1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_156 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 1.16 1.47 0.48 0.01 0.25 0.16 0.77 2.28 0.6 0.25 0.0 5.96 0.0 1.99 0.79 2.86 0.67 1.77 3.81 1.03 4.37 0.78 0.21 0.3 0.39 0.73 0.7 0.0 0.97 1.04 0.46 1.39 1.66 0.23 0.24 0.1 0.06 0.75 3.43 3.35 1.24 0.11 0.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.13 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.29 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os01g21520.1 (LOC_Os01g21520)
 9.35 6.64 2.13 0.0 0.0 0.36 0.05 0.08 29.94 0.0 1.78 0.07 0.5 0.47 20.78 12.37 0.97 30.15 1.89 8.6 0.06 2.83 0.25 1.71 8.5 8.31 21.81 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.33 0.04 0.07 0.09 0.04 0.05 2.16 3.06 1.3 0.2 0.0
LOC_Os01g44000.1 (LOC_Os01g44000)
 0.14 0.42 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os02g26840.1 (LOC_Os02g26840)
 0.18 0.34 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.01 0.05 0.03 0.0 0.02 0.0 0.05 0.07 1.13 0.0 0.27 0.0 0.07 0.0 0.13 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.16 0.08 0.05 0.0 0.02
LOC_Os02g30550.1 (LOC_Os02g30550)
 0.03 3.57 0.0 0.0 0.0 1.37 0.28 0.09 8.74 0.0 0.33 0.78 1.31 0.0 0.0 0.0 0.0 9.78 0.0 0.53 3.07 4.16 2.9 3.37 0.0 0.0 3.1 3.92 1.29 6.18 3.67 2.3 0.0 1.25 1.83 6.04 3.27 3.23 0.0 0.14 0.07 0.47 0.38 0.0 0.56 1.24 0.0 0.0 0.0
LOC_Os02g43780.1 (LOC_Os02g43780)
 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.66 0.0 0.01 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.66 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.07 0.03 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os03g15130.1 (LOC_Os03g15130)
 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os03g29150.1 (3BETAHSD/D1)
 0.01 0.18 0.0 0.0 0.18 0.0 0.84 0.87 0.02 0.01 0.26 8.41 5.72 8.33 0.0 0.0 0.02 18.79 0.42 1.37 11.04 9.32 6.78 7.53 1.88 0.0 0.0 5.55 7.05 9.79 5.78 3.77 8.02 8.75 5.21 5.59 6.09 10.98 10.96 0.15 0.1 0.24 0.31 2.14 0.86 0.47 0.0 0.0 0.0
LOC_Os03g32460.1 (LOC_Os03g32460)
 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.01 0.06 0.13 0.02 0.0 0.04 0.85 0.27 2.09 0.04 0.0 0.0 6.05 0.0 0.4 1.66 2.66 1.44 1.49 0.14 0.02 0.0 1.46 1.39 1.46 1.04 0.86 1.1 0.43 0.99 1.51 1.01 1.9 1.23 0.01 0.03 0.04 0.05 0.01 0.02 0.03 0.05 0.0 0.0
LOC_Os03g41690.1 (LOC_Os03g41690)
 0.03 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os04g04040.1 (LOC_Os04g04040)
 0.0 0.44 0.01 0.02 0.04 0.0 0.04 0.12 0.15 0.12 0.06 0.41 0.0 0.06 0.29 0.85 0.01 0.44 0.46 0.11 0.09 0.0 0.06 0.09 0.46 0.0 0.57 0.0 0.28 0.19 0.11 0.25 0.07 0.18 0.08 0.19 0.0 0.05 0.06 0.05 0.09 0.04 0.11 0.04 0.04 0.04 0.1 0.0 0.0
LOC_Os04g04050.1 (LOC_Os04g04050)
 0.0 0.38 0.02 0.0 0.0 0.1 0.03 0.02 0.26 0.06 0.03 0.41 0.0 0.13 0.67 0.0 0.07 0.42 0.0 0.06 0.1 0.0 0.09 0.28 0.37 0.25 0.68 0.0 0.0 0.45 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.15 0.14 0.0 0.0 0.06 0.12 0.08 0.35 0.03 0.2 0.09 0.0 0.0 0.0
LOC_Os04g06500.1 (LOC_Os04g06500)
 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.26 0.29 0.02 0.0 0.0 1.33 0.0 0.02 0.41 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.0 0.19 0.31 0.21 0.3 0.17 0.26 0.08 0.39 0.3 0.78 0.76 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
