Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo102001	0.24	0.11	0.06	0.18	0.55	0.6	0.99	0.8	0.52	0.59	0.39	0.26	0.04	0.08	0.36	0.07	0.17	0.16	0.16	0.57	0.58	0.82	0.15	0.14	0.14	0.26	0.79	1.0	0.19	0.23	0.22	0.17
Smo103241	0.12	0.09	0.1	0.17	0.28	0.42	0.96	0.75	0.79	0.4	0.36	0.21	0.03	0.04	0.36	0.05	0.12	0.11	0.09	0.14	0.74	1.0	0.08	0.09	0.74	0.13	0.67	0.97	0.2	0.21	0.25	0.14
Smo103955	0.4	0.31	0.23	0.38	0.46	0.65	0.61	0.71	0.61	0.54	0.5	0.39	0.23	0.26	0.55	0.21	0.28	0.09	0.29	0.25	0.1	1.0	0.29	0.24	0.37	0.31	0.5	0.37	0.28	0.29	0.28	0.24
Smo106624	0.41	0.42	0.35	0.38	0.64	0.73	0.89	1.0	0.7	0.71	0.47	0.4	0.33	0.26	0.89	0.38	0.42	0.38	0.4	0.52	0.29	0.76	0.45	0.34	0.43	0.35	0.63	0.69	0.44	0.5	0.3	0.24
Smo110121	0.1	0.08	0.07	0.11	0.22	0.35	0.38	0.42	0.35	0.31	0.19	0.16	0.05	0.03	0.18	0.06	0.12	0.19	0.11	0.12	0.09	1.0	0.14	0.11	0.02	0.07	0.28	0.29	0.15	0.2	0.22	0.15
Smo111998 (CRR22)	0.5	0.31	0.35	0.33	0.42	1.0	0.9	0.8	0.73	0.78	0.28	0.41	0.11	0.19	0.47	0.17	0.39	0.42	0.26	0.11	0.84	0.66	0.19	0.2	0.39	0.24	0.73	0.48	0.36	0.35	0.49	0.46
Smo112100	0.14	0.06	0.1	0.26	0.52	0.68	0.92	0.83	0.67	0.51	0.46	0.29	0.11	0.15	0.8	0.12	0.22	0.12	0.34	0.62	0.35	0.6	0.24	0.21	0.2	0.15	1.0	0.41	0.27	0.35	0.39	0.34
Smo112121	0.18	0.05	0.1	0.31	0.16	0.8	0.8	1.0	0.73	0.66	0.33	0.34	0.03	0.07	0.14	0.08	0.41	0.56	0.21	0.0	0.09	0.44	0.2	0.13	0.47	0.14	0.68	0.67	0.57	0.55	0.49	0.41
Smo117185	0.61	0.28	0.44	0.3	0.72	0.67	0.83	0.8	0.95	0.8	0.58	0.55	0.18	0.09	0.42	0.26	0.43	0.54	0.53	0.21	0.1	0.49	0.39	0.34	0.23	0.43	0.6	0.91	0.83	0.97	1.0	0.88
Smo117846 (CRR2)	0.38	0.18	0.22	0.25	0.49	0.51	0.69	0.79	0.83	0.72	0.59	0.55	0.29	0.11	0.31	0.26	0.27	0.3	0.27	0.09	0.68	1.0	0.32	0.31	0.26	0.46	0.54	0.57	0.39	0.36	0.48	0.44
Smo120613	0.29	0.19	0.2	0.32	0.39	0.77	0.77	0.73	0.48	0.58	0.41	0.43	0.13	0.16	0.85	0.25	0.54	0.67	0.58	0.0	0.07	1.0	0.54	0.34	0.37	0.55	0.66	0.8	0.71	0.6	0.22	0.16
