1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_222 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Frond
Fertile Frond
Young Stem with Root
Mature Stem with Root
Root
1053.33 764.58 287.34 271.44 48.02
Ppi_g00123 (PGR5)
 162.18 116.17 23.83 14.76 7.67
15.11 13.92 7.2 8.51 6.19
28.91 24.34 13.72 12.66 9.58
6.23 3.9 0.55 0.42 0.15
117.31 86.99 45.53 33.77 19.38
76.1 65.29 32.11 33.42 13.21
71.24 62.78 38.34 34.61 27.48
19.62 14.43 5.1 2.75 1.52
124.66 99.11 43.01 48.33 33.13
3.88 3.3 1.29 1.51 0.77
Ppi_g02261 (ERS)
 21.52 17.49 11.5 11.58 6.17
717.03 561.48 248.01 339.42 59.23
195.56 171.32 83.53 100.82 29.42
575.45 405.5 118.04 143.99 78.76
24.85 22.58 10.03 6.3 6.45
Ppi_g03209 (SBE2.2)
 67.46 51.83 32.1 28.84 12.04
Ppi_g03239 (PUB44)
 4.5 3.42 1.76 2.15 1.73
107.34 78.25 15.02 13.18 8.45
237.98 203.98 95.75 80.6 50.46
75.57 59.26 49.43 42.78 29.56
37.44 27.32 8.79 8.09 5.69
Ppi_g04362 (EMB2001)
 15.66 13.85 8.17 7.32 5.32
37.92 28.39 14.7 16.15 4.46
338.86 240.06 96.34 90.75 43.59
Ppi_g05207 (COI1)
 20.55 13.65 5.45 5.6 5.1
Ppi_g05279 (LSF1)
 16.77 12.57 5.81 4.22 2.49
124.0 102.46 53.35 58.22 39.94
41.84 30.51 15.91 16.1 6.52
4.9 4.35 2.38 2.29 1.04
Ppi_g06946 (SPT)
 10.45 8.83 3.8 4.45 1.71
930.97 689.09 306.16 370.79 141.27
13.95 9.94 1.66 1.32 0.0
7.11 5.83 0.27 0.25 0.0
53.86 44.25 22.05 22.92 18.09
9.77 7.83 3.95 2.01 1.19
Ppi_g08422 (PIRL4)
 63.27 47.42 25.24 31.86 20.6
64.62 62.47 30.87 29.49 16.4
118.74 108.86 55.05 65.22 44.08
Ppi_g09346 (GWD)
 68.2 48.19 20.6 25.6 13.92
31.11 24.68 17.37 14.64 2.25
28.89 24.41 10.71 9.09 8.09
Ppi_g10566 (CHLI2)
 93.7 64.95 32.05 25.58 11.37
Ppi_g10917 (DUF3)
 10.26 9.23 5.75 4.23 2.85
70.52 51.89 25.23 29.13 24.27
Ppi_g11535 (ATPPR5)
 9.85 7.93 5.47 5.23 3.52
Ppi_g11585 (emb2726)
 72.41 55.79 22.68 20.15 9.03
19.58 15.65 7.54 8.04 4.67
Ppi_g12183 (TROL)
 62.94 52.79 23.76 30.62 21.79
32.21 26.62 13.48 14.73 11.01
Ppi_g12641 (OK1)
 69.61 48.59 15.0 18.31 10.7
6.01 5.01 2.0 2.55 1.01
2.81 1.81 0.33 0.45 0.0
92.11 82.13 72.12 66.62 59.24
18.75 15.14 6.81 7.05 2.88
Ppi_g14241 (ALA1)
 29.45 22.47 5.88 6.57 5.9
19.34 15.76 6.47 8.8 2.14
Ppi_g15429 (emb1688)
 4.77 4.32 2.52 2.92 1.81
58.99 46.95 29.23 28.12 16.42
40.22 33.74 20.5 16.13 15.64
Ppi_g16378 (CP31)
 40.39 37.44 18.0 14.65 10.55