LOC_Os04g11970.1 (LOC_Os04g11970)
 0.05 0.78 0.14 0.0 0.0 0.0 0.9 1.54 4.17 0.04 0.29 13.23 1.02 5.31 35.14 35.42 0.0 28.37 5.72 9.64 0.46 22.08 0.37 14.88 8.8 0.23 0.38 0.41 0.13 0.33 0.21 0.14 0.11 0.25 0.22 0.42 0.79 0.42 1.1 2.74 2.15 6.33 5.09 0.11 0.41 0.17 0.0 0.0 0.0
LOC_Os04g14540.1 (LOC_Os04g14540)
 0.04 0.2 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.09 0.23 0.04 0.0 0.0 0.08 0.51 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02 0.03 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.01 0.09 0.02 0.0 0.03 0.03 0.05 0.02 0.04 0.02 0.04 0.04 0.03 0.23 0.08 0.07 0.0 0.03 0.0
LOC_Os04g14740.1 (LOC_Os04g14740)
 0.02 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.06 0.01 0.11 0.0 0.0 0.0 0.69 0.04 0.18 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0
LOC_Os04g26350.1 (LOC_Os04g26350)
 0.69 1.05 1.09 0.0 0.01 0.01 0.4 0.48 2.95 0.02 0.24 0.71 0.01 0.0 0.24 0.37 0.29 1.02 0.14 0.15 0.1 0.28 0.09 0.27 0.08 0.09 0.05 0.13 0.05 0.12 0.12 0.14 0.11 0.0 0.06 0.04 0.07 0.27 0.07 0.01 0.08 0.03 0.06 0.03 0.09 0.04 0.0 0.0 0.03
0.06 0.17 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.06 0.0 0.04 0.2 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.08 0.1 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.22 0.0 0.24 0.18 0.0 0.0 0.27 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os05g04900.1 (LOC_Os05g04900)
 0.05 0.32 0.0 0.87 1.28 0.18 0.03 0.03 0.74 0.0 0.05 1.36 1.13 0.0 0.0 0.0 0.15 1.37 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os05g08554.1 (LOC_Os05g08554)
 0.66 1.61 172.77 0.0 0.0 0.0 157.58 105.32 31.84 0.34 8.76 365.84 3.32 10.49 53.28 74.8 0.0 436.52 0.0 21.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 17.05 11.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18.97 77.5 119.2 0.0 0.0 0.0
0.14 1.8 0.3 0.05 0.18 0.99 0.01 0.01 0.1 0.0 0.1 1.83 0.03 0.08 0.11 0.27 0.03 1.44 0.18 0.15 0.05 1.15 0.05 0.15 0.0 0.2 0.2 0.03 0.0 0.09 0.0 0.12 0.03 0.03 0.07 0.99 0.02 0.04 0.02 0.02 0.13 0.14 0.11 0.02 0.11 0.42 0.04 0.03 0.0
LOC_Os06g18790.1 (UGT88A1)
 0.01 0.35 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 12.84 0.01 0.47 0.16 1.06 2.71 0.94 1.83 1.2 10.6 3.36 2.02 0.69 1.09 0.47 1.96 3.37 1.09 0.64 0.61 0.38 0.98 0.67 0.52 0.23 0.41 0.92 2.09 0.81 1.24 1.21 0.03 0.1 0.1 0.05 0.01 0.3 2.31 0.03 0.44 1.13
LOC_Os06g21310.1 (LOC_Os06g21310)
 0.01 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 5.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.81 0.0 0.32 0.02 0.85 1.24 0.01 8.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os06g28600.1 (LOC_Os06g28600)
 0.01 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.1 0.25 0.07 0.0 0.07 0.65 1.18 0.01 0.13 0.15 18.83 3.17 3.77 0.25 0.63 0.01 22.14 0.0 1.96 6.69 8.04 4.71 0.81 0.2 0.71 0.68 8.0 5.9 5.17 3.69 4.06 7.16 5.61 8.28 12.08 9.74 7.32 5.37 3.21 4.82 6.4 9.17 0.13 1.8 2.5 0.0 0.0 0.0
LOC_Os07g03220.1 (LOC_Os07g03220)
 0.39 0.53 0.43 0.05 0.01 0.03 0.04 0.06 0.5 0.07 0.31 0.05 0.29 0.12 0.79 0.35 0.1 1.4 1.49 0.64 0.08 0.65 0.11 0.52 1.72 0.25 0.68 0.06 0.05 0.41 0.11 0.25 0.05 0.0 0.29 0.15 0.05 0.04 0.05 0.05 0.09 0.08 0.06 0.24 0.6 1.04 1.12 0.0 0.12
LOC_Os07g19160.1 (CYP71B12)
