Heatmap: Cluster_184 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
0.03 0.25 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.42 0.01 0.71 0.5 0.01 0.05 0.0 0.0 0.04 0.05 1.31 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.21 14.4 23.37 0.53 1.76 1.5
LOC_Os01g04560.1 (LOC_Os01g04560)
0.02 0.27 0.0 0.1 0.04 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.05 0.09 0.48 10.73 0.0 0.0 0.0 0.24 0.17 0.09 0.07 0.0 0.02 0.01 0.05 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.23 0.02 0.09 0.05 0.06 0.04 0.02 0.02 0.03 0.03 17.09 4.57 0.0 0.0 0.0
LOC_Os01g09810.1 (LOC_Os01g09810)
0.06 0.54 0.54 0.0 0.01 0.0 0.06 0.13 0.02 0.1 0.09 0.94 0.56 0.2 0.0 0.0 0.23 0.23 0.0 0.2 0.04 0.03 0.02 0.03 0.44 0.0 0.06 0.17 0.0 0.19 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.02 0.91 4.63 4.93 0.73 0.14 0.0
LOC_Os01g11790.1 (LOC_Os01g11790)
0.01 0.15 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.18 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 2.1 4.69 0.0 0.07 0.04
LOC_Os01g36590.1 (LOC_Os01g36590)
1.4 0.43 0.29 0.0 0.04 0.02 0.28 0.22 1.05 0.67 0.44 0.91 0.11 0.17 0.16 0.16 0.84 0.22 1.21 0.31 0.01 0.12 0.06 0.09 0.0 0.55 0.71 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.02 3.32 5.66 9.91 0.3 0.0 0.0
LOC_Os01g48660.1 (LOC_Os01g48660)
1.13 0.94 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.12 0.04 0.09 0.32 0.04 0.12 0.02 0.07 0.07 0.04 2.7 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.84 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 11.38 9.4 11.05 0.6 0.5 0.06
LOC_Os01g55060.1 (LOC_Os01g55060)
0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 1.52 9.26 2.89 0.42 0.0
LOC_Os01g70990.1 (LOC_Os01g70990)
0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 5.13 8.79 0.18 0.23 0.21
LOC_Os02g08210.1 (LOC_Os02g08210)
0.02 0.3 0.0 0.0 0.05 0.26 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 1.59 3.65 0.07 0.0 0.0
LOC_Os03g07620.1 (LOC_Os03g07620)
0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 2.14 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.55 1.53 4.18 0.14 0.0 0.0
0.01 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.53 1.94 9.85 0.0 0.0 0.0
3.44 1.67 0.59 0.22 0.31 1.57 0.87 0.77 1.11 0.31 0.5 11.58 1.95 2.24 0.2 0.22 3.93 0.66 8.3 0.51 0.07 0.08 0.07 0.08 0.21 0.78 0.74 0.09 0.09 0.05 0.07 0.08 0.12 0.01 0.06 0.12 0.08 0.09 0.05 0.04 0.07 0.06 0.08 7.61 73.77 142.08 1.66 1.96 9.12
LOC_Os04g05400.1 (LOC_Os04g05400)
0.04 0.25 0.04 0.39 0.33 1.39 0.08 0.08 0.04 0.12 0.12 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.03 0.02 0.13 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.03 0.03 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.61 0.4 2.91 0.61 0.23 0.01
LOC_Os04g34490.1 (LOC_Os04g34490)
0.01 0.25 0.0 0.01 0.0 0.0 3.46 5.37 0.13 0.45 0.17 3.33 0.79 1.6 1.11 0.74 0.25 3.25 0.15 0.21 0.14 0.11 0.22 0.21 0.76 0.03 0.02 0.23 0.38 0.64 0.76 0.36 0.09 0.0 0.09 0.1 0.02 0.35 0.23 0.11 0.17 0.13 0.12 5.56 19.95 40.07 5.72 5.36 4.8
LOC_Os04g52220.1 (LOC_Os04g52220)
