1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.8 0.0 0.0 0.0 0.1 0.2 0.18 0.0 0.14 0.08 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0 0.09 0.25 0.79 0.0 0.47 0.89 0.08 0.09 0.26 0.0
0.25 0.05 0.02 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.03 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
4.31 0.18 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.33 0.19 0.68 0.18 0.38 1.76 2.27 2.89 1.23 1.08 1.67 1.32 8.9 2.02 1.19 1.74 1.45 7.41 5.17 4.8 1.91 3.65 1.55 0.93 0.3
0.76 0.33 0.1 0.2 0.09 0.34 0.22 0.07 0.27 0.22 0.42 0.27 0.18 0.21 0.24 0.23 0.42 0.1 0.63 0.01 0.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.25 0.09 0.25 0.16 0.21 0.15 0.2
Smo136259 (TUB2)
 0.33 0.01 0.04 0.02 0.05 0.08 0.21 0.04 0.07 0.17 0.04 0.08 0.58 0.06 0.13 0.38 0.03 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.0 0.07 0.06 0.04 0.06 0.17 0.0 0.03
3.0 1.9 1.51 0.9 1.03 1.12 2.88 2.18 3.59 3.59 3.33 3.0 0.42 1.3 0.21 0.35 1.25 0.73 1.07 0.03 10.11 0.04 1.03 1.0 1.76 2.61 2.51 1.77 1.46 1.13 2.41 2.36
Smo172677 (ATB2)
 26.91 24.82 15.35 16.51 19.98 20.01 20.63 30.76 17.62 19.88 17.45 25.32 6.35 62.32 12.67 17.55 15.34 6.53 14.58 1.09 31.39 0.38 12.41 9.86 28.03 19.26 47.49 31.22 18.49 14.37 14.04 8.76
1.54 0.85 0.74 0.37 0.29 0.6 0.48 1.47 0.94 0.55 1.13 0.55 0.0 0.0 0.05 0.05 0.15 0.0 0.44 0.0 0.97 1.3 0.16 0.1 0.0 0.26 0.79 1.07 0.1 0.1 0.28 0.18
Smo180766 (ATB2)
 14.47 14.24 13.87 13.11 11.37 15.5 13.26 17.99 12.32 12.23 12.6 13.76 1.09 22.39 3.51 4.84 9.5 7.67 11.42 0.41 18.37 1.29 7.67 7.32 31.01 15.66 25.06 18.14 10.57 7.99 6.52 5.29
Smo36987 (NTT)
 46.49 31.16 38.78 29.47 30.83 32.86 23.07 28.43 35.44 38.88 36.72 41.1 29.95 28.64 31.79 57.16 25.27 24.31 56.88 0.0 6.51 0.17 12.3 10.56 28.17 43.15 26.16 37.29 25.9 27.21 25.1 24.82
0.33 0.11 0.06 0.02 0.21 0.05 0.06 0.37 0.49 0.19 0.43 0.19 0.03 0.06 0.08 0.03 0.05 0.0 0.03 0.0 0.74 0.0 0.06 0.05 0.2 0.1 0.13 0.0 0.07 0.02 0.02 0.0
0.04 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.14 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.41 5.05 5.75 4.55 5.47 5.89 5.08 5.04 6.04 6.17 5.64 5.43 4.67 6.61 5.67 6.42 2.73 0.95 7.44 1.85 5.49 3.21 3.11 3.31 5.42 5.98 3.75 3.77 4.19 4.34 4.61 4.18
0.53 0.43 0.09 0.06 0.45 0.34 0.18 0.0 0.0 0.19 0.19 0.18 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.4 0.69 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.1 0.0 0.0 0.08 0.14 0.2 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.08 0.07
0.5 0.12 0.05 0.13 0.0 0.0 0.25 0.2 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0
6.28 4.6 4.57 6.78 6.72 7.34 6.25 7.36 7.28 8.09 7.66 6.31 3.17 4.8 6.38 3.68 3.47 5.83 5.39 3.5 3.87 6.64 4.56 4.64 10.94 5.85 5.55 7.41 4.35 4.39 3.5 4.26
0.63 0.11 0.12 0.09 0.18 0.11 0.19 0.09 0.52 0.08 0.0 0.3 0.15 0.35 0.31 0.12 0.04 0.0 0.24 0.0 0.21 0.0 0.0 0.11 0.88 0.47 0.53 0.72 0.1 0.21 0.0 0.09
0.35 0.0 0.0 0.03 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.25 0.66 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.83 1.18 1.53 1.56 0.91 1.81 1.19 2.37 2.33 1.97 2.22 1.63 0.78 2.63 2.14 0.83 0.46 0.59 0.54 0.98 3.85 0.33 0.26 0.37 3.09 1.95 1.86 1.47 0.47 0.7 0.39 0.47
