Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
46.89 33.55 59.92 264.86 102.82 19.25 10.34 25.78 6.28 27.62 34.6 4.7 11.27 10.23 12.0 19.32 11.16 11.12 20.46 48.01 21.91 125.28
2.9 0.0 0.0 3.4 16.15 1.35 0.61 0.0 0.0 1.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 4.78 0.0 0.0 0.0
0.19 0.0 0.0 0.61 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.58 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.0 0.0 0.5 0.91 0.11 0.05 0.0 0.07 0.0 0.07 0.13 0.0 0.14 0.04 0.11 0.03 0.0 0.51 0.0 0.0 0.46
0.16 0.0 0.06 0.76 0.45 0.1 0.08 0.05 0.1 0.0 0.12 0.0 0.0 0.06 0.03 0.11 0.03 0.16 0.07 0.04 0.09 0.44
Mp2g20630.1 (PHT2)
0.09 0.0 0.0 0.3 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.15 3.13 2.99 10.88 5.11 4.11 0.04 1.51 3.83 3.22 1.92 1.46 4.55 4.5 0.68 0.92 0.78 0.58 0.54 2.01 1.76 7.52
0.0 0.0 0.0 0.2 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.67
0.0 0.0 0.0 0.5 9.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.94 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 6.51 1.67 1266.38 0.85 1.96 4.17 0.0 0.71 0.0 0.51 0.0 14.35 0.1 0.0 0.09 0.09 7.29 2.73 1.65 4.3
0.0 0.0 0.37 0.69 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.98 11.37 19.2 44.61 25.31 6.54 6.57 11.34 3.48 11.68 12.82 4.25 4.02 2.91 2.34 6.86 1.39 4.64 7.85 18.31 7.72 56.92
1.19 0.8 3.15 2.53 1.88 0.54 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.14 0.03 0.98 0.56 0.11 0.28 0.04 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.08 0.06 0.13 0.1 0.1 0.0 0.58
1.14 0.97 0.0 1.93 1.45 0.04 0.2 0.44 0.0 1.36 0.7 0.0 0.19 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
Mp4g03050.1 (ELP1)
0.02 0.22 0.17 0.19 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.34 0.19 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.38 0.21 0.65 2.94 0.21 0.25 0.0 0.37 0.17 0.0 0.72 0.0 0.21 0.4 0.14 0.27 0.45 0.55 0.58 0.0 0.19
0.01 0.0 0.14 0.22 0.13 0.02 0.06 0.0 0.11 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.08 0.0 0.26 0.05 1.96 0.16 0.1 0.13 0.0 0.24 0.0 0.25 0.06 0.12 0.18 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 1.96 1.34 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28
0.04 0.39 0.59 1.18 3.39 0.27 0.12 0.08 0.96 0.0 0.0 0.77 0.35 0.13 0.16 0.52 0.32 0.27 1.77 0.5 0.14 0.17
0.01 0.0 0.0 0.44 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.43 0.85 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.03 0.0 0.07 0.77 1.59 0.05 0.04 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.1 0.03 0.0 0.42 0.73 0.04 0.04 0.04 0.0 0.0 0.04 0.07 0.05 0.07 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.19 0.03 0.04
Mp5g11720.1 (HAI3)
1.83 0.64 0.05 0.32 12.53 0.22 0.07 0.91 0.67 0.85 0.67 1.27 0.09 0.51 0.05 0.1 0.02 0.11 0.31 2.59 2.65 1.12
Mp5g13420.1 (ATZIP4)
0.02 0.09 0.03 0.37 0.34 0.02 0.01 0.01 0.11 0.04 0.1 0.15 0.0 0.04 0.03 0.01 0.02 0.02 0.0 0.05 0.07 0.0
3.99 13.36 4.47 91.88 34.5 11.29 0.0 0.0 0.0 3.32 1.09 0.0 28.44 3.12 0.31 1.46 0.0 2.65 5.79 15.49 13.88 4.08
0.01 0.0 0.0 0.42 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.5 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.12 0.18 0.53 0.2 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.34 0.58 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.13 2.01 1.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0
0.53 1.12 0.44 11.41 8.9 1.85 2.85 0.64 0.42 0.57 1.04 0.41 1.56 0.6 0.54 1.59 1.27 1.5 1.87 1.83 1.12 5.91
0.12 0.0 0.0 0.68 3.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.98 11.37 19.2 44.61 25.31 6.54 6.57 11.34 3.48 11.68 12.82 4.25 4.02 2.91 2.34 6.86 1.39 4.64 7.85 18.31 7.72 56.92
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.0 0.0 0.49 1.68 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)