Smo122489	0.08	0.06	0.07	0.1	0.13	0.25	0.37	0.32	0.27	0.18	0.09	0.09	0.02	0.01	0.11	0.05	0.18	0.22	0.11	0.0	0.02	1.0	0.12	0.07	0.1	0.04	0.25	0.3	0.2	0.18	0.11	0.04
Smo123858	0.2	0.11	0.25	0.22	0.52	0.88	1.0	0.92	0.89	0.57	0.35	0.33	0.08	0.05	0.32	0.12	0.28	0.29	0.26	0.0	0.58	0.83	0.23	0.2	0.34	0.26	0.78	0.7	0.51	0.53	0.46	0.39
Smo125160	0.56	0.31	0.25	0.54	0.49	0.7	0.96	1.0	1.0	0.84	1.0	0.64	0.3	0.14	0.48	0.45	0.39	0.46	0.57	0.01	0.1	0.53	0.42	0.37	0.12	0.94	0.87	0.85	0.81	0.63	0.7	0.92
Smo125997 (CRR2)	0.22	0.13	0.18	0.26	0.32	0.71	1.0	0.89	0.68	0.59	0.36	0.3	0.09	0.04	0.42	0.12	0.35	0.46	0.25	0.24	0.14	0.54	0.26	0.21	0.34	0.14	0.48	0.53	0.52	0.54	0.73	0.62
Smo127854	0.19	0.31	0.12	0.32	0.5	0.74	1.0	0.94	0.88	0.89	0.43	0.46	0.08	0.12	0.24	0.21	0.33	0.37	0.43	0.0	0.0	0.56	0.39	0.24	0.0	0.34	0.64	0.63	0.54	0.62	0.65	0.57
Smo130516 (OTP84)	0.11	0.08	0.07	0.13	0.15	0.25	0.32	0.41	0.33	0.35	0.14	0.13	0.03	0.02	0.35	0.07	0.21	0.21	0.15	0.01	0.02	1.0	0.13	0.11	0.38	0.06	0.38	0.35	0.19	0.24	0.21	0.15
Smo132317	0.15	0.19	0.5	0.54	0.32	0.82	1.0	0.72	0.87	0.75	0.43	0.14	0.07	0.09	0.34	0.18	0.37	0.35	0.3	0.04	0.01	0.8	0.31	0.18	0.43	0.07	0.36	0.21	0.42	0.46	0.35	0.29
Smo134253	0.28	0.1	0.16	0.17	0.39	0.67	0.92	0.98	1.0	0.45	0.55	0.22	0.03	0.01	0.16	0.04	0.27	0.29	0.14	0.0	0.82	0.39	0.22	0.23	0.12	0.23	0.72	0.48	0.34	0.39	0.5	0.42
Smo135764	0.3	0.27	0.19	0.25	0.39	0.73	0.95	1.0	0.91	0.86	0.68	0.55	0.05	0.03	0.22	0.07	0.31	0.42	0.27	0.01	0.0	0.87	0.21	0.15	0.19	0.64	0.94	0.85	0.46	0.47	0.47	0.3
Smo135850	0.3	0.16	0.12	0.23	0.37	0.65	1.0	0.74	0.72	0.67	0.5	0.32	0.03	0.07	0.15	0.07	0.22	0.44	0.17	0.09	0.57	0.64	0.17	0.1	0.26	0.19	0.75	0.61	0.29	0.3	0.22	0.17
Smo136503	0.28	0.14	0.07	0.21	0.4	1.0	0.77	0.84	0.5	0.57	0.32	0.21	0.06	0.04	0.27	0.09	0.23	0.49	0.16	0.04	0.01	0.74	0.22	0.17	0.19	0.13	0.76	0.75	0.38	0.37	0.51	0.33
Smo153443 (HSD1)	0.39	0.24	0.28	0.36	0.62	0.85	0.93	1.0	0.83	0.79	0.62	0.49	0.12	0.08	0.18	0.16	0.37	0.24	0.47	0.47	0.7	0.81	0.38	0.32	0.51	0.48	0.74	0.77	0.47	0.47	0.43	0.31
