1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.37 0.43 0.45 0.5 0.47 0.52 0.39 0.42 0.39 0.36 0.37 0.34 0.43 0.84 0.88 0.5 0.38 0.25 0.39 0.34 0.18 0.08 0.39 0.36 0.81 0.59 0.85 1.0 0.33 0.35 0.25 0.28
0.38 0.46 0.42 0.52 0.52 0.51 0.46 0.47 0.42 0.34 0.34 0.33 0.44 1.0 0.59 0.38 0.34 0.23 0.26 0.2 0.14 0.1 0.3 0.28 0.84 0.47 0.8 0.79 0.25 0.26 0.19 0.16
0.51 0.23 0.2 0.22 0.39 0.34 0.23 0.64 0.51 0.61 0.74 0.69 0.64 0.99 0.88 0.71 0.17 0.06 0.38 0.01 0.07 0.0 0.15 0.2 0.06 1.0 0.93 0.96 0.28 0.32 0.29 0.21
0.4 0.38 0.4 0.49 0.52 0.51 0.57 0.65 0.58 0.6 0.57 0.56 0.51 0.63 1.0 0.48 0.34 0.22 0.44 0.11 0.11 0.37 0.4 0.38 0.79 0.7 0.83 0.85 0.37 0.42 0.3 0.26
Smo114371 (MSH3)
 0.57 0.58 0.51 0.67 0.9 0.72 0.68 0.7 0.78 0.61 0.5 0.5 0.48 0.41 0.59 0.38 0.22 0.06 0.31 0.01 0.0 0.21 0.26 0.32 0.74 0.77 1.0 0.89 0.15 0.21 0.12 0.14
0.42 0.47 0.55 0.66 0.68 0.64 0.54 0.64 0.67 0.65 0.65 0.5 0.27 0.64 0.85 0.33 0.17 0.03 0.16 0.32 0.15 0.1 0.15 0.12 0.97 1.0 0.88 0.78 0.15 0.18 0.09 0.08
0.35 0.33 0.3 0.22 0.24 0.26 0.24 0.47 0.34 0.36 0.46 0.45 0.0 0.71 0.08 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 1.0 0.79 0.7 0.01 0.01 0.0 0.01
0.36 0.38 0.38 0.52 0.57 0.55 0.55 0.53 0.43 0.41 0.4 0.35 0.39 0.6 0.77 0.49 0.32 0.28 0.35 0.07 0.11 0.15 0.37 0.42 0.95 0.63 1.0 0.91 0.36 0.38 0.22 0.2
Smo140217 (emb1027)
 0.46 0.44 0.39 0.48 0.48 0.5 0.56 0.64 0.61 0.59 0.52 0.52 0.27 0.29 0.72 0.25 0.25 0.21 0.37 0.28 0.17 0.25 0.24 0.27 0.54 1.0 0.83 0.73 0.29 0.3 0.27 0.31
Smo165253 (FUS8)
 0.54 0.51 0.45 0.6 0.59 0.6 0.56 0.64 0.64 0.59 0.56 0.55 0.6 0.87 1.0 0.65 0.37 0.26 0.58 0.16 0.13 0.02 0.41 0.45 0.63 0.56 0.73 0.68 0.39 0.41 0.41 0.44
0.32 0.38 0.43 0.47 0.47 0.49 0.48 0.43 0.46 0.37 0.35 0.35 0.38 0.88 1.0 0.33 0.36 0.36 0.25 0.25 0.42 0.35 0.31 0.25 0.52 0.23 0.65 0.68 0.31 0.37 0.25 0.25
Smo167575 (CSN3)
 0.45 0.44 0.47 0.49 0.48 0.5 0.53 0.54 0.55 0.55 0.54 0.48 0.44 0.69 1.0 0.46 0.3 0.26 0.53 0.33 0.24 0.34 0.38 0.42 0.61 0.71 0.61 0.62 0.3 0.33 0.34 0.38
Smo167999 (GlcNAc1pUT2)
 0.62 0.57 0.53 0.62 0.59 0.56 0.55 0.59 0.61 0.55 0.53 0.51 0.52 1.0 0.95 0.58 0.35 0.3 0.41 0.17 0.23 0.06 0.53 0.49 0.74 0.6 0.82 0.76 0.37 0.42 0.38 0.42
Smo170784 (SYTF)
 0.5 0.5 0.55 0.55 0.57 0.57 0.47 0.6 0.56 0.52 0.55 0.48 0.7 0.59 0.57 0.59 0.26 0.21 0.53 0.04 0.03 0.05 0.51 0.59 0.47 0.84 0.87 1.0 0.36 0.38 0.27 0.28
