1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_86 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.39 0.33 0.33 0.36 0.48 0.59 0.56 0.64 0.54 0.53 0.58 0.43 0.28 0.21 0.33 0.4 0.25 0.12 0.27 0.39 0.23 1.0 0.24 0.29 0.46 0.61 0.47 0.45 0.31 0.3 0.26 0.24
Smo110422 (OTP82)
 0.48 0.34 0.29 0.42 0.5 0.4 0.49 0.6 0.76 0.57 0.49 0.52 0.35 0.18 0.22 0.49 0.35 0.11 0.5 0.0 0.07 0.54 0.49 0.4 0.06 1.0 0.54 0.53 0.52 0.52 0.43 0.39
0.37 0.51 0.48 0.48 0.53 0.49 0.48 0.45 0.41 0.38 0.37 0.45 0.47 0.77 1.0 0.51 0.12 0.05 0.17 0.0 0.0 0.37 0.19 0.19 0.09 0.45 0.69 0.77 0.14 0.18 0.09 0.07
0.5 0.54 0.49 0.67 0.64 0.63 0.62 0.71 0.62 0.57 0.55 0.54 0.62 0.78 0.74 0.7 0.34 0.27 0.59 0.45 0.68 0.72 0.46 0.5 0.98 1.0 0.8 0.82 0.4 0.4 0.35 0.31
Smo143637 (PPa1)
 0.68 0.54 0.48 0.43 0.43 0.45 0.4 0.53 0.55 0.5 0.58 0.59 0.31 0.55 0.51 0.3 0.33 0.19 0.38 0.15 0.8 0.69 0.33 0.35 0.41 1.0 0.96 0.76 0.41 0.41 0.25 0.24
Smo143777 (FIE)
 0.55 0.44 0.47 0.5 0.54 0.58 0.55 0.69 0.78 0.73 0.71 0.65 0.42 0.4 0.64 0.49 0.35 0.18 0.52 0.18 0.22 0.77 0.43 0.5 0.31 1.0 0.76 0.83 0.4 0.4 0.45 0.36
Smo230635 (QSOX2)
 0.56 0.58 0.57 0.57 0.56 0.59 0.52 0.59 0.63 0.6 0.76 0.59 0.51 1.0 0.91 0.54 0.35 0.16 0.48 0.32 0.07 0.58 0.39 0.4 0.2 0.62 0.43 0.48 0.34 0.38 0.4 0.47
0.44 0.43 0.4 0.48 0.6 0.57 0.56 0.7 0.64 0.56 0.51 0.46 0.5 0.3 0.45 0.45 0.23 0.22 0.46 0.24 0.22 0.75 0.32 0.44 0.8 1.0 0.97 0.75 0.33 0.36 0.38 0.55
0.69 0.72 0.77 0.77 0.87 0.85 0.78 0.79 0.7 0.7 0.67 0.6 0.69 0.79 1.0 0.77 0.45 0.41 0.71 0.31 0.19 0.97 0.62 0.7 0.37 0.75 0.81 0.82 0.44 0.5 0.41 0.46
0.43 0.39 0.24 0.31 0.48 0.51 0.35 0.45 0.28 0.52 0.43 0.44 0.1 0.08 0.33 0.22 0.28 0.22 0.59 0.37 0.04 0.6 0.26 0.2 0.54 0.48 1.0 0.81 0.27 0.3 0.24 0.24
0.5 0.48 0.39 0.43 0.5 0.45 0.43 0.49 0.43 0.58 0.58 0.5 0.21 0.25 0.43 0.28 0.32 0.02 0.32 0.21 0.38 0.9 0.26 0.27 0.55 0.9 0.79 1.0 0.34 0.35 0.27 0.22
0.36 0.37 0.41 0.42 0.47 0.42 0.48 0.53 0.49 0.48 0.44 0.37 0.43 0.48 0.55 0.45 0.3 0.26 0.36 0.36 0.43 1.0 0.35 0.39 0.77 0.71 0.91 0.81 0.4 0.4 0.47 0.45
Smo404911 (ADL2)
 0.23 0.24 0.28 0.34 0.35 0.31 0.32 0.36 0.35 0.4 0.35 0.3 0.26 0.39 0.55 0.3 0.19 0.18 0.33 0.12 0.23 1.0 0.21 0.21 0.45 0.65 0.52 0.51 0.22 0.21 0.23 0.21
