Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.61 0.25 0.07 1.0 0.0 0.22 0.04 0.38 0.0 0.07 0.12 0.0 0.03 0.97 0.09 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.37 0.0 0.22 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.31 0.0 1.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.14 0.19 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.92 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g28890.1 (EXP7)
0.36 0.0 0.05 1.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.18 0.0 1.0 0.02 0.06 0.01 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79
1.0 0.17 0.25 0.98 0.04 0.06 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.6 0.14 0.0 1.0 0.21 0.0 0.07 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g07380.1 (OMT1)
1.0 0.41 0.0 0.87 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.21 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.23
0.59 0.0 0.0 1.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.1 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.28 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.88 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.14 0.06 1.0 0.0 0.05 0.11 0.07 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.67 0.07 0.0 1.0 0.1 0.04 0.01 0.07 0.14 0.03 0.06 0.13 0.02 0.03 0.03 0.05 0.03 0.05 0.05 0.03 0.06 0.14
Mp2g19620.1 (OMT1)
0.62 0.24 0.0 1.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0
0.64 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.07 0.19 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.14 0.08 1.0 0.0 0.04 0.14 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.05 0.0
0.75 0.12 0.03 1.0 0.0 0.01 0.03 0.18 0.0 0.19 0.97 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.95 0.05 0.0 1.0 0.18 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08
Mp3g09620.1 (PTR2)
0.63 0.25 0.49 1.0 0.01 0.01 0.01 0.11 0.0 0.07 0.0 0.03 0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.06 0.23 0.09
0.52 0.11 0.0 1.0 0.08 0.1 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.11 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.32 0.19
1.0 0.17 0.46 0.42 0.07 0.1 0.07 0.1 0.0 0.11 0.1 0.12 0.11 0.06 0.02 0.04 0.02 0.06 0.05 0.07 0.32 0.16
0.28 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.91 0.0 0.0 1.0 0.21 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
0.91 0.0 0.0 1.0 0.21 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g07810.1 (SIP1A)
0.28 0.39 0.31 0.81 0.2 0.17 0.11 0.39 0.36 0.4 0.29 0.36 0.2 1.0 0.03 0.06 0.08 0.09 0.28 0.23 0.2 0.33
0.42 0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78
Mp5g01760.1 (RBP1)
1.0 0.0 0.12 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.23 0.98 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.71 0.02 0.0 1.0 0.03 0.01 0.02 0.09 0.17 0.02 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.03
1.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.52 0.0 0.56 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.63 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g11680.1 (FRO6)
0.67 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.39 0.0 0.38 0.32 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0
Mp5g17560.1 (LIP1)
0.4 0.07 0.19 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g20010.1 (SNL4)
0.35 0.07 0.0 1.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.02 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32
Mp5g22280.1 (MYB3R-5)
1.0 0.0 0.55 1.0 0.62 0.04 0.21 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g22890.1 (TFL2)
0.63 0.0 0.02 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.03 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g00230.1 (DRD3)
1.0 0.18 0.02 0.68 0.0 0.1 0.03 0.1 0.13 0.1 0.02 0.11 0.04 0.09 0.09 0.07 0.12 0.18 0.0 0.06 0.01 0.0
1.0 0.35 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.31 0.82 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.17
1.0 0.36 0.0 0.07 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g10190.1 (BAM9)
0.68 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.28 0.66 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.73 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.62 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.13 0.57 0.0 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.09 0.07 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.6 0.0 0.18 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.82 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.7 0.0 0.0 1.0 0.03 0.04 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23
0.47 0.3 0.13 1.0 0.08 0.15 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.25 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.0 0.48 0.0 0.04 0.33 0.28 0.04 1.0 0.46 0.22 0.0 0.34 0.57 0.0 0.29 0.54 0.43 0.0 0.41 0.0 0.97
0.39 0.0 0.47 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
Mp7g15910.1 (GMI1)
1.0 0.03 0.01 0.54 0.12 0.03 0.01 0.01 0.1 0.02 0.02 0.06 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
Mp7g17270.1 (BPM2)
1.0 0.0 0.0 0.75 0.05 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g18690.1 (LBD22)
0.75 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.51 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.18 0.04 1.0 0.01 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.13 0.08 0.02 0.0 0.07 0.0 0.06 0.0 0.0
0.58 0.19 0.0 1.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.52 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.48 0.0
1.0 0.0 0.0 0.92 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.17 0.58 0.0 0.02 0.14 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.63 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
1.0 0.0 0.0 0.61 0.15 0.08 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.43 0.02 0.5 0.04 0.13 0.11 0.05 0.0 0.02 0.11 0.0 0.01 0.1 0.11 0.21 0.09 0.21 0.17 0.14 0.04 0.05
1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.11 0.01 1.0 0.0 0.03 0.01 0.04 0.11 0.07 0.07 0.06 0.01 0.25 0.01 0.02 0.02 0.03 0.01 0.04 0.03 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)