Heatmap: Cluster_156 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovary	Egg cell	Pollen tricellular	Pollen	Sperm	Flower (buds)	Flower	Panicle	Milk grains	Seeds	Seedling	Seedling (12-day-old, DongJin)	Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)	Seedling (22-days-old, 22C)	Seedling (22-days-old, 30C)	Meristem	Stems	Callus	Leaf	Leaf (Azucena)	Leaf (Kinandang puti)	Leaf (Pandan wangi)	Leaf (Tadukan)	Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)	Leaf (drought-stress, 1 day)	Leaf (drought-stress, 3 days)	Leaf (drought-stress, 15 min)	Leaf (drought-stress, 45 min)	Leaf (drought-stress, 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)	Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)	Leaf (heat-stress, 15 min)	Leaf (heat-stress, 150 min)	Leaf (heat-stress, 210 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)	Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)	Leaf (dry season, irrigated field)	Leaf (dry season, rainfed field)	Leaf (wet season, irrigated field)	Leaf (wet season, rainfed field)	Root	Root (heading stage)	Root (tillering stage)	Root (differentiation zone)	Root (elongation zone)	Root (meristematic zone)
ChrUn.fgenesh.mRNA.86	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.19	0.25	0.08	0.0	0.04	0.03	0.13	0.38	0.1	0.04	0.0	1.0	0.0	0.33	0.13	0.48	0.11	0.3	0.64	0.17	0.73	0.13	0.04	0.05	0.07	0.12	0.12	0.0	0.16	0.17	0.08	0.23	0.28	0.04	0.04	0.02	0.01	0.13	0.58	0.56	0.21	0.02	0.0
ChrUn.fgenesh.mRNA.90	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.45	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.07	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os01g21520.1 (LOC_Os01g21520)	0.31	0.22	0.07	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.99	0.0	0.06	0.0	0.02	0.02	0.69	0.41	0.03	1.0	0.06	0.29	0.0	0.09	0.01	0.06	0.28	0.28	0.72	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.1	0.04	0.01	0.0
LOC_Os01g44000.1 (LOC_Os01g44000)	0.32	1.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os02g26840.1 (LOC_Os02g26840)	0.16	0.3	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.01	0.04	0.03	0.0	0.02	0.0	0.05	0.06	1.0	0.0	0.24	0.0	0.06	0.0	0.12	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.14	0.07	0.05	0.0	0.02
LOC_Os02g30550.1 (LOC_Os02g30550)	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.14	0.03	0.01	0.89	0.0	0.03	0.08	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.05	0.31	0.43	0.3	0.35	0.0	0.0	0.32	0.4	0.13	0.63	0.38	0.24	0.0	0.13	0.19	0.62	0.33	0.33	0.0	0.01	0.01	0.05	0.04	0.0	0.06	0.13	0.0	0.0	0.0
LOC_Os02g43780.1 (LOC_Os02g43780)	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.11	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.03	0.04	0.0	0.04	0.0	0.03	0.02	0.0	0.01	0.1	0.04	0.0	0.03	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os03g15130.1 (LOC_Os03g15130)	0.35	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os03g29150.1 (3BETAHSD/D1)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.05	0.0	0.0	0.01	0.45	0.3	0.44	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.07	0.59	0.5	0.36	0.4	0.1	0.0	0.0	0.3	0.38	0.52	0.31	0.2	0.43	0.47	0.28	0.3	0.32	0.58	0.58	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0
LOC_Os03g32460.1 (LOC_Os03g32460)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.14	0.04	0.35	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.07	0.27	0.44	0.24	0.25	0.02	0.0	0.0	0.24	0.23	0.24	0.17	0.14	0.18	0.07	0.16	0.25	0.17	0.31	0.2	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
