1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
0.0 3.29 0.0 0.0 0.0
0.0 4.01 0.0 0.0 0.0
0.0 4.15 0.0 0.0 0.0
0.08 10.11 0.0 0.0 0.0
0.0 4.13 0.0 0.14 0.0
0.0 5.12 0.0 0.0 0.0
0.19 3.76 0.0 0.04 0.04
0.09 5.25 0.0 0.0 0.05
Ppi_g00498 (ATF2)
 0.17 3.02 0.04 0.0 0.0
Ppi_g00520 (FED A)
 0.87 17.37 0.0 0.36 0.24
0.23 9.27 0.11 0.0 0.05
0.91 18.0 0.0 0.63 0.05
Ppi_g00680 (GPX4)
 0.0 8.65 0.0 0.26 0.0
0.52 10.45 0.01 0.65 0.03
0.78 16.51 0.19 0.29 0.05
1.0 16.97 0.0 0.74 0.36
0.36 9.34 0.0 0.21 0.0
0.63 14.44 0.13 0.15 0.0
0.32 7.57 0.0 0.39 0.12
0.22 3.34 0.0 0.07 0.0
1.46 25.82 0.09 0.97 0.09
0.07 2.79 0.0 0.0 0.0
Ppi_g02731 (OLI7)
 0.39 5.55 0.07 0.29 0.17
0.28 9.42 0.0 0.19 0.0
0.0 2.31 0.0 0.13 0.0
0.1 4.92 0.0 0.0 0.0
0.1 3.08 0.0 0.12 0.0
0.12 3.21 0.02 0.19 0.01
1.86 25.67 0.48 1.79 0.72
0.26 7.41 0.01 0.22 0.04
Ppi_g04553 (MAN1)
 0.31 6.51 0.01 0.17 0.04
Ppi_g04656 (RBP-DR1)
 0.1 2.06 0.0 0.12 0.02
0.12 4.26 0.0 0.0 0.0
0.16 7.03 0.0 0.08 0.0
0.13 3.16 0.0 0.0 0.0
0.25 5.04 0.03 0.31 0.03
0.13 3.15 0.0 0.07 0.11
0.51 18.95 0.0 1.18 0.0
0.0 3.75 0.0 0.0 0.0
0.0 2.3 0.0 0.07 0.0
Ppi_g07882 (GSTU11)
 0.1 2.72 0.0 0.02 0.0
Ppi_g07896 (RABG3c)
 0.03 2.49 0.0 0.14 0.0
Ppi_g07924 (YCF6)
 0.0 4.62 0.0 0.09 0.0
Ppi_g07934 (ALDH2)
 0.26 3.52 0.04 0.17 0.07
0.0 2.44 0.0 0.0 0.0
0.12 2.73 0.0 0.07 0.02
Ppi_g08001 (FUG1)
 0.0 2.12 0.0 0.0 0.0
Ppi_g08090 (GAPCP-1)
 0.22 4.15 0.02 0.32 0.12
0.44 9.89 0.15 0.14 0.17
0.05 2.61 0.0 0.13 0.0
Ppi_g08911 (MYB3R-5)
 0.16 2.15 0.0 0.09 0.05
Ppi_g09056 (CPK3)
 0.03 3.38 0.0 0.03 0.0
Ppi_g09293 (RPS11-BETA)
 0.37 6.17 0.0 0.18 0.0
0.09 2.01 0.02 0.06 0.05
0.01 2.97 0.0 0.17 0.0
0.15 5.56 0.0 0.26 0.0
0.24 5.68 0.03 0.2 0.0
Ppi_g10077 (SAR1)
 0.06 2.13 0.0 0.18 0.0
0.96 21.81 0.23 2.03 0.51
Ppi_g10317 (TCTP)
 0.11 3.07 0.0 0.0 0.0
0.0 1.88 0.05 0.06 0.0
Ppi_g10502 (CAT2)
 0.2 8.55 0.1 0.34 0.1
0.19 3.08 0.02 0.06 0.02
0.0 2.14 0.0 0.0 0.0
0.07 6.11 0.06 0.38 0.03
Ppi_g11264 (TH7)
 0.97 16.61 0.0 0.11 0.0
0.08 2.09 0.01 0.03 0.0
0.09 3.1 0.0 0.09 0.0