Smo172645 (OTP82)	0.27	0.29	0.2	0.33	0.41	0.88	0.92	1.0	0.9	0.63	0.34	0.35	0.13	0.06	0.36	0.15	0.32	0.17	0.23	0.04	0.74	0.52	0.31	0.21	0.8	0.12	0.77	0.61	0.42	0.44	0.42	0.22
Smo186416	0.24	0.09	0.08	0.14	0.25	0.75	0.77	0.9	0.76	0.54	0.28	0.19	0.05	0.04	0.33	0.07	0.21	0.24	0.18	0.11	0.59	0.76	0.16	0.11	0.38	0.19	0.72	1.0	0.27	0.35	0.24	0.19
Smo30677	0.31	0.22	0.14	0.24	0.46	0.62	0.89	0.76	0.81	0.54	0.36	0.27	0.07	0.07	0.56	0.12	0.25	0.21	0.18	0.46	0.3	0.85	0.19	0.16	0.41	0.25	0.78	1.0	0.35	0.38	0.24	0.23
Smo32476	0.12	0.06	0.1	0.19	0.38	0.62	0.67	0.94	0.51	0.59	0.35	0.17	0.04	0.09	0.51	0.18	0.27	0.31	0.14	0.15	0.07	0.49	0.28	0.11	0.2	0.07	1.0	0.88	0.25	0.32	0.38	0.28
Smo33143	0.24	0.14	0.11	0.23	0.5	0.7	0.81	1.0	0.69	0.37	0.32	0.27	0.11	0.03	0.26	0.17	0.26	0.28	0.24	0.05	0.27	0.34	0.28	0.2	1.0	0.19	0.66	0.74	0.35	0.44	0.67	0.32
Smo3444	0.39	0.45	0.28	0.38	0.63	0.73	0.68	0.76	0.79	1.0	0.52	0.39	0.3	0.19	0.86	0.23	0.59	0.61	0.6	0.0	0.12	0.0	0.66	0.49	0.05	0.34	0.6	0.74	0.51	0.7	0.47	0.51
Smo405011	0.21	0.13	0.13	0.16	0.14	0.33	0.3	0.32	0.34	0.29	0.29	0.22	0.12	0.08	0.26	0.18	0.12	0.3	0.26	0.24	0.06	1.0	0.17	0.16	0.3	0.24	0.32	0.33	0.23	0.21	0.11	0.11
Smo407654	0.35	0.42	0.44	0.47	0.54	0.71	0.88	0.89	1.0	0.78	0.6	0.49	0.25	0.13	0.36	0.44	0.55	0.44	0.56	0.21	0.37	0.56	0.58	0.57	0.46	0.62	0.61	0.83	0.48	0.44	0.58	0.43
Smo407937	0.44	0.47	0.43	0.47	0.55	0.72	0.89	1.0	0.78	0.8	0.73	0.54	0.44	0.37	0.88	0.43	0.51	0.47	0.5	0.88	0.86	0.96	0.52	0.49	0.24	0.47	0.84	0.84	0.5	0.54	0.58	0.45
Smo419677 (MEF1)	0.13	0.07	0.13	0.16	0.32	0.33	0.45	0.54	0.46	0.3	0.27	0.18	0.07	0.04	0.16	0.09	0.17	0.18	0.15	0.19	0.34	1.0	0.21	0.16	0.42	0.29	0.77	0.49	0.26	0.28	0.3	0.23
Smo419920	0.23	0.27	0.16	0.12	0.21	0.29	0.51	0.35	0.37	0.31	0.2	0.25	0.03	0.01	0.16	0.06	0.16	0.38	0.11	0.0	0.05	1.0	0.38	0.12	0.36	0.15	0.42	0.55	0.33	0.32	0.23	0.11
Smo422321	0.21	0.2	0.25	0.18	0.38	0.5	0.83	0.7	0.71	0.61	0.26	0.31	0.03	0.08	0.39	0.1	0.25	0.02	0.29	0.06	0.0	0.46	0.18	0.17	0.05	0.3	0.98	1.0	0.31	0.35	0.28	0.19
