Heatmap: Cluster_222 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Frond	Fertile Frond	Young Stem with Root	Mature Stem with Root	Root
Ppi_g00090	1.0	0.73	0.27	0.26	0.05
Ppi_g00123 (PGR5)	1.0	0.72	0.15	0.09	0.05
Ppi_g00704	1.0	0.92	0.48	0.56	0.41
Ppi_g00925	1.0	0.84	0.47	0.44	0.33
Ppi_g00978	1.0	0.63	0.09	0.07	0.02
Ppi_g01483	1.0	0.74	0.39	0.29	0.17
Ppi_g01739	1.0	0.86	0.42	0.44	0.17
Ppi_g01758	1.0	0.88	0.54	0.49	0.39
Ppi_g01910	1.0	0.74	0.26	0.14	0.08
Ppi_g02195	1.0	0.8	0.35	0.39	0.27
Ppi_g02197	1.0	0.85	0.33	0.39	0.2
Ppi_g02261 (ERS)	1.0	0.81	0.53	0.54	0.29
Ppi_g02694	1.0	0.78	0.35	0.47	0.08
Ppi_g02717	1.0	0.88	0.43	0.52	0.15
Ppi_g02720	1.0	0.7	0.21	0.25	0.14
Ppi_g02799	1.0	0.91	0.4	0.25	0.26
Ppi_g03209 (SBE2.2)	1.0	0.77	0.48	0.43	0.18
Ppi_g03239 (PUB44)	1.0	0.76	0.39	0.48	0.38
Ppi_g03607	1.0	0.73	0.14	0.12	0.08
Ppi_g04076	1.0	0.86	0.4	0.34	0.21
Ppi_g04159	1.0	0.78	0.65	0.57	0.39
Ppi_g04297	1.0	0.73	0.23	0.22	0.15
Ppi_g04362 (EMB2001)	1.0	0.88	0.52	0.47	0.34
Ppi_g04379	1.0	0.75	0.39	0.43	0.12
Ppi_g04549	1.0	0.71	0.28	0.27	0.13
Ppi_g05207 (COI1)	1.0	0.66	0.27	0.27	0.25
Ppi_g05279 (LSF1)	1.0	0.75	0.35	0.25	0.15
Ppi_g06001	1.0	0.83	0.43	0.47	0.32
Ppi_g06180	1.0	0.73	0.38	0.38	0.16
Ppi_g06328	1.0	0.89	0.49	0.47	0.21
Ppi_g06946 (SPT)	1.0	0.84	0.36	0.43	0.16
Ppi_g07133	1.0	0.74	0.33	0.4	0.15
Ppi_g07184	1.0	0.71	0.12	0.09	0.0
Ppi_g07240	1.0	0.82	0.04	0.04	0.0
Ppi_g07342	1.0	0.82	0.41	0.43	0.34
Ppi_g08087	1.0	0.8	0.4	0.21	0.12
Ppi_g08422 (PIRL4)	1.0	0.75	0.4	0.5	0.33
Ppi_g08939	1.0	0.97	0.48	0.46	0.25
Ppi_g09138	1.0	0.92	0.46	0.55	0.37
Ppi_g09346 (GWD)	1.0	0.71	0.3	0.38	0.2
Ppi_g10105	1.0	0.79	0.56	0.47	0.07
Ppi_g10300	1.0	0.85	0.37	0.31	0.28
Ppi_g10566 (CHLI2)	1.0	0.69	0.34	0.27	0.12
Ppi_g10917 (DUF3)	1.0	0.9	0.56	0.41	0.28
Ppi_g11527	1.0	0.74	0.36	0.41	0.34
Ppi_g11535 (ATPPR5)	1.0	0.8	0.56	0.53	0.36
Ppi_g11585 (emb2726)	1.0	0.77	0.31	0.28	0.12
Ppi_g12111	1.0	0.8	0.39	0.41	0.24
Ppi_g12183 (TROL)	1.0	0.84	0.38	0.49	0.35
Ppi_g12616	1.0	0.83	0.42	0.46	0.34
Ppi_g12641 (OK1)	1.0	0.7	0.22	0.26	0.15
Ppi_g12716	1.0	0.83	0.33	0.42	0.17
Ppi_g13174	1.0	0.64	0.12	0.16	0.0
Ppi_g13456	1.0	0.89	0.78	0.72	0.64
Ppi_g13592	1.0	0.81	0.36	0.38	0.15
Ppi_g14241 (ALA1)	1.0	0.76	0.2	0.22	0.2
Ppi_g14613	1.0	0.82	0.33	0.45	0.11
Ppi_g15429 (emb1688)	1.0	0.91	0.53	0.61	0.38
Ppi_g15490	1.0	0.8	0.5	0.48	0.28
Ppi_g15946	1.0	0.84	0.51	0.4	0.39
Ppi_g16378 (CP31)	1.0	0.93	0.45	0.36	0.26
Ppi_g16493 (CDF3)	1.0	0.79	0.26	0.41	0.09
