Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Archegoniophore (female)	Antheridiophore (male)	Antheridium (male)	Sperm	Sporeling	Thallus	Thallus (vegetative)	Thallus (MpPAP1OX-1)	Thallus (Tak1-2)	Thallus (MpPAP1OX-3)	Thallus (MpPAP1OX-2)	Thallus (Tak1-3)	mid rib (male)	Gametophyte	Gemmaling (female, hpt2040)	Gemmaling (male, hpt2040)	Gemmaling (BC3-38)	Gemmaling (Tak1)	Gemmaling	Gemma cup	gemma cup (male)	Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Mp1g02340.1	0.1	0.06	0.36	1.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g04090.1	0.11	0.0	0.55	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g07080.1	0.0	0.0	0.28	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g15260.1	0.0	0.04	0.4	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g15380.1 (RING1B)	0.05	0.07	0.72	1.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05
Mp1g19090.1	0.07	0.0	0.16	1.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g19630.1	0.1	0.08	0.47	1.0	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g19840.1	0.01	0.08	1.0	0.54	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g20100.1	0.0	0.0	0.85	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g20170.1	0.0	0.0	0.59	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g20480.1	0.01	0.08	1.0	0.57	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.07
Mp1g23900.1	0.0	0.0	1.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g05840.1	0.03	0.0	0.72	1.0	0.07	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g08250.1	0.0	0.0	0.36	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g11330.1 (ATM1)	0.06	0.14	0.29	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g13630.1	0.0	0.0	1.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g17150.1	0.02	0.1	0.71	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g17660.1	0.04	0.39	0.8	1.0	0.04	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.05	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g19560.1	0.1	0.1	1.0	0.95	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g19840.1 (MSH5)	0.0	0.21	1.0	0.46	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g00580.1	0.0	0.0	0.37	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g01660.1	0.0	0.0	0.91	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g02800.1	0.04	0.04	1.0	0.39	0.02	0.03	0.09	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g05450.1	0.02	0.08	0.38	1.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g05660.1	0.0	0.16	0.53	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g05700.1	0.01	0.0	0.42	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g09500.1	0.08	0.11	1.0	0.64	0.02	0.02	0.02	0.11	0.0	0.14	0.06	0.1	0.02	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.08	0.04	0.0	0.0
Mp3g14040.1	0.0	0.0	0.32	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g18150.1	0.0	0.34	1.0	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g21640.1	0.14	0.0	0.43	1.0	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g23450.1	0.0	0.0	0.35	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g23890.1	0.03	0.12	0.68	1.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g02040.1	0.13	0.0	0.8	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g02340.1	0.0	0.0	0.35	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g07170.1	0.04	0.06	1.0	0.36	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g09630.1	0.0	0.11	0.51	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g14460.1	0.08	0.0	0.62	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g16440.1	0.0	0.0	0.31	1.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g17870.1	0.0	0.0	0.8	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g23760.1	0.1	0.29	0.97	1.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.16
Mp5g01550.1	0.0	0.0	0.26	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp5g03830.1	0.09	0.19	0.72	1.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp5g08500.1	0.0	0.0	1.0	0.9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp5g10620.1	0.01	0.14	1.0	0.89	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0
Mp5g11940.1	0.02	0.11	1.0	0.88	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp5g12020.1	0.04	0.2	1.0	0.31	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp5g17740.1 (SWN)	0.02	0.12	1.0	0.74	0.02	0.01	0.0	0.0	0.17	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0
Mp5g23960.1	0.0	0.0	1.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g00640.1	0.0	0.03	1.0	0.46	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g03470.1	0.17	0.06	1.0	0.7	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g09280.1 (LOB)	0.01	0.09	1.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g10710.1	0.1	0.0	1.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g11650.1	0.0	0.0	1.0	0.76	0.0	0.0	0.03	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g13640.1	0.09	0.29	1.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g14220.1	0.01	0.08	1.0	0.66	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0
Mp6g14740.1	0.05	0.0	0.62	1.0	0.03	0.01	0.02	0.0	0.25	0.0	0.0	0.24	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g16730.1	0.0	0.05	0.36	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g19540.1	0.02	0.02	1.0	0.74	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g19960.1	0.0	0.1	0.72	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g20940.1	0.06	0.0	1.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g01730.1	0.06	0.0	0.22	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g01870.1	0.07	0.0	0.84	1.0	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g03780.1	0.0	0.0	1.0	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g04200.1	0.04	0.13	1.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Mp7g06090.1	0.0	0.0	0.69	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g10280.1	0.0	0.0	1.0	0.87	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g15170.1	0.0	0.0	0.86	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g17460.1	0.14	0.0	1.0	0.88	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp8g05250.1	0.0	0.0	0.62	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp8g05330.1 (AMT1;3)	0.01	0.0	0.78	1.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp8g05950.1 (PTR1)	0.0	0.1	1.0	0.93	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp8g08790.1	0.01	0.06	1.0	0.59	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0
Mp8g16740.1	0.02	0.07	1.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp8g17080.1	0.04	0.06	0.8	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp8g17260.1	0.0	0.0	0.78	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp8g17590.1	0.0	0.0	1.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp8g17850.1	0.01	0.09	1.0	0.54	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MpVg00210.1	0.0	0.02	1.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MpVg00290.1	0.0	0.0	0.64	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MpVg01000.1	0.0	0.0	1.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MpVg01110.1	0.0	0.0	0.32	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
MpVg01190.1	0.01	0.08	0.74	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mpzg00170.1 (STOP1)	0.07	0.12	0.29	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mpzg01480.1 (FEI2)	0.17	0.07	0.64	1.0	0.02	0.06	0.1	0.07	0.09	0.06	0.0	0.08	0.03	0.01	0.03	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.08	0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)