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Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
0.24 0.69 0.63 1.0
0.23 0.54 0.65 1.0
Pnu_g00666 (NAC019)
 0.95 0.97 0.63 1.0
0.56 0.66 0.84 1.0
0.6 0.96 0.58 1.0
0.84 0.93 1.0 0.99
0.99 0.96 0.98 1.0
0.25 1.0 0.36 0.85
0.11 1.0 0.23 0.32
0.47 0.69 0.73 1.0
Pnu_g01535 (ILR3)
 1.0 0.94 0.99 0.79
1.0 0.96 0.99 0.84
0.92 0.77 0.89 1.0
0.64 0.83 1.0 0.92
0.79 0.94 0.95 1.0
Pnu_g02680 (FP3)
 0.4 0.6 0.79 1.0
0.86 0.75 0.74 1.0
0.56 0.6 0.74 1.0
0.62 0.63 0.77 1.0
Pnu_g02997 (MAMI)
 0.64 1.0 0.67 0.9
0.84 0.74 0.86 1.0
0.72 0.63 0.94 1.0
0.59 0.68 0.62 1.0
0.53 0.71 0.49 1.0
0.57 1.0 0.91 0.88
0.56 0.75 0.72 1.0
0.72 1.0 0.88 0.87
0.51 0.88 1.0 0.8
0.27 1.0 0.28 0.56
Pnu_g05013 (MED9)
 0.63 0.82 1.0 0.79
0.43 1.0 0.1 0.86
0.2 1.0 0.35 0.54
0.3 1.0 0.02 0.95
0.77 0.66 1.0 0.85
0.2 1.0 0.31 0.84
0.15 1.0 0.14 0.69
0.16 0.73 0.12 1.0
0.24 1.0 0.07 0.99
0.24 1.0 0.34 0.74
0.3 0.84 0.51 1.0
0.23 1.0 0.08 0.95
0.22 0.81 0.19 1.0
0.55 0.91 0.78 1.0
0.57 0.59 0.5 1.0
0.11 1.0 0.31 0.75
0.08 1.0 0.26 0.6
0.82 0.63 0.82 1.0
0.59 0.71 0.62 1.0
0.84 0.82 1.0 0.95
0.94 1.0 0.99 0.92
0.57 0.73 0.8 1.0
0.77 0.8 1.0 0.83
Pnu_g07427 (NFA3)
 0.83 1.0 0.99 0.93
0.3 0.84 0.43 1.0
0.49 0.48 0.65 1.0
0.93 0.98 0.99 1.0
0.59 0.64 0.74 1.0
0.31 1.0 0.47 0.91
0.4 0.82 0.49 1.0
0.34 1.0 0.23 0.69
Pnu_g08902 (RIN4)
 0.9 1.0 0.86 0.91
0.79 0.92 0.87 1.0
0.78 0.66 1.0 0.42
0.49 0.62 0.72 1.0
0.99 0.96 1.0 0.87
0.14 1.0 0.23 0.8
0.62 0.92 1.0 1.0
0.92 0.81 0.78 1.0
0.67 0.79 1.0 0.93
0.22 1.0 0.46 0.62
0.31 1.0 0.33 1.0
0.6 0.72 0.78 1.0
Pnu_g10615 (AFR)
 0.87 1.0 0.93 0.97
0.29 1.0 0.34 0.76
0.3 1.0 0.5 0.72
0.97 0.95 0.94 1.0
0.55 0.56 1.0 0.84
0.87 0.77 0.91 1.0
Pnu_g12485 (MBF1B)
 0.93 1.0 0.96 0.94
Pnu_g12561 (YCF2.1)
 0.7 0.63 1.0 0.75
0.82 0.51 0.65 1.0
0.3 1.0 0.27 0.64
0.58 0.77 0.85 1.0
0.63 0.83 0.64 1.0
0.81 0.88 1.0 0.83
0.23 1.0 0.45 0.9
0.88 0.91 1.0 0.94
0.52 0.96 0.67 1.0
0.89 1.0 0.86 0.94
0.76 0.76 0.83 1.0
0.5 0.6 0.77 1.0
0.4 0.84 0.15 1.0
0.73 0.72 0.9 1.0
0.44 0.61 0.58 1.0