0.61 0.52 0.51 0.61 0.65 0.63 0.64 0.69 0.67 0.76 0.63 0.53 0.7 0.78 0.99 0.69 0.43 0.35 0.61 0.2 0.17 0.21 0.44 0.49 0.93 0.74 0.96 1.0 0.5 0.56 0.37 0.44
0.37 0.38 0.36 0.51 0.48 0.48 0.5 0.55 0.51 0.46 0.43 0.43 0.38 0.6 1.0 0.36 0.17 0.14 0.38 0.28 0.32 0.29 0.23 0.28 0.73 0.75 0.78 0.63 0.19 0.23 0.15 0.16
0.53 0.51 0.48 0.56 0.45 0.5 0.42 0.6 0.65 0.75 0.73 0.67 0.16 0.81 0.9 0.16 0.12 0.04 0.18 0.01 0.09 0.05 0.11 0.12 0.22 1.0 0.61 0.63 0.13 0.13 0.11 0.1
Smo230105 (LCB1)
 0.49 0.48 0.48 0.57 0.59 0.53 0.49 0.58 0.48 0.49 0.46 0.43 0.55 0.84 1.0 0.64 0.34 0.31 0.5 0.22 0.23 0.08 0.45 0.47 0.62 0.57 0.63 0.68 0.33 0.34 0.33 0.35
Smo269334 (CPA)
 0.29 0.36 0.43 0.45 0.5 0.56 0.58 0.52 0.41 0.39 0.37 0.32 0.41 0.82 1.0 0.4 0.32 0.24 0.43 0.28 0.33 0.25 0.36 0.35 0.6 0.46 0.76 0.75 0.26 0.28 0.22 0.24
Smo27355 (ACN1)
 0.36 0.36 0.2 0.3 0.17 0.51 0.29 0.3 0.21 0.5 0.44 0.18 0.0 0.38 0.44 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.19 1.0 0.77 0.27 0.0 0.02 0.0 0.0
0.44 0.42 0.36 0.53 0.55 0.49 0.3 0.5 0.43 0.32 0.47 0.35 0.21 1.0 0.76 0.17 0.07 0.01 0.14 0.07 0.02 0.03 0.08 0.06 0.13 0.57 0.6 0.55 0.04 0.06 0.05 0.02
Smo406168 (MGP2)
 0.6 0.62 0.5 0.6 0.7 0.66 0.65 0.72 0.86 0.62 0.77 0.67 0.46 0.97 0.86 0.42 0.13 0.11 0.19 0.09 0.11 0.11 0.35 0.36 0.26 1.0 0.63 0.66 0.15 0.17 0.11 0.1
0.55 0.45 0.46 0.59 0.71 0.57 0.69 0.74 0.76 0.78 0.66 0.65 0.17 0.61 0.77 0.23 0.17 0.14 0.23 0.21 0.31 0.1 0.15 0.16 0.7 1.0 0.64 0.75 0.18 0.24 0.2 0.15
0.56 0.52 0.47 0.5 0.55 0.55 0.58 0.55 0.57 0.57 0.44 0.5 0.31 0.36 0.56 0.31 0.28 0.14 0.38 0.17 0.37 0.06 0.29 0.3 0.75 0.65 1.0 0.94 0.3 0.28 0.32 0.33
Smo409623 (REF1)
 0.33 0.32 0.19 0.22 0.34 0.26 0.24 0.37 0.46 0.25 0.32 0.27 0.0 0.57 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.84 1.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.43 0.45 0.56 0.67 0.55 0.65 0.59 0.55 0.48 0.45 0.39 0.6 0.58 0.98 0.8 0.24 0.18 0.44 0.03 0.13 0.2 0.19 0.23 0.39 0.68 0.92 1.0 0.34 0.39 0.3 0.32
0.33 0.42 0.54 0.6 0.6 0.58 0.69 0.63 0.61 0.55 0.53 0.43 0.54 0.59 0.82 0.56 0.23 0.17 0.35 0.2 0.14 0.12 0.36 0.45 0.51 1.0 0.82 0.91 0.29 0.33 0.24 0.26
Smo410502 (DPL1)
 0.41 0.48 0.49 0.54 0.56 0.55 0.48 0.52 0.46 0.43 0.42 0.4 0.28 0.68 0.74 0.49 0.35 0.3 0.62 0.02 0.1 0.09 0.32 0.29 0.77 1.0 0.93 0.95 0.32 0.34 0.21 0.17
Smo411162 (TT8)
 0.46 0.42 0.31 0.35 0.23 0.41 0.43 0.5 0.48 0.53 0.48 0.43 0.05 0.38 0.46 0.1 0.15 0.02 0.12 0.03 0.35 0.1 0.07 0.05 0.71 1.0 0.73 0.53 0.11 0.11 0.04 0.05
