Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
-0.1 0.05 -0.03 0.07
-0.18 0.1 0.04 0.03
Pnu_g00494 (PEX7)
-0.19 0.06 0.17 -0.07
-0.32 -0.0 0.32 -0.08
-0.25 0.19 0.3 -0.35
Pnu_g01282 (FUS8)
-0.19 0.1 -0.05 0.12
-0.47 0.09 -0.03 0.31
-0.23 0.08 0.28 -0.2
Pnu_g01961 (LBD4)
-0.65 -0.07 0.4 0.12
Pnu_g02051 (MAP1A)
-0.24 -0.07 0.21 0.06
Pnu_g02720 (VIP3)
-0.28 0.28 -0.12 0.06
-0.44 0.16 0.19 0.01
-0.09 0.14 -0.05 -0.01
-0.31 0.12 0.18 -0.03
Pnu_g03491 (BIN3)
-0.18 0.05 0.22 -0.13
-0.86 0.04 0.29 0.26
-0.29 -0.03 0.31 -0.06
-0.64 0.3 0.53 -0.54
Pnu_g03833 (BRCC36A)
-0.18 0.11 0.02 0.04
-1.08 0.32 0.51 -0.23
-0.59 -0.44 0.39 0.37
-0.18 0.1 0.0 0.06
-0.26 0.06 0.23 -0.08
-0.18 0.05 0.06 0.05
-0.53 0.07 0.23 0.12
Pnu_g06913 (UVH6)
-0.16 0.06 0.14 -0.05
-0.2 0.11 0.23 -0.19
Pnu_g07767 (RRP4)
-0.28 -0.09 0.3 0.01
-0.13 0.12 0.14 -0.15
Pnu_g08768 (RFC4)
-0.21 0.06 0.13 0.0
-0.17 0.04 0.15 -0.05
Pnu_g09055 (PUM4)
-0.16 0.05 0.01 0.09
Pnu_g09153 (PRS3)
-0.23 0.09 0.16 -0.05
-0.13 -0.01 0.11 0.02
0.04 -0.0 0.37 -0.54
Pnu_g09813 (CPN10)
-0.34 0.0 0.13 0.16
-0.25 -0.06 0.28 -0.02
-0.74 0.13 0.53 -0.21
Pnu_g09907 (EMB1135)
-0.31 0.1 0.18 -0.01
-0.1 -0.01 0.06 0.04
Pnu_g10694 (CXE20)
-0.33 -0.08 0.25 0.1
-0.39 0.11 0.27 -0.08
-0.72 0.1 0.34 0.07
Pnu_g11171 (TAF15b)
-0.13 0.05 0.09 -0.03
-0.05 -0.23 0.51 -0.4
-0.44 0.24 -0.0 0.12
Pnu_g11482 (U1-70K)
-0.27 0.02 0.21 0.0
Pnu_g11483 (U1-70K)
-0.12 -0.02 0.17 -0.05
Pnu_g11484 (U1-70K)
-0.26 -0.03 0.08 0.16
Pnu_g11505 (RCY1)
-0.35 -0.21 0.27 0.2
Pnu_g11727 (RHF2A)
-0.17 -0.04 0.26 -0.09
-0.1 0.13 -0.08 0.04
Pnu_g11948 (CPSF160)
-0.12 0.08 0.03 0.0
-0.79 0.2 0.28 0.07
Pnu_g12189 (DRH1)
-0.25 -0.09 0.24 0.05
Pnu_g12293 (PP2A-2)
-0.29 0.11 0.13 0.02
-0.16 0.09 0.12 -0.07
-0.16 -0.06 0.07 0.14
Pnu_g13016 (CIP111)
-0.24 0.08 -0.02 0.15
-0.2 0.12 -0.05 0.1
-0.14 -0.04 0.17 -0.01
-0.38 0.07 0.28 -0.04
-0.13 0.11 -0.0 0.02
-0.28 0.04 0.04 0.17
Pnu_g13801 (EMB2016)
-0.09 0.03 0.1 -0.05
-0.36 -0.02 0.35 -0.07
-0.41 0.22 0.05 0.07
-0.8 -0.1 0.38 0.25
-0.15 -0.05 0.25 -0.08
-0.56 0.09 0.5 -0.25
-0.28 0.05 0.1 0.09
-0.34 0.12 0.18 -0.01
Pnu_g15679 (ECT5)
-0.41 0.08 0.05 0.21
