1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.43 0.45 0.47 0.48 0.52 0.54 0.61 0.59 0.53 0.48 0.45 0.43 0.54 0.54 1.0 0.61 0.57 0.43 0.58 0.82 0.5 0.49 0.55 0.55 0.61 0.48 0.61 0.61 0.52 0.5 0.47 0.43
Smo108652 (CRR22)
 0.35 0.32 0.32 0.31 0.49 0.37 0.48 0.34 0.4 0.2 0.34 0.22 0.17 0.45 1.0 0.23 0.29 0.22 0.28 0.44 0.05 0.1 0.24 0.18 0.26 0.27 0.51 0.51 0.17 0.19 0.12 0.2
Smo136241 (EMB2758)
 0.21 0.12 0.14 0.16 0.25 0.39 0.45 0.46 0.51 0.4 0.31 0.25 0.13 0.08 1.0 0.2 0.17 0.08 0.17 0.24 0.0 0.0 0.16 0.17 0.0 0.16 0.29 0.31 0.24 0.23 0.33 0.29
0.37 0.29 0.3 0.31 0.31 0.36 0.36 0.46 0.34 0.52 0.39 0.39 0.4 0.88 1.0 0.45 0.15 0.04 0.23 0.31 0.09 0.16 0.24 0.22 0.21 0.66 0.72 0.62 0.14 0.12 0.16 0.16
Smo1587 (CYP78A7)
 0.15 0.18 0.15 0.14 0.22 0.2 0.2 0.26 0.2 0.21 0.2 0.19 0.99 0.62 1.0 0.96 0.12 0.13 0.91 0.01 0.08 0.04 0.16 0.23 0.15 0.29 0.14 0.21 0.23 0.32 0.13 0.1
Smo166175 (RPN5B)
 0.36 0.34 0.33 0.37 0.39 0.39 0.39 0.42 0.4 0.41 0.41 0.37 0.43 0.79 1.0 0.43 0.24 0.2 0.36 0.54 0.24 0.35 0.27 0.31 0.69 0.52 0.48 0.48 0.24 0.27 0.25 0.24
Smo167367 (NOP56)
 0.2 0.24 0.26 0.28 0.32 0.36 0.39 0.33 0.26 0.23 0.21 0.19 0.29 0.24 1.0 0.34 0.24 0.2 0.37 0.48 0.04 0.22 0.25 0.26 0.21 0.46 0.59 0.68 0.24 0.27 0.14 0.14
Smo228494 (SEC22)
 0.51 0.47 0.43 0.44 0.44 0.43 0.4 0.5 0.44 0.44 0.47 0.4 0.61 0.93 1.0 0.63 0.32 0.3 0.53 0.48 0.51 0.3 0.48 0.56 0.5 0.73 0.73 0.64 0.32 0.33 0.37 0.41
Smo234054 (HCC1)
 0.4 0.35 0.34 0.44 0.44 0.68 0.59 0.67 0.54 0.42 0.37 0.38 0.45 0.33 1.0 0.44 0.38 0.39 0.51 0.52 0.39 0.14 0.47 0.46 0.52 0.41 0.67 0.67 0.36 0.41 0.32 0.36
0.25 0.29 0.27 0.3 0.33 0.32 0.33 0.29 0.24 0.2 0.24 0.23 0.34 0.81 1.0 0.33 0.25 0.27 0.3 0.55 0.3 0.33 0.25 0.28 0.26 0.49 0.56 0.47 0.2 0.21 0.29 0.31
Smo36509 (SNP33)
 0.04 0.04 0.1 0.07 0.03 0.06 0.09 0.1 0.11 0.04 0.05 0.05 0.29 0.14 1.0 0.27 0.15 0.19 0.11 0.39 0.27 0.44 0.02 0.01 0.05 0.02 0.03 0.06 0.08 0.1 0.04 0.06
0.35 0.31 0.35 0.35 0.46 0.39 0.4 0.3 0.32 0.25 0.26 0.23 0.39 0.74 1.0 0.5 0.29 0.37 0.53 0.43 0.24 0.13 0.37 0.43 0.31 0.35 0.65 0.58 0.33 0.36 0.27 0.36
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.13 0.0 0.06 0.0 0.08 0.0 0.69 0.22 0.97 0.79 0.0 0.24 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.16 0.18 0.35 0.23 0.0 0.15 0.22
