1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.41 0.14 0.13 0.4 0.31 0.28 0.69 0.77 0.61 0.68 0.3 0.54 0.13 0.06 0.16 0.29 0.46 0.46 0.39 0.0 0.0 0.0 0.43 0.31 0.0 0.53 0.69 0.84 0.5 0.77 1.0 0.93
Smo100734 (MYB119)
 0.09 0.11 0.19 0.2 0.19 0.3 0.54 0.35 0.4 0.46 0.28 0.27 0.35 0.35 0.51 0.41 0.75 0.54 0.2 0.0 0.17 0.0 0.54 0.29 0.1 0.27 0.93 0.71 0.64 0.63 0.9 1.0
0.23 0.31 0.42 0.44 0.45 0.65 0.83 0.69 0.73 0.8 0.57 0.45 0.15 0.29 0.33 0.2 0.3 0.27 0.25 0.0 0.0 0.09 0.22 0.16 0.03 0.09 0.29 0.28 0.45 0.46 1.0 0.7
0.16 0.21 0.26 0.3 0.32 0.4 0.54 0.52 0.53 0.54 0.36 0.28 0.12 0.22 0.27 0.16 0.27 0.21 0.23 0.01 0.09 0.03 0.19 0.11 0.21 0.06 0.25 0.2 0.42 0.39 1.0 0.66
0.18 0.23 0.26 0.33 0.36 0.38 0.56 0.5 0.52 0.48 0.35 0.3 0.15 0.25 0.26 0.19 0.28 0.29 0.25 0.01 0.04 0.18 0.2 0.14 0.06 0.07 0.13 0.14 0.49 0.44 1.0 0.7
0.15 0.07 0.11 0.16 0.44 0.4 0.47 0.52 0.2 0.23 0.1 0.13 0.05 0.01 0.1 0.11 0.43 1.0 0.25 0.0 0.09 0.06 0.26 0.22 0.14 0.11 0.42 0.29 0.48 0.49 0.47 0.31
0.15 0.13 0.33 0.2 0.4 0.26 0.65 0.57 0.33 0.24 0.19 0.21 0.06 0.06 0.13 0.11 0.39 1.0 0.21 0.0 0.0 0.19 0.37 0.24 0.0 0.1 0.45 0.08 0.53 0.47 0.83 0.52
0.22 0.19 0.1 0.28 0.4 0.53 0.75 0.59 0.44 0.75 0.46 0.3 0.23 0.04 0.07 0.33 0.58 1.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.49 0.44 0.22 0.21 0.26 0.4 0.87 0.9 0.87 0.56
0.52 0.37 0.45 0.7 0.39 0.68 0.78 1.0 0.53 0.45 0.48 0.69 0.69 0.22 0.46 0.52 0.63 0.91 0.68 0.19 0.0 0.0 0.81 0.57 0.0 0.2 0.31 0.39 0.72 0.79 0.72 0.75
Smo115258 (OTP84)
 0.05 0.0 0.0 0.18 0.24 0.65 1.0 0.43 0.33 0.21 0.08 0.0 0.07 0.0 0.03 0.07 0.18 0.8 0.2 0.0 0.0 0.0 0.17 0.1 0.49 0.28 0.35 0.41 0.39 0.31 0.18 0.1
Smo115449 (EMB2758)
 0.17 0.09 0.23 0.24 0.37 0.66 0.85 0.73 0.5 0.26 0.28 0.18 0.19 0.03 0.47 0.16 0.42 0.56 0.25 0.0 0.05 0.0 0.38 0.39 0.17 0.19 0.87 1.0 0.52 0.71 0.73 0.58
0.28 0.13 0.23 0.33 0.37 0.59 1.0 0.76 0.89 0.69 0.46 0.3 0.13 0.1 0.27 0.19 0.58 0.39 0.47 0.0 0.09 0.48 0.3 0.21 0.08 0.15 0.63 0.79 0.74 0.66 0.76 0.67
0.26 0.25 0.04 0.06 0.11 0.45 0.44 1.0 0.55 0.42 0.28 0.34 0.18 0.05 0.52 0.35 0.3 0.66 0.34 0.0 0.0 0.0 0.38 0.17 0.21 0.24 0.66 0.68 0.5 0.6 0.96 0.82
