1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.7 0.7 0.65 1.04 2.52 0.69 1.17 0.93 1.42 0.57 0.87 0.87 0.38 0.48 0.88 0.13 0.62 0.07 0.29 0.89 0.19 0.0 0.07 0.06 0.4 0.28 0.33 0.2 0.3 0.55 0.42 0.53
Smo122321 (BRS1)
 0.46 0.34 0.51 1.17 1.75 0.47 0.57 0.85 1.04 0.84 0.64 0.17 0.03 0.09 0.07 0.0 0.09 0.79 0.12 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.16 0.39 0.42 0.65 0.2 0.07 0.23 0.11
Smo135313 (SSADH)
 0.01 0.0 2.01 0.0 3.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.51 6.5 1.07 0.49 17.53 3.56 0.0 3.28 3.16 0.53 0.0 1.25 3.76 1.25 1.28 4.79 3.81 4.32 5.41 0.0 0.0 0.0 4.37 2.11 4.91 0.0 3.71 3.27 5.78 4.08 7.43 5.66
0.05 0.11 0.05 0.04 1.6 0.17 0.0 0.05 0.0 0.24 0.16 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.06 0.38
0.09 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.4 0.13 0.16 0.82 0.13 0.21 0.21 0.06 0.11 0.04 0.18 0.34 0.14 0.09 0.03 0.04 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.08 0.43 0.1 0.18 0.01 0.07 0.02 0.0
1.38 1.66 1.12 1.2 1.54 1.24 1.77 0.9 1.33 0.78 0.91 1.1 0.84 1.45 1.51 0.81 0.27 0.37 0.72 0.0 0.0 0.0 0.64 0.6 0.07 0.86 0.76 0.68 0.37 0.33 0.2 0.12
0.03 0.0 0.0 0.02 0.5 0.02 0.04 0.04 0.04 0.17 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.06 0.06 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.03 0.13 0.11 0.06 0.04 0.0 0.0
0.08 0.03 0.25 0.08 0.48 0.09 0.12 0.01 0.04 0.07 0.06 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.06 0.04 0.03 0.05 0.08
1.08 2.17 3.69 2.37 2.93 2.91 2.82 1.54 2.5 3.44 1.73 1.36 1.05 0.56 1.64 2.71 1.77 0.38 1.31 0.0 0.34 0.0 2.18 1.6 1.47 1.23 1.71 2.44 1.87 1.69 1.64 0.86
Smo4073 (CDC2)
 0.01 0.14 0.17 0.13 0.59 0.0 0.05 0.06 0.03 0.08 0.2 0.01 0.11 0.05 0.0 0.04 0.17 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.06 0.08 0.21 0.0 0.27 0.1 0.07 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 9.93 2.4 0.01 2.3 0.0 0.0 0.23 0.0 1.59 0.17 2.74 0.25 2.78 1.03 2.92 0.0 1.07 0.0 1.98 3.12 9.14 0.31 0.84 0.65 2.04 1.77 2.23 3.67
0.05 0.0 0.0 0.06 1.06 0.24 0.05 0.07 0.52 0.16 0.06 0.12 0.24 0.06 0.16 0.18 0.13 0.29 0.34 0.0 0.0 0.0 0.17 0.19 0.0 0.14 0.23 0.36 0.09 0.26 0.28 0.09
1.52 3.99 2.06 2.3 5.52 1.24 1.78 1.06 2.11 2.1 2.01 2.75 0.0 0.03 0.0 0.28 1.58 2.0 6.28 0.0 0.0 0.0 0.98 0.69 0.63 6.97 2.8 2.58 1.88 2.22 0.9 0.79
0.47 0.21 0.18 0.73 1.24 0.19 0.35 0.66 0.51 0.48 0.52 0.37 0.0 0.11 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo410684 (P5CS2)
 6.52 0.0 4.83 2.58 11.61 5.63 3.64 5.94 5.58 1.7 5.77 1.46 0.22 0.57 0.48 0.24 0.32 0.0 0.81 0.0 1.12 0.0 0.31 0.2 0.0 1.47 3.7 2.24 0.36 0.6 0.09 0.18
0.03 0.06 0.03 0.27 0.71 0.04 0.0 0.11 0.11 0.06 0.03 0.13 0.08 0.0 0.09 0.0 0.19 0.19 0.39 0.0 0.0 0.0 0.4 0.15 0.4 0.29 0.09 0.17 0.13 0.14 0.24 0.13