0.3 0.33 0.25 0.32 0.49 0.36 0.4 0.49 0.47 0.37 0.45 0.36 0.47 0.47 0.58 0.46 0.16 0.25 0.43 0.3 0.22 0.66 0.39 0.43 0.92 0.85 0.93 1.0 0.28 0.3 0.25 0.17
0.57 0.64 0.72 0.67 0.82 0.75 0.75 0.71 0.63 0.65 0.64 0.57 0.5 0.54 0.76 0.55 0.43 0.33 0.58 0.4 0.51 0.99 0.45 0.46 0.25 0.87 1.0 1.0 0.43 0.43 0.45 0.44
0.48 0.55 0.41 0.63 0.46 0.51 0.42 0.47 0.36 0.38 0.37 0.39 0.12 0.52 0.74 0.15 0.15 0.21 0.54 0.51 0.38 0.62 0.19 0.19 0.3 0.71 1.0 0.99 0.12 0.13 0.1 0.1
Smo407378 (GSTU25)
 0.35 0.42 0.48 0.4 0.44 0.4 0.57 0.43 0.49 0.47 0.45 0.39 0.06 0.32 0.43 0.16 0.27 0.18 0.26 0.02 0.16 0.78 0.11 0.1 0.13 0.89 1.0 0.66 0.17 0.19 0.12 0.1
0.34 0.26 0.37 0.34 0.31 0.37 0.29 0.48 0.44 0.41 0.42 0.35 0.28 0.34 0.48 0.29 0.34 0.13 0.39 0.07 0.61 1.0 0.36 0.36 0.69 0.77 0.85 0.8 0.32 0.3 0.33 0.37
0.35 0.51 0.42 0.37 0.42 0.39 0.39 0.52 0.52 0.33 0.43 0.48 0.44 0.31 0.35 0.46 0.23 0.02 0.36 0.08 0.08 0.52 0.29 0.27 0.16 1.0 0.4 0.43 0.27 0.29 0.18 0.18
Smo408729 (AAT2)
 0.23 0.32 0.12 0.14 0.12 0.15 0.35 0.58 0.39 0.31 0.38 0.33 0.0 1.0 0.68 0.01 0.05 0.06 0.04 0.0 0.0 0.94 0.0 0.01 0.41 0.73 0.41 0.28 0.04 0.12 0.0 0.0
0.36 0.32 0.38 0.41 0.58 0.47 0.47 0.59 0.58 0.53 0.48 0.4 0.34 0.28 0.64 0.33 0.2 0.04 0.31 0.19 0.31 0.92 0.25 0.3 0.45 0.95 1.0 0.84 0.2 0.21 0.24 0.4
0.3 0.29 0.32 0.39 0.41 0.5 0.64 0.78 0.93 1.0 0.96 0.56 0.44 0.28 0.64 0.53 0.22 0.2 0.43 0.37 0.16 0.66 0.27 0.29 0.46 0.99 0.93 0.83 0.43 0.44 0.26 0.29
Smo416931 (TDP1)
 0.14 0.16 0.09 0.15 0.23 0.17 0.24 0.3 0.26 0.19 0.26 0.16 0.3 0.14 0.41 0.33 0.19 0.07 0.48 0.04 0.0 0.56 0.39 0.37 0.08 1.0 0.28 0.26 0.19 0.32 0.23 0.13
0.03 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 0.19 0.09 0.05 0.17 0.29 0.12 0.29 0.97 0.03 0.19 0.12 1.0 0.28 0.16 0.17 0.08 0.03 0.0
0.34 0.33 0.33 0.35 0.27 0.31 0.34 0.36 0.42 0.42 0.43 0.4 0.39 0.36 0.66 0.54 0.31 0.21 0.48 0.33 0.51 1.0 0.26 0.3 0.31 0.98 0.47 0.53 0.38 0.38 0.22 0.19
Smo420649 (HIT1)
 0.48 0.5 0.47 0.5 0.46 0.46 0.47 0.57 0.56 0.56 0.57 0.52 0.5 0.57 0.84 0.52 0.29 0.19 0.4 0.32 0.22 0.89 0.36 0.39 0.22 1.0 0.7 0.67 0.31 0.34 0.43 0.49
0.51 0.57 0.54 0.55 0.55 0.49 0.38 0.5 0.47 0.48 0.5 0.47 0.39 0.54 1.0 0.59 0.26 0.17 0.41 0.44 0.24 0.44 0.29 0.29 0.12 0.96 0.75 0.87 0.3 0.29 0.39 0.26