Ppi_g16493 (CDF3)
 30.63 24.12 7.95 12.56 2.63
13.35 11.04 5.01 3.98 2.61
33.75 23.92 10.2 13.84 5.88
6.4 5.17 1.16 0.87 0.04
295.07 210.35 35.87 34.73 4.13
Ppi_g21618 (MSRB2)
 90.39 71.59 39.11 28.63 24.33
32.04 29.46 11.83 12.59 8.33
27.67 19.4 7.2 10.37 4.05
383.41 329.99 176.07 193.46 135.99
Ppi_g23973 (CSD1)
 188.15 166.35 107.01 81.38 51.57
567.98 467.18 214.68 250.97 41.39
Ppi_g26269 (TT7)
 8.83 6.95 2.31 1.93 0.07
26.04 19.51 1.98 5.61 0.12
65.33 57.42 24.4 17.1 13.4
Ppi_g29310 (PIP)
 6.44 6.21 3.45 2.61 1.59
10.53 7.49 3.43 3.65 1.66
28.55 21.85 7.24 11.86 3.44
Ppi_g30079 (CCB1)
 10.47 10.54 4.82 3.63 1.67
14.15 12.04 7.66 6.55 5.66
Ppi_g30936 (CR88)
 66.04 58.01 28.5 27.97 13.38
16.76 11.8 2.07 4.28 0.04
58.66 46.84 6.9 15.22 0.52
487.04 361.33 150.02 142.11 29.06
281.0 215.25 111.09 94.05 20.62
14.87 9.98 5.02 5.73 1.93
18.33 13.55 5.39 5.9 2.69
80.04 62.82 20.48 29.58 4.82
Ppi_g31967 (RPL27)
 183.1 145.11 71.24 53.45 19.25
373.34 321.02 194.46 203.75 139.28
9.29 7.04 4.44 3.24 2.31
Ppi_g33059 (OE23)
 645.4 486.58 232.29 151.24 17.19
12.34 8.7 5.5 2.17 0.76
20.08 18.7 9.92 11.38 7.17
22.47 15.72 6.93 5.03 2.71
156.67 118.26 7.79 3.27 0.42
Ppi_g38876 (CP31)
 86.87 76.11 31.23 38.87 27.98
5.11 4.29 2.25 2.0 1.45
9.03 7.3 2.99 3.91 3.12
46.31 36.83 12.87 13.07 13.08
24.96 19.8 8.82 7.96 4.54
Ppi_g42183 (LHCB2)
 2976.11 2279.67 608.8 262.59 37.15
Ppi_g43473 (SS3)
 90.35 60.2 23.13 21.89 3.72
82.44 71.03 35.99 47.75 15.66
Ppi_g45361 (Phox2)
 27.85 22.29 7.77 9.86 3.84
66.67 54.24 29.69 23.78 4.63
Ppi_g46522 (RFC3)
 80.21 64.56 29.02 32.5 23.38
7.28 5.62 2.77 1.96 1.81
34.17 27.48 9.12 12.71 4.67
Ppi_g53494 (UGT74E2)
 15.74 11.0 0.55 0.61 0.0
Ppi_g54343 (HB5)
 71.25 55.59 20.68 27.63 1.64
16.89 13.09 3.24 2.89 2.53
231.0 151.1 15.91 9.2 0.4
Ppi_g55758 (ECT5)
 21.96 16.04 9.47 10.97 6.15
69.3 43.9 12.13 13.63 12.44
Ppi_g56556 (TRANS11)
 8.37 7.36 4.8 5.24 3.95
13.66 10.4 0.88 4.1 0.59
Ppi_g58181 (AAE1)
 71.02 53.29 24.66 27.66 19.09
Ppi_g59302 (CRR22)
 13.97 11.07 6.34 6.03 3.37
30.53 22.76 10.73 12.33 5.17
4.77 3.21 1.7 1.77 0.89
300.93 219.92 108.08 101.8 79.09
28.79 21.06 13.5 13.03 6.71
47.03 23.94 8.24 8.91 6.08
108.14 90.3 0.82 0.99 0.0
Ppi_g63817 (emb1513)
 14.85 12.82 5.99 6.8 4.32

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)