 0.09 0.59 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.03 0.13 0.37 0.0 0.0 0.01 0.39 0.0 0.23 0.02 0.21 0.0 0.14 0.43 0.05 0.53 0.0 0.09 0.0 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.03 0.04 0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os08g36540.1 (LOC_Os08g36540)
 0.0 0.3 0.0 0.0 0.01 0.0 0.26 0.22 3.18 0.0 0.16 1.26 0.9 1.88 2.46 2.87 0.26 4.84 2.59 1.83 0.14 0.86 0.11 0.76 0.85 0.44 1.41 0.23 0.08 0.05 0.15 0.2 0.09 0.06 0.08 0.23 0.06 0.03 0.18 0.16 0.21 0.21 0.22 0.64 3.41 3.3 0.36 0.0 0.07
LOC_Os09g18290.1 (LOC_Os09g18290)
 0.01 1.01 0.0 0.0 0.53 0.0 0.23 0.05 0.0 0.0 0.0 0.6 0.61 0.93 3.51 1.23 0.0 2.39 0.0 0.96 0.37 0.26 0.22 0.03 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.2 0.07 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os09g25270.1 (LOC_Os09g25270)
 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.18 0.41 0.68 0.0 0.0 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os10g18990.1 (LOC_Os10g18990)
 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.1 0.02 0.01 0.01 0.27 0.16 0.11 0.02 0.0 0.02 0.22 0.07 0.02 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0
LOC_Os10g36070.1 (LOC_Os10g36070)
 0.19 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 8.94 0.01 0.17 0.26 2.38 21.32 0.0 0.0 0.6 8.08 0.0 0.12 0.33 0.3 0.03 0.3 0.46 0.0 0.17 1.1 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
LOC_Os11g35500.1 (LOC_Os11g35500)
 0.06 0.21 0.01 0.0 0.01 0.02 2.97 3.07 0.04 0.3 0.07 1.56 1.97 3.14 0.16 0.16 0.05 4.84 0.6 2.06 0.24 0.1 0.35 0.19 0.16 0.94 1.28 0.21 0.12 0.15 0.08 0.18 0.16 0.01 0.07 0.13 0.17 0.21 0.17 0.06 0.06 0.12 0.17 0.15 0.55 1.32 0.05 0.0 0.0
8.98 17.27 2.37 1.05 1.0 34.75 12.47 14.98 10.91 4.82 5.85 5.38 6.73 6.41 12.33 12.39 0.78 53.4 2.84 15.07 10.61 0.21 3.34 5.89 16.3 0.06 0.08 8.4 5.24 13.35 7.23 7.63 8.29 7.91 7.32 11.22 10.59 8.36 10.74 0.66 0.73 1.51 2.22 13.01 7.26 6.51 6.42 5.37 1.03
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.03 0.17 0.16 0.27 1.4 0.13 0.13 0.02 8.76 0.0 1.02 1.57 1.6 0.6 1.14 2.12 0.0 0.0 1.15 1.35 1.8 0.98 0.81 0.89 1.95 2.12 1.89 2.03 2.28 2.56 0.01 0.0 0.04 0.02 1.54 0.5 0.08 0.0 0.0 0.0
LOC_Os11g36180.1 (LOC_Os11g36180)
 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.37 0.21 0.2 0.01 0.12 0.43 1.94 0.24 0.31 0.01 0.01 0.05 0.01 0.0 0.12 0.22 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.55 0.26 0.42 0.02 0.0 0.0
LOC_Os12g09500.1 (CYP76C2)
 0.03 0.22 0.0 0.02 0.0 0.34 0.2 0.29 0.04 0.07 0.07 0.72 1.79 2.52 0.0 0.0 0.03 1.43 0.0 0.02 0.05 0.08 0.1 0.12 0.14 0.0 0.0 0.07 0.04 0.04 0.02 0.04 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.35 1.35 0.02 0.0 0.0
LOC_Os12g33770.1 (LOC_Os12g33770)
 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.48 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os12g40600.1 (LOC_Os12g40600)
 0.0 0.11 0.0 0.01 0.04 0.15 0.0 0.0 0.0 0.21 0.04 0.26 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.17 0.1 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.27 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.12 0.74 0.01 0.05 0.08 0.0 0.05 1.0 3.32 0.17 0.02 0.01 0.01 0.03 0.09 0.0 0.19 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)