0.21 0.06 0.0 0.03 0.33 0.07 0.08 0.08 0.19 0.07 0.2 0.12 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.01 0.03 0.0
0.03 0.0 0.02 0.07 0.29 0.16 0.14 0.17 0.14 0.08 0.11 0.08 0.0 0.02 0.05 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0
20.23 30.72 42.97 30.76 39.12 35.8 23.24 21.77 35.36 20.88 23.55 18.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 2.53 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 2.85 2.26 0.95 0.07 0.23 0.37 0.14
1.59 1.28 0.55 0.9 3.04 1.29 1.02 0.97 1.69 1.42 2.55 2.33 0.38 0.43 0.56 0.28 1.55 0.31 0.96 0.0 0.0 0.0 0.66 0.61 0.14 2.79 1.5 1.63 1.31 1.06 1.53 0.97
0.01 0.07 0.15 0.18 0.37 0.27 0.11 0.27 0.31 0.03 0.19 0.03 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.08 0.09 0.37 0.0 0.04 0.0 0.0
0.5 0.35 0.14 0.24 0.85 0.35 0.18 0.57 0.58 0.59 1.25 0.78 0.47 0.23 0.55 0.51 0.3 0.05 0.53 0.04 0.35 0.1 0.34 0.26 0.27 1.03 0.05 0.0 0.41 0.34 0.84 1.17
0.08 0.0 0.0 0.0 4.92 0.0 0.0 0.98 0.0 0.11 0.26 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.22 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.36 0.71 0.4 0.5 0.31 0.45 0.23 0.28 0.13 0.34 0.21 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.15 0.17 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.1 0.63 0.0 0.15 0.07 0.47 0.0 0.1 0.0 0.06 0.0 0.18 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.09 0.09 0.09 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 3.5 0.7 0.0 0.8 0.06 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.02 0.81 0.0 0.0 0.0 0.23 0.07 0.0 0.0
0.84 0.53 0.23 1.02 3.1 0.67 1.1 1.75 0.26 1.82 1.33 1.17 1.38 0.61 1.03 0.81 0.07 0.0 0.84 0.0 0.0 0.22 1.7 3.16 4.55 0.33 1.16 2.13 0.85 0.36 0.64 0.41
0.01 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.13 0.02 0.04 0.0 0.05 0.24 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.16 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo418240 (KUP3)
 0.1 0.05 0.49 0.16 1.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.8 0.05 0.19 0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.2 0.0 0.0 0.14 0.05 0.05 0.0
0.03 0.11 0.0 0.04 0.79 0.06 0.34 0.0 0.0 0.17 0.0 0.22 0.0 0.07 0.0 0.14 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.06 0.68 0.0 0.14 0.29 0.0 0.18 0.0 0.0
0.34 0.08 0.11 0.21 0.41 0.09 0.19 0.09 0.42 0.07 0.0 0.02 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo419328 (KAO2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.36 0.0 0.37 1.54 0.49 0.28 0.0 0.75 0.25 0.34 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 1.06 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.79 0.86 0.7 0.11 0.39 0.38 0.0 0.0 0.0 0.27 0.27 0.0 0.25 0.49 0.0 0.1 0.16 0.21 0.15
Smo422417 (PS1)
 3.74 8.01 12.28 9.15 17.68 10.51 9.14 11.49 19.52 16.03 8.3 4.8 0.49 0.16 0.03 0.28 2.61 2.27 2.18 0.0 0.0 0.0 1.63 1.29 2.49 5.57 2.29 1.83 3.04 2.05 3.45 2.71
