Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.01 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.03 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.05 1.0 0.0 0.01 0.01
0.02 1.0 0.0 0.0 0.01
Ppi_g00498 (ATF2)
0.06 1.0 0.01 0.0 0.0
Ppi_g00520 (FED A)
0.05 1.0 0.0 0.02 0.01
0.02 1.0 0.01 0.0 0.01
0.05 1.0 0.0 0.04 0.0
Ppi_g00680 (GPX4)
0.0 1.0 0.0 0.03 0.0
0.05 1.0 0.0 0.06 0.0
0.05 1.0 0.01 0.02 0.0
0.06 1.0 0.0 0.04 0.02
0.04 1.0 0.0 0.02 0.0
0.04 1.0 0.01 0.01 0.0
0.04 1.0 0.0 0.05 0.02
0.07 1.0 0.0 0.02 0.0
0.06 1.0 0.0 0.04 0.0
0.02 1.0 0.0 0.0 0.0
Ppi_g02731 (OLI7)
0.07 1.0 0.01 0.05 0.03
0.03 1.0 0.0 0.02 0.0
0.0 1.0 0.0 0.06 0.0
0.02 1.0 0.0 0.0 0.0
0.03 1.0 0.0 0.04 0.0
0.04 1.0 0.01 0.06 0.0
0.07 1.0 0.02 0.07 0.03
0.04 1.0 0.0 0.03 0.0
Ppi_g04553 (MAN1)
0.05 1.0 0.0 0.03 0.01
Ppi_g04656 (RBP-DR1)
0.05 1.0 0.0 0.06 0.01
0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.02 1.0 0.0 0.01 0.0
0.04 1.0 0.0 0.0 0.0
0.05 1.0 0.01 0.06 0.01
0.04 1.0 0.0 0.02 0.03
0.03 1.0 0.0 0.06 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.03 0.0
Ppi_g07882 (GSTU11)
0.04 1.0 0.0 0.01 0.0
Ppi_g07896 (RABG3c)
0.01 1.0 0.0 0.06 0.0
Ppi_g07924 (YCF6)
0.0 1.0 0.0 0.02 0.0
Ppi_g07934 (ALDH2)
0.07 1.0 0.01 0.05 0.02
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.04 1.0 0.0 0.03 0.01
Ppi_g08001 (FUG1)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Ppi_g08090 (GAPCP-1)
0.05 1.0 0.01 0.08 0.03
0.04 1.0 0.01 0.01 0.02
0.02 1.0 0.0 0.05 0.0
Ppi_g08911 (MYB3R-5)
0.08 1.0 0.0 0.04 0.02
Ppi_g09056 (CPK3)
0.01 1.0 0.0 0.01 0.0
Ppi_g09293 (RPS11-BETA)
0.06 1.0 0.0 0.03 0.0
0.05 1.0 0.01 0.03 0.02
0.0 1.0 0.0 0.06 0.0
0.03 1.0 0.0 0.05 0.0
0.04 1.0 0.01 0.04 0.0
Ppi_g10077 (SAR1)
0.03 1.0 0.0 0.09 0.0
0.04 1.0 0.01 0.09 0.02
Ppi_g10317 (TCTP)
0.04 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.03 0.03 0.0
Ppi_g10502 (CAT2)
0.02 1.0 0.01 0.04 0.01
0.06 1.0 0.01 0.02 0.01
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.01 1.0 0.01 0.06 0.01
Ppi_g11264 (TH7)
0.06 1.0 0.0 0.01 0.0
0.04 1.0 0.01 0.01 0.0
0.03 1.0 0.0 0.03 0.0
0.02 1.0 0.0 0.0 0.02
Ppi_g12132 (PSAG)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.04 1.0 0.0 0.01 0.0
0.02 1.0 0.0 0.02 0.0
Ppi_g12793 (PSBR)
0.02 1.0 0.0 0.03 0.0
0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.01 1.0 0.0 0.03 0.0
0.1 1.0 0.0 0.04 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Ppi_g14663 (BBC1)
0.02 1.0 0.02 0.01 0.0
0.05 1.0 0.01 0.02 0.0
0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
Ppi_g15204 (LHCA6)
0.04 1.0 0.0 0.02 0.0
0.06 1.0 0.01 0.03 0.01
0.05 1.0 0.01 0.1 0.02
Ppi_g17059 (NPQ4)
0.03 1.0 0.01 0.03 0.01
0.07 1.0 0.0 0.0 0.0
0.04 1.0 0.0 0.04 0.0
Ppi_g18415 (NDPK1)
0.03 1.0 0.0 0.01 0.03
0.07 1.0 0.01 0.01 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.05 1.0 0.0 0.0 0.0
Ppi_g19173 (ELI3)
0.03 1.0 0.0 0.01 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.03 1.0 0.0 0.01 0.0
0.03 1.0 0.0 0.03 0.02
0.03 1.0 0.0 0.03 0.0
0.04 1.0 0.0 0.01 0.0
0.03 1.0 0.01 0.02 0.01
0.05 1.0 0.04 0.0 0.0
Ppi_g19349 (GRP2B)
0.02 1.0 0.0 0.02 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.07 1.0 0.0 0.05 0.0
0.02 1.0 0.0 0.01 0.0
0.0 1.0 0.0 0.03 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.01
0.0 1.0 0.0 0.0 0.03
0.03 1.0 0.02 0.01 0.0
Ppi_g19761 (GSA1)
0.07 1.0 0.0 0.01 0.01
0.04 1.0 0.0 0.07 0.04
0.03 1.0 0.0 0.01 0.0
Ppi_g19836 (APA1)
0.03 1.0 0.0 0.03 0.01
0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.03 1.0 0.0 0.05 0.01
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.03 1.0 0.0 0.09 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.01 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.05 1.0 0.0 0.01 0.02
0.06 1.0 0.0 0.02 0.0
0.01 1.0 0.0 0.01 0.0
0.05 1.0 0.0 0.02 0.0
Ppi_g20441 (FED A)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.02 1.0 0.0 0.01 0.01
0.02 1.0 0.0 0.01 0.0
Ppi_g20507 (CHLM)
0.0 1.0 0.0 0.07 0.0
0.07 1.0 0.0 0.07 0.01
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.03 1.0 0.0 0.02 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.05
0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.06 1.0 0.0 0.01 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.02 0.04
Ppi_g54231 (2CPB)
0.04 1.0 0.04 0.03 0.0
0.05 1.0 0.0 0.0 0.0
Ppi_g54652 (PETE2)
0.05 1.0 0.01 0.04 0.01
0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.09 1.0 0.01 0.01 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)