Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
-0.27 0.38 -0.06 -0.14
-0.07 0.09 0.07 -0.1
0.03 -0.04 0.11 -0.11
-0.39 0.26 0.57 -0.84
-0.09 0.12 0.2 -0.27
-0.28 -0.05 0.15 0.14
-0.35 0.03 0.07 0.2
-3.37 0.42 0.58 0.1
-0.18 0.09 0.08 -0.0
-0.31 -0.04 0.25 0.03
-0.15 -0.2 0.18 0.12
-0.1 0.06 0.01 0.04
Pnu_g02986 (ATATH8)
-0.61 0.38 0.13 -0.07
Pnu_g03041 (KAB1)
-0.09 -0.01 0.11 -0.02
-0.15 -0.56 0.38 0.17
-0.07 -0.01 0.24 -0.2
-0.56 0.25 0.14 0.04
-0.23 0.11 0.01 0.09
-1.05 0.15 0.48 0.02
-0.82 0.42 0.29 -0.2
-0.38 0.29 0.36 -0.46
-0.21 -0.09 0.25 0.02
-0.04 -0.04 0.1 -0.03
-0.29 0.05 0.32 -0.16
-0.36 0.47 -0.49 0.17
-2.4 0.27 0.05 0.65
-0.66 0.4 0.52 -0.71
-0.39 0.23 -0.07 0.16
-0.19 0.09 0.16 -0.08
-0.19 -0.07 0.18 0.04
-0.31 0.27 0.21 -0.28
-0.46 0.58 -0.63 0.18
Pnu_g07011 (DSPTP1)
-0.54 0.04 0.2 0.18
-0.2 -0.04 0.27 -0.07
-0.25 0.08 -0.03 0.16
-1.04 0.26 0.3 0.12
-0.4 0.49 0.2 -0.54
Pnu_g09023 (IAA13)
-0.21 0.26 0.04 -0.13
-0.58 0.5 -0.27 0.12
-0.54 -0.11 0.47 -0.0
-0.23 0.14 0.11 -0.05
-0.47 0.37 -0.11 0.08
-1.37 0.29 0.2 0.31
-0.18 0.13 0.12 -0.1
-0.06 0.09 0.11 -0.16
Pnu_g11140 (scpl50)
-0.3 0.16 0.04 0.06
Pnu_g11311 (NHX1)
-0.06 0.0 0.02 0.04
-0.28 0.02 0.14 0.09
Pnu_g11471 (PCK1)
-0.2 0.03 0.12 0.03
-0.09 0.08 0.25 -0.29
-0.12 0.11 0.03 -0.03
-2.55 0.84 0.34 -0.36
Pnu_g12380 (SLY1)
-2.35 0.91 -0.26 0.12
-0.37 0.06 0.34 -0.12
0.26 0.04 0.27 -0.83
-0.33 -0.02 0.26 0.03
-0.67 0.54 0.06 -0.2
-0.44 0.3 0.08 -0.05
-0.28 0.01 0.13 0.1
-0.39 0.31 0.06 -0.06
-2.29 0.84 -0.47 0.36
-0.19 -0.1 0.25 0.0
-0.47 0.08 0.73 -0.8
-0.22 0.14 0.23 -0.2
-0.97 0.03 0.53 0.04
-0.19 0.09 0.01 0.07
-1.03 0.61 -1.06 0.59
-0.3 0.41 0.21 -0.5
-0.94 0.08 0.6 -0.14
-0.94 0.33 0.18 0.13
-0.4 -0.01 0.24 0.1
Pnu_g16792 (RAP2.12)
-0.79 0.08 0.33 0.15
-0.22 -0.06 0.34 -0.13
-0.33 0.27 -0.07 0.07
-1.35 0.2 0.38 0.21
-0.58 -0.09 0.34 0.18
Pnu_g17894 (TBL5)
-0.35 0.23 0.23 -0.19
-2.33 0.58 -0.28 0.57
0.0 0.0 0.18 -0.2
-0.33 0.12 0.21 -0.06
Pnu_g18809 (EMB1691)
-0.31 -0.25 0.4 0.05
-0.05 -0.18 0.27 -0.08
-0.34 -0.45 0.58 -0.02
-0.31 0.45 -0.06 -0.21
-0.2 0.12 0.15 -0.1
-0.1 0.03 0.19 -0.14
-0.33 0.13 0.0 0.15
-0.04 -0.01 0.07 -0.02
-0.02 0.24 0.28 -0.69
-0.41 0.02 0.36 -0.08
-0.51 0.25 0.26 -0.13
-0.48 0.63 0.45 -1.42
-0.24 0.01 0.29 -0.11
-0.55 0.09 1.17 -
-0.03 -0.3 0.24 0.04
-0.06 0.02 0.19 -0.18
-1.02 -0.26 0.59 0.23
-0.49 0.24 0.25 -0.12
Pnu_g23272 (ARI8)
-0.0 0.07 0.18 -0.29
-1.15 0.28 0.2 0.24
-0.4 0.1 0.68 -0.83
0.13 -0.0 0.26 -0.5
-0.18 0.29 0.03 -0.19
-0.27 0.21 -0.1 0.11
-0.55 0.37 0.13 -0.1
Pnu_g24768 (AGB1)
-0.73 0.32 0.45 -0.35
-0.21 0.24 -0.06 -0.01
Pnu_g24960 (CNA)
-0.64 0.12 0.4 -0.06
-0.98 0.36 0.4 -0.18
-0.38 0.29 0.35 -0.46
-0.45 -1.17 0.7 0.27
-1.07 0.33 0.05 0.3
Pnu_g26222 (ARI8)
-0.02 0.08 0.07 -0.14
-0.22 0.28 0.35 -0.62
Pnu_g26703 (PIMT2)
-0.1 0.09 -0.06 0.06
-0.38 0.22 -0.04 0.12
-0.17 0.1 0.08 -0.03
-0.22 0.16 0.17 -0.16
Pnu_g27079 (PRT6)
-0.13 0.02 0.05 0.06
-0.8 0.06 0.67 -0.34
- 0.52 0.81 -0.31
Pnu_g28244 (MKK9)
-0.51 0.13 0.2 0.08
-1.14 0.5 0.5 -0.47
-0.03 0.25 0.14 -0.45
Pnu_g28898 (MOR1)
-0.33 0.21 0.38 -0.42
-0.77 0.39 0.77 -1.33
Pnu_g30096 (OTP84)
0.13 0.05 0.13 -0.37
0.12 0.21 0.01 -0.42
-0.63 -0.01 0.36 0.11
-2.09 0.88 0.16 -0.3
-0.55 0.64 0.23 -0.76
-0.43 1.19 -0.17 -3.49
-0.24 -0.01 0.31 -0.12
-0.36 0.31 -0.79 0.49
-0.04 -0.08 -0.03 0.14
Pnu_g32116 (ARA3)
-0.17 0.03 0.19 -0.07
-0.53 0.36 0.51 -0.73
-0.58 0.66 0.11 -0.58
-1.16 0.43 0.73 -0.89
Pnu_g32746 (PPD2)
-0.35 0.17 0.03 0.1
-0.11 -0.22 0.29 -0.01
-0.01 0.05 0.18 -0.26
-1.88 0.68 0.34 -0.22
-0.16 -0.59 0.38 0.18
-0.28 0.25 -0.12 0.09
Pnu_g33677 (HEMA1)
-0.21 -0.41 0.56 -0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.