Ppi_g16633	1.0	0.83	0.38	0.3	0.2
Ppi_g16746	1.0	0.71	0.3	0.41	0.17
Ppi_g17095	1.0	0.81	0.18	0.14	0.01
Ppi_g18449	1.0	0.71	0.12	0.12	0.01
Ppi_g21618 (MSRB2)	1.0	0.79	0.43	0.32	0.27
Ppi_g22067	1.0	0.92	0.37	0.39	0.26
Ppi_g22188	1.0	0.7	0.26	0.37	0.15
Ppi_g23891	1.0	0.86	0.46	0.5	0.35
Ppi_g23973 (CSD1)	1.0	0.88	0.57	0.43	0.27
Ppi_g24544	1.0	0.82	0.38	0.44	0.07
Ppi_g26269 (TT7)	1.0	0.79	0.26	0.22	0.01
Ppi_g27251	1.0	0.75	0.08	0.22	0.0
Ppi_g27940	1.0	0.88	0.37	0.26	0.21
Ppi_g29310 (PIP)	1.0	0.96	0.54	0.41	0.25
Ppi_g29430	1.0	0.71	0.33	0.35	0.16
Ppi_g29472	1.0	0.77	0.25	0.42	0.12
Ppi_g30079 (CCB1)	0.99	1.0	0.46	0.34	0.16
Ppi_g30472	1.0	0.85	0.54	0.46	0.4
Ppi_g30936 (CR88)	1.0	0.88	0.43	0.42	0.2
Ppi_g31058	1.0	0.7	0.12	0.26	0.0
Ppi_g31059	1.0	0.8	0.12	0.26	0.01
Ppi_g31288	1.0	0.74	0.31	0.29	0.06
Ppi_g31289	1.0	0.77	0.4	0.33	0.07
Ppi_g31522	1.0	0.67	0.34	0.39	0.13
Ppi_g31617	1.0	0.74	0.29	0.32	0.15
Ppi_g31664	1.0	0.78	0.26	0.37	0.06
Ppi_g31967 (RPL27)	1.0	0.79	0.39	0.29	0.11
Ppi_g32647	1.0	0.86	0.52	0.55	0.37
Ppi_g32971	1.0	0.76	0.48	0.35	0.25
Ppi_g33059 (OE23)	1.0	0.75	0.36	0.23	0.03
Ppi_g33578	1.0	0.7	0.45	0.18	0.06
Ppi_g35699	1.0	0.93	0.49	0.57	0.36
Ppi_g35775	1.0	0.7	0.31	0.22	0.12
Ppi_g38143	1.0	0.75	0.05	0.02	0.0
Ppi_g38876 (CP31)	1.0	0.88	0.36	0.45	0.32
Ppi_g39074	1.0	0.84	0.44	0.39	0.28
Ppi_g40012	1.0	0.81	0.33	0.43	0.35
Ppi_g40603	1.0	0.8	0.28	0.28	0.28
Ppi_g41643	1.0	0.79	0.35	0.32	0.18
Ppi_g42183 (LHCB2)	1.0	0.77	0.2	0.09	0.01
Ppi_g43473 (SS3)	1.0	0.67	0.26	0.24	0.04
Ppi_g44345	1.0	0.86	0.44	0.58	0.19
Ppi_g45361 (Phox2)	1.0	0.8	0.28	0.35	0.14
Ppi_g46355	1.0	0.81	0.45	0.36	0.07
Ppi_g46522 (RFC3)	1.0	0.8	0.36	0.41	0.29
Ppi_g46587	1.0	0.77	0.38	0.27	0.25
Ppi_g52663	1.0	0.8	0.27	0.37	0.14
Ppi_g53494 (UGT74E2)	1.0	0.7	0.03	0.04	0.0
Ppi_g54343 (HB5)	1.0	0.78	0.29	0.39	0.02
Ppi_g54535	1.0	0.78	0.19	0.17	0.15
Ppi_g55166	1.0	0.65	0.07	0.04	0.0
Ppi_g55758 (ECT5)	1.0	0.73	0.43	0.5	0.28
Ppi_g55924	1.0	0.63	0.18	0.2	0.18
Ppi_g56556 (TRANS11)	1.0	0.88	0.57	0.63	0.47
Ppi_g57314	1.0	0.76	0.06	0.3	0.04
Ppi_g58181 (AAE1)	1.0	0.75	0.35	0.39	0.27
Ppi_g59302 (CRR22)	1.0	0.79	0.45	0.43	0.24
Ppi_g59311	1.0	0.75	0.35	0.4	0.17
Ppi_g59328	1.0	0.67	0.36	0.37	0.19
Ppi_g60121	1.0	0.73	0.36	0.34	0.26
Ppi_g60559	1.0	0.73	0.47	0.45	0.23
Ppi_g61336	1.0	0.51	0.18	0.19	0.13
Ppi_g63170	1.0	0.84	0.01	0.01	0.0
Ppi_g63817 (emb1513)	1.0	0.86	0.4	0.46	0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)