1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.9 0.0 0.0 0.0 0.11 0.22 0.2 0.0 0.16 0.09 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.14 0.1 0.0 0.0 0.0 0.11 0.29 0.89 0.0 0.53 1.0 0.09 0.1 0.29 0.0
1.0 0.19 0.09 0.11 0.0 0.11 0.0 0.0 0.17 0.19 0.0 0.11 0.0 0.29 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.02 0.08 0.02 0.04 0.2 0.25 0.32 0.14 0.12 0.19 0.15 1.0 0.23 0.13 0.2 0.16 0.83 0.58 0.54 0.21 0.41 0.17 0.1 0.03
1.0 0.43 0.13 0.26 0.11 0.45 0.29 0.1 0.36 0.29 0.55 0.36 0.24 0.27 0.32 0.3 0.55 0.13 0.83 0.01 0.0 0.0 0.07 0.17 0.0 0.33 0.12 0.33 0.21 0.28 0.2 0.26
Smo136259 (TUB2)
 0.57 0.01 0.06 0.03 0.08 0.14 0.36 0.07 0.13 0.3 0.07 0.14 1.0 0.1 0.23 0.66 0.04 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.0 0.12 0.11 0.07 0.11 0.29 0.0 0.05
0.3 0.19 0.15 0.09 0.1 0.11 0.29 0.22 0.36 0.35 0.33 0.3 0.04 0.13 0.02 0.03 0.12 0.07 0.11 0.0 1.0 0.0 0.1 0.1 0.17 0.26 0.25 0.17 0.14 0.11 0.24 0.23
Smo172677 (ATB2)
 0.43 0.4 0.25 0.26 0.32 0.32 0.33 0.49 0.28 0.32 0.28 0.41 0.1 1.0 0.2 0.28 0.25 0.1 0.23 0.02 0.5 0.01 0.2 0.16 0.45 0.31 0.76 0.5 0.3 0.23 0.23 0.14
1.0 0.55 0.48 0.24 0.19 0.39 0.31 0.96 0.61 0.36 0.73 0.36 0.0 0.0 0.03 0.03 0.1 0.0 0.28 0.0 0.63 0.84 0.1 0.07 0.0 0.17 0.51 0.69 0.06 0.07 0.18 0.12
Smo180766 (ATB2)
 0.47 0.46 0.45 0.42 0.37 0.5 0.43 0.58 0.4 0.39 0.41 0.44 0.04 0.72 0.11 0.16 0.31 0.25 0.37 0.01 0.59 0.04 0.25 0.24 1.0 0.51 0.81 0.59 0.34 0.26 0.21 0.17
Smo36987 (NTT)
 0.81 0.55 0.68 0.52 0.54 0.57 0.4 0.5 0.62 0.68 0.64 0.72 0.52 0.5 0.56 1.0 0.44 0.43 1.0 0.0 0.11 0.0 0.22 0.18 0.49 0.75 0.46 0.65 0.45 0.48 0.44 0.43
0.44 0.15 0.08 0.02 0.28 0.07 0.08 0.5 0.66 0.26 0.58 0.25 0.04 0.09 0.1 0.04 0.07 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.07 0.07 0.27 0.14 0.18 0.0 0.09 0.03 0.03 0.0
0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.14 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.86 0.68 0.77 0.61 0.74 0.79 0.68 0.68 0.81 0.83 0.76 0.73 0.63 0.89 0.76 0.86 0.37 0.13 1.0 0.25 0.74 0.43 0.42 0.44 0.73 0.8 0.5 0.51 0.56 0.58 0.62 0.56
0.6 0.49 0.1 0.07 0.51 0.38 0.2 0.0 0.0 0.21 0.21 0.21 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.45 0.78 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.24 0.0 0.0 0.19 0.33 0.47 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.18 0.17
0.8 0.19 0.08 0.2 0.0 0.0 0.39 0.33 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.42 0.42 0.62 0.61 0.67 0.57 0.67 0.67 0.74 0.7 0.58 0.29 0.44 0.58 0.34 0.32 0.53 0.49 0.32 0.35 0.61 0.42 0.42 1.0 0.53 0.51 0.68 0.4 0.4 0.32 0.39
0.71 0.12 0.14 0.1 0.2 0.12 0.21 0.1 0.59 0.1 0.0 0.34 0.17 0.39 0.35 0.13 0.04 0.0 0.27 0.0 0.23 0.0 0.0 0.12 1.0 0.54 0.61 0.82 0.12 0.23 0.0 0.11
0.54 0.0 0.0 0.04 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.38 1.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.31 0.4 0.41 0.24 0.47 0.31 0.61 0.61 0.51 0.58 0.42 0.2 0.68 0.56 0.21 0.12 0.15 0.14 0.25 1.0 0.09 0.07 0.1 0.8 0.51 0.48 0.38 0.12 0.18 0.1 0.12