0.26 1.0 0.36 0.91
0.31 0.75 0.31 1.0
Pnu_g15804 (HSP91)
 0.69 0.67 0.91 1.0
0.87 0.84 0.88 1.0
0.87 0.96 1.0 0.93
0.17 0.84 0.22 1.0
0.98 0.57 0.78 1.0
0.14 0.66 0.14 1.0
0.17 0.78 0.13 1.0
0.94 1.0 0.7 0.78
0.16 1.0 0.47 0.71
0.34 0.16 0.33 1.0
0.21 1.0 0.29 0.99
0.32 0.91 0.37 1.0
0.97 1.0 0.92 0.86
0.69 0.9 1.0 0.95
0.37 0.59 0.36 1.0
Pnu_g18096 (CUC2)
 0.31 0.75 1.0 0.9
0.27 0.75 0.43 1.0
Pnu_g18378 (TT8)
 0.79 1.0 0.91 0.74
0.14 0.74 0.12 1.0
0.41 1.0 0.54 0.49
Pnu_g18773 (VAM3)
 0.9 0.93 1.0 0.99
0.68 1.0 0.65 0.76
0.48 0.38 0.5 1.0
0.23 0.97 0.51 1.0
0.76 0.77 0.83 1.0
0.2 0.6 0.58 1.0
0.3 0.72 0.31 1.0
0.19 1.0 0.25 0.94
0.09 0.77 0.29 1.0
1.0 0.91 0.76 0.5
0.67 0.59 1.0 0.47
0.56 1.0 0.45 0.83
Pnu_g20201 (FPG-2)
 0.84 0.78 1.0 0.96
0.1 1.0 0.16 0.84
0.55 0.36 0.7 1.0
0.56 0.77 0.96 1.0
Pnu_g20724 (HAT22)
 0.52 1.0 0.74 0.99
0.62 0.61 0.86 1.0
0.27 1.0 0.26 0.43
0.57 1.0 0.43 0.67
0.72 0.07 0.75 1.0
0.63 1.0 0.77 0.94
0.75 0.78 1.0 0.6
0.36 0.65 0.65 1.0
0.27 0.73 0.32 1.0
0.07 1.0 0.32 0.71
0.18 1.0 0.36 0.53
0.41 1.0 0.65 0.91
Pnu_g24677 (ATRER1A)
 0.7 0.81 0.83 1.0
0.37 1.0 0.26 0.93
0.87 0.93 0.92 1.0
0.59 1.0 0.82 0.86
0.24 1.0 0.41 0.91
0.51 0.67 0.76 1.0
0.54 0.39 0.68 1.0
Pnu_g26843 (ATB' BETA)
 0.93 1.0 0.98 0.79
0.99 1.0 0.89 0.96
0.93 1.0 0.95 0.82
0.68 0.75 0.78 1.0
0.18 0.71 0.26 1.0
0.25 1.0 0.37 0.83
0.25 0.92 0.63 1.0
0.39 1.0 0.62 0.56
0.33 0.71 0.54 1.0
0.88 0.9 1.0 0.87
0.14 1.0 0.37 0.94
0.13 0.8 0.29 1.0
0.81 0.85 0.94 1.0
0.68 0.74 0.68 1.0
0.66 0.72 0.79 1.0
0.69 0.81 0.8 1.0
Pnu_g29931 (PFD4)
 0.76 0.91 0.78 1.0
Pnu_g30238 (MBF1B)
 0.85 0.81 0.99 1.0
0.66 0.47 1.0 0.95
0.6 0.61 0.66 1.0
0.31 0.85 0.22 1.0
0.51 1.0 0.44 0.86
0.19 1.0 0.24 0.85
0.66 0.94 0.67 1.0
0.24 0.98 0.52 1.0
0.85 0.63 0.78 1.0
Pnu_g31278 (BIN4)
 0.64 0.74 0.75 1.0
0.49 0.77 0.63 1.0
0.92 0.9 1.0 0.86
0.21 1.0 0.37 0.67
0.5 1.0 0.8 0.92
0.65 0.81 1.0 0.79
0.55 0.8 0.75 1.0
Pnu_g33371 (scpl48)
 0.76 0.81 0.84 1.0
0.75 0.68 0.82 1.0
0.61 1.0 0.95 0.88
1.0 0.96 0.98 0.91

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)