1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_83 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo101052 (NTMC2T4)
 -0.36 -0.02 0.33 0.54 0.56 0.32 0.52 0.5 0.26 0.16 0.03 0.01 -0.35 0.09 -0.65 0.18 -0.54 -1.23 0.12 -2.49 -1.42 -3.91 -0.24 -0.02 -0.04 0.58 0.71 0.71 -0.32 -0.3 0.09 -0.1
-0.04 0.06 0.2 0.24 0.27 0.21 0.17 0.23 0.03 0.02 0.13 -0.19 0.59 0.36 0.07 0.6 -0.09 -0.46 0.24 -3.78 -1.78 -4.83 0.33 0.24 0.72 -0.38 -0.19 -0.09 -0.16 -0.14 -0.05 -0.07
0.13 0.05 0.11 0.06 0.1 -0.22 -0.34 -0.08 0.02 0.32 0.2 0.3 0.55 -0.34 -0.8 0.42 0.15 -0.21 0.31 -5.73 -1.75 - 0.39 0.29 0.19 0.2 0.09 -0.05 0.33 0.49 0.25 0.08
-0.08 0.05 -0.13 0.14 0.42 0.17 0.47 0.51 0.12 0.2 -0.09 0.01 1.3 -1.55 -0.59 0.43 0.1 -0.7 0.88 -6.19 -1.49 - -0.26 -0.15 -0.6 -0.38 0.45 0.61 0.09 -0.09 -0.19 -0.13
0.2 0.12 -0.21 -0.09 0.02 -0.33 -0.56 -0.36 0.19 -0.13 0.07 -0.03 0.74 0.28 -0.52 0.83 -0.5 -0.38 0.38 -2.5 -1.55 -1.51 0.26 0.56 0.06 0.69 0.08 -0.17 -0.22 -0.1 0.33 0.35
-0.1 0.08 0.16 0.3 0.14 0.21 0.07 -0.01 0.1 0.01 0.1 0.07 -0.06 0.22 -0.65 0.29 -0.14 -0.5 0.26 -2.3 -0.15 -1.22 0.49 0.24 0.76 0.05 -0.04 0.2 -0.29 -0.22 -0.24 -0.21
0.24 0.08 0.04 0.04 -0.05 0.1 -0.03 0.17 0.25 0.29 0.25 0.16 0.25 -0.76 -1.46 0.73 0.03 -0.55 -0.11 -1.39 0.22 -0.14 -0.07 -0.01 0.55 0.07 -0.11 0.0 0.18 0.2 -0.64 -0.65
-0.28 -0.08 0.05 0.24 0.11 0.18 0.46 0.62 0.45 0.53 0.29 0.18 0.37 0.05 -0.27 0.58 -0.17 -0.42 0.34 -2.76 -2.07 -2.82 -0.05 0.08 0.18 0.43 -0.38 -0.37 0.11 0.06 -0.43 -0.43
0.26 0.06 -0.17 0.15 0.32 0.21 -0.1 0.09 0.08 0.19 0.06 0.19 0.92 -0.96 -1.64 0.82 -0.21 -0.57 0.6 - -4.67 -5.41 0.35 0.37 0.28 0.6 -0.62 -0.72 0.23 0.19 0.32 0.31
0.22 0.23 0.18 0.16 0.02 0.02 0.05 0.2 0.2 0.21 0.22 0.27 -0.01 0.31 0.46 0.5 -0.23 -0.58 0.66 -3.48 -1.89 -2.9 0.02 0.14 0.4 0.52 -0.54 -0.44 0.17 0.18 -0.47 -0.68
Smo167524 (IMPL1)
 0.43 0.33 0.09 0.24 0.15 -0.01 0.06 0.1 0.2 0.16 0.16 0.27 -0.39 0.46 0.12 -0.24 -0.03 -0.41 -0.08 -3.64 -0.44 -2.84 -0.03 0.06 1.03 -0.16 0.29 0.09 -0.23 -0.12 -0.21 -0.4
Smo170465 (ABC1)
 0.14 0.25 0.37 0.29 0.49 0.36 0.27 0.25 0.17 0.16 0.13 0.03 -0.1 -0.27 -1.65 -0.01 0.04 -0.44 0.45 -1.73 -0.49 -2.0 -0.08 -0.11 0.31 -0.15 -0.03 -0.12 0.26 0.21 0.02 0.03
Smo171378 (ATG18D)