0.58 1.15 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.1 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.21 0.01 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.09 3.06 4.03 0.0 0.0 0.0
LOC_Os05g01920.1 (LOC_Os05g01920)
0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.89 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.05 113.33 187.46 13.84 2.31 0.0
LOC_Os05g33420.1 (LOC_Os05g33420)
0.01 0.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.04 0.24 0.02 0.01 0.07 0.0 0.0 0.02 0.03 1.32 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 1.55 12.98 0.03 0.14 0.0
0.14 0.87 0.0 0.0 0.0 0.01 0.17 0.3 0.09 0.05 0.3 0.05 0.16 0.28 0.06 0.4 0.09 0.34 0.18 0.86 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.14 0.15 0.42 2.87 5.39 11.68 0.07 0.29 0.14
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.01 0.21 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.01 5.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.93 3.0 12.36 1.42 6.22 12.74
LOC_Os06g18880.1 (LOC_Os06g18880)
0.03 0.29 0.08 0.0 0.0 0.01 0.06 0.05 0.2 0.01 0.11 0.88 0.02 0.19 0.0 0.0 0.47 0.02 0.49 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 1.21 1.04 7.44 2.08 2.57 3.66
LOC_Os06g37750.1 (LOC_Os06g37750)
1.27 0.19 0.57 0.14 0.09 0.01 0.08 0.11 0.98 0.01 0.23 2.42 0.02 0.05 0.0 0.0 0.22 0.35 3.43 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.11 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.43 13.12 32.12 1.74 4.66 6.87
LOC_Os06g38730.1 (LOC_Os06g38730)
1.56 1.5 1.45 0.27 0.25 0.13 3.46 3.45 0.88 1.21 1.2 1.48 3.85 2.35 0.21 0.05 4.53 1.17 0.55 1.54 0.72 0.02 0.14 0.02 0.66 0.16 0.12 0.83 0.52 0.54 0.36 0.88 0.86 0.38 0.66 0.89 0.76 0.91 0.89 0.51 0.73 0.6 0.94 4.89 18.54 27.22 4.85 3.45 3.07
LOC_Os06g47690.1 (LOC_Os06g47690)
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 19.26 0.0 0.0 0.0
0.03 0.18 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.04 2.07 0.23 0.13 0.82 0.54 0.0 0.21 0.0 0.25 0.05 0.04 0.01 0.01 1.58 0.0 0.0 0.0 0.03 0.28 0.24 0.65 0.04 0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.12 0.12 1.02 3.28 3.97 0.1 0.0 0.0
LOC_Os07g06470.2 (NF-YA10)
0.46 0.63 0.2 0.13 0.24 3.58 0.23 0.25 2.57 0.86 0.8 0.4 0.43 1.26 0.19 0.1 1.6 4.0 0.16 0.73 1.28 0.63 0.81 0.79 0.16 0.45 0.81 0.79 0.57 0.18 0.18 0.73 0.99 0.22 1.09 1.41 0.57 0.79 0.88 0.03 0.06 0.05 0.07 1.67 8.96 23.72 0.0 0.14 0.25
LOC_Os07g12440.1 (LOC_Os07g12440)
0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.39 1.8 0.0 0.0 0.0
LOC_Os07g14820.1 (LOC_Os07g14820)
0.02 0.18 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.21 1.13 0.32 0.02 0.02 0.02 0.04 0.26 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 1.25 1.08 0.0 0.0 0.0
LOC_Os08g07320.1 (LOC_Os08g07320)
0.01 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.25 0.07 0.08 0.06 0.0 0.03 0.01 0.2 0.09 0.0 0.03 0.03 0.01 0.07 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 8.79 2.18 0.03 0.0 0.0
LOC_Os08g09570.1 (LOC_Os08g09570)
0.0 0.14 0.01 0.08 0.07 4.82 0.03 0.04 0.31 0.16 0.09 0.08 0.07 0.78 0.0 0.0 0.39 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 1.42 10.93 0.07 0.01 0.18
LOC_Os08g26240.1 (LOC_Os08g26240)