0.22 0.2 0.08 0.14 0.19 0.88 0.63 0.55 0.5 0.47 0.19 0.22 0.11 0.06 0.35 0.19 0.45 0.46 0.39 0.05 0.0 0.27 0.39 0.35 0.15 0.33 1.0 0.82 0.76 0.72 0.52 0.46
0.32 0.21 0.15 0.32 0.32 0.55 0.55 0.67 0.83 0.68 0.52 0.48 0.1 0.05 0.34 0.17 0.41 0.4 0.37 0.04 0.0 0.01 0.38 0.33 0.09 0.23 0.53 0.42 0.52 0.56 1.0 0.79
0.33 0.19 0.33 0.28 0.39 0.32 0.78 0.73 0.79 0.77 0.47 0.46 0.08 0.08 0.17 0.1 0.49 0.26 0.27 0.01 0.25 0.0 0.25 0.2 0.03 0.32 0.48 0.58 0.55 0.46 1.0 0.77
0.34 0.07 0.18 0.24 0.43 0.66 0.86 0.7 0.58 0.46 0.68 0.57 0.13 0.03 0.27 0.31 0.55 0.71 0.57 0.0 0.23 0.0 0.44 0.3 0.09 0.26 0.46 0.57 0.84 0.77 1.0 0.87
Smo133790 (OTP84)
 0.35 0.28 0.22 0.35 0.56 0.71 0.94 0.73 0.88 0.66 0.4 0.43 0.19 0.09 0.33 0.27 0.51 0.72 0.58 0.0 0.05 0.02 0.4 0.35 0.3 0.35 1.0 0.67 0.58 0.62 0.66 0.62
0.09 0.22 0.17 0.2 0.5 0.61 0.32 0.41 0.36 0.29 0.62 0.4 0.3 0.07 0.27 0.29 0.45 0.75 0.54 0.0 0.08 0.0 0.62 0.41 0.4 0.29 0.44 0.47 0.9 0.95 1.0 0.7
Smo137492 (EMB175)
 0.11 0.09 0.26 0.25 0.27 0.58 0.87 0.7 0.75 0.39 0.41 0.27 0.04 0.04 0.32 0.12 0.36 0.84 0.23 0.0 0.0 0.33 0.46 0.27 0.0 0.27 0.58 0.09 0.66 0.65 1.0 0.88
0.46 0.23 0.25 0.27 0.44 0.48 0.79 0.79 0.65 0.86 0.62 0.51 0.13 0.06 0.25 0.24 0.36 0.48 0.35 0.04 0.44 0.1 0.27 0.3 0.06 0.18 0.19 0.14 0.55 0.53 1.0 0.91
0.56 0.11 0.11 0.27 0.14 0.23 0.57 0.81 0.37 0.39 0.19 0.35 0.3 0.02 0.27 0.34 0.49 0.77 0.66 0.0 0.0 0.0 0.54 0.49 0.0 0.12 0.13 0.13 0.75 0.71 1.0 0.76
0.23 0.15 0.23 0.21 0.28 0.46 0.61 0.83 0.72 0.53 0.34 0.29 0.24 0.13 0.45 0.27 0.71 0.58 0.5 0.13 0.06 0.12 0.5 0.41 0.07 0.33 0.81 0.67 0.87 0.83 1.0 0.93
0.36 0.18 0.2 0.39 0.39 0.82 0.87 0.74 0.76 0.57 0.38 0.44 0.23 0.07 0.45 0.38 0.63 0.62 0.66 0.01 0.09 0.07 0.57 0.45 0.06 0.34 0.86 0.63 1.0 0.85 0.7 0.69
0.29 0.09 0.28 0.24 0.34 0.57 0.87 0.88 0.35 0.58 0.29 0.25 0.15 0.08 0.25 0.18 0.58 0.49 0.52 0.0 0.0 0.0 0.25 0.27 0.0 0.34 0.75 1.0 0.8 0.73 0.71 0.48
0.08 0.19 0.15 0.21 0.2 0.49 0.37 0.47 0.26 0.33 0.16 0.05 0.04 0.01 0.16 0.05 0.29 1.0 0.2 0.0 0.14 0.08 0.19 0.14 0.06 0.36 0.54 0.8 0.49 0.22 0.31 0.25