Smo425515	0.28	0.23	0.22	0.31	0.48	0.63	0.95	0.79	0.76	0.59	0.61	0.38	0.19	0.27	0.64	0.27	0.32	0.37	0.55	0.26	0.0	1.0	0.29	0.26	0.48	0.56	0.62	0.36	0.54	0.53	0.69	0.55
Smo427027 (UGT72B3)	0.04	0.04	0.0	0.05	0.23	0.23	0.3	0.37	0.19	0.17	0.14	0.13	0.0	0.0	0.11	0.02	0.07	0.04	0.04	0.0	0.27	1.0	0.03	0.03	0.13	0.21	0.72	0.5	0.11	0.12	0.09	0.07
Smo427320	0.03	0.03	0.14	0.3	0.21	0.7	0.82	0.71	0.86	0.95	0.29	0.17	0.05	0.02	0.25	0.09	0.29	1.0	0.38	0.0	0.0	0.55	0.34	0.22	0.43	0.1	0.96	0.37	0.47	0.44	0.5	0.39
Smo428574	0.23	0.0	0.03	0.0	0.0	0.49	0.6	0.59	0.11	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.44	0.0	0.03	0.13	0.0	0.57	1.0	0.03	0.03	0.0	0.03
Smo443679	0.61	0.4	0.27	0.31	0.73	0.56	0.6	0.87	0.79	0.79	0.71	0.68	0.23	0.14	0.27	0.37	0.43	0.35	0.6	0.05	0.68	0.83	0.4	0.45	0.64	0.78	1.0	0.89	0.59	0.62	0.71	0.9
Smo446519	0.31	0.14	0.17	0.23	0.45	0.66	0.84	0.98	0.72	0.57	0.4	0.38	0.05	0.04	0.26	0.08	0.25	0.34	0.18	0.03	1.0	0.79	0.23	0.19	0.24	0.15	0.61	0.56	0.36	0.45	0.46	0.39
Smo449384	0.38	0.4	0.36	0.39	0.56	0.46	0.45	0.7	0.59	0.51	0.52	0.52	0.52	0.16	0.43	0.6	0.45	0.24	0.53	0.1	0.54	1.0	0.31	0.39	0.04	0.36	0.24	0.42	0.59	0.58	0.54	0.52
Smo45405	0.33	0.24	0.26	0.26	0.29	0.45	0.48	0.46	0.44	0.47	0.32	0.32	0.19	0.14	0.36	0.22	0.24	0.18	0.34	0.25	0.73	1.0	0.23	0.23	0.53	0.2	0.45	0.38	0.26	0.26	0.31	0.31
Smo50243	0.28	0.19	0.21	0.29	0.45	0.62	0.8	0.99	0.73	0.62	0.45	0.38	0.09	0.05	0.36	0.14	0.35	0.41	0.33	0.2	0.06	1.0	0.34	0.26	0.04	0.23	0.64	0.51	0.51	0.48	0.64	0.46
Smo53336	0.5	0.49	0.51	0.57	0.68	0.72	0.86	1.0	0.86	0.89	0.8	0.72	0.13	0.14	0.18	0.19	0.48	0.32	0.33	0.7	0.83	0.94	0.38	0.34	0.48	0.23	0.45	0.46	0.54	0.58	0.31	0.34
Smo541 (CRR22)	0.29	0.25	0.1	0.25	0.39	0.8	1.0	0.69	0.73	0.63	0.21	0.24	0.08	0.12	0.96	0.08	0.31	0.2	0.39	0.0	0.05	0.86	0.16	0.17	0.05	0.08	0.47	0.59	0.37	0.36	0.48	0.4
Smo55945	0.11	0.07	0.09	0.13	0.21	0.31	0.39	0.41	0.35	0.31	0.27	0.17	0.04	0.02	0.1	0.05	0.08	0.1	0.08	0.12	0.14	1.0	0.07	0.05	0.05	0.16	0.41	0.4	0.13	0.13	0.18	0.12