Smo410945 (PAP9)
 0.49 0.03 0.19 0.07 0.0 0.11 0.03 0.2 0.8 0.09 0.0 0.13 0.16 0.03 0.02 0.12 0.18 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.07 0.07 0.17
Smo411574 (CYP709B3)
 2.85 2.02 1.95 2.27 1.8 2.24 1.65 2.08 2.0 3.13 2.04 2.73 0.43 2.91 1.7 0.61 0.23 0.23 0.34 0.44 2.32 1.88 0.44 0.63 7.19 3.27 4.01 1.84 0.22 0.22 0.12 0.11
0.34 0.13 0.06 0.1 0.21 0.12 0.06 0.07 0.02 0.19 0.0 0.04 0.0 0.05 0.06 0.05 0.05 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06 0.11 0.16 0.25 0.28 0.03 0.02 0.04 0.07
0.23 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.26 0.0 0.0 0.01 0.22 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Smo412723 (ELP3)
 0.08 0.09 0.0 0.02 0.55 0.16 0.06 0.02 0.26 0.17 0.07 0.17 0.03 0.13 0.63 0.0 0.07 0.0 0.25 0.0 0.85 0.0 0.07 0.02 0.0 0.22 0.27 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02
4.38 3.03 2.6 3.52 3.31 3.14 3.02 2.95 3.82 4.16 3.56 3.43 5.16 4.4 3.41 2.09 4.25 1.92 3.13 0.32 15.55 5.47 1.78 2.63 9.73 0.82 0.57 1.0 2.95 2.41 3.4 1.91
1.63 0.75 0.64 0.54 0.0 0.39 0.9 0.62 0.22 0.56 0.13 0.53 0.0 0.24 0.09 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.13 0.23 0.0 1.24 0.33 0.0 0.24 0.72 0.0 0.46
Smo414626 (SBT5.4)
 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.17 0.0 0.07 0.04 0.1 0.0 0.08 0.23 0.04 0.05 0.06 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.23 2.93 4.25 3.79 3.84 3.65 4.4 4.9 4.06 4.26 4.12 2.95 4.5 1.67 4.29 1.71 4.34 3.41 1.04 4.34 4.96 4.44 0.62 0.66 1.09 1.56 1.12 0.8 2.55 2.26 2.45 2.07
0.15 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.02 0.07 0.09 0.06 0.03 0.03 0.0 0.0 0.07 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.14 0.03 0.09 0.06
1.31 1.13 1.79 1.91 2.27 1.79 1.71 2.17 1.93 2.29 1.78 2.12 0.8 0.92 1.54 0.94 0.51 0.11 0.75 0.94 2.62 1.42 0.55 0.69 5.33 1.91 1.34 1.98 0.44 0.44 0.27 0.25
0.73 0.87 0.87 0.6 0.96 0.77 0.91 0.61 1.67 1.08 0.57 0.53 0.38 1.32 0.85 0.32 0.15 0.36 0.2 0.27 2.01 1.44 0.08 0.05 1.28 0.33 0.43 0.94 0.23 0.2 0.14 0.09
Smo419476 (DSO)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.63 0.36 0.11 0.34 0.05 0.35 0.37 0.3 0.18 0.43 0.34 0.19 0.0 0.03 0.19 0.07 0.37 0.05 0.3 0.12 0.07 0.0 0.13 0.23 1.2 0.12 0.31 0.41 0.2 0.33 0.12 0.14
1.34 1.26 0.23 0.77 0.55 0.67 0.9 0.79 0.92 0.44 0.83 0.83 0.07 0.74 0.96 0.07 0.0 0.95 0.12 0.5 2.31 0.46 0.0 0.06 1.44 0.88 0.66 1.57 0.03 0.0 0.0 0.0
Smo423309 (PAP9)
 0.54 1.03 0.51 0.52 3.16 0.4 1.13 0.42 0.77 1.05 0.97 0.71 0.0 0.15 0.52 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 3.74 0.0 0.0 0.0 0.0 1.77 1.41 0.42 0.05 0.0 0.0 0.0
Smo424862 (FIM1)
 1.11 0.38 0.37 0.5 0.18 0.44 0.48 0.35 0.12 0.2 0.16 0.29 0.0 0.41 0.37 0.08 0.19 0.0 0.07 0.94 1.97 0.63 0.0 0.0 0.55 0.14 0.26 0.67 0.0 0.07 0.0 0.0
0.44 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.15 0.0 0.32 0.95 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.65 1.01 0.08 0.03 0.15 0.23 0.26 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.29 0.29 0.3 0.08 0.06 0.15 0.42 0.18 0.06 0.91 0.09 0.14 0.08 0.12 0.06 0.0 0.08