Smo403930 (CDT1)
 0.24 0.25 0.27 0.29 0.37 0.34 0.37 0.39 0.42 0.38 0.43 0.28 0.28 0.26 1.0 0.27 0.21 0.16 0.26 0.46 0.16 0.21 0.22 0.26 0.24 0.33 0.28 0.32 0.22 0.24 0.19 0.22
0.04 0.08 0.06 0.1 0.09 0.14 0.09 0.08 0.02 0.06 0.16 0.09 0.17 0.16 1.0 0.31 0.04 0.03 0.17 0.37 0.16 0.05 0.07 0.09 0.19 0.29 0.28 0.24 0.06 0.1 0.07 0.14
0.28 0.32 0.39 0.35 0.42 0.4 0.48 0.24 0.34 0.34 0.32 0.34 0.29 0.97 1.0 0.34 0.11 0.04 0.67 0.96 0.22 0.57 0.1 0.14 0.76 0.71 0.53 0.85 0.07 0.13 0.02 0.03
Smo406783 (PPR596)
 0.12 0.18 0.22 0.25 0.34 0.34 0.34 0.2 0.14 0.12 0.11 0.1 0.19 0.08 1.0 0.19 0.22 0.17 0.29 0.55 0.03 0.27 0.19 0.24 0.5 0.2 0.41 0.45 0.14 0.18 0.09 0.09
0.27 0.32 0.29 0.38 0.39 0.41 0.36 0.4 0.36 0.37 0.37 0.28 0.59 0.49 1.0 0.57 0.4 0.23 0.55 0.63 0.09 0.38 0.32 0.36 0.27 0.41 0.45 0.57 0.42 0.4 0.2 0.22
0.15 0.19 0.23 0.24 0.2 0.24 0.35 0.29 0.29 0.14 0.15 0.18 0.17 0.14 1.0 0.22 0.28 0.2 0.34 0.52 0.05 0.05 0.23 0.21 0.24 0.36 0.38 0.46 0.27 0.23 0.1 0.05
0.09 0.18 0.19 0.21 0.09 0.0 0.16 0.16 0.07 0.21 0.05 0.06 0.04 0.11 1.0 0.07 0.06 0.0 0.28 0.71 0.0 0.41 0.1 0.04 0.08 0.16 0.21 0.35 0.1 0.06 0.08 0.09
0.06 0.09 0.03 0.04 0.08 0.08 0.08 0.03 0.07 0.12 0.08 0.06 0.05 0.07 1.0 0.07 0.06 0.06 0.23 0.98 0.04 0.0 0.02 0.03 0.12 0.07 0.06 0.0 0.05 0.05 0.04 0.03
0.06 0.05 0.06 0.07 0.03 0.06 0.06 0.07 0.08 0.05 0.06 0.05 0.08 0.76 1.0 0.2 0.04 0.07 0.05 0.34 0.04 0.21 0.03 0.04 0.04 0.02 0.09 0.11 0.03 0.05 0.03 0.03
0.13 0.15 0.18 0.23 0.3 0.29 0.26 0.18 0.2 0.23 0.24 0.18 0.08 0.03 0.91 0.14 0.3 0.17 0.14 1.0 0.19 0.66 0.16 0.09 0.06 0.18 0.35 0.47 0.16 0.22 0.07 0.04
Smo414001 (PAKRP1)
 0.1 0.1 0.14 0.13 0.13 0.13 0.15 0.1 0.14 0.12 0.13 0.1 0.09 0.05 1.0 0.1 0.18 0.12 0.11 0.73 0.06 0.3 0.04 0.04 0.05 0.04 0.08 0.11 0.09 0.1 0.06 0.05
0.15 0.19 0.18 0.19 0.18 0.2 0.18 0.12 0.23 0.15 0.15 0.13 0.09 0.06 1.0 0.16 0.16 0.09 0.16 0.35 0.11 0.37 0.03 0.02 0.03 0.11 0.18 0.24 0.09 0.13 0.04 0.04
0.04 0.05 0.04 0.11 0.16 0.07 0.04 0.09 0.07 0.08 0.06 0.05 0.27 0.55 1.0 0.3 0.02 0.0 0.15 0.46 0.07 0.04 0.02 0.05 0.06 0.1 0.14 0.18 0.01 0.02 0.02 0.01
0.07 0.1 0.03 0.13 0.17 0.1 0.07 0.08 0.11 0.08 0.07 0.09 0.43 0.44 1.0 0.64 0.03 0.01 0.53 0.33 0.03 0.08 0.04 0.08 0.11 0.14 0.15 0.14 0.03 0.07 0.02 0.02
Smo417560 (MRP5)
