05	0.2	0.13	0.05	0.12	0.12	0.22
Spa_g14837 (scpl42)	0.67	0.72	1.0	0.04	0.05	0.05	0.05	0.12	0.25	0.02
Spa_g14976	0.53	0.3	1.0	0.08	0.1	0.13	0.08	0.11	0.09	0.17
Spa_g15137	0.0	0.52	1.0	0.0	0.02	0.0	0.19	0.0	0.11	0.09
Spa_g15783 (CRCK2)	0.72	0.8	1.0	0.16	0.11	0.18	0.11	0.51	0.36	0.15
Spa_g16035	0.58	0.48	1.0	0.14	0.06	0.14	0.07	0.16	0.11	0.3
Spa_g16116	0.63	0.81	1.0	0.07	0.07	0.11	0.0	0.15	0.22	0.21
Spa_g16340	0.04	0.81	1.0	0.02	0.01	0.03	0.0	0.01	0.0	0.01
Spa_g16998	0.67	0.53	1.0	0.08	0.1	0.06	0.11	0.29	0.13	0.23
Spa_g18018 (SPL8)	1.0	0.44	0.93	0.01	0.01	0.01	0.0	0.3	0.08	0.03
Spa_g18172	0.39	1.0	0.84	0.05	0.29	0.08	0.15	0.3	0.21	0.18
Spa_g18173 (CENP-C)	0.18	1.0	0.65	0.05	0.1	0.05	0.07	0.22	0.11	0.11
Spa_g18429 (ATTPPA)	0.2	0.6	1.0	0.26	0.09	0.23	0.04	0.2	0.1	0.24
Spa_g18606	0.45	1.0	0.54	0.02	0.37	0.17	0.27	0.11	0.15	0.19
Spa_g18858 (LIP1)	0.93	1.0	0.89	0.06	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03
Spa_g19141	0.01	0.75	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spa_g20993	0.54	0.38	1.0	0.06	0.07	0.1	0.12	0.2	0.1	0.1
Spa_g21812	1.0	0.53	0.94	0.33	0.24	0.34	0.2	0.35	0.23	0.24
Spa_g22365	0.91	1.0	0.85	0.04	0.12	0.1	0.05	0.18	0.08	0.1
Spa_g22774	0.29	1.0	0.94	0.08	0.1	0.07	0.12	0.19	0.36	0.21
Spa_g24604 (VTE5)	0.98	0.96	1.0	0.18	0.36	0.19	0.35	0.58	0.45	0.23
Spa_g24736	0.31	1.0	0.88	0.06	0.06	0.07	0.07	0.14	0.27	0.19
Spa_g24928 (ORP4B)	0.69	0.48	1.0	0.18	0.17	0.18	0.17	0.34	0.13	0.21
Spa_g25690	0.49	0.84	1.0	0.09	0.18	0.12	0.1	0.14	0.31	0.13
Spa_g25879	1.0	0.86	0.75	0.08	0.1	0.12	0.08	0.22	0.1	0.05
Spa_g26603	0.99	0.94	1.0	0.06	0.11	0.06	0.08	0.11	0.08	0.17
Spa_g27968	0.88	0.82	1.0	0.47	0.56	0.53	0.64	0.47	0.71	0.63
Spa_g28501	0.36	0.89	1.0	0.03	0.17	0.27	0.09	0.21	0.25	0.11
Spa_g28530	0.09	0.49	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.02	0.14	0.0
Spa_g28712	0.0	0.58	1.0	0.01	0.05	0.0	0.13	0.03	0.2	0.09
Spa_g29218	0.53	1.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Spa_g30247	0.41	1.0	0.79	0.13	0.08	0.1	0.05	0.29	0.12	0.09
Spa_g34012	0.25	1.0	0.79	0.08	0.36	0.09	0.15	0.21	0.12	0.13
Spa_g34596	0.78	0.75	1.0	0.19	0.12	0.2	0.21	0.6	0.3	0.51
Spa_g36391 (ECT5)	0.65	0.71	1.0	0.21	0.28	0.33	0.29	0.42	0.37	0.4
Spa_g39838	0.53	0.28	1.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.15	0.07
Spa_g40961	0.62	1.0	0.76	0.23	0.33	0.26	0.25	0.07	0.18	0.19
Spa_g42100	0.42	1.0	0.77	0.29	0.32	0.29	0.35	0.38	0.36	0.28
Spa_g43415	0.28	1.0	0.97	0.08	0.09	0.08	0.05	0.0	0.06	0.01
Spa_g44139	0.3	1.0	0.8	0.0	0.04	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02
Spa_g44182	0.62	0.39	1.0	0.13	0.14	0.21	0.25	0.27	0.21	0.22
Spa_g44527	0.53	0.38	1.0	0.04	0.05	0.04	0.04	0.1	0.25	0.35
Spa_g46667	0.4	1.0	0.71	0.08	0.07	0.09	0.04	0.25	0.09	0.13
Spa_g46787	0.65	0.57	1.0	0.07	0.0	0.08	0.0	0.03	0.01	0.21
Spa_g46997	0.53	0.35	1.0	0.05	0.04	0.06	0.03	0.17	0.09	0.02
Spa_g47471	0.06	0.83	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0
Spa_g47685 (LACS4)	1.0	0.49	0.81	0.32	0.21	0.33	0.21	0.37	0.26	0.18
Spa_g47717	0.76	0.4	1.0	0.17	0.08	0.17	0.05	0.21	0.11	0.28
Spa_g47724 (ACR3)	0.0	0.56	1.0	0.0	0.07	0.0	0.15	0.03	0.21	0.09
Spa_g50175	1.0	0.49	0.71	0.03	0.01	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0
Spa_g50176 (BLH2)	1.0	0.8	0.99	0.03	0.02	0.04	0.05	0.16	0.1	0.0
Spa_g50188 (CHM)	0.5	0.49	1.0	0.25	0.2	0.25	0.18	0.34	0.23	0.12
Spa_g50650	0.45	0.63	1.0	0.06	0.01	0.16	0.02	0.15	0.06	0.0
Spa_g51156	0.66	0.35	1.0	0.15	0.18	0.14	0.21	0.15	0.1	0.25
Spa_g52082	0.2	1.0	0.79	0.08	0.2	0.08	0.19	0.17	0.08	0.06
Spa_g53437	0.66	1.0	0.91	0.24	0.27	0.24	0.29	0.1	0.27	0.16
Spa_g54061 (MRP6)	0.39	1.0	0.82	0.36	0.27	0.42	0.27	0.29	0.3	0.46
Spa_g54742	0.78	1.0	0.65	0.05	0.12	0.05	0.17	0.05	0.03	0.16
Spa_g56342	0.07	1.0	0.84	0.06	0.14	0.01	0.1	0.0	0.01	0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)