 -0.04 0.16 0.19 0.2 0.25 0.12 0.34 0.51 0.46 0.65 0.58 0.43 0.07 -0.03 -0.19 0.36 -0.63 -0.88 0.38 -2.04 -0.87 -3.21 -0.21 -0.05 -0.05 0.07 -0.24 -0.46 -0.18 -0.11 -0.07 0.14
Smo172410 (PSAT1)
 -0.04 0.01 0.06 0.41 0.34 0.21 0.36 0.66 0.73 0.65 0.61 0.43 -0.28 0.11 -0.85 0.15 -0.25 -0.46 0.21 -2.69 -1.3 -3.03 -0.49 -0.74 0.24 0.43 -0.02 -0.12 -0.01 -0.16 -0.41 -0.16
Smo174745 (CCR2)
 0.02 0.02 -0.15 0.21 0.16 0.18 0.01 0.1 0.08 0.03 -0.14 -0.15 0.41 0.0 -0.77 1.1 0.19 -0.63 0.3 -2.54 -0.79 -1.8 -0.13 -0.25 0.87 0.05 0.32 0.59 0.01 -0.02 -0.58 -0.91
-0.21 -0.19 -0.09 0.06 0.08 0.01 0.0 0.12 0.12 0.04 0.05 -0.0 0.44 0.46 -0.14 0.64 -0.1 -0.79 0.52 -1.98 -0.52 -1.7 0.35 0.49 0.3 0.42 -0.29 -0.25 0.01 -0.0 -0.14 -0.46
Smo231344 (TGA2)
 -0.21 0.02 -0.04 0.07 0.24 0.11 -0.04 -0.07 0.04 -0.04 -0.03 -0.23 0.77 0.15 -1.63 0.68 -0.18 -0.74 0.37 -1.5 -1.23 -3.55 0.11 0.03 0.31 0.61 0.34 0.29 -0.13 -0.03 0.16 0.43
-0.67 -0.19 -0.16 0.19 0.27 0.25 0.4 0.57 0.44 0.54 0.24 0.05 0.17 -0.03 -0.97 0.5 -0.49 -1.09 0.31 -3.21 -1.73 -2.97 0.31 0.47 0.5 0.61 0.08 0.08 -0.21 -0.22 -0.15 -0.11
0.12 0.12 0.22 0.23 0.36 0.22 0.25 0.26 0.27 0.18 0.0 -0.02 0.13 -0.31 0.17 0.24 -0.22 -0.59 0.35 -1.79 -0.44 -2.62 -0.01 -0.02 0.3 0.05 0.17 0.39 0.09 0.16 -0.75 -0.59
0.26 -0.1 -0.42 -0.2 -0.19 -0.23 -0.08 0.19 0.3 0.34 0.27 0.43 0.28 0.44 -0.35 0.23 -0.33 -0.42 0.13 -2.02 -0.69 -3.88 -0.33 -0.14 0.62 0.42 0.35 0.24 -0.04 0.07 0.04 0.25
Smo402795 (RUS3)
 0.16 0.28 -0.16 0.28 0.46 0.3 -0.02 0.07 0.25 0.11 -0.13 -0.18 0.71 0.36 0.32 0.73 -0.18 -1.43 0.46 -2.46 -1.94 -4.77 0.09 0.42 0.77 0.05 -0.08 -0.16 -0.29 -0.18 -0.73 -0.67
Smo405738 (CLS)
 0.08 0.01 -0.27 0.22 0.47 0.2 0.1 0.12 0.16 0.22 -0.1 -0.06 0.41 -0.4 0.26 0.77 0.18 -0.31 0.41 -3.25 -2.07 -1.92 0.26 0.37 0.5 -0.5 -0.53 -0.6 0.36 0.23 -0.11 -0.21
0.36 0.21 -0.05 0.16 0.16 0.03 -0.2 0.04 0.16 0.13 0.24 0.31 0.07 0.32 0.63 0.51 -0.17 -1.48 0.4 -3.89 -1.43 -3.18 -0.24 -0.23 0.7 0.37 0.05 0.24 0.2 0.34 -0.85 -0.72
-0.16 0.12 -0.13 0.25 0.24 0.46 0.52 0.27 0.38 0.21 0.1 -0.05 0.0 -1.03 -1.85 0.21 -0.1 0.01 0.29 -3.02 -0.89 -3.04 -0.09 -0.07 0.58 -0.1 0.37 0.55 0.22 0.04 0.18 -0.09
