1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_42 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
360.13 399.73 378.87 405.2
12.85 15.6 14.97 14.84
Pnu_g00494 (PEX7)
 23.2 27.52 29.61 25.22
12.88 16.07 20.1 15.25
3.12 4.25 4.57 2.91
Pnu_g01282 (FUS8)
 48.95 59.91 53.76 60.39
19.22 28.37 26.03 33.0
11.29 14.01 16.09 11.48
Pnu_g01961 (LBD4)
 6.55 9.76 13.55 11.16
Pnu_g02051 (MAP1A)
 38.98 43.71 53.26 47.86
Pnu_g02720 (VIP3)
 47.19 69.13 52.49 59.64
55.39 84.09 85.78 75.78
14.6 17.06 15.0 15.34
22.11 29.86 31.07 26.94
Pnu_g03491 (BIN3)
 8.34 9.79 10.99 8.6
2.09 3.92 4.66 4.57
212.34 253.35 322.36 249.29
4.94 9.47 11.14 5.31
Pnu_g03833 (BRCC36A)
 22.71 27.78 26.14 26.52
0.87 2.28 2.61 1.57
3.68 4.08 7.25 7.15
20.97 25.5 23.79 24.85
38.01 47.32 53.36 43.1
90.25 105.83 105.96 105.6
126.8 192.81 214.11 198.63
Pnu_g06913 (UVH6)
 5.62 6.52 6.91 6.06
31.06 38.29 41.85 31.18
Pnu_g07767 (RRP4)
 14.89 16.93 22.3 18.19
6.71 7.96 8.1 6.64
Pnu_g08768 (RFC4)
 10.94 13.21 13.83 12.67
25.81 29.81 32.19 28.02
Pnu_g09055 (PUM4)
 11.46 13.28 12.88 13.6
Pnu_g09153 (PRS3)
 13.95 17.36 18.21 15.79
102.28 110.88 120.81 113.62
5.75 5.6 7.22 3.84
Pnu_g09813 (CPN10)
 277.27 351.65 383.43 391.83
665.0 755.26 958.95 780.8
1.89 3.45 4.55 2.73
Pnu_g09907 (EMB1135)
 13.24 17.56 18.52 16.22
6.03 6.41 6.75 6.63
Pnu_g10694 (CXE20)
 22.08 26.32 32.98 29.75
259.31 367.13 408.48 321.16
19.45 34.28 40.36 33.62
Pnu_g11171 (TAF15b)
 109.89 123.92 128.03 117.82
6.82 6.04 10.06 5.35
109.29 175.08 148.52 161.37
Pnu_g11482 (U1-70K)
 97.51 118.96 135.34 117.79
Pnu_g11483 (U1-70K)
 41.25 44.1 50.32 43.34
Pnu_g11484 (U1-70K)
 111.65 130.75 141.23 149.35
Pnu_g11505 (RCY1)
 54.13 59.73 83.36 79.57
Pnu_g11727 (RHF2A)
 22.95 25.06 30.94 24.26
25.69 30.17 26.21 28.41
Pnu_g11948 (CPSF160)
 16.81 19.31 18.73 18.32
36.69 73.27 77.41 66.93
Pnu_g12189 (DRH1)
 26.28 29.31 36.93 32.18
Pnu_g12293 (PP2A-2)
 27.98 36.81 37.31 34.72
34.66 41.08 41.9 36.84
18.9 20.26 22.27 23.3
Pnu_g13016 (CIP111)
 16.13 20.15 18.83 21.07
23.59 29.53 26.2 29.0
52.73 56.7 65.19 57.89
44.69 61.07 70.83 56.82
368.18 434.3 403.58 409.11
111.48 139.16 139.5 152.88
Pnu_g13801 (EMB2016)
 14.64 15.87 16.69 14.99
15.34 19.36 25.12 18.75
5.92 9.15 8.13 8.27
3.36 5.49 7.66 6.97
36.95 39.54 48.54 38.58
8.83 13.83 18.46 10.92
157.32 198.14 205.3 203.83
