Heatmap: Cluster_184 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.62 1.0 0.02 0.08 0.06
LOC_Os01g04560.1 (LOC_Os01g04560)
0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.63 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.0 0.0 0.0
LOC_Os01g09810.1 (LOC_Os01g09810)
0.01 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.02 0.19 0.11 0.04 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.09 0.0 0.01 0.03 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.18 0.94 1.0 0.15 0.03 0.0
LOC_Os01g11790.1 (LOC_Os01g11790)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.45 1.0 0.0 0.02 0.01
LOC_Os01g36590.1 (LOC_Os01g36590)
0.14 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.11 0.07 0.04 0.09 0.01 0.02 0.02 0.02 0.08 0.02 0.12 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.57 1.0 0.03 0.0 0.0
LOC_Os01g48660.1 (LOC_Os01g48660)
0.1 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.83 0.97 0.05 0.04 0.01
LOC_Os01g55060.1 (LOC_Os01g55060)
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 1.0 0.31 0.05 0.0
LOC_Os01g70990.1 (LOC_Os01g70990)
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.58 1.0 0.02 0.03 0.02
LOC_Os02g08210.1 (LOC_Os02g08210)
0.01 0.08 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.44 1.0 0.02 0.0 0.0
LOC_Os03g07620.1 (LOC_Os03g07620)
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.37 1.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.2 1.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.52 1.0 0.01 0.01 0.06
LOC_Os04g05400.1 (LOC_Os04g05400)
0.01 0.09 0.01 0.13 0.11 0.48 0.03 0.03 0.01 0.04 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.21 0.14 1.0 0.21 0.08 0.0
LOC_Os04g34490.1 (LOC_Os04g34490)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.13 0.0 0.01 0.0 0.08 0.02 0.04 0.03 0.02 0.01 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.5 1.0 0.14 0.13 0.12
LOC_Os04g52220.1 (LOC_Os04g52220)
0.14 0.29 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.76 1.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os05g01920.1 (LOC_Os05g01920)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.6 1.0 0.07 0.01 0.0
LOC_Os05g33420.1 (LOC_Os05g33420)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 1.0 0.0 0.01 0.0
0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01 0.03 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.25 0.46 1.0 0.01 0.02 0.01
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.24 0.97 0.11 0.49 1.0
LOC_Os06g18880.1 (LOC_Os06g18880)
0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.12 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.14 1.0 0.28 0.35 0.49
LOC_Os06g37750.1 (LOC_Os06g37750)
0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.41 1.0 0.05 0.15 0.21
LOC_Os06g38730.1 (LOC_Os06g38730)
0.06 0.06 0.05 0.01 0.01 0.0 0.13 0.13 0.03 0.04 0.04 0.05 0.14 0.09 0.01 0.0 0.17 0.04 0.02 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.02 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.18 0.68 1.0 0.18 0.13 0.11
LOC_Os06g47690.1 (LOC_Os06g47690)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.52 0.06 0.03 0.21 0.13 0.0 0.05 0.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.06 0.16 0.01 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.03 0.26 0.83 1.0 0.02 0.0 0.0
LOC_Os07g06470.2 (NF-YA10)
0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.15 0.01 0.01 0.11 0.04 0.03 0.02 0.02 0.05 0.01 0.0 0.07 0.17 0.01 0.03 0.05 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.04 0.01 0.05 0.06 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.38 1.0 0.0 0.01 0.01
LOC_Os07g12440.1 (LOC_Os07g12440)
0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 1.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os07g14820.1 (LOC_Os07g14820)
0.01 0.14 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.17 0.9 0.26 0.02 0.02 0.02 0.03 0.2 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 1.0 0.87 0.0 0.0 0.0
LOC_Os08g07320.1 (LOC_Os08g07320)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.25 0.0 0.0 0.0
LOC_Os08g09570.1 (LOC_Os08g09570)
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.44 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.07 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 1.0 0.01 0.0 0.02
LOC_Os08g26240.1 (LOC_Os08g26240)
0.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.06 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.3 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.01 0.02 0.03 0.36 0.52 1.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os08g33479.1 (LOC_Os08g33479)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.81 1.0 0.45 0.27 0.22
LOC_Os09g23770.1 (LOC_Os09g23770)
0.01 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.13 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.37 0.02 0.01 0.0 0.01 0.03 0.18 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.05 0.38 1.0 0.76 0.14 0.06
LOC_Os10g03950.1 (LOC_Os10g03950)
0.06 0.69 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.25 0.0 0.01 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.3 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.88 1.0 0.05 0.0 0.0
LOC_Os11g02800.1 (LOC_Os11g02800)
0.14 0.06 0.09 0.01 0.0 0.0 0.09 0.09 0.09 0.02 0.03 0.15 0.01 0.02 0.03 0.06 0.01 0.07 0.01 0.07 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.09 0.07 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.72 0.72 1.0 0.21 0.4 0.18
LOC_Os11g16460.1 (LOC_Os11g16460)
0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.25 1.0 0.0 0.06 0.0
LOC_Os11g19290.1 (LOC_Os11g19290)
0.02 0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.64 1.0 0.56 0.03 0.01
LOC_Os11g33430.1 (LOC_Os11g33430)
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.46 1.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os11g45670.1 (LOC_Os11g45670)
0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0
LOC_Os11g47480.1 (LOC_Os11g47480)
0.22 0.3 0.08 0.01 0.0 0.01 0.08 0.15 0.03 0.03 0.05 0.16 0.02 0.2 0.0 0.0 0.22 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.75 1.0 0.03 0.06 0.15
0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.03 0.0 0.06 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.04 0.01 0.02 0.01 0.04 0.05 0.03 0.03 0.11 0.1 0.11 0.69 1.0 0.01 0.01 0.0
LOC_Os12g38770.1 (LOC_Os12g38770)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.21 0.01 0.0 0.01 0.01 0.13 0.45 0.13 0.05 0.0 0.0 0.01 0.02 0.5 0.01 0.02 0.01 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.94 1.0 0.03 0.01 0.02
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.06 0.01 0.01 0.01 0.06 0.05 0.04 0.06 0.02 0.07 0.0 0.12 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.07 1.0 0.19 0.08 0.02 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.34 0.73 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 1.0 0.13 0.01 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)