0.02 0.47 -0.09 0.17 0.06 -0.11 -0.04 0.06 0.14 0.09 0.27 -0.06 -0.12 -0.98 -0.76 0.69 -0.19 -0.4 0.53 - -1.09 - 0.04 0.14 0.26 0.65 0.09 -0.32 0.27 0.37 0.43 0.51
Smo419690 (HA11)
 0.4 0.6 0.28 0.2 0.16 0.17 -0.04 -0.07 0.15 0.02 0.03 -0.06 1.28 -0.38 -3.26 0.86 -0.32 -0.43 0.45 -5.41 -2.96 - 0.39 0.25 -0.39 0.53 -0.14 -0.14 0.13 0.15 -0.31 -0.25
Smo42421 (RIN2)
 -0.37 0.01 0.17 0.11 0.3 0.07 0.34 0.68 0.56 0.54 0.48 0.37 0.62 -0.17 -1.12 0.44 -0.72 -1.11 0.14 -2.36 -1.38 -2.59 -0.06 0.17 0.18 0.53 -0.05 -0.14 -0.22 -0.19 -0.25 -0.05
-0.36 -0.18 -0.08 0.16 0.44 0.57 0.07 -0.08 -0.04 -0.23 -0.25 -0.44 0.01 0.34 -2.44 1.27 -0.03 -0.2 0.69 -2.07 -0.02 -3.46 0.27 -0.14 0.27 -0.17 0.25 0.67 0.1 0.18 -0.47 -1.08
Smo442186 (ERF1-3)
 0.12 -0.11 0.02 0.03 0.15 0.16 0.3 0.38 0.41 0.58 0.51 0.4 0.04 0.05 -0.05 0.15 -0.47 -0.37 0.24 -3.96 -1.66 -3.55 -0.15 -0.12 0.13 0.59 0.09 -0.18 -0.16 -0.13 0.05 0.16
0.4 0.24 0.09 0.22 0.2 0.21 -0.17 0.16 0.3 0.07 0.15 0.09 -0.07 0.37 0.24 0.01 0.15 -0.58 0.1 -2.13 -1.12 -3.05 0.33 0.23 0.3 0.17 0.4 0.3 -0.16 -0.16 -0.64 -0.66
-0.34 -0.2 -0.04 0.25 0.42 0.41 0.63 0.61 0.41 0.43 0.24 -0.02 0.02 -0.19 -1.12 0.17 -0.23 -0.91 0.16 -0.94 -0.8 -2.95 0.3 0.14 -0.02 0.43 0.32 0.33 -0.22 -0.23 -0.29 -0.53
0.07 -0.12 -0.26 -0.15 -0.12 -0.03 -0.16 0.06 0.1 0.18 -0.03 0.11 0.41 0.17 0.0 0.43 -0.08 -0.47 0.29 -2.26 -1.16 -3.06 0.17 0.24 0.57 0.06 0.17 0.11 0.04 0.12 0.25 0.47
0.17 0.0 0.14 0.25 0.3 0.35 -0.08 -0.04 0.19 0.16 0.04 -0.02 0.16 0.16 0.13 0.34 -0.13 -5.34 0.26 -2.67 -1.04 -3.44 0.3 0.44 0.6 0.62 0.17 0.08 -0.14 -0.15 -0.24 -0.07
0.3 0.32 0.07 0.47 0.16 0.4 0.21 0.47 0.25 0.21 0.34 0.29 0.07 -0.45 0.22 0.17 -0.41 -1.22 0.29 -5.0 -0.95 -5.84 0.01 0.15 0.26 0.3 0.4 0.18 -0.06 0.1 -0.72 -0.75
0.08 -0.05 -0.17 -0.03 0.07 -0.0 -0.09 -0.13 0.04 0.15 -0.18 0.08 0.15 0.29 -0.07 0.44 -0.05 -0.43 0.6 -2.41 -1.18 -3.92 0.07 0.07 0.54 0.6 0.19 0.16 0.1 0.12 0.05 0.07
Smo62955 (ROPGEF7)
 0.06 -0.05 0.08 0.2 0.2 0.33 -0.19 -0.09 0.15 -0.0 -0.07 -0.24 -0.36 -0.09 -1.32 0.22 0.07 -0.45 0.19 -1.77 -2.52 -7.19 0.81 0.47 0.1 0.83 0.63 0.76 -0.12 0.0 -0.1 -0.17
-0.01 0.22 0.11 0.21 0.09 0.07 -0.23 0.04 0.11 -0.0 -0.01 -0.24 0.28 0.12 -0.14 0.7 -0.24 -0.39 0.41 -2.15 -2.71 -5.78 0.69 0.69 0.98 -0.21 -0.14 -0.18 0.02 0.12 -0.39 -0.31