0.19 0.2 0.18 0.19 0.22 0.26 0.24 0.25 0.28 0.23 0.18 0.21 0.24 0.17 0.47 0.26 0.18 0.0 0.25 0.1 0.3 1.0 0.2 0.21 0.52 0.87 0.44 0.49 0.17 0.15 0.08 0.12
0.48 0.35 0.36 0.52 0.53 0.55 0.87 0.84 0.79 0.78 0.63 0.7 0.04 0.2 0.27 0.04 0.37 0.21 0.31 0.35 0.14 1.0 0.12 0.14 0.88 0.68 0.71 0.64 0.45 0.47 0.39 0.44
0.42 0.42 0.47 0.39 0.48 0.39 0.42 0.4 0.47 0.47 0.54 0.4 0.4 0.32 0.25 0.49 0.32 0.19 0.5 0.01 0.22 0.59 0.37 0.38 0.37 1.0 0.92 0.9 0.35 0.36 0.34 0.35
0.49 0.39 0.34 0.17 0.29 0.51 0.5 0.72 0.31 0.34 0.51 0.3 0.07 0.81 0.3 0.14 0.01 0.07 0.08 0.55 0.0 0.82 0.17 0.09 0.26 0.9 1.0 0.78 0.06 0.07 0.06 0.0
0.06 0.11 0.26 0.29 0.21 0.17 0.24 0.26 0.2 0.18 0.12 0.08 0.17 0.07 0.22 0.16 0.12 0.08 0.14 0.13 0.09 0.66 0.12 0.09 0.3 1.0 0.36 0.36 0.05 0.05 0.03 0.06
Smo427521 (MCM9)
 0.2 0.22 0.17 0.24 0.47 0.26 0.32 0.38 0.42 0.46 0.36 0.26 0.32 0.19 1.0 0.31 0.27 0.24 0.42 0.36 0.33 0.92 0.16 0.16 0.47 0.6 0.37 0.64 0.21 0.24 0.11 0.07
0.43 0.46 0.27 0.39 0.45 0.41 0.52 0.53 0.45 0.53 0.39 0.36 0.05 0.21 0.24 0.07 0.03 0.07 0.09 0.35 0.43 1.0 0.1 0.04 0.3 0.9 0.87 0.62 0.06 0.06 0.06 0.05
0.65 0.53 0.47 0.62 0.86 0.75 0.81 0.67 0.5 0.46 0.5 0.51 0.14 0.45 0.97 0.21 0.09 0.27 0.14 0.51 0.42 0.96 0.1 0.17 0.41 1.0 0.98 0.98 0.11 0.1 0.11 0.11
0.47 0.43 0.46 0.49 0.6 0.49 0.47 0.42 0.49 0.48 0.49 0.44 0.4 0.28 0.27 0.47 0.3 0.16 0.51 0.06 0.21 0.69 0.4 0.38 0.3 1.0 0.46 0.49 0.32 0.36 0.2 0.19
0.43 0.21 0.31 0.28 0.39 0.3 0.34 0.7 0.47 0.44 0.37 0.28 0.13 0.1 0.39 0.16 0.14 0.07 0.46 0.61 0.15 0.72 0.19 0.26 0.86 0.73 1.0 0.72 0.22 0.25 0.24 0.22
Smo437421 (CYCT1;4)
 0.38 0.39 0.39 0.39 0.46 0.51 0.48 0.59 0.49 0.49 0.49 0.43 0.42 0.38 0.71 0.53 0.29 0.24 0.57 0.4 0.53 1.0 0.38 0.37 0.68 0.94 0.61 0.69 0.43 0.41 0.31 0.36
Smo437525 (GAUT11)
 0.41 0.42 0.45 0.48 0.53 0.58 0.57 0.66 0.63 0.65 0.64 0.47 0.48 0.51 0.67 0.52 0.37 0.29 0.51 0.45 0.33 0.91 0.37 0.4 0.32 1.0 0.8 0.89 0.35 0.39 0.3 0.29
Smo438401 (NRPA1)
 0.31 0.28 0.28 0.32 0.36 0.32 0.39 0.41 0.42 0.4 0.38 0.32 0.34 0.27 0.54 0.4 0.23 0.15 0.46 0.5 0.19 1.0 0.28 0.31 0.1 0.75 0.76 0.71 0.3 0.32 0.29 0.35
0.48 0.53 0.6 0.52 0.57 0.59 0.57 0.69 0.61 0.59 0.62 0.52 0.66 1.0 0.85 0.66 0.49 0.42 0.65 0.46 0.27 0.87 0.52 0.56 0.37 0.67 0.54 0.49 0.52 0.53 0.38 0.42