Smo410945 (PAP9)
 0.61 0.04 0.24 0.09 0.0 0.14 0.04 0.25 1.0 0.11 0.0 0.17 0.2 0.04 0.03 0.15 0.23 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.17 0.09 0.09 0.21
Smo411574 (CYP709B3)
 0.4 0.28 0.27 0.32 0.25 0.31 0.23 0.29 0.28 0.44 0.28 0.38 0.06 0.41 0.24 0.08 0.03 0.03 0.05 0.06 0.32 0.26 0.06 0.09 1.0 0.46 0.56 0.26 0.03 0.03 0.02 0.02
1.0 0.38 0.18 0.3 0.64 0.35 0.18 0.21 0.06 0.55 0.0 0.11 0.0 0.15 0.16 0.16 0.15 0.04 0.14 0.0 0.0 0.0 0.3 0.18 0.33 0.47 0.73 0.84 0.09 0.05 0.13 0.21
0.91 0.05 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.22 1.0 0.0 0.0 0.04 0.87 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.73 0.39 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo412723 (ELP3)
 0.09 0.1 0.0 0.03 0.65 0.19 0.07 0.03 0.31 0.2 0.08 0.2 0.03 0.16 0.74 0.0 0.08 0.0 0.29 0.0 1.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.26 0.31 0.0 0.02 0.03 0.03 0.02
0.28 0.19 0.17 0.23 0.21 0.2 0.19 0.19 0.25 0.27 0.23 0.22 0.33 0.28 0.22 0.13 0.27 0.12 0.2 0.02 1.0 0.35 0.11 0.17 0.63 0.05 0.04 0.06 0.19 0.15 0.22 0.12
1.0 0.46 0.4 0.33 0.0 0.24 0.56 0.38 0.13 0.34 0.08 0.33 0.0 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.08 0.14 0.0 0.76 0.2 0.0 0.15 0.44 0.0 0.28
Smo414626 (SBT5.4)
 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.52 0.0 0.21 0.12 0.3 0.0 0.24 0.68 0.13 0.16 0.18 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.59 0.86 0.76 0.77 0.74 0.89 0.99 0.82 0.86 0.83 0.59 0.91 0.34 0.86 0.34 0.88 0.69 0.21 0.87 1.0 0.89 0.12 0.13 0.22 0.31 0.23 0.16 0.51 0.45 0.49 0.42
1.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.2 0.0 0.15 0.45 0.62 0.41 0.17 0.22 0.0 0.0 0.46 0.63 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.21 0.0 0.0 0.45 0.0 0.94 0.2 0.58 0.37
0.25 0.21 0.34 0.36 0.43 0.34 0.32 0.41 0.36 0.43 0.33 0.4 0.15 0.17 0.29 0.18 0.1 0.02 0.14 0.18 0.49 0.27 0.1 0.13 1.0 0.36 0.25 0.37 0.08 0.08 0.05 0.05
0.36 0.43 0.43 0.3 0.48 0.38 0.45 0.3 0.83 0.54 0.29 0.26 0.19 0.66 0.42 0.16 0.07 0.18 0.1 0.13 1.0 0.72 0.04 0.02 0.64 0.17 0.21 0.47 0.11 0.1 0.07 0.05
Smo419476 (DSO)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.53 0.3 0.09 0.28 0.04 0.29 0.31 0.25 0.15 0.36 0.29 0.16 0.0 0.02 0.16 0.06 0.31 0.04 0.25 0.1 0.06 0.0 0.11 0.2 1.0 0.1 0.26 0.35 0.16 0.27 0.1 0.12
0.58 0.55 0.1 0.33 0.24 0.29 0.39 0.34 0.4 0.19 0.36 0.36 0.03 0.32 0.42 0.03 0.0 0.41 0.05 0.22 1.0 0.2 0.0 0.02 0.62 0.38 0.29 0.68 0.01 0.0 0.0 0.0
Smo423309 (PAP9)
 0.14 0.27 0.14 0.14 0.84 0.11 0.3 0.11 0.21 0.28 0.26 0.19 0.0 0.04 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.38 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0
Smo424862 (FIM1)
 0.56 0.19 0.19 0.25 0.09 0.22 0.24 0.18 0.06 0.1 0.08 0.14 0.0 0.21 0.19 0.04 0.1 0.0 0.04 0.47 1.0 0.32 0.0 0.0 0.28 0.07 0.13 0.34 0.0 0.04 0.0 0.0
0.46 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.15 0.0 0.34 1.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
