Heatmap: Cluster_61 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Archegonia (mature)	Antheridia (9 DAI)	Antheridia (small, 11 DAI)	Antheridia (mature, 14-15 DAI)	Antheridia (japan)	Antheridia	Antheridia Reute	Antheridia Gransden	Sperm cell packages	Gametophore	Gametophore (dehydrated)	Gametophore (rehydrated)	Gametophore (hydroponic)	Gametophore+auxin (hydroponic)	Leaflets	Paraphysis	Sporophyte (9 DAF)	Sporophyte (16 DAF)	Sporophyte S1	Sporophyte S2	Sporophyte S3	Sporophyte S4	Sporophyte (10 DPC)	Spore capsule (green)	Spore capsule (green, reute)	Spore capsule (mature)	Spore capsule (mature, reute)	Spores (germinating, continous light)	Protoplast	Protonema	Protonema (liquid culture)	Protonema+aba	Protonema+gametophore	Protonema+gametophore (continous light)	Protonema+gametophore (heat stress)	Protonema+gametophore (high light)	Protonema+gametophore (low light)	Protonema+gametophore+acetone	Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)	Protonema+gametophore+glucose (blue light)	Protonema+gametophore+glucose (darkness)	Protonema+gametophore+glucose (far red light)	Protonema+gametophore+glucose (red light)	Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)	Protonema+gametophore+jasmonate	Protonema+gametophore+stringolactone	Protonema+glucose (continous light)	Chloronema
Pp3c11_14193V3.1 (Pp3c11_14193)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.1	0.02	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.07	0.06	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.15	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c11_15720V3.1 (RPB2)	0.15	1.0	0.21	0.25	0.02	0.0	0.03	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c13_19910V3.1 (Pp3c13_19910)	0.05	1.0	0.26	0.04	0.03	0.02	0.07	0.08	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.12	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.3	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0
Pp3c14_18300V3.1 (Pp3c14_18300)	0.12	1.0	0.13	0.15	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c14_18490V3.1 (Pp3c14_18490)	0.12	1.0	0.13	0.15	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c14_6660V3.1 (Pp3c14_6660)	0.0	1.0	0.59	0.1	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.32	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c15_18360V3.1 (Pp3c15_18360)	0.0	1.0	0.02	0.14	0.02	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c15_19430V3.1 (Pp3c15_19430)	0.0	1.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c16_1340V3.1 (Pp3c16_1340)	0.0	1.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.07	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c16_1650V3.1 (Pp3c16_1650)	0.06	1.0	0.1	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c16_1660V3.1 (Pp3c16_1660)	0.0	1.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c16_2410V3.1 (Pp3c16_2410)	0.0	1.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c16_3470V3.1 (Pp3c16_3470)	0.0	1.0	0.25	0.26	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c16_4990V3.1 (Pp3c16_4990)	0.0	1.0	0.15	0.19	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c16_6030V3.1 (Pp3c16_6030)	0.0	1.0	0.62	0.5	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c19_23040V3.1 (Pp3c19_23040)	0.0	1.0	0.87	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c1_13240V3.1 (Pp3c1_13240)	0.0	0.99	1.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0
Pp3c1_32630V3.1 (Pp3c1_32630)	0.0	1.0	0.25	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c20_14250V3.1 (Pp3c20_14250)	0.0	1.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c20_15320V3.1 (Pp3c20_15320)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c21_14390V3.1 (Pp3c21_14390)	0.0	1.0	0.2	0.27	0.08	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c22_6320V3.1 (Pp3c22_6320)	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c23_10730V3.1 (Pp3c23_10730)	0.0	1.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c26_12510V3.1 (Pp3c26_12510)	0.0	1.0	0.38	0.16	0.12	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.45	0.15	0.66	0.32	0.0	0.13	0.0	0.0	0.04	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0
Pp3c27_4220V3.1 (PKDM7D)	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c2_29190V3.1 (Pp3c2_29190)	0.0	1.0	0.26	0.15	0.01	0.04	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c2_29220V3.1 (Pp3c2_29220)	0.22	1.0	0.8	0.15	0.09	0.12	0.13	0.15	0.49	0.06	0.1	0.0	0.02	0.0	0.07	0.21	0.79	0.21	0.0	0.02	0.06	0.03	0.12	0.85	0.15	0.53	0.05	0.02	0.03	0.07	0.05	0.09	0.04	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.03	0.02	0.0	0.0	0.03	0.01	0.03	0.07	0.03	0.07
Pp3c2_4340V3.1 (Pp3c2_4340)	0.0	1.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c2_9780V3.1 (Pp3c2_9780)	0.0	1.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c3_33120V3.1 (Pp3c3_33120)	0.0	1.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c4_24780V3.1 (Pp3c4_24780)	0.0	1.0	0.76	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.73	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.15	0.12	0.03	0.0	0.0	0.09	0.0	0.11	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.36	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1
Pp3c4_26010V3.1 (Pp3c4_26010)	0.12	1.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c5_15760V3.1 (Pp3c5_15760)	0.0	1.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c5_25960V3.1 (Pp3c5_25960)	0.14	1.0	0.25	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c6_23038V3.1 (Pp3c6_23038)	0.0	1.0	0.0	0.04	0.01	0.0	0.05	0.01	0.02	0.0	0.26	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.26	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c7_26060V3.1 (Pp3c7_26060)	0.0	1.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c7_7860V3.1 (Pp3c7_7860)	0.0	1.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c8_23380V3.1 (Pp3c8_23380)	0.0	1.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c8_6270V3.1 (Pp3c8_6270)	0.0	1.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3c9_1439V3.1 (Pp3c9_1439)	0.01	1.0	0.05	0.28	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.2	0.25	0.0	0.0	0.0	0.19	0.24	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Pp3s76_50V3.1 (Pp3s76_50)	0.0	1.0	0.3	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)