Smo29563 (OBP4)
 0.54 0.43 0.54 0.44 0.58 0.37 0.29 0.23 0.26 0.19 0.23 0.22 0.06 0.06 0.05 0.23 0.53 1.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.79 0.58 0.0 0.07 0.2 0.12 0.72 0.75 1.0 0.83
Smo30076 (MEF21)
 0.36 0.26 0.26 0.4 0.64 0.61 1.0 0.68 1.0 0.75 0.59 0.42 0.34 0.13 0.51 0.31 0.58 0.67 0.49 0.0 0.0 0.02 0.61 0.47 0.19 0.41 0.87 0.57 0.62 0.71 0.78 0.66
0.39 0.25 0.43 0.31 0.59 0.39 0.3 0.28 0.29 0.17 0.33 0.2 0.24 0.16 0.19 0.27 0.74 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.4 0.26 0.0 0.03 0.09 0.13 0.67 0.64 0.6 0.64
0.11 0.16 0.19 0.09 0.24 0.37 0.6 0.45 0.59 0.29 0.36 0.21 0.02 0.0 0.06 0.05 0.43 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.3 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.44 0.99 0.57
0.16 0.13 0.07 0.13 0.31 0.75 0.48 0.7 0.98 0.35 0.45 0.22 0.2 0.0 0.24 0.27 0.68 0.93 0.39 0.02 0.0 0.0 0.41 0.34 0.0 0.23 1.0 0.77 0.82 0.66 0.68 0.38
0.04 0.1 0.13 0.12 0.0 0.35 0.52 0.38 0.23 0.09 0.2 0.0 0.0 0.05 0.27 0.0 0.36 1.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.21 0.05 0.0 0.24 0.58 0.8 0.64 0.54 0.15 0.0
0.08 0.07 0.0 0.14 0.37 0.22 0.38 0.46 0.25 0.56 0.04 0.15 0.25 0.0 0.19 0.12 0.55 0.91 0.39 0.35 0.21 0.12 0.33 0.33 0.32 0.0 0.2 0.2 0.8 0.79 1.0 0.53
0.17 0.13 0.19 0.25 0.42 0.29 0.38 0.53 0.86 0.84 0.68 0.47 0.15 0.1 0.15 0.1 0.66 0.53 0.06 0.12 0.17 0.11 0.07 0.05 0.22 0.3 0.23 0.15 0.62 0.61 1.0 0.74
0.18 0.17 0.08 0.14 0.02 0.7 0.59 0.67 0.47 0.22 0.11 0.16 0.2 0.03 0.17 0.11 0.45 1.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.39 0.16 0.0 0.07 0.36 0.17 0.63 0.6 0.58 0.32
0.35 0.17 0.19 0.29 0.51 0.75 1.0 0.73 0.91 0.6 0.51 0.34 0.28 0.09 0.34 0.22 0.46 0.73 0.58 0.15 0.19 0.07 0.53 0.49 0.12 0.34 0.7 0.76 0.78 0.86 0.91 0.72
0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.37 0.44 0.31 0.34 0.42 0.0 0.0 0.0 0.15 0.28 0.0 0.16 1.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.88 0.76 0.33 0.28 0.07 0.35 0.0