LOC_Os03g41690.1 (LOC_Os03g41690)	0.54	1.0	0.0	0.9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os04g04040.1 (LOC_Os04g04040)	0.0	0.52	0.01	0.03	0.05	0.0	0.05	0.14	0.18	0.14	0.07	0.48	0.0	0.07	0.34	1.0	0.01	0.52	0.54	0.13	0.11	0.0	0.07	0.1	0.54	0.0	0.67	0.0	0.33	0.22	0.12	0.29	0.08	0.22	0.09	0.23	0.0	0.06	0.07	0.05	0.1	0.05	0.13	0.05	0.05	0.05	0.12	0.0	0.0
LOC_Os04g04050.1 (LOC_Os04g04050)	0.01	0.57	0.02	0.0	0.0	0.15	0.05	0.02	0.39	0.08	0.05	0.61	0.0	0.2	0.99	0.0	0.1	0.62	0.0	0.08	0.15	0.0	0.13	0.41	0.55	0.37	1.0	0.0	0.0	0.67	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.23	0.21	0.0	0.0	0.08	0.18	0.12	0.51	0.04	0.29	0.14	0.0	0.0	0.0
LOC_Os04g06500.1 (LOC_Os04g06500)	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.2	0.22	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.31	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.14	0.23	0.16	0.23	0.13	0.19	0.06	0.3	0.22	0.59	0.57	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0
LOC_Os04g11970.1 (LOC_Os04g11970)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.12	0.0	0.01	0.37	0.03	0.15	0.99	1.0	0.0	0.8	0.16	0.27	0.01	0.62	0.01	0.42	0.25	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.06	0.18	0.14	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os04g14540.1 (LOC_Os04g14540)	0.07	0.39	0.05	0.01	0.01	0.0	0.03	0.05	0.11	0.03	0.02	0.17	0.46	0.08	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.02	0.05	0.0	0.05	0.04	0.05	0.0	0.03	0.06	0.0	0.02	0.02	0.17	0.04	0.0	0.07	0.06	0.1	0.03	0.08	0.04	0.07	0.08	0.05	0.45	0.15	0.14	0.0	0.06	0.0
LOC_Os04g14740.1 (LOC_Os04g14740)	0.03	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.08	0.02	0.14	0.0	0.0	0.0	0.93	0.06	0.24	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0
LOC_Os04g26350.1 (LOC_Os04g26350)	0.23	0.36	0.37	0.0	0.0	0.0	0.14	0.16	1.0	0.01	0.08	0.24	0.0	0.0	0.08	0.13	0.1	0.35	0.05	0.05	0.03	0.09	0.03	0.09	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.04	0.0	0.02	0.01	0.02	0.09	0.02	0.0	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01
LOC_Os04g28570.1 (FAR5)	0.11	0.29	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.12	0.09	0.0	0.06	0.34	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.13	0.17	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.38	0.0	0.4	0.31	0.0	0.0	0.46	0.05	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os05g04900.1 (LOC_Os05g04900)	0.04	0.23	0.0	0.63	0.94	0.13	0.02	0.02	0.54	0.0	0.04	0.99	0.83	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os05g08554.1 (LOC_Os05g08554)	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.36	0.24	0.07	0.0	0.02	0.84	0.01	0.02	0.12	0.17	0.0	1.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.18	0.27	0.0	0.0	0.0
LOC_Os05g14800.1 (CAS1)	0.08	0.98	0.17	0.03	0.1	0.54	0.01	0.01	0.05	0.0	0.05	1.0	0.02	0.04	0.06	0.15	0.02	0.79	0.1	0.08	0.03	0.63	0.02	0.08	0.0	0.11	0.11	0.02	0.0	0.05	0.0	0.07	0.02	0.02	0.04	0.54	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.06	0.01	0.06	0.23	0.02	0.02	0.0
LOC_Os06g18790.1 (UGT88A1)	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04	0.01	0.08	0.21	0.07	0.14	0.09	0.83	0.26	0.16	0.05	0.09	0.04	0.15	0.26	0.08	0.05	0.05	0.03	0.08	0.05	0.04	0.02	0.03	0.07	0.16	0.06	0.1	0.09	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.18	0.0	0.03	0.09
LOC_Os06g21310.1 (LOC_Os06g21310)	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.04	0.0	0.1	0.15	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os06g28600.1 (LOC_Os06g28600)	0.03	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.08	0.08	0.0	0.0	0.09	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os06g28820.1 (CAS1)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.0	0.01	0.01	0.85	0.14	0.17	0.01	0.03	0.0	1.0	0.0	0.09	0.3	0.36	0.21	0.04	0.01	0.03	0.03	0.36	0.27	0.23	0.17	0.18	0.32	0.25	0.37	0.55	0.44	0.33	0.24	0.14	0.22	0.29	0.41	0.01	0.08	0.11	0.0	0.0	0.0