0.15 0.03 0.62 0.47 1.72 0.42 0.17 0.18 1.27 0.91 0.18 0.35 0.08 0.25 0.02 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.26 0.07 0.0 0.16 0.0 0.0 0.07 0.04 0.04 0.03
0.57 0.87 0.59 0.74 1.96 0.81 0.36 0.71 2.22 1.13 2.04 1.69 0.87 0.96 0.76 1.0 0.67 0.47 1.31 0.05 0.1 1.18 1.14 1.01 0.9 1.84 1.38 0.57 0.9 0.92 0.59 0.49
0.36 0.48 0.52 0.19 1.26 0.13 0.55 0.52 0.5 0.65 0.77 0.26 0.39 0.32 0.5 0.32 0.11 0.1 0.78 0.0 0.2 0.0 0.07 0.0 0.84 0.64 0.41 0.55 0.09 0.03 0.04 0.09
0.01 0.0 0.02 0.01 0.65 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.1 0.02 0.02 0.04 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.47 0.08 0.12 0.22 0.0 0.02 0.14 0.07 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.02 0.0 0.08 0.02
0.16 0.09 0.07 0.07 0.4 0.13 0.16 0.19 0.14 0.22 0.14 0.19 0.04 0.09 0.09 0.07 0.05 0.07 0.2 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.25 0.13 0.13 0.12 0.12 0.1 0.09 0.02
6.55 8.59 5.98 7.27 11.73 7.76 7.22 6.48 10.44 6.22 6.42 6.32 4.33 5.02 7.0 5.05 2.75 0.69 4.36 0.74 2.74 5.51 3.86 4.78 1.87 4.02 3.75 4.36 2.62 3.12 2.7 3.11
0.03 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.05 0.06 0.03 0.05 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.55 0.08 0.21 1.1 0.05 0.26 0.0 0.21 0.18 0.0 0.0 1.11 0.26 0.0 0.22 0.05 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.31 0.15 0.0 0.52 0.12 0.46 0.09 0.0 0.05 0.0
2.19 0.56 0.15 2.06 10.63 6.36 1.17 0.0 7.81 0.08 2.95 1.52 0.78 1.87 2.51 3.26 0.0 0.87 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 0.0 0.0 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo5479 (CYP704B1)
 0.07 0.0 0.0 0.0 1.73 0.0 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.17 0.39 0.55 0.1 0.08 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06
0.12 0.0 0.0 0.0 1.78 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.1 0.0 0.08 0.0 1.86 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.68 0.79 0.38 0.15 0.08 0.08 0.15
4.07 5.89 7.96 5.9 9.06 4.31 4.13 2.64 3.17 2.53 3.55 4.34 2.08 2.6 3.15 1.34 1.86 1.46 5.98 0.0 0.8 0.0 1.47 0.64 0.0 1.48 2.76 1.55 2.62 2.53 1.22 1.76
0.26 0.04 0.0 0.0 3.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.67 0.0 1.88 6.94 7.15 3.88 11.43 6.52 3.17 0.0 4.84 0.0 0.27 0.0 1.43 2.24 0.75 6.13 0.96 0.0 0.0 0.0 4.89 3.28 0.0 0.0 3.01 0.0 3.62 3.22 1.11 1.79
0.0 0.06 0.0 0.33 0.67 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.09 0.14 0.0 0.15 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 2.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
4.95 2.11 1.2 1.73 5.01 1.74 1.4 2.5 4.5 3.44 3.97 3.3 0.13 0.15 0.08 1.36 0.64 0.58 1.09 0.0 1.04 0.0 0.06 0.45 0.74 5.75 5.13 5.35 0.73 0.48 1.02 0.83

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)