0.32 0.24 0.25 0.26 0.37 0.36 0.4 0.55 0.51 0.67 0.62 0.72 0.36 0.27 0.99 0.38 0.2 0.11 0.37 0.3 0.11 0.32 0.24 0.31 0.51 1.0 0.58 0.56 0.23 0.26 0.17 0.18
Smo446044 (SR45)
 0.59 0.48 0.4 0.47 0.52 0.5 0.56 0.68 0.68 0.68 0.67 0.7 0.42 0.38 0.81 0.45 0.3 0.2 0.52 0.38 0.31 0.93 0.4 0.47 0.45 1.0 0.64 0.55 0.36 0.37 0.44 0.49
0.33 0.27 0.27 0.43 0.52 0.57 0.65 0.79 0.74 0.62 0.63 0.44 0.21 0.25 1.0 0.24 0.25 0.44 0.22 0.55 0.47 0.96 0.42 0.75 0.54 0.73 0.98 0.95 0.25 0.36 0.21 0.2
0.42 0.43 0.39 0.42 0.52 0.65 0.61 0.9 0.78 0.91 0.63 0.52 0.35 0.2 0.69 0.34 0.44 0.37 0.47 0.31 0.2 0.7 0.41 0.28 0.43 0.98 0.96 1.0 0.46 0.45 0.47 0.54
0.57 0.5 0.53 0.56 0.7 0.7 0.68 0.8 0.67 0.73 0.65 0.58 0.81 0.63 0.86 0.87 0.49 0.42 0.83 0.93 0.49 0.8 0.63 0.75 0.53 1.0 0.81 0.84 0.57 0.64 0.73 0.86
0.28 0.28 0.25 0.28 0.23 0.21 0.25 0.37 0.38 0.33 0.34 0.36 0.34 0.3 0.63 0.31 0.13 0.1 0.26 0.08 0.07 0.61 0.27 0.3 0.32 1.0 0.36 0.21 0.27 0.27 0.15 0.12
0.52 0.53 0.53 0.54 0.59 0.57 0.55 0.67 0.62 0.56 0.52 0.52 0.53 0.51 0.63 0.51 0.38 0.33 0.53 0.25 0.88 0.79 0.44 0.51 0.85 0.91 1.0 0.98 0.43 0.44 0.4 0.37
0.25 0.25 0.34 0.33 0.36 0.43 0.48 0.52 0.5 0.45 0.36 0.34 0.38 0.21 0.82 0.4 0.32 0.27 0.43 0.14 0.38 0.75 0.27 0.28 0.57 1.0 0.55 0.55 0.35 0.37 0.25 0.36
Smo90336 (DLS1)
 0.85 0.92 0.85 0.88 0.92 0.89 0.89 0.85 0.87 0.9 0.85 0.9 0.76 0.78 0.78 0.83 0.56 0.39 0.79 0.54 0.48 0.96 0.66 0.66 0.8 1.0 0.94 0.99 0.56 0.61 0.79 0.86
0.26 0.18 0.21 0.25 0.36 0.39 0.52 0.66 0.65 0.82 0.66 0.71 0.32 0.2 0.86 0.26 0.17 0.05 0.32 0.04 0.06 0.15 0.28 0.45 0.34 1.0 0.29 0.3 0.24 0.27 0.21 0.23
0.58 0.57 0.52 0.52 0.59 0.64 0.66 0.68 0.83 0.82 0.76 0.71 0.41 0.21 0.31 0.55 0.37 0.18 0.47 0.45 0.54 0.92 0.41 0.47 0.64 1.0 0.61 0.54 0.48 0.52 0.44 0.44
Smo94768 (ANN5)
 0.3 0.33 0.36 0.42 0.44 0.25 0.48 0.36 0.42 0.38 0.37 0.51 0.02 0.85 0.41 0.08 0.02 0.12 0.15 0.01 0.43 0.87 0.04 0.06 0.25 1.0 0.8 0.71 0.03 0.04 0.06 0.05
0.68 0.63 0.51 0.64 0.66 0.63 0.55 0.56 0.54 0.62 0.68 0.67 0.71 0.81 1.0 0.74 0.47 0.35 0.53 0.41 0.1 0.52 0.53 0.62 0.44 0.56 0.59 0.68 0.36 0.41 0.43 0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)