0.41 0.47 0.61 0.47 0.57 0.49 0.42 0.51 0.46 0.43 0.52 0.45 0.15 0.76 1.0 0.17 0.12 0.1 0.13 0.0 0.01 0.0 0.14 0.16 0.04 0.44 0.48 0.54 0.09 0.11 0.08 0.07
0.27 0.36 0.26 0.34 0.22 0.38 0.33 0.3 0.35 0.43 0.3 0.29 0.26 1.0 0.81 0.19 0.09 0.07 0.33 0.0 0.15 0.03 0.16 0.15 0.74 0.67 0.91 0.92 0.13 0.13 0.14 0.13
Smo421784 (IIL1)
 0.35 0.3 0.29 0.38 0.42 0.61 0.59 0.6 0.62 0.44 0.49 0.42 0.07 0.58 0.78 0.12 0.07 0.02 0.1 0.07 0.14 0.04 0.05 0.09 0.8 0.89 0.94 1.0 0.05 0.06 0.04 0.05
0.26 0.26 0.38 0.37 0.44 0.25 0.42 0.37 0.33 0.51 0.26 0.34 0.14 0.75 1.0 0.36 0.04 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.09 0.34 0.16 0.27 0.04 0.07 0.06 0.02
0.38 0.42 0.55 0.59 0.61 0.56 0.58 0.56 0.54 0.69 0.31 0.35 0.06 0.38 0.86 0.07 0.1 0.12 0.11 0.0 0.0 0.01 0.03 0.07 0.09 0.79 1.0 0.79 0.07 0.07 0.06 0.07
0.61 0.63 0.59 0.7 0.77 0.68 0.65 0.68 0.68 0.65 0.62 0.6 0.5 1.0 0.81 0.43 0.17 0.02 0.36 0.24 0.08 0.08 0.24 0.29 0.53 0.91 0.82 0.81 0.16 0.16 0.14 0.13
0.33 0.39 0.42 0.47 0.39 0.47 0.41 0.4 0.49 0.45 0.53 0.38 0.19 0.62 0.51 0.18 0.06 0.01 0.16 0.03 0.04 0.09 0.1 0.11 0.17 1.0 0.76 0.62 0.06 0.06 0.05 0.04
0.6 0.59 0.49 0.59 0.67 0.67 0.57 0.68 0.56 0.61 0.6 0.57 0.6 0.71 0.69 0.65 0.34 0.3 0.57 0.11 0.23 0.15 0.48 0.57 0.74 1.0 0.98 0.97 0.36 0.38 0.36 0.38
0.36 0.29 0.26 0.47 0.33 0.37 0.61 0.57 0.78 0.22 0.49 0.53 0.06 0.76 0.67 0.05 0.03 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.03 1.0 0.79 0.85 0.01 0.03 0.0 0.03
Smo425292 (TPK1)
 0.59 0.62 0.15 0.55 0.2 0.32 0.61 0.53 1.0 0.69 0.76 0.82 0.32 0.8 0.93 0.43 0.14 0.01 0.25 0.02 0.0 0.02 0.15 0.24 0.0 0.78 0.68 0.59 0.16 0.19 0.08 0.1
0.33 0.41 0.26 0.43 0.41 0.47 0.64 0.46 0.35 0.63 0.37 0.47 0.07 1.0 0.95 0.24 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.36 0.37 0.39 0.03 0.03 0.02 0.02
0.64 0.51 0.4 0.5 0.47 0.52 0.38 0.53 0.62 0.64 0.69 0.73 0.8 1.0 0.96 0.81 0.11 0.01 0.17 0.06 0.17 0.05 0.23 0.23 0.28 0.83 0.57 0.55 0.14 0.15 0.17 0.19
Smo429828 (CARA)
 0.52 0.52 0.45 0.5 0.61 0.54 0.57 0.48 0.46 0.53 0.55 0.52 0.7 1.0 0.86 0.59 0.24 0.11 0.42 0.13 0.21 0.05 0.3 0.39 0.69 0.51 0.6 0.58 0.24 0.26 0.1 0.1
0.29 0.14 0.35 0.29 0.41 0.31 0.49 0.6 0.51 0.67 0.75 0.41 0.0 0.33 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.8 0.45 0.0 0.0 0.0 0.01
0.63 0.77 0.67 0.67 0.62 0.54 0.64 0.59 0.62 0.56 0.55 0.56 0.47 0.95 1.0 0.51 0.24 0.17 0.3 0.06 0.02 0.04 0.2 0.2 0.08 0.66 0.66 0.83 0.24 0.3 0.12 0.14
Smo440989 (BLI)