3.33 3.43 1.31 2.31 2.8 2.77 2.18 3.4 3.48 3.26 3.58 2.79 0.1 0.01 0.46 0.81 0.8 0.0 3.12 4.85 5.04 6.01 1.22 2.4 0.37 2.57 0.88 0.89 0.7 1.1 1.21 0.83
0.54 0.19 0.07 0.14 0.05 0.26 0.19 0.07 0.11 0.14 0.0 0.49 0.0 0.05 0.2 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.18 0.36 0.22 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.31 1.19 0.15 0.33 0.6 0.41 0.41 1.57 0.9 0.39 1.34 0.08 0.0 0.04 0.04 0.04 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 3.63 0.39 0.39 0.3 0.04 0.04 0.07 0.03
0.51 0.31 1.19 0.15 0.33 0.6 0.41 0.41 1.57 0.9 0.39 1.34 0.08 0.0 0.04 0.04 0.04 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 3.63 0.39 0.39 0.3 0.04 0.04 0.07 0.03
0.61 0.08 0.0 0.17 0.0 0.0 0.3 0.05 0.04 0.11 0.1 0.09 0.0 0.0 0.06 0.05 0.15 0.1 0.18 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.72 0.1 0.13 0.22 0.18 0.37 0.18 0.0
Smo429997 (ELI3)
 4.37 1.72 1.4 2.22 0.83 1.52 1.17 1.71 3.47 2.89 3.61 3.51 0.77 0.97 0.62 1.1 1.3 0.17 2.15 0.39 7.2 0.0 1.42 1.77 3.22 3.92 2.42 1.16 1.81 1.77 0.79 0.63
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.77 1.91 1.75 1.78 1.51 1.7 1.65 1.69 1.4 2.65 2.1 1.96 0.56 4.22 2.94 0.7 0.25 0.97 1.06 0.0 1.01 0.0 0.89 0.95 3.01 3.59 1.8 3.09 0.19 0.47 0.2 0.27
0.31 0.12 0.13 0.08 0.0 0.06 0.06 0.0 0.13 0.0 0.12 0.06 0.02 0.0 0.22 0.04 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.13 0.05 0.05 0.03 0.0
67.68 78.25 92.54 119.23 108.35 110.34 121.25 130.96 132.32 141.33 117.37 97.25 129.77 96.88 163.67 97.03 74.26 43.42 108.17 109.3 128.64 36.58 77.99 80.16 262.92 201.66 98.54 96.44 71.66 72.26 68.34 85.82
0.36 0.11 0.16 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
25.08 17.63 12.12 11.55 11.39 10.68 9.4 13.29 15.44 14.57 14.81 19.74 4.76 5.69 5.24 6.43 16.08 14.43 17.98 0.57 5.01 0.38 13.58 6.31 34.09 3.39 6.16 6.26 11.98 11.94 6.06 5.25
7.39 6.84 5.62 7.07 9.09 8.02 7.32 7.29 6.26 9.02 6.37 7.45 6.41 7.26 6.74 7.45 4.04 3.92 8.71 4.08 14.86 5.94 4.05 4.88 4.59 7.15 3.7 3.56 5.86 5.15 6.29 4.61
17.39 3.34 0.98 2.69 0.53 0.53 3.3 2.07 0.78 1.97 2.81 6.07 1.27 0.87 2.75 2.42 1.45 4.83 3.86 0.87 0.0 0.0 1.19 1.18 0.0 0.51 0.59 2.39 2.01 2.86 7.39 5.15
5.22 0.28 0.0 0.0 4.71 1.05 0.0 1.42 0.0 0.52 1.4 0.91 0.0 0.39 0.27 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.47 0.26 0.68
3.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.44 0.82 0.37 1.48 1.11 0.97 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.73 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.22 0.21 1.91 2.76 3.35 0.0 0.75 0.72 0.0 0.46
65.67 67.93 64.98 65.34 61.08 54.37 57.18 59.23 53.43 58.75 58.28 61.68 8.83 74.61 40.43 32.92 57.14 20.61 25.86 8.1 21.21 5.89 43.64 35.84 124.77 61.91 46.67 48.09 44.66 48.63 42.94 23.05
1.32 0.22 0.19 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.23 0.0 0.36 0.22 0.0 0.4 0.17 0.57 0.17 0.0 3.17 0.0 0.0 0.0 1.06 0.55 0.68 0.0 0.36 0.0 0.53 0.17

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)