1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.28 0.28 0.26 0.41 1.0 0.27 0.47 0.37 0.56 0.23 0.35 0.35 0.15 0.19 0.35 0.05 0.25 0.03 0.11 0.35 0.08 0.0 0.03 0.03 0.16 0.11 0.13 0.08 0.12 0.22 0.16 0.21
Smo122321 (BRS1)
 0.26 0.19 0.29 0.67 1.0 0.27 0.32 0.48 0.59 0.48 0.36 0.09 0.01 0.05 0.04 0.0 0.05 0.45 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.09 0.22 0.24 0.37 0.12 0.04 0.13 0.06
Smo135313 (SSADH)
 0.0 0.0 0.51 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 0.37 0.06 0.03 1.0 0.2 0.0 0.19 0.18 0.03 0.0 0.07 0.21 0.07 0.07 0.27 0.22 0.25 0.31 0.0 0.0 0.0 0.25 0.12 0.28 0.0 0.21 0.19 0.33 0.23 0.42 0.32
0.03 0.07 0.03 0.03 1.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.15 0.1 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.24
0.09 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.49 0.16 0.2 1.0 0.16 0.26 0.26 0.07 0.14 0.05 0.23 0.42 0.17 0.11 0.03 0.04 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.1 0.53 0.13 0.22 0.01 0.08 0.03 0.0
0.78 0.94 0.63 0.67 0.87 0.7 1.0 0.51 0.75 0.44 0.51 0.62 0.47 0.82 0.85 0.45 0.15 0.21 0.41 0.0 0.0 0.0 0.36 0.34 0.04 0.48 0.43 0.38 0.21 0.19 0.11 0.07
0.06 0.0 0.0 0.05 1.0 0.05 0.08 0.09 0.07 0.34 0.04 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.13 0.12 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.05 0.26 0.22 0.12 0.07 0.0 0.0
0.17 0.07 0.53 0.17 1.0 0.2 0.25 0.02 0.09 0.16 0.13 0.21 0.13 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.13 0.08 0.06 0.11 0.16
0.29 0.59 1.0 0.64 0.8 0.79 0.76 0.42 0.68 0.93 0.47 0.37 0.28 0.15 0.44 0.74 0.48 0.1 0.36 0.0 0.09 0.0 0.59 0.43 0.4 0.33 0.46 0.66 0.51 0.46 0.44 0.23
Smo4073 (CDC2)
 0.02 0.23 0.28 0.22 1.0 0.0 0.08 0.1 0.05 0.14 0.34 0.01 0.18 0.09 0.0 0.07 0.29 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.1 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0
0.21 0.3 0.77 0.0 1.0 0.38 0.27 0.22 0.0 0.0 0.07 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.23 0.0 0.0 0.02 0.0 0.16 0.02 0.28 0.02 0.28 0.1 0.29 0.0 0.11 0.0 0.2 0.31 0.92 0.03 0.08 0.07 0.21 0.18 0.22 0.37
0.05 0.0 0.0 0.06 1.0 0.22 0.05 0.06 0.49 0.15 0.06 0.11 0.22 0.05 0.15 0.17 0.12 0.28 0.33 0.0 0.0 0.0 0.16 0.18 0.0 0.13 0.22 0.34 0.09 0.24 0.27 0.08
0.22 0.57 0.3 0.33 0.79 0.18 0.26 0.15 0.3 0.3 0.29 0.39 0.0 0.0 0.0 0.04 0.23 0.29 0.9 0.0 0.0 0.0 0.14 0.1 0.09 1.0 0.4 0.37 0.27 0.32 0.13 0.11
0.38 0.17 0.14 0.59 1.0 0.15 0.28 0.53 0.41 0.39 0.42 0.3 0.0 0.09 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo410684 (P5CS2)
 0.56 0.0 0.42 0.22 1.0 0.49 0.31 0.51 0.48 0.15 0.5 0.13 0.02 0.05 0.04 0.02 0.03 0.0 0.07 0.0 0.1 0.0 0.03 0.02 0.0 0.13 0.32 0.19 0.03 0.05 0.01 0.02
0.05 0.09 0.04 0.38 1.0 0.05 0.0 0.15 0.16 0.08 0.04 0.18 0.11 0.0 0.13 0.0 0.26 0.26 0.54 0.0 0.0 0.0 0.56 0.2 0.56 0.4 0.13 0.23 0.19 0.2 0.34 0.19
0.64 0.18 0.0 0.08 1.0 0.21 0.25 0.25 0.58 0.2 0.61 0.36 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.22 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.19 0.0 0.03 0.09 0.0
0.09 0.0 0.06 0.22 1.0 0.55 0.49 0.58 0.46 0.28 0.38 0.28 0.0 0.06 0.16 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.15 0.28 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0
0.47 0.71 1.0 0.72 0.91 0.83 0.54 0.51 0.82 0.49 0.55 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0
0.52 0.42 0.18 0.3 1.0 0.43 0.34 0.32 0.56 0.47 0.84 0.77 0.12 0.14 0.18 0.09 0.51 0.1 0.32 0.0 0.0 0.0 0.22 0.2 0.05 0.92 0.49 0.54 0.43 0.35 0.5 0.32
0.04 0.18 0.39 0.49 1.0 0.73 0.29 0.73 0.83 0.09 0.52 0.09 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.23 0.24 0.98 0.0 0.1 0.0 0.0
0.4 0.28 0.11 0.19 0.68 0.28 0.14 0.46 0.46 0.47 1.0 0.62 0.37 0.19 0.44 0.4 0.24 0.04 0.42 0.03 0.28 0.08 0.27 0.2 0.22 0.83 0.04 0.0 0.33 0.27 0.67 0.94
0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.51 1.0 0.57 0.7 0.44 0.63 0.32 0.39 0.18 0.47 0.29 0.03 0.0 0.0 0.02 0.07 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.22 0.24 0.0 0.11 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.67 0.0 0.16 0.08 0.5 0.0 0.1 0.0 0.06 0.0 0.19 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.1 0.09 0.09 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.23 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.23 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0