0.01 0.23 0.02 0.04 0.0 0.0 0.21 0.04 0.0 0.01 0.01 0.09 0.78 0.25 0.0 0.0 0.02 0.17 0.0 1.19 0.04 0.04 0.01 0.13 0.0 0.0 0.29 0.0 0.16 0.0 0.0 0.13 0.09 0.0 0.19 0.0 0.17 0.0 0.31 0.01 0.06 0.07 0.13 1.42 2.04 3.92 0.0 0.0 0.0
LOC_Os08g33479.1 (LOC_Os08g33479)
1.72 1.44 1.86 0.0 0.0 0.0 1.74 1.51 1.29 0.94 3.41 74.03 2.37 1.92 0.73 1.11 5.56 1.66 25.45 2.13 0.65 0.49 0.69 0.48 0.0 2.87 3.29 0.17 0.49 0.4 0.14 0.98 0.77 0.0 1.59 0.17 0.36 0.38 0.39 0.34 0.71 0.43 0.83 8.22 281.9 346.19 156.21 94.87 74.43
LOC_Os09g23770.1 (LOC_Os09g23770)
0.08 1.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.14 0.08 0.09 0.8 0.13 0.28 0.0 0.0 0.01 0.43 2.3 0.13 0.09 0.03 0.08 0.18 1.12 0.0 0.0 0.37 0.0 0.16 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.03 0.1 0.29 2.33 6.19 4.72 0.88 0.37
LOC_Os10g03950.1 (LOC_Os10g03950)
0.12 1.37 0.18 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.5 0.0 0.01 0.01 0.08 0.16 0.0 0.0 0.14 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.02 0.59 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.74 1.97 0.11 0.0 0.0
LOC_Os11g02800.1 (LOC_Os11g02800)
3.71 1.66 2.41 0.19 0.03 0.02 2.21 2.19 2.21 0.54 0.84 3.98 0.35 0.49 0.72 1.56 0.24 1.85 0.37 1.69 0.16 0.49 0.17 0.56 0.7 2.39 1.86 0.09 0.14 0.23 0.06 0.09 0.0 0.0 0.46 0.1 0.0 0.0 0.0 0.07 0.13 0.15 0.04 18.51 18.48 25.71 5.31 10.24 4.65
LOC_Os11g16460.1 (LOC_Os11g16460)
0.01 0.19 0.0 0.04 0.0 0.0 0.24 0.06 0.0 0.01 0.2 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 1.16 4.65 0.0 0.26 0.0
LOC_Os11g19290.1 (LOC_Os11g19290)
0.08 0.47 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 2.15 3.35 1.87 0.11 0.02
LOC_Os11g33430.1 (LOC_Os11g33430)
0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.78 1.69 0.0 0.0 0.0
LOC_Os11g45670.1 (LOC_Os11g45670)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.04 0.0 0.0 0.0
LOC_Os11g47480.1 (LOC_Os11g47480)
1.18 1.61 0.4 0.07 0.0 0.08 0.45 0.78 0.17 0.18 0.25 0.86 0.1 1.06 0.0 0.0 1.16 0.3 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 4.02 5.36 0.17 0.33 0.82
0.05 0.25 0.02 0.01 0.01 0.05 0.19 0.09 0.1 0.0 0.18 0.69 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 0.0 0.08 0.09 0.1 0.07 0.0 0.02 0.0 0.13 0.05 0.0 0.08 0.04 0.04 0.12 0.05 0.08 0.04 0.13 0.15 0.11 0.11 0.35 0.32 0.36 2.26 3.26 0.03 0.04 0.0
LOC_Os12g38770.1 (LOC_Os12g38770)
0.04 0.23 0.04 0.05 0.26 4.6 0.12 0.11 0.15 0.3 2.77 9.97 2.81 1.08 0.03 0.06 0.18 0.44 11.18 0.11 0.42 0.19 1.41 0.33 0.16 0.02 0.06 0.58 0.6 0.33 0.28 0.5 0.38 0.23 0.19 0.12 0.18 0.29 0.05 0.06 0.01 0.11 0.01 1.17 20.81 22.15 0.57 0.14 0.47
0.12 3.13 0.16 0.0 0.0 0.0 8.07 8.88 5.98 0.58 1.34 1.03 5.27 4.55 3.56 5.33 1.84 6.54 0.17 11.74 0.58 0.47 0.52 0.34 3.07 1.69 0.4 0.45 0.3 0.39 0.35 0.37 0.36 0.36 0.41 0.78 0.74 0.84 0.7 0.58 0.84 0.81 0.85 6.91 95.25 17.83 7.63 1.51 0.06
0.04 0.77 0.0 0.0 0.0 0.47 26.89 57.25 1.69 0.06 0.25 0.43 0.95 3.69 0.2 0.0 0.13 0.9 0.0 5.43 0.01 0.19 0.04 0.22 1.55 0.46 0.17 0.0 0.14 0.22 0.25 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.2 0.2 0.52 0.13 1.18 78.27 10.53 0.4 0.06 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)