0.05 2.27 0.0 0.0 0.05
Ppi_g12132 (PSAG)
 0.0 2.4 0.0 0.0 0.0
0.21 5.86 0.02 0.04 0.0
0.07 2.93 0.0 0.04 0.0
Ppi_g12793 (PSBR)
 0.54 25.94 0.0 0.66 0.12
0.12 4.62 0.0 0.0 0.0
0.21 21.19 0.0 0.6 0.0
1.65 16.17 0.0 0.69 0.05
0.0 2.03 0.0 0.0 0.0
Ppi_g14663 (BBC1)
 0.13 5.21 0.1 0.06 0.0
0.1 2.06 0.02 0.05 0.0
0.15 5.83 0.0 0.0 0.0
Ppi_g15204 (LHCA6)
 0.75 20.95 0.09 0.35 0.05
0.13 2.23 0.01 0.07 0.02
0.25 5.01 0.05 0.49 0.08
Ppi_g17059 (NPQ4)
 0.36 12.16 0.1 0.34 0.1
0.3 4.61 0.0 0.0 0.0
0.22 5.5 0.0 0.19 0.0
Ppi_g18415 (NDPK1)
 0.14 4.2 0.0 0.05 0.13
2.76 41.28 0.31 0.56 0.03
0.0 1.96 0.0 0.0 0.0
0.0 4.03 0.0 0.0 0.0
0.1 2.06 0.0 0.0 0.0
Ppi_g19173 (ELI3)
 0.11 3.45 0.0 0.04 0.0
0.0 2.61 0.0 0.0 0.0
0.27 9.33 0.0 0.1 0.0
0.14 5.19 0.0 0.14 0.12
0.1 3.31 0.0 0.09 0.0
0.39 10.81 0.05 0.11 0.05
0.12 3.79 0.03 0.09 0.04
0.99 20.58 0.88 0.06 0.06
Ppi_g19349 (GRP2B)
 0.15 6.8 0.0 0.15 0.0
0.0 2.48 0.0 0.0 0.0
0.0 2.31 0.0 0.0 0.0
0.44 6.08 0.0 0.31 0.0
0.24 9.89 0.0 0.09 0.0
0.0 2.42 0.0 0.08 0.0
0.0 2.85 0.0 0.0 0.04
0.0 2.74 0.0 0.0 0.08
0.2 5.71 0.11 0.08 0.0
Ppi_g19761 (GSA1)
 0.14 2.07 0.0 0.03 0.01
0.2 4.73 0.0 0.34 0.18
0.15 5.35 0.0 0.08 0.0
Ppi_g19836 (APA1)
 0.09 2.61 0.0 0.08 0.04
0.08 3.06 0.0 0.0 0.0
0.06 2.02 0.0 0.11 0.03
0.0 2.12 0.0 0.0 0.0
0.15 4.77 0.0 0.45 0.0
0.0 2.03 0.0 0.0 0.0
0.0 2.29 0.0 0.0 0.0
0.02 3.31 0.01 0.0 0.0
0.0 2.39 0.0 0.0 0.0
0.24 4.87 0.0 0.06 0.12
0.14 2.48 0.0 0.05 0.0
0.03 2.94 0.0 0.04 0.0
0.49 9.03 0.0 0.2 0.0
Ppi_g20441 (FED A)
 0.0 1.87 0.0 0.0 0.0
0.09 3.72 0.0 0.02 0.05
0.05 2.03 0.0 0.03 0.0
Ppi_g20507 (CHLM)
 0.0 2.06 0.0 0.14 0.0
6.14 91.43 0.25 6.35 0.84
0.0 6.58 0.0 0.0 0.0
0.07 1.98 0.0 0.04 0.0
0.0 4.02 0.0 0.0 0.18
0.11 3.47 0.0 0.0 0.0
1.15 19.78 0.06 0.14 0.09
0.0 2.31 0.0 0.0 0.0
0.0 1.95 0.0 0.03 0.07
Ppi_g54231 (2CPB)
 0.28 7.67 0.28 0.23 0.0
0.46 10.16 0.0 0.0 0.0
Ppi_g54652 (PETE2)
 1.66 36.34 0.29 1.47 0.25
0.29 8.68 0.0 0.0 0.0
4.99 54.88 0.63 0.59 0.39

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)