Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.39 -0.33 2.27 3.73 -2.59 -5.45 -2.16 - - - - - - - -0.46 -0.58 - - - - - -
0.48 - 2.87 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.25 4.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.83 2.6 3.92 -3.04 -4.77 - - - - - - - -3.56 - - - - - - - -
Mp1g15380.1 (RING1B)
-0.8 -0.46 2.98 3.45 -1.42 -3.26 -4.42 - - - - - -1.98 -1.62 - - -1.73 - - - - -0.91
0.2 - 1.4 4.01 -3.32 -2.38 -2.83 - - - 0.23 - - -1.15 - - - - - - - -
0.27 -0.01 2.56 3.64 -1.64 - -2.76 - - - -0.1 - - - - - - - - - - -
-2.43 -0.02 3.7 2.81 -0.78 -4.18 -2.38 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.33 3.56 - -2.4 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.02 3.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.49 -0.02 3.58 2.76 -4.06 -2.82 -2.75 - - - - - - - - - - -0.16 - - - -0.31
- - 3.97 2.47 - - - - - - - - - - -0.26 - - - - - - -
-1.42 - 3.06 3.55 -0.3 - - -0.42 - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.55 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp2g11330.1 (ATM1)
-0.1 0.99 2.07 3.87 -2.2 - -3.87 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.79 3.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.12 0.26 3.04 3.53 -2.96 - - - - - - - - -2.85 -0.83 - - - - - - -
-1.54 1.78 2.82 3.14 -1.41 -1.94 -1.17 - - - - - - -3.45 -1.47 -1.19 -1.39 - - - - -
0.03 0.08 3.35 3.27 -4.14 -5.9 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp2g19840.1 (MSH5)
-4.05 1.44 3.69 2.58 - -2.9 - - - - - - - -2.4 - - - - - - - -
- - 2.49 3.91 - - -0.94 - - - - - - -0.35 - - - - - - - -
- - 3.39 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.9 -0.98 3.63 2.26 -1.76 -1.52 0.2 - - -0.44 - - - -2.98 - -0.73 -0.92 - - - - -
-2.08 0.05 2.38 3.78 -0.24 - - - - - - - - - - -0.09 - - - - - -
- 1.08 2.78 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.54 - 2.65 3.9 -0.63 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.46 -0.05 3.15 2.5 -2.89 -2.18 -2.88 -0.05 - 0.28 -0.8 -0.16 -2.28 -3.76 -1.74 - - - -0.55 -1.49 - -
- - 2.27 3.91 - - - - - - - - 0.36 -0.28 - - - - - - - -
- 1.89 3.44 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.89 - 2.51 3.73 -0.09 -2.12 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.48 4.0 -1.35 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.57 0.44 3.0 3.55 -2.76 -2.07 - - - - - - - -2.31 - - - - - - - -
0.57 - 3.19 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.52 4.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.87 -0.26 3.81 2.32 -1.36 -1.52 - - - - - - - - - - -0.2 - - - - -
- 0.62 2.79 3.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.1 - 3.0 3.68 - -3.02 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.31 4.02 -0.68 -2.6 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.29 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.2 1.28 3.03 3.08 -3.0 -2.3 -4.37 - - - - - - - - - - - - -1.53 - 0.43
- - 2.18 4.1 -1.48 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.13 0.99 2.95 3.42 -1.91 -3.56 - - - - - - - -1.76 - - - - - - - -
- - 3.54 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.15 0.49 3.35 3.19 - -3.56 -2.18 - - - - - - -2.09 - - - - - -0.76 - -
-1.99 0.22 3.45 3.26 -4.02 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.74 1.52 3.81 2.1 -4.03 -6.92 -3.43 - - - - - - -3.74 - - - - - - - -
-2.13 0.23 3.32 2.89 -2.52 -3.31 - - 0.77 -1.92 - - - -3.46 - - - - -0.25 - - -
- - 3.82 2.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.1 3.85 2.72 -1.08 -5.02 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.94 -0.55 3.47 2.96 -2.6 -5.73 - - - - - - - -1.55 - - - - - - - -
-3.59 0.23 3.66 3.01 -7.31 -5.6 - - - - - - -4.65 - - - - - - - - -
0.2 - 3.57 3.17 - -5.23 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.31 2.92 - - -1.62 1.86 - - - - - -0.82 - - - - - - - -
-0.09 1.58 3.38 2.88 -4.66 - - - - - - - -2.01 - - - - - - - - -
-3.52 -0.19 3.5 2.9 - -4.01 - - - - - - - -2.25 -1.23 -1.38 - - - - 0.23 -
-1.12 - 2.57 3.25 -1.98 -3.96 -2.11 - 1.23 - - 1.17 - -0.11 - - - - - - - -
- -0.48 2.29 3.75 -0.58 -5.66 - - 1.17 - - - - - - - - - - - - -
-1.95 -2.12 3.62 3.18 -2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.29 3.12 3.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.2 - 3.79 2.77 - - - - - - - - - -1.14 - - - - - - - -
-0.02 - 1.9 4.09 -1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.63 - 3.0 3.26 -3.79 -1.98 -3.4 - - - 1.22 - - 0.07 - - - - - - - -
- - 3.63 3.26 - -4.09 - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.8 0.9 3.83 2.33 - -6.69 -4.47 - - - - - -3.29 - - - - - - -2.44 - -
- - 3.16 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.52 3.33 - -3.29 -2.89 - - - - - - -2.21 - - - - - - - -
- - 3.35 3.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.6 - 3.43 3.24 - -3.46 -3.07 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.07 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp8g05330.1 (AMT1;3)
-2.55 - 3.18 3.53 -3.6 -3.97 -3.17 - - - - - - -2.49 - - - -0.4 - - - -
Mp8g05950.1 (PTR1)
- 0.1 3.39 3.29 -0.73 -5.11 - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.84 -0.57 3.52 2.75 -3.85 -3.9 -1.58 - - - - - - - - - - - - 1.31 - -
-2.2 -0.16 3.76 2.87 -4.94 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.12 -0.56 3.19 3.52 -2.88 -6.91 - - - - - - - -3.7 - - - - - - - -
- - 3.27 3.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.85 2.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.81 0.2 3.7 2.82 -1.25 -7.25 -4.8 - - - -2.69 - - -3.49 - - - - - - - -
-5.57 -1.47 4.04 2.37 - -4.27 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.1 3.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.06 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.43 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.08 -0.08 3.14 3.57 -3.08 -5.99 -5.94 - - - - - - - - -4.38 - - - - - -
Mpzg00170.1 (STOP1)
-0.04 0.8 2.06 3.85 - -2.04 - - - - - - - -1.26 - - - - - - - -
Mpzg01480.1 (FEI2)
0.48 -0.74 2.43 3.07 -2.47 -0.99 -0.24 -0.8 -0.48 -1.0 - -0.54 -2.02 -3.52 -1.96 - -1.6 -2.06 - - -0.62 -1.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.