Smo73567 (MCT)
 -0.09 -0.13 -0.21 -0.06 -0.31 -0.01 -0.02 0.01 0.15 -0.1 -0.14 -0.1 0.11 0.39 0.1 0.26 0.01 0.08 0.02 -3.2 -1.31 -2.95 -0.05 0.19 0.94 0.1 0.57 0.71 0.18 0.16 -0.12 -0.19
0.06 0.13 0.12 0.28 0.4 0.42 0.42 0.61 0.39 0.49 0.29 0.31 -0.08 -0.4 -0.31 0.42 -0.23 -0.71 0.4 -3.39 -2.39 -3.62 0.01 0.15 0.03 0.22 -0.21 -0.16 0.09 -0.13 -0.08 -0.17
0.01 0.05 -0.11 0.21 0.28 0.2 -0.17 -0.03 0.22 -0.04 0.07 -0.01 0.08 0.27 0.2 0.25 -0.24 -0.57 0.39 -4.92 0.09 -2.06 0.12 0.07 0.77 -0.08 0.05 0.12 0.01 0.1 -0.27 -0.21
Smo81880 (SDG25)
 -0.14 0.05 0.13 0.11 0.25 0.37 -0.07 0.03 0.12 -0.12 0.08 -0.13 0.23 -0.23 -0.3 0.39 0.19 -0.05 0.57 -5.51 -1.09 -3.82 0.37 0.33 0.75 -0.26 0.06 -0.13 0.3 0.31 -0.35 -0.19
-0.22 0.05 -0.18 0.22 0.61 0.23 -0.08 0.33 0.22 0.26 0.04 0.0 0.53 -0.65 -0.31 0.39 -0.32 -0.25 1.02 -2.67 -3.76 -4.92 0.08 0.37 0.44 0.15 0.45 0.35 -0.13 -0.14 -0.69 -0.45
Smo82507 (CAX5)
 -0.17 -0.16 -0.03 0.11 -0.05 0.08 0.07 0.52 0.51 0.58 0.43 0.32 0.18 0.3 -0.55 0.33 -0.34 -0.71 0.18 -3.22 -1.27 -3.66 0.18 0.16 0.36 0.43 -0.19 -0.15 0.11 0.04 -0.08 -0.03
Smo84118 (TEJ)
 0.31 0.19 0.3 0.24 0.38 0.34 -0.05 0.12 0.25 0.22 0.02 0.25 0.03 0.04 0.03 0.1 -0.07 -1.28 0.58 -4.7 -0.61 -2.1 -0.05 -0.16 0.84 0.34 0.14 0.06 -0.11 -0.11 -0.62 -0.86
0.23 0.03 -0.18 0.14 0.24 0.04 -0.13 0.24 0.39 0.1 0.34 0.41 -0.31 -0.22 -0.22 0.12 -0.13 -0.67 0.42 -3.63 -2.54 -5.17 0.08 0.28 0.15 0.03 0.06 0.13 0.17 0.18 0.43 0.69
-0.19 0.11 0.13 0.31 0.27 0.38 0.16 -0.02 0.04 0.04 -0.13 0.02 0.01 -0.26 -0.9 0.33 -0.1 -0.3 0.35 -2.28 -1.3 -2.73 0.4 0.41 0.41 0.37 0.23 0.41 -0.12 -0.04 0.09 -0.02
-0.4 -0.11 -0.58 -0.09 -0.18 -0.15 -0.23 -0.09 0.09 0.13 0.0 0.05 0.78 0.19 -0.14 0.99 -0.26 -0.56 0.72 -2.86 -0.84 -1.95 0.13 0.29 0.35 0.29 -0.26 -0.36 0.07 0.07 0.31 0.37
Smo88682 (UBP27)
 0.03 -0.03 0.01 -0.01 0.07 0.19 -0.04 0.05 0.08 0.06 -0.12 -0.1 0.31 -0.2 -0.12 0.54 0.05 -0.83 0.57 -1.81 -1.15 -1.75 0.04 0.11 0.45 0.14 0.22 0.19 0.2 0.17 -0.03 0.15
0.42 0.05 -0.02 -0.22 -0.23 -0.02 -0.2 -0.2 -0.05 -0.05 -0.12 -0.03 0.19 0.37 -0.8 0.54 -0.31 -0.43 0.36 -3.96 -0.61 -2.95 0.09 0.22 0.02 0.39 0.68 0.41 0.03 0.01 0.51 0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.