0.33 0.39 0.43 0.5 0.48 0.47 0.58 0.54 0.56 0.52 0.46 0.34 0.14 0.43 0.29 0.2 0.5 0.31 0.34 0.05 0.15 0.07 0.46 0.34 0.12 0.27 0.47 0.47 0.49 0.49 1.0 0.61
0.26 0.24 0.21 0.32 0.3 0.78 1.0 0.77 0.88 0.35 0.49 0.31 0.09 0.02 0.14 0.06 0.39 0.84 0.15 0.0 0.0 0.0 0.19 0.17 0.09 0.11 0.34 0.25 0.63 0.52 0.7 0.44
0.11 0.0 0.12 0.05 0.24 1.0 0.98 0.71 0.25 0.27 0.32 0.17 0.04 0.08 0.33 0.11 0.45 0.37 0.45 0.0 0.0 0.0 0.45 0.27 0.26 0.22 0.57 0.42 0.42 0.55 0.43 0.38
0.21 0.06 0.02 0.08 0.09 0.55 0.3 0.58 0.23 0.26 0.27 0.15 0.11 0.03 0.1 0.14 0.42 1.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.2 0.27 0.12 0.07 0.25 0.2 0.59 0.55 0.36 0.4
Smo70094 (CLB19)
 0.27 0.09 0.12 0.26 0.28 0.79 0.72 0.72 0.47 0.29 0.28 0.2 0.11 0.05 0.24 0.12 0.6 0.86 0.35 0.34 0.02 0.09 0.27 0.32 0.22 0.08 0.43 0.32 0.64 0.77 1.0 0.62
0.16 0.06 0.16 0.28 0.35 0.65 0.57 0.74 0.58 0.39 0.38 0.24 0.57 0.16 0.2 0.33 0.43 1.0 0.57 0.01 0.11 0.0 0.33 0.28 0.1 0.22 0.27 0.26 0.66 0.59 0.65 0.6
0.22 0.1 0.02 0.15 0.28 0.55 0.4 0.97 0.9 0.45 0.29 0.18 0.05 0.05 0.35 0.06 0.3 1.0 0.26 0.1 0.52 0.18 0.28 0.31 0.66 0.21 0.79 0.58 0.68 0.56 0.33 0.2
0.19 0.21 0.08 0.16 0.2 0.44 0.61 0.65 0.66 0.42 0.26 0.28 0.14 0.14 0.57 0.29 0.49 0.77 0.44 0.18 0.0 0.0 0.47 0.33 0.05 0.25 0.89 1.0 0.83 0.75 0.8 0.55
0.22 0.16 0.15 0.12 0.41 0.26 0.39 0.54 0.37 0.41 0.32 0.23 0.14 0.06 0.19 0.21 0.23 0.29 0.31 0.01 0.16 0.0 0.27 0.26 0.02 0.31 0.43 0.21 0.36 0.38 1.0 0.63
0.33 0.27 0.16 0.27 0.6 0.67 0.65 0.9 0.36 0.45 0.38 0.26 0.24 0.14 0.34 0.24 0.31 0.82 0.33 0.08 0.25 0.27 0.36 0.28 0.99 0.25 0.78 1.0 0.42 0.52 0.5 0.37
0.14 0.05 0.16 0.26 0.25 0.51 0.76 0.4 0.79 0.44 0.29 0.16 0.37 0.04 0.21 0.24 0.49 0.78 0.48 0.0 0.04 0.27 0.54 0.41 0.23 0.43 0.6 0.67 1.0 0.9 0.84 0.69
0.21 0.21 0.14 0.23 0.5 0.42 0.56 0.45 0.46 0.48 0.18 0.23 0.29 0.04 0.34 0.26 0.69 0.84 0.58 0.0 0.02 0.05 0.61 0.5 0.4 0.2 0.56 0.4 0.74 0.64 1.0 0.7
0.23 0.13 0.13 0.22 0.36 0.54 0.89 0.59 0.68 0.49 0.43 0.36 0.2 0.15 0.2 0.31 0.62 0.89 0.66 0.21 0.05 0.79 0.48 0.37 0.25 0.23 0.58 0.74 1.0 0.89 0.84 0.51
Smo72439 (REME1)