 0.06 0.05 0.04 0.1 0.08 0.1 0.13 0.1 0.08 0.07 0.1 0.11 0.54 0.49 1.0 0.29 0.04 0.19 0.7 0.08 0.0 0.0 0.07 0.05 0.1 0.06 0.14 0.12 0.04 0.05 0.03 0.03
0.21 0.16 0.14 0.29 0.22 0.31 0.28 0.29 0.34 0.4 0.42 0.29 0.51 0.71 1.0 0.46 0.17 0.19 0.41 0.67 0.27 0.5 0.38 0.54 0.38 0.27 0.28 0.28 0.22 0.28 0.25 0.27
Smo418055 (MK)
 0.32 0.35 0.23 0.31 0.25 0.33 0.3 0.28 0.4 0.32 0.28 0.31 0.2 0.61 1.0 0.24 0.1 0.12 0.18 0.77 0.4 0.27 0.14 0.16 0.67 0.48 0.36 0.32 0.12 0.16 0.06 0.07
Smo418913 (TSK)
 0.13 0.22 0.22 0.26 0.27 0.28 0.27 0.18 0.21 0.14 0.16 0.14 0.08 0.08 1.0 0.13 0.22 0.08 0.17 0.91 0.05 0.51 0.08 0.05 0.07 0.08 0.18 0.25 0.14 0.19 0.04 0.06
0.13 0.21 0.2 0.27 0.2 0.34 0.22 0.19 0.13 0.25 0.17 0.19 0.11 0.65 0.68 0.11 0.02 0.0 0.04 1.0 0.13 0.52 0.05 0.09 0.4 0.31 0.18 0.24 0.05 0.02 0.03 0.03
0.1 0.07 0.13 0.15 0.14 0.14 0.15 0.04 0.06 0.04 0.05 0.08 0.71 0.88 1.0 0.32 0.16 0.09 0.52 0.31 0.24 0.25 0.13 0.12 0.22 0.07 0.47 0.46 0.07 0.16 0.08 0.1
0.15 0.15 0.11 0.15 0.15 0.14 0.15 0.12 0.2 0.1 0.14 0.1 0.36 0.63 1.0 0.4 0.12 0.46 0.24 0.24 0.14 0.0 0.17 0.29 0.4 0.15 0.24 0.21 0.1 0.12 0.11 0.12
0.19 0.18 0.06 0.23 0.12 0.23 0.28 0.16 0.37 0.2 0.25 0.26 0.15 0.78 1.0 0.14 0.03 0.01 0.04 0.36 0.02 0.02 0.1 0.05 0.02 0.39 0.71 0.7 0.01 0.05 0.04 0.03
Smo431276 (HCT)
 0.05 0.06 0.09 0.06 0.11 0.08 0.07 0.03 0.04 0.03 0.06 0.05 0.09 0.18 1.0 0.16 0.05 0.25 0.03 0.53 0.02 0.31 0.05 0.06 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.05 0.03 0.05
Smo438068 (MCM6)
 0.24 0.31 0.27 0.35 0.37 0.34 0.34 0.26 0.26 0.24 0.24 0.24 0.28 0.3 1.0 0.34 0.39 0.21 0.28 0.69 0.19 0.4 0.2 0.2 0.34 0.27 0.37 0.31 0.24 0.28 0.14 0.13
Smo440021 (RPA2)
 0.29 0.34 0.36 0.39 0.46 0.41 0.44 0.43 0.39 0.36 0.37 0.33 0.15 0.14 1.0 0.18 0.25 0.14 0.23 0.76 0.18 0.64 0.19 0.16 0.4 0.36 0.5 0.43 0.21 0.22 0.2 0.16
Smo442045 (RMI1)
 0.14 0.16 0.11 0.17 0.16 0.23 0.26 0.22 0.12 0.16 0.13 0.15 0.1 0.27 0.81 0.12 0.08 0.04 0.09 1.0 0.22 0.55 0.07 0.06 0.1 0.08 0.43 0.33 0.05 0.05 0.04 0.04
Smo442428 (CYCA1;1)
 0.1 0.11 0.12 0.12 0.13 0.15 0.15 0.09 0.14 0.08 0.14 0.08 0.08 0.02 1.0 0.16 0.15 0.07 0.08 0.42 0.05 0.44 0.05 0.05 0.03 0.03 0.08 0.1 0.07 0.12 0.06 0.09
Smo443310 (ASE2)
 0.34 0.48 0.48 0.4 0.46 0.5 0.53 0.51 0.46 0.4 0.43 0.38 0.36 0.23 0.97 0.43 0.31 0.22 0.54 0.5 0.05 0.43 0.3 0.3 0.53 1.0 0.79 0.89 0.41 0.41 0.14 0.1
