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Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
-1.44 0.11 -0.02 0.65
-1.42 -0.16 0.11 0.73
Pnu_g00666 (NAC019)
 0.09 0.13 -0.49 0.17
-0.45 -0.21 0.13 0.39
-0.39 0.29 -0.44 0.35
-0.17 -0.02 0.09 0.08
0.01 -0.03 -0.01 0.02
-1.28 0.7 -0.78 0.47
-1.96 1.27 -0.86 -0.36
-0.63 -0.07 0.02 0.47
Pnu_g01535 (ILR3)
 0.11 0.01 0.09 -0.23
0.08 0.02 0.07 -0.17
0.04 -0.22 -0.0 0.16
-0.4 -0.04 0.24 0.12
-0.22 0.03 0.04 0.12
Pnu_g02680 (FP3)
 -0.81 -0.21 0.18 0.52
0.04 -0.16 -0.18 0.26
-0.38 -0.27 0.03 0.47
-0.27 -0.27 0.03 0.41
Pnu_g02997 (MAMI)
 -0.32 0.31 -0.26 0.16
-0.03 -0.21 -0.01 0.22
-0.19 -0.38 0.19 0.28
-0.3 -0.08 -0.22 0.47
-0.37 0.06 -0.48 0.55
-0.56 0.25 0.11 0.07
-0.43 -0.01 -0.07 0.4
-0.27 0.21 0.02 0.01
-0.64 0.14 0.32 0.01
-0.96 0.92 -0.9 0.07
Pnu_g05013 (MED9)
 -0.36 0.01 0.31 -0.03
-0.47 0.74 -2.54 0.52
-1.37 0.94 -0.59 0.04
-0.91 0.82 -4.76 0.74
-0.1 -0.3 0.28 0.05
-1.56 0.77 -0.92 0.52
-1.75 1.02 -1.84 0.49
-1.64 0.54 -2.07 0.99
-1.24 0.79 -3.0 0.78
-1.28 0.78 -0.76 0.36
-1.14 0.34 -0.37 0.59
-1.31 0.83 -2.77 0.75
-1.33 0.55 -1.52 0.84
-0.57 0.17 -0.06 0.3
-0.21 -0.18 -0.41 0.59
-2.27 0.88 -0.81 0.47
-2.54 1.04 -0.91 0.31
0.01 -0.37 -0.0 0.29
-0.32 -0.04 -0.24 0.46
-0.11 -0.13 0.15 0.07
-0.03 0.05 0.04 -0.06
-0.44 -0.09 0.04 0.37
-0.14 -0.09 0.23 -0.03
Pnu_g07427 (NFA3)
 -0.17 0.09 0.08 -0.01
-1.08 0.39 -0.58 0.63
-0.41 -0.46 -0.01 0.61
-0.07 0.01 0.02 0.04
-0.33 -0.22 -0.01 0.43
-1.12 0.57 -0.51 0.44
-0.76 0.28 -0.48 0.56
-0.75 0.82 -1.27 0.29
Pnu_g08902 (RIN4)
 -0.03 0.12 -0.09 -0.01
-0.17 0.03 -0.04 0.16
0.13 -0.11 0.48 -0.77
-0.54 -0.19 0.03 0.5
0.05 0.01 0.07 -0.14
-1.94 0.88 -1.23 0.56
-0.52 0.06 0.17 0.18
0.07 -0.11 -0.18 0.19
-0.34 -0.1 0.24 0.13
-1.37 0.79 -0.32 0.11
-1.11 0.6 -0.99 0.6
-0.36 -0.11 0.01 0.37
Pnu_g10615 (AFR)
 -0.11 0.09 -0.02 0.04
-1.06 0.74 -0.81 0.35
-1.09 0.67 -0.33 0.19
0.01 -0.02 -0.04 0.05
-0.43 -0.39 0.44 0.19
-0.03 -0.21 0.04 0.18
Pnu_g12485 (MBF1B)
 -0.04 0.06 0.01 -0.03
Pnu_g12561 (YCF2.1)
 -0.13 -0.29 0.37 -0.04
0.14 -0.54 -0.2 0.42
-0.86 0.85 -1.04 0.21
-0.47 -0.05 0.09 0.33
-0.3 0.1 -0.27 0.37
-0.11 -0.0 0.18 -0.09
-1.47 0.63 -0.51 0.48
-0.09 -0.03 0.1 0.01
-0.61 0.29 -0.23 0.35
-0.06 0.12 -0.11 0.04
-0.14 -0.14 -0.01 0.26
-0.53 -0.25 0.1 0.48
-0.58 0.49 -1.97 0.74
-0.2 -0.21 0.1 0.25
-0.58 -0.11 -0.17 0.6
