1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_61 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
Pp3c11_14193V3.1 (Pp3c11_14193)
 0.0 2.66 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.27 0.06 0.0 1.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0 0.0 0.19 0.15 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.4 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 1.53 0.31 0.39 0.03 0.0 0.04 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c13_19910V3.1 (Pp3c13_19910)
 0.1 2.28 0.59 0.1 0.06 0.05 0.16 0.17 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.83 0.27 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.67 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0
Pp3c14_18300V3.1 (Pp3c14_18300)
 0.34 2.78 0.35 0.43 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c14_18490V3.1 (Pp3c14_18490)
 0.34 2.78 0.35 0.43 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c14_6660V3.1 (Pp3c14_6660)
 0.0 1.15 0.68 0.11 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.37 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c15_18360V3.1 (Pp3c15_18360)
 0.0 2.08 0.05 0.28 0.04 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c15_19430V3.1 (Pp3c15_19430)
 0.0 0.59 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c16_1340V3.1 (Pp3c16_1340)
 0.0 1.38 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.1 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c16_1650V3.1 (Pp3c16_1650)
 0.94 15.58 1.61 3.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 1.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c16_1660V3.1 (Pp3c16_1660)
 0.0 4.23 0.0 1.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c16_2410V3.1 (Pp3c16_2410)
 0.0 1.88 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c16_3470V3.1 (Pp3c16_3470)
 0.0 49.27 12.1 12.96 3.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c16_4990V3.1 (Pp3c16_4990)
 0.0 9.44 1.41 1.76 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c16_6030V3.1 (Pp3c16_6030)
 0.0 0.22 0.14 0.11 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c19_23040V3.1 (Pp3c19_23040)
 0.0 0.2 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c1_13240V3.1 (Pp3c1_13240)
 0.0 0.24 0.24 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
Pp3c1_32630V3.1 (Pp3c1_32630)
 0.0 3.08 0.77 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c20_14250V3.1 (Pp3c20_14250)
 0.0 9.63 0.0 3.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c20_15320V3.1 (Pp3c20_15320)
 0.0 6.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c21_14390V3.1 (Pp3c21_14390)
 0.0 3.68 0.73 0.99 0.28 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 2.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c22_6320V3.1 (Pp3c22_6320)
 0.0 6.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c23_10730V3.1 (Pp3c23_10730)
 0.0 7.91 5.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c26_12510V3.1 (Pp3c26_12510)
 0.0 0.75 0.29 0.12 0.09 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.34 0.12 0.49 0.24 0.0 0.09 0.0 0.0 0.03 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Pp3c27_4220V3.1 (PKDM7D)
 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c2_29190V3.1 (Pp3c2_29190)
 0.0 2.0 0.52 0.3 0.03 0.08 0.0 0.36 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Pp3c2_29220V3.1 (Pp3c2_29220)
 0.25 1.14 0.91 0.17 0.1 0.14 0.14 0.18 0.55 0.07 0.11 0.0 0.02 0.0 0.08 0.24 0.9 0.24 0.0 0.02 0.07 0.04 0.14 0.96 0.18 0.61 0.06 0.02 0.03 0.08 0.06 0.1 0.05 0.08 0.01 0.08 0.1 0.07 0.03 0.03 0.0 0.0 0.04 0.01 0.04 0.08 0.04 0.08
Pp3c2_4340V3.1 (Pp3c2_4340)
 0.0 4.12 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.83 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c2_9780V3.1 (Pp3c2_9780)
 0.0 0.13 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c3_33120V3.1 (Pp3c3_33120)
 0.0 7.92 0.0 1.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c4_24780V3.1 (Pp3c4_24780)
 0.0 0.35 0.26 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.05 0.04 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Pp3c4_26010V3.1 (Pp3c4_26010)
 0.17 1.44 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c5_15760V3.1 (Pp3c5_15760)
 0.0 0.62 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c5_25960V3.1 (Pp3c5_25960)
 2.64 18.69 4.65 2.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c6_23038V3.1 (Pp3c6_23038)
 0.0 2.17 0.0 0.08 0.02 0.0 0.11 0.02 0.05 0.0 0.56 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.57 0.19 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c7_26060V3.1 (Pp3c7_26060)
 0.0 5.14 2.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c7_7860V3.1 (Pp3c7_7860)
 0.0 4.05 0.0 1.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 1.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c8_23380V3.1 (Pp3c8_23380)
 0.0 38.56 0.0 12.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c8_6270V3.1 (Pp3c8_6270)
 0.0 6.77 0.0 2.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 2.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3c9_1439V3.1 (Pp3c9_1439)
 0.02 3.1 0.16 0.88 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.62 0.76 0.0 0.0 0.0 0.58 0.74 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Pp3s76_50V3.1 (Pp3s76_50)
 0.0 0.48 0.14 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)