0.18 0.12 0.05 0.22 0.68 0.15 0.24 0.38 0.06 0.4 0.29 0.26 0.3 0.13 0.23 0.18 0.02 0.0 0.18 0.0 0.0 0.05 0.37 0.69 1.0 0.07 0.25 0.47 0.19 0.08 0.14 0.09
0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.08 0.26 0.04 0.09 0.0 0.11 0.48 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.32 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo418240 (KUP3)
 0.1 0.05 0.45 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.73 0.05 0.17 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.18 0.0 0.0 0.13 0.04 0.04 0.0
0.04 0.14 0.0 0.05 1.0 0.08 0.43 0.0 0.0 0.22 0.0 0.28 0.0 0.09 0.0 0.18 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.07 0.87 0.0 0.18 0.36 0.0 0.23 0.0 0.0
0.81 0.19 0.26 0.5 0.97 0.21 0.45 0.2 1.0 0.18 0.0 0.05 0.0 0.11 0.1 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo419328 (KAO2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.24 1.0 0.32 0.18 0.0 0.49 0.16 0.22 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.74 0.81 0.65 0.1 0.37 0.36 0.0 0.0 0.0 0.26 0.25 0.0 0.23 0.46 0.0 0.1 0.15 0.2 0.14
Smo422417 (PS1)
 0.19 0.41 0.63 0.47 0.91 0.54 0.47 0.59 1.0 0.82 0.43 0.25 0.03 0.01 0.0 0.01 0.13 0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.13 0.29 0.12 0.09 0.16 0.11 0.18 0.14
0.09 0.02 0.36 0.27 1.0 0.24 0.1 0.11 0.74 0.53 0.1 0.21 0.05 0.15 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.02
0.26 0.39 0.26 0.33 0.88 0.36 0.16 0.32 1.0 0.51 0.92 0.76 0.39 0.43 0.34 0.45 0.3 0.21 0.59 0.02 0.05 0.53 0.51 0.46 0.41 0.83 0.62 0.26 0.4 0.42 0.27 0.22
0.29 0.38 0.42 0.15 1.0 0.11 0.44 0.41 0.4 0.52 0.61 0.21 0.31 0.25 0.4 0.25 0.09 0.08 0.62 0.0 0.16 0.0 0.05 0.0 0.67 0.51 0.33 0.44 0.07 0.03 0.03 0.08
0.01 0.0 0.02 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.15 0.03 0.03 0.06 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 1.0 0.18 0.25 0.46 0.0 0.05 0.29 0.15 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.05 0.0 0.17 0.05
0.4 0.23 0.18 0.18 1.0 0.33 0.4 0.48 0.36 0.55 0.34 0.48 0.1 0.23 0.22 0.16 0.12 0.18 0.51 0.0 0.0 0.0 0.24 0.05 0.62 0.34 0.34 0.3 0.3 0.25 0.22 0.06
0.56 0.73 0.51 0.62 1.0 0.66 0.62 0.55 0.89 0.53 0.55 0.54 0.37 0.43 0.6 0.43 0.23 0.06 0.37 0.06 0.23 0.47 0.33 0.41 0.16 0.34 0.32 0.37 0.22 0.27 0.23 0.26
0.07 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.09 0.0 0.11 0.11 0.13 0.07 0.11 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.5 0.07 0.19 0.99 0.05 0.24 0.0 0.19 0.17 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.2 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.28 0.13 0.0 0.47 0.1 0.42 0.09 0.0 0.04 0.0
0.21 0.05 0.01 0.19 1.0 0.6 0.11 0.0 0.74 0.01 0.28 0.14 0.07 0.18 0.24 0.31 0.0 0.08 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo5479 (CYP704B1)
 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.1 0.22 0.32 0.06 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03
0.07 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.05 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.37 0.42 0.21 0.08 0.04 0.04 0.08
0.45 0.65 0.88 0.65 1.0 0.48 0.46 0.29 0.35 0.28 0.39 0.48 0.23 0.29 0.35 0.15 0.21 0.16 0.66 0.0 0.09 0.0 0.16 0.07 0.0 0.16 0.3 0.17 0.29 0.28 0.14 0.19
0.08 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.0 0.16 0.61 0.63 0.34 1.0 0.57 0.28 0.0 0.42 0.0 0.02 0.0 0.13 0.2 0.07 0.54 0.08 0.0 0.0 0.0 0.43 0.29 0.0 0.0 0.26 0.0 0.32 0.28 0.1 0.16
0.0 0.08 0.0 0.49 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.13 0.21 0.0 0.22 0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.48 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.86 0.37 0.21 0.3 0.87 0.3 0.24 0.44 0.78 0.6 0.69 0.57 0.02 0.03 0.01 0.24 0.11 0.1 0.19 0.0 0.18 0.0 0.01 0.08 0.13 1.0 0.89 0.93 0.13 0.08 0.18 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)