Smo70490	0.31	0.18	0.34	0.17	0.67	0.93	0.88	0.9	0.66	0.63	0.5	0.34	0.59	0.76	1.0	0.62	0.38	0.64	0.64	0.4	0.3	0.91	0.57	0.39	0.94	0.27	0.58	0.53	0.55	0.52	0.73	0.85
Smo72499	0.08	0.05	0.05	0.09	0.3	0.39	0.39	0.46	0.31	0.22	0.19	0.2	0.04	0.03	0.12	0.07	0.07	0.24	0.08	0.01	0.05	1.0	0.12	0.1	0.48	0.11	0.32	0.27	0.13	0.17	0.18	0.15
Smo73601	0.45	0.38	0.45	0.44	0.69	0.86	0.9	0.88	1.0	0.92	0.62	0.47	0.34	0.27	0.75	0.42	0.64	0.57	0.65	0.05	0.22	0.29	0.49	0.51	0.25	0.23	0.68	0.6	0.84	0.82	0.73	0.65
Smo81279 (EMB2261)	0.24	0.22	0.23	0.21	0.3	0.47	0.52	0.42	0.32	0.37	0.26	0.25	0.06	0.05	0.27	0.11	0.25	0.22	0.2	0.5	0.63	1.0	0.16	0.15	0.15	0.12	0.28	0.29	0.22	0.23	0.24	0.17
Smo82072 (OTP84)	0.33	0.31	0.34	0.38	0.51	0.6	0.79	0.79	0.68	0.65	0.49	0.44	0.15	0.13	0.45	0.17	0.26	0.21	0.3	0.13	0.29	1.0	0.26	0.22	0.1	0.3	0.43	0.43	0.35	0.33	0.32	0.28
Smo84108	0.24	0.22	0.05	0.09	0.21	0.29	0.41	0.4	0.47	0.39	0.33	0.22	0.1	0.1	0.44	0.21	0.21	0.42	0.31	0.0	0.24	1.0	0.3	0.2	0.24	0.14	0.48	0.53	0.45	0.42	0.31	0.24
Smo89176	0.34	0.3	0.23	0.39	0.49	0.77	0.89	1.0	0.91	0.86	0.46	0.34	0.3	0.37	0.46	0.28	0.24	0.33	0.3	0.35	0.26	0.84	0.36	0.3	0.13	0.35	0.55	0.67	0.37	0.31	0.26	0.14
Smo91690	0.37	0.34	0.35	0.52	0.72	0.73	0.86	1.0	0.76	0.89	0.61	0.41	0.14	0.09	0.45	0.29	0.78	0.82	0.52	0.01	0.08	0.74	0.46	0.5	0.26	0.34	0.93	0.86	0.89	0.8	0.87	0.67
Smo96258 (CRR2)	0.46	0.34	0.3	0.29	0.46	0.8	0.79	0.65	0.82	0.37	0.64	0.41	0.08	0.03	0.73	0.17	0.4	0.55	0.24	0.04	0.0	0.63	0.34	0.18	0.0	0.21	1.0	0.97	0.51	0.62	0.65	0.33
Smo97942	0.09	0.15	0.09	0.21	0.25	0.45	0.51	0.73	0.5	0.37	0.27	0.14	0.02	0.03	0.08	0.04	0.24	0.27	0.18	0.01	0.06	1.0	0.24	0.14	0.57	0.23	0.62	0.67	0.25	0.23	0.13	0.12
Smo98565 (OTP84)	0.32	0.2	0.13	0.27	0.39	0.6	0.56	0.71	0.58	0.71	0.5	0.42	0.23	0.09	0.3	0.38	0.32	0.47	0.39	0.02	0.27	1.0	0.3	0.3	0.98	0.93	0.99	0.87	0.5	0.56	0.51	0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)