Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.18 0.13 0.23 1.0 0.39 0.07 0.04 0.1 0.02 0.1 0.13 0.02 0.04 0.04 0.05 0.07 0.04 0.04 0.08 0.18 0.08 0.47
0.18 0.0 0.0 0.21 1.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.3 0.0 0.0 0.0
0.21 0.0 0.0 0.66 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 1.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.0 0.55 1.0 0.12 0.06 0.0 0.08 0.0 0.08 0.15 0.0 0.15 0.05 0.13 0.03 0.0 0.56 0.0 0.0 0.51
0.21 0.0 0.08 1.0 0.6 0.13 0.1 0.07 0.13 0.0 0.16 0.0 0.0 0.07 0.04 0.15 0.04 0.21 0.1 0.05 0.12 0.58
Mp2g20630.1 (PHT2)
0.09 0.0 0.0 0.32 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.29 0.28 1.0 0.47 0.38 0.0 0.14 0.35 0.3 0.18 0.13 0.42 0.41 0.06 0.08 0.07 0.05 0.05 0.18 0.16 0.69
0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.54 1.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.2 0.34 0.78 0.44 0.11 0.12 0.2 0.06 0.21 0.23 0.07 0.07 0.05 0.04 0.12 0.02 0.08 0.14 0.32 0.14 1.0
0.38 0.25 1.0 0.8 0.6 0.17 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.14 0.03 1.0 0.57 0.11 0.28 0.04 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.09 0.07 0.13 0.1 0.11 0.0 0.59
0.59 0.5 0.0 1.0 0.75 0.02 0.11 0.23 0.0 0.71 0.36 0.0 0.1 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
Mp4g03050.1 (ELP1)
0.07 1.0 0.78 0.88 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 1.0 0.56 0.02 0.01 0.11 0.0 0.0 0.0 0.24 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.13 0.07 0.22 1.0 0.07 0.08 0.0 0.13 0.06 0.0 0.24 0.0 0.07 0.14 0.05 0.09 0.15 0.19 0.2 0.0 0.07
0.04 0.0 0.64 1.0 0.58 0.08 0.29 0.0 0.5 0.0 0.1 0.16 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
0.04 0.0 0.14 0.02 1.0 0.08 0.05 0.07 0.0 0.12 0.0 0.13 0.03 0.06 0.09 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 1.0 0.68 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
0.01 0.11 0.17 0.35 1.0 0.08 0.04 0.02 0.28 0.0 0.0 0.23 0.1 0.04 0.05 0.15 0.09 0.08 0.52 0.15 0.04 0.05
0.01 0.0 0.0 0.88 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.59 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.02 0.0 0.04 0.48 1.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.14 0.05 0.0 0.58 1.0 0.06 0.05 0.05 0.0 0.0 0.06 0.09 0.06 0.09 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.26 0.04 0.05
Mp5g11720.1 (HAI3)
0.15 0.05 0.0 0.03 1.0 0.02 0.01 0.07 0.05 0.07 0.05 0.1 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.21 0.21 0.09
Mp5g13420.1 (ATZIP4)
0.05 0.24 0.07 1.0 0.93 0.06 0.02 0.04 0.29 0.1 0.28 0.41 0.0 0.1 0.07 0.02 0.05 0.05 0.0 0.14 0.19 0.0
0.04 0.15 0.05 1.0 0.38 0.12 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.31 0.03 0.0 0.02 0.0 0.03 0.06 0.17 0.15 0.04
0.02 0.0 0.0 1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.24 0.35 1.0 0.38 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.58 1.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.07 1.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.05 0.1 0.04 1.0 0.78 0.16 0.25 0.06 0.04 0.05 0.09 0.04 0.14 0.05 0.05 0.14 0.11 0.13 0.16 0.16 0.1 0.52
0.03 0.0 0.0 0.17 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.2 0.34 0.78 0.44 0.11 0.12 0.2 0.06 0.21 0.23 0.07 0.07 0.05 0.04 0.12 0.02 0.08 0.14 0.32 0.14 1.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.29 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)