Smo446235 (MEI1)
 0.33 0.35 0.38 0.39 0.43 0.39 0.39 0.43 0.4 0.42 0.41 0.39 0.33 0.34 1.0 0.46 0.32 0.17 0.62 0.65 0.27 0.39 0.33 0.32 0.57 0.75 0.46 0.51 0.33 0.36 0.25 0.2
Smo52147 (OTP84)
 0.18 0.11 0.17 0.27 0.38 0.38 0.56 0.3 0.27 0.19 0.22 0.17 0.14 0.07 1.0 0.21 0.22 0.24 0.25 0.43 0.0 0.01 0.16 0.19 0.06 0.17 0.49 0.3 0.13 0.19 0.17 0.16
Smo54873 (KCO5)
 0.05 0.1 0.03 0.1 0.2 0.11 0.05 0.04 0.05 0.14 0.17 0.08 0.22 0.17 1.0 0.28 0.05 0.11 0.72 0.0 0.0 0.02 0.07 0.13 0.06 0.09 0.08 0.08 0.08 0.1 0.06 0.21
0.08 0.11 0.1 0.14 0.16 0.16 0.13 0.16 0.13 0.14 0.17 0.11 0.08 0.32 1.0 0.17 0.02 0.32 0.22 0.76 0.02 0.05 0.01 0.01 0.0 0.08 0.17 0.18 0.02 0.03 0.06 0.1
0.07 0.05 0.04 0.08 0.05 0.13 0.13 0.11 0.12 0.1 0.12 0.08 0.41 0.49 1.0 0.55 0.07 0.06 0.11 0.57 0.09 0.43 0.07 0.06 0.21 0.2 0.25 0.24 0.06 0.09 0.07 0.07
Smo79780 (EBP1)
 0.29 0.36 0.34 0.39 0.37 0.42 0.41 0.37 0.31 0.3 0.25 0.25 0.47 0.43 1.0 0.49 0.34 0.32 0.54 0.37 0.07 0.24 0.38 0.43 0.46 0.48 0.52 0.49 0.32 0.32 0.39 0.34
Smo81450 (PSF3)
 0.1 0.17 0.05 0.14 0.14 0.13 0.15 0.09 0.15 0.08 0.14 0.09 0.07 0.11 1.0 0.22 0.11 0.04 0.07 0.29 0.12 0.48 0.06 0.03 0.03 0.05 0.04 0.05 0.09 0.11 0.03 0.02
Smo81986 (CBF5)
 0.26 0.31 0.3 0.32 0.4 0.48 0.4 0.31 0.23 0.21 0.19 0.18 0.23 0.13 1.0 0.3 0.22 0.25 0.32 0.74 0.08 0.3 0.19 0.21 0.08 0.2 0.43 0.4 0.19 0.2 0.1 0.1
0.11 0.12 0.13 0.12 0.15 0.13 0.2 0.07 0.18 0.14 0.13 0.12 0.08 0.04 1.0 0.08 0.15 0.15 0.03 0.81 0.01 0.25 0.01 0.02 0.08 0.01 0.04 0.07 0.08 0.07 0.02 0.01
0.07 0.07 0.08 0.09 0.08 0.09 0.1 0.09 0.1 0.09 0.09 0.08 0.06 0.08 1.0 0.11 0.11 0.07 0.07 0.56 0.01 0.54 0.01 0.02 0.03 0.08 0.08 0.1 0.07 0.08 0.08 0.09
0.23 0.25 0.25 0.24 0.25 0.3 0.31 0.29 0.25 0.27 0.25 0.22 0.35 0.58 1.0 0.38 0.2 0.15 0.36 0.73 0.3 0.23 0.18 0.21 0.37 0.27 0.45 0.45 0.18 0.19 0.26 0.21
Smo98462 (RECQI1)
 0.11 0.18 0.1 0.16 0.16 0.18 0.11 0.16 0.16 0.13 0.14 0.09 0.12 0.13 1.0 0.24 0.12 0.04 0.06 0.4 0.26 0.24 0.05 0.04 0.04 0.13 0.09 0.18 0.07 0.08 0.01 0.01
0.48 0.55 0.5 0.57 0.62 0.62 0.55 0.6 0.54 0.47 0.44 0.42 0.47 0.43 1.0 0.58 0.49 0.31 0.64 0.71 0.2 0.19 0.41 0.39 0.47 0.82 0.85 0.95 0.45 0.49 0.27 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)