-0.4 0.14 0.25 -0.06
Pnu_g15964 (DRH1)
-0.42 -0.05 0.32 0.05
Pnu_g16880 (ADNT1)
-0.28 0.1 0.21 -0.08
-0.34 0.18 0.18 -0.07
-0.29 -0.06 0.41 -0.18
-0.41 0.02 0.29 0.02
-0.47 0.25 0.03 0.1
-0.2 0.04 0.22 -0.09
Pnu_g17450 (GGB)
-0.15 0.09 0.0 0.04
Pnu_g17479 (NUDX26)
-0.38 -0.04 0.3 0.04
-0.6 0.18 0.32 -0.05
-0.05 -0.13 0.29 -0.15
Pnu_g17838 (TAF6)
-0.24 0.07 0.12 0.03
-0.18 0.06 0.22 -0.13
-0.25 0.07 0.04 0.11
-0.99 0.02 0.63 -0.09
-0.24 0.04 0.13 0.05
-0.32 0.1 0.18 -0.01
-0.21 0.01 0.15 0.02
Pnu_g19624 (MAC3A)
-0.2 0.07 0.22 -0.13
-0.64 0.15 0.21 0.13
Pnu_g20333 (AGO1)
-0.14 -0.08 0.16 0.04
-0.48 0.26 0.23 -0.13
-0.15 0.11 0.07 -0.04
-0.29 0.06 -0.02 0.2
Pnu_g21023 (XCT)
-0.4 -0.05 0.45 -0.13
-0.28 0.17 -0.03 0.1
-0.13 -0.02 0.19 -0.06
-0.24 0.12 0.09 0.01
-0.41 0.07 -0.01 0.27
Pnu_g22690 (TAF15)
-0.82 -0.05 0.45 0.13
Pnu_g23074 (LPA66)
-0.12 0.17 0.11 -0.19
-0.29 0.21 0.04 -0.01
-0.31 0.26 0.01 -0.02
Pnu_g24112 (DCAF1)
-0.29 0.04 0.16 0.05
-0.14 0.13 0.05 -0.06
-0.34 0.18 -0.03 0.13
-0.41 0.07 0.29 -0.04
Pnu_g24962 (PRR7)
-0.24 -0.08 0.24 0.05
-0.22 0.09 -0.01 0.12
-0.35 0.07 0.1 0.13
-0.23 0.15 -0.02 0.07
Pnu_g25350 (TUA3)
-0.37 -0.02 0.44 -0.17
-0.25 0.05 0.26 -0.11
-0.34 0.05 0.28 -0.05
-0.56 0.17 0.06 0.2
Pnu_g26686 (REME1)
-0.19 -0.01 0.24 -0.07
-0.26 0.16 0.02 0.05
-0.35 0.05 0.32 -0.1
Pnu_g26964 (CEN2)
-0.15 -0.01 0.03 0.12
-0.24 0.01 0.17 0.03
Pnu_g27471 (BGT)
-0.19 0.09 0.05 0.03
Pnu_g27604 (IMPA-9)
-0.15 0.06 0.16 -0.09
Pnu_g27754 (SLOMO)
-0.15 0.05 0.06 0.03
-0.95 0.27 0.69 -0.59
-0.55 0.21 0.32 -0.14
-0.34 -0.01 0.17 0.12
-0.14 0.06 0.2 -0.16
-0.61 0.2 0.42 -0.22
-0.22 0.05 0.12 0.03
-0.42 0.04 0.27 0.02
-0.5 -0.11 0.14 0.34
-0.05 -0.07 0.52 -0.62
-0.46 0.08 0.05 0.24
-0.08 0.05 0.12 -0.11
-0.36 0.17 0.16 -0.03
-0.38 -0.19 0.24 0.23
Pnu_g31635 (ILP1)
-0.27 0.01 0.26 -0.04
-0.18 0.06 0.06 0.05
Pnu_g31813 (DGK4)
-0.29 0.03 0.2 0.01
-0.17 -0.03 0.14 0.03
Pnu_g32063 (ATG18G)
0.05 -0.07 0.02 -0.01
-0.26 0.05 0.07 0.1
-0.25 0.06 0.07 0.09
-0.18 0.07 0.17 -0.08
-0.57 0.13 0.46 -0.23
-0.19 0.15 0.02 0.0
Pnu_g34096 (CRL)
-0.25 0.09 0.03 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.