LOC_Os07g03220.1 (LOC_Os07g03220)	0.23	0.31	0.25	0.03	0.0	0.02	0.03	0.04	0.29	0.04	0.18	0.03	0.17	0.07	0.46	0.2	0.06	0.81	0.87	0.37	0.05	0.38	0.06	0.3	1.0	0.14	0.39	0.04	0.03	0.24	0.06	0.15	0.03	0.0	0.17	0.09	0.03	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.14	0.35	0.6	0.65	0.0	0.07
LOC_Os07g19160.1 (CYP71B12)	0.15	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.03	0.0	0.03	0.05	0.22	0.62	0.0	0.0	0.02	0.67	0.0	0.39	0.04	0.36	0.01	0.23	0.73	0.09	0.9	0.0	0.15	0.0	0.08	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.03	0.04	0.07	0.05	0.04	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os08g36540.1 (LOC_Os08g36540)	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.66	0.0	0.03	0.26	0.19	0.39	0.51	0.59	0.05	1.0	0.53	0.38	0.03	0.18	0.02	0.16	0.18	0.09	0.29	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.13	0.7	0.68	0.07	0.0	0.01
LOC_Os09g18290.1 (LOC_Os09g18290)	0.0	0.29	0.0	0.0	0.15	0.0	0.07	0.01	0.0	0.0	0.0	0.17	0.17	0.27	1.0	0.35	0.0	0.68	0.0	0.27	0.1	0.07	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.06	0.02	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os09g25270.1 (LOC_Os09g25270)	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.17	0.38	0.62	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os10g18990.1 (LOC_Os10g18990)	0.03	0.37	0.01	0.0	0.0	0.02	0.48	0.37	0.09	0.04	0.04	1.0	0.59	0.41	0.08	0.0	0.09	0.83	0.26	0.09	0.04	0.04	0.01	0.16	0.0	0.05	0.0	0.08	0.0	0.04	0.0	0.15	0.0	0.0	0.13	0.14	0.07	0.05	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.2	0.24	0.0	0.0	0.0
LOC_Os10g36070.1 (LOC_Os10g36070)	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.42	0.0	0.01	0.01	0.11	1.0	0.0	0.0	0.03	0.38	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
LOC_Os11g35500.1 (LOC_Os11g35500)	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.63	0.01	0.06	0.01	0.32	0.41	0.65	0.03	0.03	0.01	1.0	0.12	0.42	0.05	0.02	0.07	0.04	0.03	0.19	0.27	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.0	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.11	0.27	0.01	0.0	0.0
LOC_Os11g35710.1 (CAS1)	0.17	0.32	0.04	0.02	0.02	0.65	0.23	0.28	0.2	0.09	0.11	0.1	0.13	0.12	0.23	0.23	0.01	1.0	0.05	0.28	0.2	0.0	0.06	0.11	0.31	0.0	0.0	0.16	0.1	0.25	0.14	0.14	0.16	0.15	0.14	0.21	0.2	0.16	0.2	0.01	0.01	0.03	0.04	0.24	0.14	0.12	0.12	0.1	0.02
LOC_Os11g35930.1 (CHS)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.16	0.01	0.01	0.0	1.0	0.0	0.12	0.18	0.18	0.07	0.13	0.24	0.0	0.0	0.13	0.15	0.21	0.11	0.09	0.1	0.22	0.24	0.22	0.23	0.26	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0
LOC_Os11g36180.1 (LOC_Os11g36180)	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.19	0.11	0.11	0.01	0.06	0.22	1.0	0.12	0.16	0.01	0.0	0.03	0.01	0.0	0.06	0.11	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.28	0.13	0.22	0.01	0.0	0.0
LOC_Os12g09500.1 (CYP76C2)	0.01	0.09	0.0	0.01	0.0	0.14	0.08	0.12	0.02	0.03	0.03	0.29	0.71	1.0	0.0	0.0	0.01	0.57	0.0	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.0	0.0	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.14	0.54	0.01	0.0	0.0
LOC_Os12g33770.1 (LOC_Os12g33770)	0.05	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.19	1.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os12g40600.1 (LOC_Os12g40600)	0.0	0.42	0.0	0.04	0.15	0.58	0.01	0.0	0.0	0.8	0.15	1.0	0.14	0.04	0.0	0.0	0.0	0.63	0.37	0.04	0.01	0.01	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
LOC_Os12g40630.1 (PIL5)	0.0	0.08	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.22	0.0	0.02	0.02	0.0	0.01	0.3	1.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)