 0.77 0.68 0.65 0.66 0.69 0.67 0.54 0.59 0.63 0.56 0.64 0.53 0.63 0.74 0.63 0.72 0.39 0.28 0.55 0.07 0.18 0.11 0.54 0.57 0.58 1.0 0.86 0.92 0.37 0.42 0.31 0.29
0.41 0.43 0.53 0.54 0.53 0.54 0.54 0.57 0.58 0.52 0.53 0.4 0.34 0.53 0.78 0.32 0.24 0.19 0.21 0.24 0.14 0.24 0.37 0.42 0.51 0.56 0.84 1.0 0.24 0.27 0.19 0.2
0.64 0.65 0.59 0.63 0.58 0.59 0.56 0.58 0.59 0.62 0.59 0.6 0.53 0.67 0.63 0.63 0.37 0.27 0.62 0.2 0.29 0.15 0.4 0.44 0.62 0.99 0.89 1.0 0.46 0.49 0.36 0.33
0.58 0.67 0.63 0.65 0.67 0.65 0.66 0.66 0.53 0.59 0.52 0.51 0.44 0.43 0.54 0.41 0.25 0.0 0.44 0.13 0.24 0.31 0.35 0.37 0.72 0.71 1.0 0.92 0.21 0.21 0.28 0.29
0.73 0.78 0.67 0.72 0.81 0.78 0.7 0.95 0.76 0.7 0.74 0.67 0.59 0.75 0.8 0.67 0.44 0.14 0.58 0.41 0.21 0.32 0.52 0.58 0.64 0.92 1.0 0.87 0.45 0.48 0.49 0.51
0.39 0.41 0.32 0.46 0.52 0.53 0.49 0.65 0.67 0.57 0.55 0.49 0.41 0.24 0.51 0.4 0.24 0.02 0.35 0.17 0.19 0.15 0.29 0.34 0.49 1.0 0.84 0.66 0.27 0.28 0.2 0.28
0.3 0.43 0.46 0.54 0.46 0.46 0.48 0.43 0.38 0.32 0.34 0.29 0.41 0.73 0.48 0.47 0.41 0.28 0.37 0.06 0.12 0.02 0.39 0.37 0.83 0.39 0.81 1.0 0.33 0.34 0.18 0.18
Smo75640 (AFH14)
 0.33 0.42 0.56 0.52 0.73 0.57 0.48 0.56 0.56 0.53 0.51 0.45 0.1 0.36 0.61 0.14 0.15 0.09 0.12 0.0 0.01 0.0 0.15 0.15 0.62 0.75 0.74 1.0 0.13 0.13 0.11 0.08
0.49 0.56 0.56 0.71 0.75 0.74 0.73 0.66 0.54 0.53 0.51 0.55 0.72 0.95 0.98 0.57 0.47 0.31 0.4 0.04 0.16 0.16 0.32 0.28 0.84 0.58 1.0 0.98 0.42 0.46 0.24 0.26
0.42 0.46 0.48 0.5 0.42 0.53 0.47 0.52 0.46 0.45 0.44 0.46 0.29 0.58 0.83 0.31 0.26 0.27 0.34 0.15 0.24 0.07 0.28 0.36 0.83 0.7 1.0 0.9 0.25 0.28 0.25 0.28
0.33 0.36 0.41 0.38 0.51 0.44 0.52 0.54 0.58 0.56 0.47 0.42 0.44 0.59 0.95 0.47 0.27 0.25 0.43 0.14 0.12 0.09 0.32 0.33 0.82 0.88 1.0 0.99 0.33 0.32 0.24 0.21
Smo88496 (MAP2B)
 0.45 0.49 0.47 0.51 0.53 0.54 0.54 0.55 0.53 0.55 0.46 0.52 0.39 0.57 0.67 0.41 0.24 0.17 0.39 0.19 0.2 0.23 0.33 0.41 0.92 0.76 1.0 0.94 0.26 0.27 0.25 0.28
0.67 0.58 0.6 0.63 0.61 0.69 0.59 0.59 0.62 0.57 0.56 0.51 0.32 0.44 0.74 0.38 0.4 0.32 0.49 0.2 0.26 0.16 0.34 0.36 0.62 0.54 0.94 1.0 0.4 0.43 0.31 0.33
0.78 0.83 0.73 0.83 0.83 0.77 0.71 0.86 0.9 0.82 0.83 0.78 0.87 0.99 0.82 1.0 0.44 0.34 0.53 0.47 0.23 0.56 0.55 0.56 0.87 0.9 0.87 0.79 0.48 0.51 0.41 0.45
Smo98535 (MTN1)
 0.28 0.33 0.43 0.49 0.55 0.57 0.51 0.49 0.44 0.33 0.36 0.27 0.48 0.82 1.0 0.46 0.45 0.32 0.46 0.46 0.22 0.28 0.55 0.56 0.47 0.41 0.6 0.66 0.36 0.41 0.21 0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)