0.65 1.0 0.08 0.03 0.15 0.23 0.26 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.29 0.29 0.29 0.08 0.06 0.14 0.42 0.18 0.06 0.9 0.09 0.14 0.08 0.12 0.06 0.0 0.08
0.55 0.57 0.22 0.38 0.47 0.46 0.36 0.57 0.58 0.54 0.6 0.46 0.02 0.0 0.08 0.13 0.13 0.0 0.52 0.81 0.84 1.0 0.2 0.4 0.06 0.43 0.15 0.15 0.12 0.18 0.2 0.14
0.88 0.31 0.11 0.24 0.07 0.43 0.31 0.11 0.18 0.23 0.0 0.8 0.0 0.08 0.33 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.3 0.59 0.35 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.09 0.33 0.04 0.09 0.17 0.11 0.11 0.43 0.25 0.11 0.37 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.11 0.11 0.08 0.01 0.01 0.02 0.01
0.14 0.09 0.33 0.04 0.09 0.17 0.11 0.11 0.43 0.25 0.11 0.37 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.11 0.11 0.08 0.01 0.01 0.02 0.01
0.85 0.12 0.0 0.23 0.0 0.0 0.41 0.07 0.05 0.16 0.14 0.12 0.0 0.0 0.08 0.07 0.2 0.14 0.25 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 1.0 0.14 0.17 0.31 0.24 0.51 0.25 0.0
Smo429997 (ELI3)
 0.61 0.24 0.19 0.31 0.12 0.21 0.16 0.24 0.48 0.4 0.5 0.49 0.11 0.13 0.09 0.15 0.18 0.02 0.3 0.05 1.0 0.0 0.2 0.25 0.45 0.54 0.34 0.16 0.25 0.25 0.11 0.09
0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.45 0.42 0.42 0.36 0.4 0.39 0.4 0.33 0.63 0.5 0.46 0.13 1.0 0.7 0.17 0.06 0.23 0.25 0.0 0.24 0.0 0.21 0.22 0.71 0.85 0.43 0.73 0.04 0.11 0.05 0.06
0.81 0.32 0.35 0.22 0.0 0.16 0.16 0.0 0.33 0.0 0.31 0.15 0.05 0.0 0.57 0.12 0.14 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.33 0.12 0.14 0.09 0.0
0.26 0.3 0.35 0.45 0.41 0.42 0.46 0.5 0.5 0.54 0.45 0.37 0.49 0.37 0.62 0.37 0.28 0.17 0.41 0.42 0.49 0.14 0.3 0.3 1.0 0.77 0.37 0.37 0.27 0.27 0.26 0.33
1.0 0.3 0.45 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.74 0.52 0.36 0.34 0.33 0.31 0.28 0.39 0.45 0.43 0.43 0.58 0.14 0.17 0.15 0.19 0.47 0.42 0.53 0.02 0.15 0.01 0.4 0.19 1.0 0.1 0.18 0.18 0.35 0.35 0.18 0.15
0.5 0.46 0.38 0.48 0.61 0.54 0.49 0.49 0.42 0.61 0.43 0.5 0.43 0.49 0.45 0.5 0.27 0.26 0.59 0.27 1.0 0.4 0.27 0.33 0.31 0.48 0.25 0.24 0.39 0.35 0.42 0.31
1.0 0.19 0.06 0.15 0.03 0.03 0.19 0.12 0.04 0.11 0.16 0.35 0.07 0.05 0.16 0.14 0.08 0.28 0.22 0.05 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.03 0.03 0.14 0.12 0.16 0.43 0.3
1.0 0.05 0.0 0.0 0.9 0.2 0.0 0.27 0.0 0.1 0.27 0.17 0.0 0.08 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.09 0.05 0.13
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.24 0.11 0.43 0.32 0.28 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.21 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.55 0.8 0.97 0.0 0.22 0.21 0.0 0.13
0.53 0.54 0.52 0.52 0.49 0.44 0.46 0.47 0.43 0.47 0.47 0.49 0.07 0.6 0.32 0.26 0.46 0.17 0.21 0.06 0.17 0.05 0.35 0.29 1.0 0.5 0.37 0.39 0.36 0.39 0.34 0.18
0.42 0.07 0.06 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.11 0.07 0.0 0.13 0.05 0.18 0.05 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.17 0.21 0.0 0.11 0.0 0.17 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)