-1.26 0.66 -0.83 0.53
-0.94 0.35 -0.96 0.76
Pnu_g15804 (HSP91)
 -0.24 -0.29 0.15 0.29
-0.04 -0.1 -0.02 0.16
-0.11 0.03 0.09 -0.02
-1.7 0.58 -1.32 0.84
0.24 -0.54 -0.1 0.27
-1.82 0.45 -1.82 1.05
-1.62 0.59 -1.97 0.94
0.14 0.23 -0.29 -0.14
-1.9 0.77 -0.32 0.29
-0.42 -1.51 -0.48 1.13
-1.6 0.69 -1.08 0.67
-1.04 0.49 -0.8 0.62
0.04 0.09 -0.03 -0.12
-0.36 0.02 0.18 0.1
-0.65 0.03 -0.69 0.78
Pnu_g18096 (CUC2)
 -1.27 0.02 0.44 0.29
-1.21 0.29 -0.5 0.71
Pnu_g18378 (TT8)
 -0.13 0.22 0.08 -0.22
-1.84 0.57 -2.07 1.0
-0.58 0.72 -0.18 -0.32
Pnu_g18773 (VAM3)
 -0.08 -0.04 0.07 0.06
-0.18 0.38 -0.25 -0.03
-0.29 -0.64 -0.24 0.76
-1.57 0.52 -0.41 0.56
-0.14 -0.13 -0.02 0.25
-1.55 0.01 -0.05 0.75
-0.96 0.3 -0.91 0.78
-1.66 0.75 -1.23 0.66
-2.56 0.52 -0.88 0.89
0.33 0.2 -0.06 -0.67
-0.02 -0.22 0.55 -0.53
-0.35 0.5 -0.66 0.22
Pnu_g20201 (FPG-2)
 -0.08 -0.21 0.16 0.1
-2.39 0.92 -1.71 0.68
-0.24 -0.86 0.1 0.61
-0.55 -0.1 0.23 0.28
Pnu_g20724 (HAT22)
 -0.64 0.3 -0.14 0.29
-0.31 -0.35 0.15 0.37
-0.84 1.03 -0.94 -0.19
-0.22 0.58 -0.64 0.01
0.19 -3.28 0.24 0.66
-0.41 0.26 -0.12 0.17
-0.06 -0.01 0.35 -0.38
-0.88 -0.04 -0.02 0.59
-1.12 0.34 -0.86 0.79
-2.89 0.93 -0.73 0.44
-1.5 0.95 -0.54 0.03
-0.85 0.43 -0.19 0.29
Pnu_g24677 (ATRER1A)
 -0.26 -0.04 -0.01 0.26
-0.78 0.64 -1.28 0.53
-0.09 0.0 -0.02 0.1
-0.47 0.29 -0.0 0.08
-1.41 0.65 -0.65 0.51
-0.52 -0.14 0.05 0.44
-0.26 -0.76 0.06 0.61
Pnu_g26843 (ATB' BETA)
 0.01 0.11 0.08 -0.22
0.04 0.06 -0.11 0.0
0.01 0.11 0.04 -0.17
-0.23 -0.09 -0.04 0.31
-1.58 0.4 -1.07 0.9
-1.31 0.71 -0.74 0.44
-1.47 0.39 -0.15 0.52
-0.72 0.64 -0.05 -0.2
-0.97 0.14 -0.25 0.63
-0.05 -0.02 0.13 -0.07
-2.13 0.71 -0.72 0.62
-2.09 0.53 -0.95 0.85
-0.15 -0.09 0.07 0.15
-0.19 -0.07 -0.18 0.37
-0.26 -0.14 -0.01 0.34
-0.26 -0.02 -0.05 0.28
Pnu_g29931 (PFD4)
 -0.17 0.08 -0.15 0.21
Pnu_g30238 (MBF1B)
 -0.1 -0.17 0.11 0.13
-0.22 -0.72 0.38 0.3
-0.26 -0.24 -0.12 0.48
-0.92 0.51 -1.43 0.75
-0.46 0.51 -0.69 0.29
-1.58 0.81 -1.23 0.57
-0.31 0.2 -0.28 0.29
-1.49 0.52 -0.4 0.54
0.06 -0.38 -0.06 0.3
Pnu_g31278 (BIN4)
 -0.28 -0.08 -0.07 0.35
-0.57 0.09 -0.2 0.47
-0.0 -0.04 0.12 -0.09
-1.43 0.84 -0.62 0.25
-0.68 0.31 -0.01 0.19
-0.33 -0.01 0.3 -0.04
-0.49 0.04 -0.05 0.37
Pnu_g33371 (scpl48)
 -0.16 -0.07 -0.03 0.23
-0.12 -0.26 0.01 0.3
-0.49 0.22 0.15 0.03
0.06 -0.0 0.03 -0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.