1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
6.94 10.95 8.02 7.64
22.1 24.69 24.24 21.57
22.88 21.92 24.34 20.77
5.66 8.9 11.04 4.16
4.18 4.84 5.13 3.69
8.61 10.11 11.59 11.55
7.28 9.46 9.75 10.63
0.29 3.97 4.43 3.17
41.49 50.05 49.79 46.91
43.86 52.93 64.78 55.62
15.26 14.71 19.22 18.43
66.18 74.02 71.47 72.89
Pnu_g02986 (ATATH8)
 2.33 4.61 3.86 3.37
Pnu_g03041 (KAB1)
 23.77 25.13 27.37 24.9
1.98 1.48 2.84 2.46
5.08 5.3 6.3 4.63
6.88 12.1 11.23 10.48
12.59 16.02 14.91 15.73
5.56 12.79 16.06 11.64
9.46 22.32 20.49 14.58
6.49 10.28 10.78 6.13
14.71 15.93 20.19 17.2
3.76 3.76 4.14 3.77
5.38 6.83 8.24 5.89
2.98 5.29 2.71 4.31
0.79 5.01 4.29 6.52
1.97 4.11 4.44 1.9
32.21 49.62 40.25 47.33
86.28 104.77 110.63 93.25
7.43 8.08 9.6 8.71
1.79 2.67 2.56 1.83
4.93 10.13 4.37 7.71
Pnu_g07011 (DSPTP1)
 7.68 11.45 12.84 12.65
4.57 5.11 6.33 5.0
2.04 2.56 2.38 2.72
2.37 5.87 6.02 5.3
6.25 11.59 9.49 5.67
Pnu_g09023 (IAA13)
 7.12 9.85 8.47 7.53
1.93 4.09 2.39 3.14
4.23 5.71 8.56 6.14
4.08 5.27 5.19 4.63
13.47 24.0 17.25 19.74
2.85 8.98 8.47 9.16
16.88 20.92 20.65 17.8
5.17 5.71 5.81 4.82
Pnu_g11140 (scpl50)
 2.76 3.79 3.49 3.54
Pnu_g11311 (NHX1)
 20.96 21.81 22.09 22.35
6.19 7.62 8.3 8.0
Pnu_g11471 (PCK1)
 128.13 150.45 160.36 150.59
9.8 11.02 12.4 8.55
74.98 87.84 83.31 79.59
0.38 3.98 2.81 1.73
Pnu_g12380 (SLY1)
 0.43 4.14 1.84 2.41
6.71 9.01 10.94 8.0
2.91 2.49 2.92 1.37
10.08 12.5 15.23 13.02
4.84 11.17 8.03 6.71
3.92 6.55 5.63 5.14
5.04 6.17 6.69 6.53
2.28 3.69 3.11 2.86
1.37 11.99 4.86 8.61
7.9 8.4 10.7 9.01
6.83 9.99 15.67 5.43
13.26 16.99 18.09 13.42
1.33 2.66 3.78 2.69
15.66 19.01 17.92 18.78
0.79 2.44 0.77 2.42
2.18 3.55 3.1 1.89
1.02 2.08 2.98 1.79
41.95 101.23 90.95 87.84
2.35 3.08 3.66 3.33
Pnu_g16792 (RAP2.12)
 28.17 51.32 61.01 53.7
3.12 3.47 4.57 3.3
22.32 34.0 26.72 29.46
1.07 3.13 3.55 3.16
38.92 54.69 73.5 65.94
Pnu_g17894 (TBL5)
 4.75 7.09 7.1 5.31
0.55 4.12 2.27 4.1
6.86 6.86 7.74 5.95
6.22 8.51 9.03 7.47
Pnu_g18809 (EMB1691)
 4.26 4.44 7.0 5.49
17.15 15.71 21.44 16.81
41.53 38.33 78.42 51.61
2.28 3.85 2.7 2.44
15.27 19.16 19.47 16.38
3.85 4.24 4.7 3.75
31.96 43.71 40.1 44.4
8.86 9.08 9.55 9.02
14.35 17.12 17.61 8.96
2.14 2.91 3.67 2.71
2.23 3.79 3.8 2.9
1.56 3.35 2.96 0.81
9.1 10.88 13.14 9.96
0.92 1.43 3.03 0.0
7.43 6.16 8.93 7.78
2.89 3.06 3.44 2.65
1.53 2.59 4.66 3.63
3.75 6.2 6.26 4.84
Pnu_g23272 (ARI8)
 13.45 14.13 15.24 10.99
2.53 6.84 6.49 6.67
2.41 3.4 5.08 1.78
6.66 6.07 7.25 4.31
11.03 15.29 12.76 10.93
4.85 6.77 5.47 6.32
2.42 4.59 3.9 3.33
Pnu_g24768 (AGB1)
 1.19 2.45 2.69 1.54
7.58 10.4 8.43 8.76
Pnu_g24960 (CNA)
 4.03 6.82 8.29 6.02
1.24 3.15 3.23 2.16
10.92 17.41 18.17 10.37
2.48 1.5 5.49 4.08
1.49 3.94 3.23 3.85
Pnu_g26222 (ARI8)
 12.09 12.94 12.88 11.12
5.87 8.31 8.75 4.46
Pnu_g26703 (PIMT2)
 10.39 11.84 10.69 11.59
92.37 140.57 117.47 131.27
26.75 32.44 31.95 29.53
55.08 71.51 72.1 57.24
Pnu_g27079 (PRT6)
 15.98 17.64 18.02 18.16
1.01 1.84 2.83 1.4
0.0 2.78 3.4 1.56
Pnu_g28244 (MKK9)
 4.13 6.43 6.76 6.22
2.92 9.09 9.05 4.62
6.04 7.31 6.8 4.51
Pnu_g28898 (MOR1)
 2.77 4.01 4.51 2.6
1.05 2.34 3.05 0.71
Pnu_g30096 (OTP84)
 2.95 2.8 2.94 2.09
8.62 9.16 7.98 5.92
7.57 11.59 14.98 12.6
0.85 6.66 4.05 2.94
1.9 4.31 3.24 1.64
1.12 3.43 1.34 0.13
5.82 6.83 8.5 6.3
13.89 22.2 10.32 25.01
27.32 26.54 27.36 30.77
Pnu_g32116 (ARA3)
 38.52 44.23 49.36 41.14
3.23 6.0 6.63 2.81
1.34 3.17 2.16 1.34
1.27 3.81 4.69 1.52
Pnu_g32746 (PPD2)
 7.71 11.05 10.07 10.59
10.26 9.51 13.53 11.02
17.04 17.69 19.48 14.33
1.87 11.09 8.72 5.94
3.81 2.84 5.56 4.84
43.57 62.96 48.5 56.17
Pnu_g33677 (HEMA1)
 3.33 2.89 5.68 3.5

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)