8.05 11.11 11.55 10.16
Pnu_g15679 (ECT5)
 71.65 100.63 98.16 109.71
94.84 137.31 148.39 119.57
Pnu_g15964 (DRH1)
 15.75 20.26 26.28 21.77
Pnu_g16880 (ADNT1)
 98.15 128.1 137.8 113.19
8.57 12.29 12.3 10.35
12.6 14.79 20.49 13.6
27.72 37.16 44.87 37.21
17.67 29.07 24.94 26.35
20.37 24.05 27.16 21.93
Pnu_g17450 (GGB)
 18.5 21.8 20.56 21.13
Pnu_g17479 (NUDX26)
 48.43 61.36 77.53 64.56
6.35 10.9 12.04 9.33
112.13 105.83 142.23 104.63
Pnu_g17838 (TAF6)
 37.49 46.31 47.85 45.04
2.71 3.2 3.59 2.81
52.83 65.77 64.6 67.52
1.46 2.94 4.47 2.71
6.98 8.49 8.99 8.5
50.88 68.18 72.24 63.19
32.66 38.12 41.82 38.36
Pnu_g19624 (MAC3A)
 22.93 27.61 30.56 24.07
2.51 4.32 4.52 4.27
Pnu_g20333 (AGO1)
 7.25 7.55 8.91 8.22
1.56 2.61 2.57 1.99
49.47 59.32 57.51 53.37
12.53 16.02 15.14 17.68
Pnu_g21023 (XCT)
 7.39 9.41 13.28 8.94
55.55 75.8 65.83 72.31
55.19 59.5 69.01 57.9
37.18 47.77 46.87 44.3
39.43 54.73 51.96 62.91
Pnu_g22690 (TAF15)
 4.06 6.91 9.79 7.84
Pnu_g23074 (LPA66)
 3.07 3.76 3.6 2.92
2.1 2.96 2.64 2.54
89.37 132.78 111.38 108.94
Pnu_g24112 (DCAF1)
 17.34 21.78 23.53 21.87
6.29 7.62 7.19 6.67
9.98 14.35 12.4 13.86
58.83 82.04 95.91 76.14
Pnu_g24962 (PRR7)
 7.82 8.75 10.91 9.58
3.5 4.32 4.04 4.41
78.38 104.55 106.71 109.06
207.45 269.55 240.41 255.39
Pnu_g25350 (TUA3)
 28.18 35.97 49.24 32.25
20.34 24.97 29.03 22.4
6.47 8.46 9.95 7.9
27.26 45.44 42.0 46.31
Pnu_g26686 (REME1)
 5.41 6.15 7.3 5.9
215.21 288.14 261.88 267.13
42.45 56.28 67.84 50.54
Pnu_g26964 (CEN2)
 5.9 6.51 6.69 7.13
325.23 385.92 432.2 393.31
Pnu_g27471 (BGT)
 12.56 15.21 14.77 14.58
Pnu_g27604 (IMPA-9)
 10.03 11.66 12.45 10.49
Pnu_g27754 (SLOMO)
 10.9 12.52 12.57 12.29
1.48 3.46 4.62 1.9
7.34 12.49 13.48 9.81
82.75 104.04 118.05 113.96
13.93 16.01 17.57 13.74
3.25 5.7 6.62 4.25
548.24 661.9 697.84 652.89
13.42 18.43 21.64 18.12
2.58 3.4 4.03 4.63
4.15 4.1 6.2 2.8
6.77 9.86 9.69 11.01
53.39 58.4 61.16 52.37
87.54 125.83 125.28 109.49
3.95 4.53 6.08 6.07
Pnu_g31635 (ILP1)
 66.89 80.79 96.03 78.03
412.42 488.09 487.43 485.89
Pnu_g31813 (DGK4)
 5.29 6.58 7.41 6.5
6.04 6.66 7.5 6.95
Pnu_g32063 (ATG18G)
 3.36 3.1 3.29 3.22
53.0 65.66 66.36 68.02
18.21 22.56 22.64 22.94
24.26 28.72 30.73 25.91
23.25 37.82 47.75 29.56
241.3 304.59 278.63 275.81
Pnu_g34096 (CRL)
 7.83 9.92 9.54 10.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)