 0.14 0.03 0.02 0.07 0.11 0.6 0.58 0.47 0.26 0.41 0.26 0.29 0.08 0.12 0.12 0.12 0.46 1.0 0.33 0.03 0.04 0.0 0.49 0.35 0.07 0.07 0.12 0.3 0.92 0.63 0.76 0.31
0.24 0.26 0.16 0.17 0.49 0.76 0.58 0.53 0.49 0.4 0.33 0.31 0.19 0.06 0.22 0.27 0.55 1.0 0.46 0.0 0.06 0.08 0.51 0.39 0.2 0.1 0.38 0.4 0.97 0.95 0.79 0.61
0.29 0.35 0.43 0.38 0.41 0.52 0.46 0.4 0.61 0.55 0.53 0.42 0.13 0.24 0.42 0.3 1.0 0.73 0.16 0.0 0.04 0.01 0.43 0.33 0.03 0.1 0.21 0.2 0.84 0.88 1.0 0.55
0.48 0.44 0.66 0.52 0.4 0.83 0.78 0.93 0.81 0.96 0.33 0.33 0.31 0.12 0.65 0.33 0.74 0.99 0.82 0.12 0.25 0.29 0.62 0.45 0.35 0.21 0.57 0.66 0.92 0.8 0.81 1.0
0.19 0.07 0.14 0.21 0.2 0.68 0.79 0.64 0.4 0.28 0.11 0.1 0.16 0.09 0.42 0.28 0.54 0.59 0.51 0.12 0.0 0.0 0.53 0.27 0.23 0.25 0.66 0.95 0.74 0.94 1.0 0.75
0.21 0.09 0.16 0.28 0.42 0.69 0.44 0.66 0.84 0.48 0.26 0.22 0.24 0.09 0.36 0.22 0.43 0.32 0.34 0.0 0.0 0.0 0.34 0.41 0.12 0.32 1.0 0.36 0.56 0.67 0.23 0.2
0.19 0.05 0.14 0.12 0.2 0.45 0.39 0.63 0.32 0.22 0.21 0.21 0.08 0.09 0.22 0.2 0.33 0.41 0.53 0.0 0.0 0.0 0.45 0.26 0.0 0.0 0.35 0.22 0.83 0.55 1.0 0.69
0.09 0.14 0.07 0.13 0.26 0.62 0.61 0.86 0.61 0.53 0.36 0.26 0.14 0.05 0.22 0.16 0.44 1.0 0.34 0.59 0.42 0.16 0.37 0.3 0.96 0.2 0.37 0.41 0.71 0.76 0.74 0.45
0.27 0.16 0.22 0.2 0.35 0.59 0.81 0.86 0.94 0.63 0.3 0.32 0.05 0.07 0.2 0.08 0.67 0.68 0.37 0.58 0.69 1.0 0.39 0.33 0.46 0.29 0.67 0.95 0.91 0.93 0.42 0.23
0.46 0.42 0.15 0.32 0.66 0.76 0.79 0.81 0.66 0.51 0.92 0.47 0.78 0.19 0.49 0.71 0.6 0.41 0.83 0.06 0.0 0.0 0.85 0.72 0.0 0.29 0.49 0.32 0.82 0.76 1.0 0.99
0.16 0.38 0.17 0.19 0.3 0.47 0.36 0.34 0.14 0.13 0.46 0.12 0.19 0.14 0.34 0.38 0.37 1.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.57 0.46 0.0 0.33 0.34 0.52 0.5 0.51 0.2 0.28
0.4 0.32 0.3 0.36 0.58 0.49 0.6 0.55 0.57 0.54 0.4 0.41 0.22 0.2 0.39 0.27 0.67 1.0 0.45 0.06 0.58 0.22 0.57 0.44 0.2 0.29 0.5 0.68 0.8 0.63 0.67 0.62
0.16 0.23 0.26 0.43 0.61 0.97 0.71 0.49 0.29 0.24 0.18 0.14 0.19 0.06 0.06 0.27 0.4 1.0 0.28 0.25 0.58 0.58 0.5 0.37 0.18 0.14 0.21 0.19 0.25 0.24 0.16 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)